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Questions and Answers
¿Cuál es la principal ventaja de los nanocapilares en la espectrometría de masas?
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¿Qué problema se asocia principalmente al uso de nanocapilares en los análisis?
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¿Cuál es la carga máxima que puede aportar información estructural de un péptido?
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¿Qué caracteriza a la masa molecular promedio en espectrometría de masas?
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¿Qué se entiende por masa isotópica?
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¿Cuál es un efecto del alto número de carbonos en las macromoléculas en espectrometría de masas?
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¿Qué define la capacidad de resolución de una columna cromatográfica?
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¿Cómo afecta la electrospray a la ionización de las proteínas?
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¿Cuál es una alternativa a los nanocapilares mencionada en el análisis?
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¿Cuál es la relación del parámetro A en la ecuación de Van Deemter?
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¿Cómo afecta la homogeneidad del lecho a la H de la columna?
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El parámetro B en la ecuación de Van Deemter se relaciona con:
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¿Qué se busca al operar en condiciones de velocidad de elución óptimas?
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¿Cuál de las siguientes opciones describe el concepto de HETP?
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¿Qué se determina al estudiar la capacidad de resolución cromatográfica de un sistema?
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¿Cuál no es un objetivo al analizar la H en cromatografía?
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¿Cómo se logra el confinamiento de los iones en una trampa iónica?
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Qué técnica permite el análisis detallado de regiones específicas en un espectro de masa?
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Cuál es una de las características principales de los sistemas MS/MS?
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Qué ocurre cuando se aplican voltajes adicionales en la componente RF de una trampa iónica?
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Qué tipo de sistemas MS/MS son los más empleados?
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Cuál es el efecto de aumentar la componente RF en una trampa iónica?
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Que técnica permite la dirección efectiva de los iones hacia la trampa iónica?
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Qué representa la técnica de 'barrido de inestabilidad selectiva de masas'?
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¿Cuál es la principal diferencia entre el modo TIC y el modo SIM en cromatografía acoplada a MS?
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¿Cómo afecta el análisis en modo TIC a la sensibilidad de los resultados?
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Qué permite determinar la comparación de espectros con bases de datos en la cromatografía acoplada a MS?
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Qué estrategia se puede usar para determinar si los picos en un cromatograma corresponden a compuestos aislados?
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¿Cuál es un factor a considerar durante la identificación de compuestos en cromatografía acoplada a MS?
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Qué se evalúa en el análisis isotópico dentro de los espectros de masas?
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Qué aplicación se puede dar a los sistemas de tipo GC-MS?
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Cómo ayuda la trampa iónica en modo SIM durante el análisis?
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¿Qué tipo de compuestos se pueden analizar fácilmente con sistemas GC-MS?
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¿Cuál es una ventaja clave de los sistemas LC-MS sobre los sistemas GC-MS?
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¿Qué desafío tecnológico se enfrenta en la interfaz cromatógrafo-espectrómetro?
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¿Cuál es una característica de la tecnología de HPLC?
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¿Cuál es una de las ventajas de la espectrometría de masas?
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¿Qué representa el RSD en el contexto de las determinaciones cuantitativas?
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¿Qué propiedad tienen los geles utilizados en cromatografía de exclusión por tamaño?
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¿Cuál de las siguientes afirmaciones describe mejor la sensibilidad de LC-MS?
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¿Qué factor no influye en la selección de la técnica cromatográfica adecuada?
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¿Cuál es la definición correcta de selectividad en el contexto de técnicas cromatográficas?
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¿Qué describe mejor la fase móvil en un sistema cromatográfico?
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¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la sensibilidad es incorrecta?
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¿Cómo se pueden clasificar las técnicas de separación cromatográfica?
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En cromatografía, ¿qué se entiende por fase estacionaria?
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¿Cuál de las siguientes no es una ventaja de las técnicas cromatográficas?
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¿Qué aspecto NO se considera un factor analítico en la cromatografía?
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Study Notes
Apuntes de Técnicas de Análisis y Tecnologías Ómicas
- Generalidades: El documento corresponde a apuntes de clase sobre técnicas de análisis y tecnologías ómicas. El material incluye información propia, complementada con recursos gráficos y referencias de los docentes de la asignatura. El uso del material es para uso interno y de responsabilidad individual.
Bloque II: Técnica de Análisis
- Tecnologías ómicas: Abarcan la totalidad de los fenómenos biológicos, desde la secuencia del ADN hasta los metabolitos finales.
- Áreas de estudio: Genómica (genoma y expresión génica), proteómica (proteínas expresadas), metabolómica (metabolitos del organismo).
- Proteómica y afines: Estudian la información relativa a las proteínas expresadas por un organismo en un instante dado (proteoma). Se centra en el análisis global de muestras complejas, identificando cuantitativa o cualitativamente, la expresión en el proteoma.
- Metabolómica y afines: Analizan los metabolitos del organismo (metaboloma). Se enfoca en los productos finales del metabolismo.
- Integración de tecnologías ómicas: Se conoce como biología de sistemas, lo que permite una visión completa de los procesos biológicos.
- Espectrometría de masas: Es una técnica indispensable en el análisis de moléculas de gran complejidad.
- Principios de funcionamiento: Se basa en la ionización en fase gaseosa y separación de iones según su relación masa/carga (m/z). La técnica requiere una fuente de ionización y un analizador.
Espectrometría de Masas
- Introducción: Técnica basada en la separación de iones en fase gaseosa. Permite la identificación y clasificación de iones.
- Componentes: Fuente de ionización, analizador y detector.
- Principios de funcionamiento: La generación de iones en fase gaseosa y la separación de iones según su relación masa/carga (m/z).
- Tipos de analizadores: Fuente de ionización, como Electrospray (ESI) o Láser Asistente a Desorción/Ionización con Matriz (MALDI); y analizadores como Tiempo de Vuelo (TOF), Cuadrupolo, Sector Magnético e Orbitrap.
8.1.2 Análisis de proteínas mediante espectrometría de masas
- Configuración: Similar a un espectrómetro de masas convencional, pero con fuentes de ionización específicas para proteínas (ESI o MALDI).
- Análisis: Determinación de la masa de fragmentos peptídicos y de la secuencia de aminoácidos (aa) de las proteínas.
8.2 Espectrómetros de masas. Metodologías de ionización
- Metodologías de ionización: Fast Atom Bombardment (FAB); Liquid Ion Mass Spectrometry (LSIMS) y Matrix Assisted Laser Desorption Ionization (MALDI).
- Funcionamiento: Consiste en bombardear la matriz con un haz de átomos ionizados, o láser, para producir la ionización del analito, permitiéndola ser transferida a la fase gaseosa.
8.4 Tipos de analizadores en MS
- Analizadores de tiempo de vuelo (TOF): Separación de iones basada en el tiempo que tardan en recorrer un tubo de vuelo, donde los iones más ligeros llegan primero que los más pesados.
- Analizadores de cuadrupolo: Separación de iones mediante la aplicación de campos eléctricos y de radiofrecuencia, manteniendo solo los iones en resonancia dentro del cuadrupolo.
- Trampas de iones: Captura y retención de los iones, permitiendo su acumulación y subsecuente análisis.
- Analizadores de sector magnético: Los iones son desviados o enfocados en función de su relación m/z.
9. Técnicas de separación cromatográfica
- Generalidades: Técnicas para separar mezclas complejas en sus componentes individuales.
- Factores analíticos: Naturaleza de la muestra, intervalo de concentración, sensibilidad y selectividad del método.
- Factores técnico-económicos: Coste del equipo, número de muestras, velocidad de muestreo, tiempo de análisis.
- Conceptos básicos: Fase estacionaria, fase móvil, tiempo de retención, factor de retención, selectividad.
9.1.1 Técnicas de separación, factores de selección
- Cromatografía en columna: Fase estacionaria en una columna.
- Cromatografía plana: Fase estacionaria en una placa.
- Cromatografía de gases (GC): Fase móvil gaseosa, análisis de compuestos volátiles.
- Cromatografía líquida (LC): Fase móvil líquida, análisis de compuestos polares, compuestos no volátiles.
9.2 Análisis cuantitativo
- Métodos de calibración: Calibración mediante estándares (patrón externo); y calibración mediante estándares con patrón interno.
- Objetivo: Cuantificar la concentración de metabolitos en una muestra.
9.3 Cromatografía de gases (GC)
- Gas portador: Transporta la muestra a través de la columna.
- Sistemas de inyección de muestras: Split, Splitless.
9.4 Cromatografía de Líquidos (LC)
- Características: Útil con moléculas polares e inestables térmicamente.
- Mecanismos de separación: Adsorción, partición, intercambio iónico, exclusión.
- Modalidades: Fase normal, fase inversa.
10. Electroforesis en geles de poliacrilamida (PAGE)
- Introducción: Separación de proteínas mediante un campo eléctrico.
- Preparación del gel: Requerimiento de acrilamida, bisacrilamida, iniciadores y catalizadores.
- Separación: Mediante un campo eléctrico, donde las proteínas migran según su carga y tamaño.
- Revelado: Visualización de las proteínas usando métodos de tinción.
11. Proteómica
- Definición: Estudio completo de las proteínas presentes en un organismo en un momento dado.
- Metodologías: Identificación basada en geles (huella peptídica); y fragmentación acoplada.
- Ventajas: Permite analizar el proteoma completo.
11.2 Identificación de péptidos
- Huella peptídica: Análisis de fragmentos peptídicos para identificación de proteínas.
- Fragmentación peptídica: Digestión de proteínas con proteasas, separación y análisis de la fragmentación en espectrometría de masas.
11.7 Aplicaciones de la proteómica
- Convencionales: Farmacéutica, biotecnología ambiental, alimentaria, toxicología, etc
- Emergentes: Perfiles de tejidos, análisis del microbioma, optimización de cultivos.
- Metaproteómica: Estudio de las proteínas relacionadas con la respuesta al estrés.
12. Resonancia magnética nuclear y Spin electrónico
- Introducción: Aprovechamiento de los fenómenos de resonancia.
- Aplicaciones: Caracterización estructural de moléculas en disolución.
- Dispositivos empleados: Imanes superconductores, sondas de resonancia magnética nuclear.
13. Metabolómica
- Conceptos clave: Metabolitos, metaboloma.
- Aproximaciones: Dirigida (análisis de metabolitos específicos) y no dirigida (análisis masivo).
- Análisis de la componente principal (PCA): Metodología para la reducción de información.
14. Citómica: Citometría de flujo y microscopía co-focal
- Introducción: Estudio de las células individuales.
- Citometría de flujo: Clasificación y cuantificación de células en base a sus propiedades físicas y funcionales.
- Microscopía confocal: Imágenes de la superficie y secciones de células individuales.
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Description
Este cuestionario explora conceptos clave sobre espectrometría de masas, incluyendo las ventajas y problemas asociados al uso de nanocapilares, así como la influencia de diversos parámetros en la resolución de las columnas cromatográficas. A través de preguntas específicas, los participantes evaluarán su comprensión de estos temas fundamentales en análisis químico.