Podcast Beta
Questions and Answers
Quin és un exemple d'àtom àcid segons la teoria de Brønsted-Lowry?
Què és l'hidroxilació del col·lagen?
4-hidroxiprolina i 5-hidroxilisina
Les proteïnes són polímers lineals d'aminoàcids. (Cert/Fals)
False
Com es connecten els grups NH i CO entre els grups amino i carboxílic de cadenes adjacents?
Signup and view all the answers
Relaciona els nivells estructurals de les proteïnes amb les seves descripcions:
Signup and view all the answers
Quina disposició pot tenir la disposició dels grups R en una proteïna?
Signup and view all the answers
Relaciona les estructures proteiques amb els seus tipus:
Signup and view all the answers
Quins són els bioelements primaris?
Signup and view all the answers
Es desnaturalitza una proteïna quan es trenquen els enllaços peptídics.
Signup and view all the answers
Per què el carboni és capaç de formar enllaços amb altres elements?
Signup and view all the answers
Les interaccions de VdW són fortes i es produeixen entre molècules carregades.
Signup and view all the answers
El H promou que les molècules hidrofòbiques s'agrupin.
Signup and view all the answers
Relaciona els grups funcionals amb els seus noms corresponents:
Signup and view all the answers
Què són les encefalopaties espongiformes?
Signup and view all the answers
Què és el PrPSc en relació amb el Prió?
Signup and view all the answers
La transmissió iatrogènica d'encefalopaties espongiformes és provocada per alguna intervenció mèdica.
Signup and view all the answers
La purificació d'una proteïna és necessària per estudis posteriors sobre la seva ______________ i funció.
Signup and view all the answers
Relaciona els mètodes de purificació de proteïnes amb la seva descripció:
Signup and view all the answers
Quin mètode s'utilitza per detectar la proteïna quantitativament utilitzant anticossos i mesurant la senyal emesa?
Signup and view all the answers
Quin pas s'executa en segon lloc durant un ELISA indirecte?
Signup and view all the answers
La separació de les proteïnes en funció del PM es realitza durant la segona dimensió en l'electroforesi bidimensional (2-D PAGE).
Signup and view all the answers
En l'estructura del grup hemo, l'àtom de Fe es troba en estat ___.
Signup and view all the answers
Relaciona les estructures 3D de les proteïnes amb el mètode utilitzat per caracteritzar-les:
Signup and view all the answers
Què és l'hexoquinasa responsable de permetre l'ús prioritari de la glucosa pel múscul?
Signup and view all the answers
Què representa Vmàx en el metabolisme enzimàtic de la glucosa?
Signup and view all the answers
La temperatura pot incrementar la velocitat de reacció enzimàtica. (Vertader/Fals)
Signup and view all the answers
L'inhibidor s'uneix al centre actiu de l'enzim en l'______.
Signup and view all the answers
Quin és l'efecte de l'unió de l'O2 a l'hemoglobina en la seva afinitat per l'O2 desoxigenada?
Signup and view all the answers
El 2,3-BPG redueix l'afinitat de l'hemoglobina per l'O2.
Signup and view all the answers
Quin és l'efecte de l'H+ i el CO2 en la capacitat de l'hemoglobina d'alliberar l'O2?
Signup and view all the answers
En el model de Pany i Clau, Emil Fischer va proposar que el centre actiu de l'enzim té una forma complementària al ________.
Signup and view all the answers
Quins són els factors que determinen si una reacció serà espontània o no basant-nos en l'energia lliure (ΔG)?
Signup and view all the answers
ΔG d’una reacció és independent del camí que segueix la transformació dels reactants en productes (P).
Signup and view all the answers
Què és la constant d'equilibri en condicions estàndard relacionada amb la diferència d'energia lliure (ΔG)?
Signup and view all the answers
En una reacció reversible, els productes (P) i els substrats (S) evolucionen en la mateixa proporció fins arribar a ____________.
Signup and view all the answers
Relaciona el següent concepte amb la seva definició: ΔG‡
Signup and view all the answers
Study Notes
Bioelements primaris
- C, H, O, N, P, i S són els bioelements primaris
- El carboni (C) té una electronegativitat intermèdia, el que li permet unir-se amb altres elements com S, O, N, i H
Grups funcionals
- Els grups funcionals són hidroxil, carbonil, carboxil, amino, i fosfat
- Aquests grups fonctionals permeten la formació d'enllaços químics
Enllaços químics en biomolècules
- Interaccions fortes: enllaços covalents, iònics, i ponts d'H
- Interaccions febles: enllaços de Van der Waals
- Enllaços covalents: són forts i curts, formen-se entre dos àtoms que comparteixen un parell d'electrons
- Enllaços d'H: són febles, formen-se entre dos àtoms que tenen una electronegativitat diferent
Aigua com a dissolvent
- L'aigua és un dissolvent polar que debilita les interaccions electroestàtiques
- L'aigua promou la formació de membranes i micel·les, la unió d'hormones esteroides als seus receptors, i el plegament proteic
Efecte hidrofòbic
- L'efecte hidrofòbic és la tendència de les molècules hidrofòbiques a agrupar-se
- Aquest efecte promou la formació de membranes i micel·les
Interaccions de Van der Waals
- Les interaccions de Van der Waals són febles i es produeixen entre tots els àtoms
- Tenen dos components: força atractiva i força repulsiva
Ionització de l'aigua i pH
- El pH és una mesura de la concentració d'ions d'hidrogen (H+)
- L'activitat enzimàtica està influenciada pel pH
Àcids i bases
- Àcids: tendeixen a cedir protons (H+)
- Bases: tendeixen a acceptar protons (H+)
- Àcids forts: tenen una gran tendència a dissociar-se
- Àcids febles: tenen una petita tendència a dissociar-se
Aminoàcids
- Són les unitats bàsiques de les proteïnes
- Tenen un grup amino (-NH2) i un grup carboxil (-COOH)
- Són quirals, excepte la glicina
Classificació dels aminoàcids
- Segons la cadena lateral (grup R) els aminoàcids varien en:
- Mida i forma
- Polaritat
- Càrrega
- Reactivitat química
Tipus d'aminoàcids
- Hidrofòbics: no polars, amb cadenes laterals apolars
- Polars sense càrrega: amb cadenes laterals polars sense càrrega
- Aromàtics: amb cadenes laterals aromàtiques
- Carregats positivament: amb cadenes laterals amb càrrega bàsica
- Carregats negativament: amb cadenes laterals amb càrrega àcida
Pèptids i proteïnes
- Un pèptid és una cadena de aminoàcids units per enllaços peptídics
- Una proteïna és una cadena polipeptídica molt llarga
- Les proteïnes tenen una estructura primària, secundària, terciària, i quaternària
Estructura primària
- La seqüència d'aminoàcids d'una proteïna determina la seva estructura tridimensional
- Els enllaços peptídics són covalents i determinen la seqüència d'aminoàcids
Estructura secundària
- La conformació local d'una part del pèptid
- Els ponts d'H entre la cadena principal i les cadenes laterals
Estructura terciària
- El plegament tridimensional de tota la cadena polipeptídica
- Les unions no peptídiques entre les cadenes laterals
Estructura quaternària
- La disposició espacial de dues o més subunitats polipeptídiques
- Les unions no peptídiques entre les subunitats
Electroforesi d'aminoàcids i pèptids
- La electroforesi és una tècnica molt utilitzada per a la separació d'aa i pèptids curts en solució
- Els aminoàcids se separen en funció de les seves càrregues sota l'acció d'un camp elèctric### Estructura Secundària de les Proteïnes
- Conformació local d'algunes parts de la cadena polipeptídica que forma estructures regulars repetitives
- Exemples: α-hèlix, fulls plegats β i llaços Ω
α-Hèlix
- Estructura en espiral en la que la cadena principal està a l'interior i les cadenes laterals dels residus estan projectades cap a l'exterior de l'hèlix
- Cada volta de l'hèlix allotja 3.6 residus
- L'estructura helicoidal es manté estabilitzada per ponts d'H intracatenaris entre els grups NH i CO que estan distanciats 4 residus a la seqüència aminoacídica
Full Plegat β
- Estructura formada per dues o més regions d'una mateixa cadena polipeptídica o de diferents cadenes polipeptídiques (anomenades cadenes β)
- L'esquelet de la cadena β es troba estès en zigzag
- La distància entre dos aa successius al llarg de la cadena β és més gran que en l'hèlix α
- Les cadenes laterals d'aa successius s'orienten en sentits oposats de forma alternada, per sobre i per sota del pla que conté la cadena
Girs β i Llaços Ω
- Les cadenes polipeptídiques poden canviar de direcció mitjançant girs i llaços, permetent que adoptin formes tridimensionals globals
- El gir β (gir invertit) és un gir de 180º que implica 4 residus
- Els llaços Ω (Ω turns) no presenten estructures periòdiques regulars
Estructures Supersecundàries (Motius Estructurals)
- Agrupacions d'estructura secundària molt estables
- Exemples: hèlix α i fulls β
Domini
- Unitats estructurals i funcionals
- Regions d'una cadena polipeptídica que són estables de manera independent, amb funció determinada
Estructura Terciària
- Plegament o disposició tridimensional de la cadena polipeptídica a l'espai
- Interaccions febles entre cadenes laterals (enllaços iònics, forces hidrofòbiques, VdW i ponts d'H)
Proteïnes Globulars i Fibroses
- Les proteïnes globulars són molt compactes i tenen una estructura molt definida
- Les proteïnes fibroses són insolubles i tenen una estructura de fibra
Col·lagen
- Proteïna més abundant en mamífers
- És extracel·lular i té una estructura particular: triple hèlix del col·lagen
Desnaturalització de Proteïnes
- Pèrdua de la conformació tridimensional, no trenquen enllaços peptídics (no hi ha proteòlisi)
- Els agents desnaturalitzants són la calor, el canvi de pH i els desnaturalitzants químics
Xaperones Moleculars
- Proteïnes que faciliten rutes de plegament correctes o aporten microentorns on pugui donar-se el plegament
- Exemples: xaperonines i Hsp70### Tècniques de Purificació de Proteïnes
- Augmentem la concentració de l'extracte mitjançant la centrifugació i la precipitació amb sulfat d'amoni (0,8 M per precipitar el fibrinogen i 2,4 M per precipitar l'albúmina sèrica)
- Diàlisi: "dessalació" a través d'una membrana semipermeable per separar molècules petites de molècules grans
Cromatografia
- Cromatografia de gel filtració: exclusió per mida, fase estacionària amb matriu de boletes poroses (agarosa, dextrà o poliacrilamida)
- Cromatografia de bescanvi iònic: separació en funció de la càrrega, fase estacionària amb boletes carregades
- Cromatografia d'afinitat: separació en funció d'interaccions específiques amb un lligand unit a la matriu sòlida
- Cromatografia líquida d'altra pressió (HPLC-UHPLC): columna amb materials molt fins, hi ha més centres d'interacció, i s'aplica pressió per obtenir velocitats de flux adequades
Electroforesi
- Electroforesi en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE): separació en funció de la massa molecular, proteïnes es desplacen cap al pH que iguala el seu pI
- Electroforesi bidimensional: separació en funció del pI i de la massa molecular
Valoració de la Purificació
- Quantificació de la concentració de proteïna total: absorbància (280nm, aa aromàtics) o colorimetria (Biuret, Bradford)
- Determinació del pes molecular de la proteïna: electroforesi en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) i espectroscòpia de masses
- Activitat enzimàtica: unitats d'Ez en una solució (UI) i activitat específica (A.E.) unitats Ezàtiques per mg de proteïna total
- Rendiment: activitat existent després de cada pas de purificació expressada com a percentatge de l'activitat en l'extracte cru
- Grau de purificació: increment de la puresa
Identificació de Proteïnes
- Raigs X MALDI-TOF: determinació de la seqüència proteica (degradació d'Edman)
- Espectroscòpia de masses: determinació de la massa molecular de proteïnes
Estructura Tridimensional de Proteïnes
- Raigs X: caracterització de l'estructura tridimensional de proteïnes
- RMN (ressonància magnètica nuclear): determinació de l'estructura tridimensional de proteïnes en solució
Relació Estructura-Funció de Proteïnes
- Mioglobina: estructura 3D, unió reversible d'oxigen
- Hemoglobina: estructura 3D, unió cooperativa d'oxigen
Grup Hemo
- Protoporfirina IX: anell tetrapirròlic, 4 anells pirròlics units per ponts metilè i amb cadenes laterals
- Àtom de Fe en estat ferrós (Fe2+): 2+ enllaços de coordinació
- Propietats del grup Hemo: unió reversible d'oxigen, conversió irreversible a Fe3+
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
Aquesta prova tracta sobre els bioelements primaris, els grups funcionals i les seves propietats. Explora les característiques del carboni i la seva capacitat d'unir-se amb altres elements.
