T8a) - Transcripción ARN

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Questions and Answers

¿Qué factor σ sustituye a σ70 en el promotor de los genes del choque térmico?

σ14

σ24

σ45

σ32 (correct)

¿Cuál es una característica de la ARN polimerasa en la fase de elongación?

Liberación de transcritos prematuros sin consecuencias

Incapacidad para reiniciar la síntesis de ARN (correct)

Interacción con el factor σ para la elongación

Participación activa de la subunidad σ

¿Qué permite a E. coli coordinar la expresión de genes durante cambios fisiológicos?

El tipo de terminación del ARN

La presencia de subunidades adicionales en la ARN polimerasa

La utilización diferente de factores σ (correct)

La actividad del sitio activo (Mg2+)

¿Qué ocurre cuando ciertas secuencias de ADN son encontradas por la ARN polimerasa?

Se producen pausas y algunas conducen a la terminación Signup and view all the answers

¿Qué subunidad de la ARN polimerasa no forma parte del complejo de elongación completo?

Subunidad β Signup and view all the answers

¿Cuál es una función principal del ARN?

Almacenamiento de información Signup and view all the answers

¿Qué tipo de ARN codifica la secuencia de aminoácidos para un polipéptido?

ARN mensajero (ARNm) Signup and view all the answers

Durante la transcripción, ¿qué cadena del ADN se utiliza como molde?

Solo una de las hebras del ADN Signup and view all the answers

¿Cuál de los siguientes componentes no es necesario para la transcripción de ARN?

Cebador Signup and view all the answers

¿Qué son los exones en un gen eucariota?

Segmentos codificantes Signup and view all the answers

¿Cuál es una diferencia clave entre replicación y transcripción?

Durante la replicación se copia el cromosoma entero Signup and view all the answers

¿Qué función ejerce el ARN de transferencia (ARNt) en la síntesis de proteínas?

Lee la información del ARNm y entrega aminoácidos Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la transcripción es correcta?

Se lleva a cabo en el núcleo de la célula Signup and view all the answers

¿Cuál es el efecto de los cambios en las secuencias de -35 y -10 en un promotor bacteriano?

Alteran la función del promotor. Signup and view all the answers

¿Qué característica indica que se ha formado un complejo cerrado en el proceso de iniciación de la transcripción?

El ADN promotor no está desenrollado. Signup and view all the answers

¿Qué sucede cuando se han sintetizado los primeros 8 o 9 nucleótidos durante la transcripción?

La subunidad σ se libera. Signup and view all the answers

¿Qué función tiene el factor σ en el ciclo de transcripción?

Se une a la ARN polimerasa para iniciar la transcripción. Signup and view all the answers

¿Cuál es una de las consecuencias de la unión de la proteína NusA con la ARN polimerasa?

Desplaza a la subunidad σ. Signup and view all the answers

¿Qué determina el nivel de expresión basal de los diferentes genes de E.coli?

La secuencia del promotor. Signup and view all the answers

¿Cuál es la función principal del ciclo σ en la transcripción bacteriana?

Iniciar un nuevo ciclo de transcripción. Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre las 7 subunidades σ en E.coli es correcta?

Diferentes subunidades σ pueden unirse a la ARN polimerasa para diferentes promotores. Signup and view all the answers

¿Cuál es la composición de la holoenzima de ARN polimerasa en E. coli?

Cinco subunidades núcleo y una subunidad σ. Signup and view all the answers

¿Qué función cumple la subunidad σ en la holoenzima de ARN polimerasa?

Dirigir la holoenzima hacia sitios específicos en el ADN. Signup and view all the answers

¿Cuál es la secuencia consenso en el promotor de la ARN polimerasa en E. coli en la posición -10?

(5’) TATAAT(3’) Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre los promotores en E. coli es verdadera?

La seq. UP está presente entre -40 y -60 y es rica en AT. Signup and view all the answers

¿Qué característica se asocia más comúnmente a la holoenzima que contiene σ70?

Especificidad para diferentes secuencias en el ADN. Signup and view all the answers

¿Cómo se extienden los promotores de la ARN polimerasa en E. coli?

Desde -70 a +30. Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes secuencias está en la posición -35 del promotor de ARN polimerasa en E. coli?

(5’) TTGACA(3’) Signup and view all the answers

¿Qué estimulan fuertemente los promotores que contienen secuencias UP?

La transcripción en los promotores que los contienen. Signup and view all the answers

¿Cuál es la función principal de TFIIB en el complejo de transcripción?

Facilitar el acceso de la polimerasa al promotor Signup and view all the answers

¿Qué complejos se unen durante la formación del complejo de transcripción cerrado?

TBP y TFIIB Signup and view all the answers

¿Cuál es la función de la actividad quinasa de TFIIH?

Fosforilar el CTD de ARN pol II Signup and view all the answers

Durante la elongación, ¿qué papel cumple TFIIF?

Suprimir las pausas en la transcripción Signup and view all the answers

¿Qué ocurre después de que TFIIH y TFIIE se separan del complejo?

Inicia la fase de elongación Signup and view all the answers

¿Cuántos polipéptidos se requieren para formar el complejo de transcripción activo?

Más de 30 Signup and view all the answers

¿Cuál de los siguientes factores no está involucrado en la elongación de la transcripción?

TFIID Signup and view all the answers

¿Qué papel juegan los factores de elongación en la polimerasa?

Fosforilan a ARN pol II en CTD Signup and view all the answers

¿Cuál es la función principal de TFIIH en la transcripción?

Actuar en la reparación del ADN Signup and view all the answers

¿Qué hace la α-Amanitina en el proceso de transcripción?

Bloquea la ARN polimerasa II Signup and view all the answers

¿Cuál es la característica de la ARN polimerasa I?

Es similar a la ARN polimerasa dependiente de rho Signup and view all the answers

¿Qué ocurre con la ARN polimerasa II tras completar la transcripción?

Es reciclada y liberada Signup and view all the answers

La inhibición de ARN polimerasa por Actinomicina D ocurre debido a:

La intercalación en el ADN que causa deformación Signup and view all the answers

¿Qué efecto tiene la regulación de la transcripción en eucariotas?

Permite la interacción con proteínas reguladoras Signup and view all the answers

¿Cuál de los siguientes síndromes se relaciona con la reparación del ADN acoplada a la transcripción?

X.pigmentosum Signup and view all the answers

¿Cuál es el efecto de la Rifampicina en la ARN polimerasa?

Interfiere con el desalojo del promotor Signup and view all the answers

Study Notes

Metabolismo del ARN

El ARN tiene funciones de almacenamiento, transmisión de información y catálisis.
La transcripción es el proceso de copiar un segmento de ADN de doble cadena para obtener una cadena de ARN complementaria.
Existe excepción en los genomas de ARN de ciertos virus.

Terminología

Un gen es un segmento de ADN (en muy pocos casos de ARN) que codifica la información requerida para la síntesis de un producto biológico funcional, como proteínas o ARN.
En eucariotas, los genes tienen una estructura compleja con intrones (no codificantes) y exones (codificantes).
La estructura y organización de los genes, incluyendo intrones y exones, difieren en eucariotas frente a procariotas.

Clases de ARN

ARN mensajero (ARNm): Codifica la secuencia de aminoácidos para uno o más polipéptidos.
ARN de transferencia (ARNt): Lee la información codificada en el ARNm y transfiere los aminoácidos correspondientes a la cadena polipeptídica en crecimiento.
ARN ribosómico (ARNr): Forma parte de los ribosomas.
Otros ARN especializados: Poseen funciones reguladoras y catalíticas y son precursores de otros ARN.

Replicación vs. Transcripción

Replicación: Copia el cromosoma entero. La síntesis ocurre en la dirección 5' → 3'. Requiere cebador. Las dos hebras de ADN sirven como molde.
Transcripción: Sólo se transcriben genes o grupos de genes determinados. La síntesis ocurre en la dirección 5' → 3'. No requiere cebador. Sólo una de las hebras de ADN sirve como molde.

Transcripción por la ARN polimerasa

Requiere:
- Un molde de ADN.
- Nucleótidos trifosfatados (ATP, GTP, UTP y CTP).
- Iones metálicos (Mg2+ y Zn2+).
Dirección de síntesis: 5' → 3'

Mecanismo catalítico

El grupo 3'-OH actúa como nucleófilo facilitando el desplazamiento de PPi y el ataque al grupo 3'-OH.
Interacciones de apareamiento de bases de Watson y Crick (A con U, y G con C).
Geometría de los pares de bases.

Iniciación de la Transcripción

La polimerasa se une al promotor.
Consta de dos partes: unión e iniciación.
Se forma un complejo cerrado, donde el ADN promotor no está desenrollado.
Se forma un complejo abierto, donde se desenrolla una región de 12 a 15 pb cerca del sitio -10.
La transcripción comienza dentro del complejo.
La subunidad σ es liberada.
La polimerasa abandona el promotor para elongar el ARN.
La proteína NusA se une a la ARN polimerasa y compite con la subunidad o.

Ciclo σ

El ciclo consiste en unión, elongación, terminación y disociación de NusA.
Un factor σ se une a la ARN polimerasa para iniciar un nuevo ciclo de transcripción.

Promotores

Secuencias consenso en -10 y -35 (procariotas)
Secuencias de consenso varían para cada gen (eucariotas)

ARN polimerasas eucariotas

ARN polimerasa I: Síntesis de ARNr rRNA prerribosómico.
ARN polimerasa II: Síntesis de mRNA (ARN mensajero).
ARN polimerasa III: Síntesis de otros tipos de ARN (ARNt, 5S rRNA).
Varias secuencias reguladoras en promotores eucariotas.

Subunidad grande RBP1

Carboxilo terminal (CTD)
Formada por múltiples repeticiones de YSPTSPS.

Transcripción en eucariotas

Requiere varias proteínas para formar el complejo de transcripción activo.
Factores de transcripción.
Etapas: iniciación, elongación, terminación y liberación.
Complejo cerrado.
Complejo abierto.
Actividad quinasa de la TFIIH.
Liberación de la ARN polimerasa.

Terminación en procariotas

Independiente de p: Formación de horquillas en secuencias autocomplementarias de ADN.
Dependiente de p: Requiere proteína p para detener la transcripción y liberar el ARN.

Regulación de la transcripción

La transcripción está regulada para suministrar productos génicos en las proporciones requeridas.
La regulación puede afectar cualquier etapa.
La regulación preferente está en la unión de la polimerasa y etapas de iniciación.
Pueden haber diferencias en la secuencia del promotor, unión de proteínas a secuencias próximas al promotor. Esto incluye activadores (facilitan la unión de la polimerasa) y represores (bloquean la actividad de la polimerasa).

Inhibición de la ARN polimerasa

Actinomicina D y Acridina: Se intercalan en el ADN.
Rifampicina: Se une a la subunidad ß de ARN polimerasa bacteriana. Impide el desalojo del promotor.
α-Amanitina: Bloquea la ARN polimerasa II y en altas concentraciones la ARN polimerasa III.

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Description

Este cuestionario aborda aspectos clave de la biología molecular relacionados con la expresión de los genes del choque térmico. Explora el papel de la ARN polimerasa y la coordinación de la expresión genética en E. coli. Ideal para estudiantes que deseen profundizar en la regulación génica y los mecanismos de elongación.

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