محاضرة مايكرو 1 PDF

1‫محاضرة مايكرو‬  Bacterial morphology and structure: ‫ف االول اي هو علم الميكرو بيولوجي ده علم بندرس فيه االحياء الدقيقة زي‬ ‫البكتريا او فطريات اوفيروسات‬ 1. Bacteria are single-celled organisms...

1‫محاضرة مايكرو‬  Bacterial morphology and structure: ‫ف االول اي هو علم الميكرو بيولوجي ده علم بندرس فيه االحياء الدقيقة زي‬ ‫البكتريا او فطريات اوفيروسات‬ 1. Bacteria are single-celled organisms 1µm=0.001mm 2. Bacteria are measured in microns 3. Bacteria range in size from about 0.2 to 5 µm 10-6meter (Not visible to the naked eye A microscope is required)  To study bacteria, you should study:) ‫(ازاي اقارن بينهم م االخر‬  (size, shape, staining properties (‫)خصائص التلوين‬, motility (‫)الحركة‬, sporulation (‫)تكوين االبواغ \ التبوغ‬, presence of capsule and arrangement (‫))وجود الكبسولة و ترتيبها‬  The smallest bacteria (Mycoplasma) are the same size as the largest virus (Poxviruses)‫الجدري‬ (Because viruses are measured in nanometers while 10-9meter bacteria are measured in micrometers) ‫(الن الفيروسات حجمها بيتقاس ب النانو بينما ان البكتريا بتتقاس ب‬ )‫الميكرو‬  The longest rods approach the size of some Rods are yeasts and human red blood celles (7 µm) considered a form of bacteria ‫ملحوظات مهمة‬ 1-Cell shape is determined by the cell wall ‫الي بيحدد شكل الخلية هو جدار الخلية‬ 2-The cell is arranged at the time of division according to its connection to each othe ‫بتترتب الخلية وقت االنقسام علي حسب االتصال ببعضها‬  ‫مهمة‬ ‫اشكال البكتريا‬ Staining properities & steps of gram stain Gram Positive ‫ و‬Gram Negative ‫تنقسم البكتريا عندنا ل نوعين‬ )‫(شرح الصورة تحت‬  Steps of staining)‫ (خطوات التلوين‬: 1. Fixation (‫)التثبيت‬: Is the first step in the gram stain process and is essential for preparing the bacterial sample)‫ (عينة‬before applying the stain. The purpose of this step is to fix the bacteria onto the glass slide to ensure they are not lost during subsequent staining procedures while also killing the bacteria to preserve their structural shape ‫م االخر عملية مهمة جدا عشان تثبت البكتريا علي الشريحة الزجاجية عشان متفقدهاش اثناء العملية‬ ‫عن طريق قتلها و التثبيت بينقسم الي تثبيت حراري و تثبيت كيميائي‬ 2. Crystal violet( ‫(الكريستال البنفسجي‬: After applying the stain w wait for about half a minute to a minute for the stain to penetrate the cell wall and then we wash it off ‫م االخر بعد م بنحط الصبغة بنستني حوالي نص دقيقة او دقيقة بحيث تكون الصبغة اخترقت جدار الخلية‬ iodine ‫ومن بعدها هنغسلها ونحط عليها مادة‬ 3. Iodine treatment(‫(معالجة ب اليود‬:It is a process that works to fix the color (If it Gram positive the thick cell wall composed of peptidoglycan retains the complex strongly during the decolorization process) (If it is Gram negative it has a thinnr cell wall with an outer layer of lipids making it more susceptible to losing the complex during the decolorization process) ‫م االخر المادة دي بتثبت اللون ف ب التالي بتساعدي في الكشف عن ان كانت البكتريا موجبة الجرام وال‬ ‫سالبة في حالة لو موجبة ف مش هتفقد لونها بسهولة بسبب جدارالخلوي السميك المكون من‬ ‫الببتيدوغليكان ف بتحتفظ بلونها اثناء عملية ازالة اللون‬ ‫اما لو كانت سالبة ف هي عندها جدار ارق ف ب التالي بتفقد لونها بسهولة في عملية ازالة اللون‬  ‫‪(:It is differentiates between Gram‬ازالة اللون) ‪4. Decolorization‬‬ ‫‪positive and Gram negative bacteria‬‬ ‫شرحتها فوق ‪):‬‬ ‫‪(:The counter stain‬اضافة صبغة مضادة) ‪5. Counter stain safranin‬‬ ‫‪is used to identify the type of bacteria‬‬ ‫‪(If the bacteria retain their violet color then they are Gram‬‬ ‫)‪positive‬‬ ‫‪(If the color of the bacteria changes to pink then they are‬‬ ‫)‪Gram negative‬‬ ‫م االخر لو البكتريا لونها اتغير ل اللون البينك اذا هي سالبة الجرام لو متغيرش وحافظت علي لونها‬ ‫اذا هي موجبة الجرام‬ ‫في الشكل الي قدامنا هي عبارة عن‬ ‫البكتريا موجبة الجرام تحت‬ ‫الميكروسكوب و الي احتفظت ب لونها‬ ‫وبتكون واخدة الشكل الكروي (‪)cocci‬‬ ‫في الشكل ده بقا هي عبارة عن البكتريا سالبة‬ ‫الجرام و الي بتفقد لونها البنفسجي وتكتسب‬ ‫اللون االحمر او البينك نتيجة صبغة‬ ‫السافرانين وبتكون واخدة الشكل الكروي‬ ‫(‪)cocci‬‬  ‫وفي الشكل ده هي عبارة عن بكتريا سالبة‬ ‫الجرام و عرفنا بسبب لونها البينك بس هنا‬ ‫واخدة شكل الشرط (‪)bacilli‬‬ ‫)تركيب الخلية البكتيرية( ‪Structure of the bacteria cell‬‬ ‫‪1. There are about 70 ribosomes in the bacteria cell, divided into 30‬‬ ‫‪and 50 subunits.‬‬ ‫مفروض انك دلوقتي بتسال ازاي ‪ 70‬ب الرغم ان مجموع ال ‪ 50‬و‬ ‫الريبوسوم ده الي بيعمل‬ ‫‪ 30‬مفروض ‪ 80‬و ده الن بيبقو متقاطعين مع بعض زي دايرتين‬ ‫علي بناء البروتين لو فاكر‬ ‫متصلين ف بيكون فيه هناك منطقة مشتركة بينهم‬ ‫ويعتبر مصنع البروتين‬ ‫‪2.‬‬ ‫(الحاجات الي البيكتريا متقدرش تعيش من غيرها) ‪Essential structures‬‬ ‫‪1. Cell wall‬‬ ‫(غشاء الخلية( ‪2. Cell membrane‬‬ ‫‪3. Cytoplasm‬‬ ‫(الحمض النووي) ‪4. Nuclear material‬‬ ‫(حاجات مش موجودة في خاليا و خاليا ال) ‪3. Particular structures‬‬ ‫‪1. Capsule‬‬ ‫(الذيل) ‪2. Flagella‬‬ ‫(الشعيرات\االهداب) ‪3. Pili‬‬ ‫في الشكلين دول بيوضح الفرق بين البكتريا موجبة الجرام و البكتريا سالبة الجرام و‬ ‫الي بيكون في جدار الخلية )‪ (cell wall‬الي بيتكون من مكس بين السكريات و‬ ‫البروتينات‬  ‫‪4.‬‬ ‫‪In Gram positive:‬‬ ‫‪1. The peptidoglycan layer‬‬ ‫‪2. Fibers of teichoic acid protrude outside peptidoglycan layer‬‬ ‫الخالصة ان جدار البكتريا موجبة الجرام بيكون‬ ‫سميك اكتر مكون من مادة الببتيدوجليكان وان‬ ‫بتخرج الياف حمض التيكويك من طبقة‬ ‫الببتيدوجليكان وتكون ظاهرة زي م في الصورة‬ ‫‪5. In Gram negative‬‬ ‫‪1. Peptidoglycan layer is thin‬‬ ‫‪2. Outer membrane: lipopolysaccharide layer which composed of‬‬ ‫‪endotoxins (lipid A) and polysaccharide‬‬ ‫الغشاء الخارجي الي هو طبقة الليبوبوليساكاريد بتتكون من سموم داخية ل الليبيد ‪A‬‬ ‫والبوليساكاريد‬ ‫‪(:between the peptidoglycan layer‬الحيز المحيطي بالبالزم)‪3. Periplasmic space‬‬ ‫‪and the outer membrane‬‬ ‫اهميته ان فيه انزيمات بتساهم في مقاومة المضادات الحيوية بسبب وجود بعض الميكانيزمات‬ ‫زي انها تكسر في المضاد الحيوي و زي انها تقلل نسبة دخول العالج الي الخلية‬ ‫‪4. Lipoprotein layer: extend between the peptidoglycan layer and the‬‬ ‫‪outer membrane‬‬  Functions of the cell wall:  A rigid structure shape of bacteria  Osmotically insensitive  Channel to entry of essential substances  Imortant for Gram stain (differentiation)  Polysaccharide and proteins antigens  Have a role in cell division  G- ve endotoxins Important three components of the cell walls are:  Peptidoglycan: it is a complex network that surround the entire cell. It is found only in bacteria cell walls. It provides rigid support for the cell which is important in maintaining its characteristic shape, and allows the cell to withstand media of low osmotic pressure, such as water  Lipopolysaccharide (LPS): it is composed of:  ‫‪‬‬ ‫‪Lipid A: it is the endotoxin. It is responsible for‬‬ ‫‪toxic effects. It is called endotoxine‬‬ ‫‪‬‬ ‫‪Polysaccharide: represents a major surface antigen‬‬ ‫‪called somatic (O) antigen which is immunogenic.‬‬ ‫‪‬‬ ‫‪Teichoic acid: It is located in the outer layer of the‬‬ ‫‪Gram positive cell wall. It is antigenic and mediate adherence of‬‬ ‫‪the organism to mucosal cells‬‬ ‫خالصة الكالم الي فوق ده كله ان الببتيدوجليكان بيبقا عبارة عن شبكة بتحيط ب الخلية وبتبقا موجودة في‬ ‫جدارها وبتوفرلها دعامة صلبة عشان تحافظ علي شكلها وبتساعدها تتحمل البيئات الي فيها ضغط اسموزي‬ ‫منخفض‪.‬‬ ‫وان الليبوبولي سكاريد اللي بيتكون من الليبيد ‪ A‬هو السم الداخلي و المسؤول عن التاثيرات السامة‪.‬‬ ‫و السكاريد لمتعدد و بيمثل مناعة سطحية رئيسية بتسمي الجسم (‪.(O‬‬ ‫حمض التيكوئيك و اللي موجود في الطبقة الخارجية لجدار الخلية موجبة الجرام و هو بيحمي الخلية من‬ ‫المضادات الحيوية و بيسهل التصاق الكائن ب الخاليا المخاطية‬ ‫جدول مقارنة بين البكتريا موجبة الجرام و سالبة الجرام‬  ‫ بتاع البكتريا الي في‬Cell wall ‫بيختلف ال‬ ‫الصورة عن اي بكتريا تاني و اللي اسمها‬ ‫ و دي بيتم صبغها عن طريق ال‬AFB ‫ وهي صبغة بيكون لونها بينك‬Z.N Cell membrane (cytoplasmic m. or plasma m.)  Lies inner to the cell wall.  Semi permeable membrane (formed of 2 layers of phospholipids in which proteins and enzymes are embedded) Functions of cell membrane ‫ﺍﻟﻨﻘﻞ ﺍﻟﻨﺸﻂ ﻟﻠﺠﺰﻳﺌﺎﺕ‬ 1. Active transport of molecules 2. Energy generation ‫ﺗﻮﻟﻴﺪ ﺍﻟﻄﺎﻗﺔ‬ 3. Synthesis of precursors of cell wall ‫ﺗﺮﻛﻴﺐ ﺳﻮﺍﺑﻖ ﺍﻟﺨﻼﻳﺎ‬ 4. Secreation of enzymes and toxins ‫ﺇﻓﺮﺍﺯ ﺍﻹﻧﺰﻳﻤﺎﺕ ﻭﺍﻟﺴﻤﻮﻡ‬  Mesosome: 1. The origin of the transverse septum ‫ﺃﺻﻞ ﺍﻟﺤﺎﺟﺰ ﺍﻟﻌﺮﺿﻲ‬ 2. The binding site of the DNA before division ‫ﻣﻮﻗﻊ ﺍﻟﺮﺑﻂ ﻓﻲ ﺍﻟﺤﻤﺾ ﺍﻟﻨﻮﻭﻱ ﻗﺒﻞ ﺍﻻﻧﻘﺴﺎﻡ‬ Mesosome: ‫هو المكان الي بيبدا عنده االنقسام الخلوي‬  Intracytoplasmic structure )‫(هياكل داخل السيتوبالزم‬ 1. Nucleiod 1. ‫ﺍﻟﻨﻮﺍﺓ‬ 2. ‫ﺍﻟﺮﻳﺒﻮﺳﻮﻣﺎﺕ‬: 70S 30S+50S 2. Ribosomes: 70S 30S+50S Subunits ‫ﻭﺣﺪﺍﺕ ﻓﺮﻋﻴﺔ‬ 3. ‫ﺍﻟﺸﻮﺍﺋﺐ ﺩﺍﺧﻞ ﺍﻟﺴﻴﺘﻮﺑﻼﺯﻡ‬ 3. Intracytoplasmic inclusions 4. ‫ﺍﻟﺒﻼﺯﻣﻴﺪﺍﺕ‬ 5. ‫ﺍﻟﻨﻘﻞ ﺍﻟﺠﻴﻨﻲ‬ 4. Plasmids 5. Transposons Surfaces structures outside the cell wall ‫ﺍﻟﻬﻴﺎﻛﻞ ﺍﻟﺴﻄﺤﻴﺔ ﺧﺎﺭﺝ ﺟﺪﺍﺭ ﺍﻟﺨﻠﻴﺔ‬ A-Capsule)‫(مش موجودة في كله‬  Is gelatinous layes covering the entire bacteria  Composed of polysaccharide except bacillus anthrax is polypeptide ‫الكبسولة بتبقا مكونة من مادة جيالتينيه وبيستخدم في صناعة الفاكسين‬ ‫شكل الكبسولة‬  Imortance of the capsule 1. Determine virulence..‫ﺗﺤﺪﻳﺪ ﺍﻟﻔﻮﻋﺔ‬.‫ ﺗﺤﺪﻳﺪ ﺍﻟﻜﺎﺋﻦ ﺍﻟﺤﻲ ﺑﻮﺍﺳﻄﺔ ﺍﻟﻤﺼﻞ ﺍﻟﻤﻀﺎﺩ‬.2 2. Identification of the organism.‫ ﺗﺸﻜﻴﻞ ﺍﻟﻠﻘﺎﺡ‬.3 by antiserum. 3. Vaccine formation.  ‫ﺍﻟﺘﺼﺎﻕ ﺍﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺑﺎﻷﻧﺴﺠﺔ‬ 4. Adherence of bacteria to the tissue B-Flagella Organs of motility and its importanc:  Whiplike, long structure, move towards nutrients and othe attractants (chemotaxis)  Consists of a filament, a hook and basal body attached to the cytoplasmic membrand  Formed of protein (flagellin) which is antigenic ‫ وبتساعد في الحركة مما يكون بعض االمراض زي ك االلتهابات في‬flagellin ‫بتتكون من بروتين ال‬ ‫ العلي في المسالك البولية يمكن استخدامها في تحضير‬E.COLI ‫المسالك البولية عن طريق تحريك بكتريا ال‬ ‫مضادات مصلية و استخدامها ل تحديد النوع المصلي لساللة في بعض االنواع مثل تحديد النمط المصلي في‬ ‫السالمونيال‬  Flagella‫تركيب ال‬ c-pili ‫ شوية‬flagella ‫بتكون شبه ال‬ ‫بس اقصر‬  Short, thin straight projections.  Formed of protin (pilin)  Its functions: 1. Adherence 2. Sex pili  ‫‪Bacterial endospores‬‬ ‫‪‬‬ ‫‪In unfavorable conditions‬‬ ‫‪sporulation.‬‬ ‫بتنشأ في ظروف غير مالئمة زي نقص العناصر و الحرارة و الجفاف مما يؤدي الي التجرثم‬ ‫…‪ In G+ve organisms e.g‬‬ ‫بتبقا موجودة في البكتريا موجبة الجرام‬ ‫‪ Are metabolically inactive, dormant for many years.‬‬ ‫مش بتتكاثر وبتفضل خاملة ل سنين كتير‬ ‫‪ Resistant to sterilization by biliong & chemicals‬‬ ‫مقاومة ل التعقيم ب الغليان و المواد الكيميائية‬ ‫‪ Not present in vivo‬‬ ‫مش بتعيش في االجسام الحية النه يعتبر بيئة مناسبة ليها وهي بتتكون في بيئة مش مناسبة يعني مش بتقدر‬ ‫تعيش في جسم االنسان‬ ‫‪thank you‬‬