Fiche 2 Introduction à la biologie systémique de la cellule 1 (PDF)

De la cellule aux tissus 2 INTRODUCTION À LA...

De la cellule aux tissus 2 INTRODUCTION À LA BIOLOGIE SYSTÉMIQUE DE FS LA CELLULE 1 Semaine et jour : S3 le 25/09/2023 RB : Hiba HOUMEUR Professeur : Dr Aïssat CM: SELVARATNAM Sayahi et COUTANT Maelis Plan du cours I. LA CELLULE : ENSEMBLE D’ENTITES ORGANISEES..................................................... 2 II. LA CELLULE : UN SYSTEME OUVERT A FLUX ENTRANTS ET SORTANTS.................. 2 III. LA CELLULE : UN SYSTEME COMPLEXE SIMPLIFIE....................................................... 3 IV. LA CELLULE : UN SYSTEME DYNAMIQUE....................................................................... 3 A. UN SYSTEME DYNAMIQUE DANS L’ESPACE............................................................................ 3 B. UN SYSTEME DYNAMIQUE DANS LE TEMPS............................................................................ 3 V. LA CELLULE : UN SYSTEME D’INTERACTIONS............................................................... 4 VI. CONCLUSION....................................................................................................................... 4 ©Tutorat Paris XII 2023/2024 – La cellule : N°2 – Ce document n’est pas le support officiel Page 1 sur 4  I. LA CELLULE : ENSEMBLE D’ENTITES ORGANISEES La cellule : système d’organites et de biomolécules constituantes et circulantes avec des relations de continuité, d’interaction et d’interdépendance pour assurer les fonctions biologiques. Fonction/processus biologique : modifications de l’activité de la cellule pour s’ajuster à des changements à court ou long terme de l’environnement, pour aboutir à différents états (croissance, différenciation, division, mort). Biologie systémique de la cellule/biologie intégrative : intégration des biomolécules et des organites ensemble, de leurs interactions entre eux et avec leur environnement pour comprendre les fonctions de la cellule. II. LA CELLULE : UN SYSTEME OUVERT A FLUX ENTRANTS ET SORTANTS Flux entrants (matrice extracellulaire à cellule) par osmose, diffusion, transport actif/passif : Biomolécules traversant la membrane plasmique sans être modifiées, Biomolécules traversant la membrane en étant modifiées ou transformées, Biomolécules ne traversant pas : transmission information moléculaire indirecte. Flux sortants (cellule à matrice extracellulaire) par : Diffusion, Transport direct, Co-transport, Sécrétion. ©Tutorat Paris XII 2023/2024 – La cellule : N°2 – Ce document n’est pas le support officiel Page 2 sur 4  III. LA CELLULE : UN SYSTEME COMPLEXE SIMPLIFIE Les interactions des molécules dans la cellule = relation ligand-récepteur. Différentes possibilités de fixation : o Un ligand pour un récepteur, o Un même ligand pour plusieurs récepteurs, o Plusieurs ligands pour un même récepteur, o Plusieurs ligands pour plusieurs récepteurs. IV. LA CELLULE : UN SYSTEME DYNAMIQUE A. UN SYSTEME DYNAMIQUE DANS L’ESPACE La cellule a besoin de ces flux pour assurer ses fonctions biologiques (fabriquer ou dégrader des biomolécules pour produire de l’énergie). La cellule peut : Puiser ou rejeter diverses biomolécules dans le milieu extracellulaire, Communiquer avec les cellules voisines, Recevoir ou envoyer des signaux moléculaires, chimiques qui modulent son fonctionnement. Tous ces flux vont ainsi varier en fonction du contexte cellulaire, en fonction de l’état dans lequel se trouve la cellule, d’un moment précis de son cycle de vie. B. UN SYSTEME DYNAMIQUE DANS LE TEMPS Les flux entrants et sortants entre les milieux intra- et extracellulaires sont continus et perpétuels dans la cellule. Quand on fige la cellule à un instant t pour représenter les interactions à cet instant, on peut observer de nombreux phénomènes : ©Tutorat Paris XII 2023/2024 – La cellule : N°2 – Ce document n’est pas le support officiel Page 3 sur 4  V. LA CELLULE : UN SYSTEME D’INTERACTIONS La cellule est un système d’interactions entre biomolécules. Parmi les molécules en interaction, on trouve : De l’ADN, De l’ARN, Des protéines, Des lipides, Diverses molécules organiques. Représentation : Les molécules = des boules (dont les couleurs et la taille vont varier) Les interactions = des traits ou des flèches (dont l’extrémité va varier en fonction de la nature de l’interaction, ainsi qu’avec un code couleur qui va varier en fonction de la manière dont l’interaction a été démontrée). Les réseaux d’interactions entre les molécules sont disponibles dans des bases de données en ligne et visualisables via des logiciels de représentation de ces réseaux sur des ordinateurs suffisamment puissants pour traiter cette grande quantité de données. VI. CONCLUSION La cellule est : Un ensemble d’entités organisées, Un système ouvert à flux entrants et sortants, Un système complexe simplifié, Un système dynamique dans l’espace et le temps, Un système d’interactions. Pour toute erreur retrouvée, merci d’envoyer un mail à l’adresse suivante : [email protected] ©Tutorat Paris XII 2023/2024 – La cellule : N°2 – Ce document n’est pas le support officiel Page 4 sur 4