Podcast
Questions and Answers
Qual è il ruolo principale del repressore nel ciclo litico?
Qual è il ruolo principale del repressore nel ciclo litico?
- Inibire la trascrizione di Cro. (correct)
- Attivare il ciclo litico non appena è presente.
- Degradare il genoma del fago.
- Regolare la concentrazione di RNA polimerasi.
Quale fattore è responsabile della degradazione del repressore CI in caso di danno al DNA?
Quale fattore è responsabile della degradazione del repressore CI in caso di danno al DNA?
- RecA (correct)
- RNA polimerasi
- PR
- Cro
In quali situazioni il fago lambda preferisce attivare il ciclo lisogenico?
In quali situazioni il fago lambda preferisce attivare il ciclo lisogenico?
- Quando molte cellule batteriche sono già infettate.
- Quando ci sono abbondanti batteri disponibili per l'infezione.
- Quando ci sono scarse risorse per il virus.
- Quando la concentrazione di fagi è molto alta. (correct)
Qual è l'effetto della bassa concentrazione di repressore sulla trascrizione di Cro?
Qual è l'effetto della bassa concentrazione di repressore sulla trascrizione di Cro?
Cosa richiede il promotore PR per attivarsi?
Cosa richiede il promotore PR per attivarsi?
Che cosa accade all'enzima Ciuna volta che viene degradata?
Che cosa accade all'enzima Ciuna volta che viene degradata?
Nel caso di infezione con un numero elevato di fagi, quale è la strategia adottata dal fago?
Nel caso di infezione con un numero elevato di fagi, quale è la strategia adottata dal fago?
Qual è l'importanza dell'RNA polimerasi nel processo di attivazione del ciclo litico?
Qual è l'importanza dell'RNA polimerasi nel processo di attivazione del ciclo litico?
Che ruolo svolge il fattore Cro durante l'attivazione del ciclo litico?
Che ruolo svolge il fattore Cro durante l'attivazione del ciclo litico?
Quale delle seguenti affermazioni sul fattore di trascrizione GAL4 è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni sul fattore di trascrizione GAL4 è corretta?
Cosa succede ai lieviti che non contengono il plasmide con il mini-gene per il triptofano?
Cosa succede ai lieviti che non contengono il plasmide con il mini-gene per il triptofano?
Quale componente del sistema di due ibridi è legato al reporter GAL1-LacZ?
Quale componente del sistema di due ibridi è legato al reporter GAL1-LacZ?
Qual è la funzione principale del dominio di legame con il DNA di GAL4?
Qual è la funzione principale del dominio di legame con il DNA di GAL4?
Cosa determina la scelta di utilizzare lieviti difettivi per gli esperimenti con GAL4?
Cosa determina la scelta di utilizzare lieviti difettivi per gli esperimenti con GAL4?
Quale gene consente ai lieviti auxotrofi di crescere in assenza di triptofano?
Quale gene consente ai lieviti auxotrofi di crescere in assenza di triptofano?
Perché i lieviti auxotrofi richiedono un terreno arricchito con aminoacidi?
Perché i lieviti auxotrofi richiedono un terreno arricchito con aminoacidi?
Quale promotore aumenta l'espressione di un enzima nel lievito fino a 1000 volte?
Quale promotore aumenta l'espressione di un enzima nel lievito fino a 1000 volte?
Qual è la funzione principale del gene Bla nei batteri?
Qual è la funzione principale del gene Bla nei batteri?
Quali sono le metodologie utilizzate per favorire l'entrata del DNA nella cellula?
Quali sono le metodologie utilizzate per favorire l'entrata del DNA nella cellula?
Qual è il principale problema nella selezione delle cellule trasformate?
Qual è il principale problema nella selezione delle cellule trasformate?
Quale enzima è codificato dal gene TRP1?
Quale enzima è codificato dal gene TRP1?
Perché è necessario un sistema di selezione nelle cellule di lievito?
Perché è necessario un sistema di selezione nelle cellule di lievito?
Che cosa implica l'auxotrofia in lieviti mutanti?
Che cosa implica l'auxotrofia in lieviti mutanti?
Quale affermazione sulla regolazione dell'espressione genica è corretta?
Quale affermazione sulla regolazione dell'espressione genica è corretta?
Quale dei seguenti tipi di RNA viene trascritto ma non tradotto?
Quale dei seguenti tipi di RNA viene trascritto ma non tradotto?
Che ruolo hanno gli attivatori nell'espressione genica?
Che ruolo hanno gli attivatori nell'espressione genica?
Cosa descrive meglio la quantità di RNA messaggero e la produzione di proteina?
Cosa descrive meglio la quantità di RNA messaggero e la produzione di proteina?
Quale affermazione si applica ai procarioti riguardo le proteine regolatrici?
Quale affermazione si applica ai procarioti riguardo le proteine regolatrici?
In che modo gli organismi unicellulari rispondono agli stimoli?
In che modo gli organismi unicellulari rispondono agli stimoli?
Cosa indica un promotore forte nel processo di trascrizione?
Cosa indica un promotore forte nel processo di trascrizione?
Qual è il principale obiettivo delle tecniche biochimiche complesse nella determinazione della quantità di proteina?
Qual è il principale obiettivo delle tecniche biochimiche complesse nella determinazione della quantità di proteina?
Quale condizione deve essere soddisfatta affinché il ciclo lisogenico venga attivato dai fagi?
Quale condizione deve essere soddisfatta affinché il ciclo lisogenico venga attivato dai fagi?
In che modo i fattori generali della trascrizione influenzano il legame dell'RNA polimerasi al DNA negli eucarioti?
In che modo i fattori generali della trascrizione influenzano il legame dell'RNA polimerasi al DNA negli eucarioti?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo all'espressione genica negli eucarioti multicellulari?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo all'espressione genica negli eucarioti multicellulari?
Qual è il ruolo della TATA box nel processo di trascrizione eucariotica?
Qual è il ruolo della TATA box nel processo di trascrizione eucariotica?
Che cosa rende i nucleosomi un ostacolo durante la trascrizione eucariotica?
Che cosa rende i nucleosomi un ostacolo durante la trascrizione eucariotica?
Qual è la principale differenza tra cellule eucariotiche e procariotiche riguardo alla regolazione genica?
Qual è la principale differenza tra cellule eucariotiche e procariotiche riguardo alla regolazione genica?
Qual è la funzione principale di TFIID nel complesso di trascrizione?
Qual è la funzione principale di TFIID nel complesso di trascrizione?
Quale affermazione descrive meglio il controllo dell'espressione genica durante lo sviluppo embrionale eucariotico?
Quale affermazione descrive meglio il controllo dell'espressione genica durante lo sviluppo embrionale eucariotico?
Cosa succede quando la concentrazione di CI è bassa in presenza di fagi?
Cosa succede quando la concentrazione di CI è bassa in presenza di fagi?
Quali di queste affermazioni è corretta riguardo ai plasmidi nei fagi?
Quali di queste affermazioni è corretta riguardo ai plasmidi nei fagi?
Qual è l'effetto della metilazione sul riconoscimento della sequenza da parte di un enzima di restrizione?
Qual è l'effetto della metilazione sul riconoscimento della sequenza da parte di un enzima di restrizione?
Quale dei seguenti ceppi è consigliato per ottenere plasmidi non metilati?
Quale dei seguenti ceppi è consigliato per ottenere plasmidi non metilati?
Cosa indica una bassa efficienza di trasformazione di un plasmide?
Cosa indica una bassa efficienza di trasformazione di un plasmide?
Quale affermazione sulla preparazione degli enzimi per biologia molecolare è corretta?
Quale affermazione sulla preparazione degli enzimi per biologia molecolare è corretta?
Qual è il ruolo del controllo dell'attività enzimatica tramite digestione e ligazione?
Qual è il ruolo del controllo dell'attività enzimatica tramite digestione e ligazione?
Perché è necessario diluire gli enzimi venduti in glicerolo?
Perché è necessario diluire gli enzimi venduti in glicerolo?
Quale delle seguenti combinazioni di sequenze non è riconosciuta da metilasi?
Quale delle seguenti combinazioni di sequenze non è riconosciuta da metilasi?
Quale enzima di restrizione è sensibile alla metilazione mentre l'altro no?
Quale enzima di restrizione è sensibile alla metilazione mentre l'altro no?
Qual è la principale differenza tra il solco maggiore e il solco minore nel DNA?
Qual è la principale differenza tra il solco maggiore e il solco minore nel DNA?
Cosa implica la presenza di guanina nel solco maggiore riguardo alla formazione di legami?
Cosa implica la presenza di guanina nel solco maggiore riguardo alla formazione di legami?
Qual è la caratteristica della struttura del DNA-Z?
Qual è la caratteristica della struttura del DNA-Z?
Quale affermazione sul legame tra proteine e DNA è corretta?
Quale affermazione sul legame tra proteine e DNA è corretta?
Quale delle seguenti opzioni descrive correttamente l'effetto della bassa umidità sulla struttura del DNA?
Quale delle seguenti opzioni descrive correttamente l'effetto della bassa umidità sulla struttura del DNA?
Qual è la principale differenza tra plasmidi rilassati e plasmidi stringenti?
Qual è la principale differenza tra plasmidi rilassati e plasmidi stringenti?
Cosa determina un superavvolgimento di segno opposto nel DNA?
Cosa determina un superavvolgimento di segno opposto nel DNA?
Quale affermazione è vera riguardo al DNA CCC?
Quale affermazione è vera riguardo al DNA CCC?
Cosa può influenzare la composizione delle basi dell'rRNA nei batteri?
Cosa può influenzare la composizione delle basi dell'rRNA nei batteri?
Qual è l'importanza dell'esperimento di Ingram?
Qual è l'importanza dell'esperimento di Ingram?
Quale affermazione sul DNA linearizzato è corretta?
Quale affermazione sul DNA linearizzato è corretta?
Cosa caratterizza le cellule con intensa sintesi proteica?
Cosa caratterizza le cellule con intensa sintesi proteica?
Quale affermazione descrive meglio il collegamento tra geni e la sequenza aminoacidica delle proteine?
Quale affermazione descrive meglio il collegamento tra geni e la sequenza aminoacidica delle proteine?
Qual è la relazione tra i livelli di G e C nel DNA e il suo comportamento durante la replicazione?
Qual è la relazione tra i livelli di G e C nel DNA e il suo comportamento durante la replicazione?
Qual è la caratteristica principale del ribosio rispetto al desossiribosio?
Qual è la caratteristica principale del ribosio rispetto al desossiribosio?
Quale posizione dell'azoto nella pirimidina si lega al nucleoside?
Quale posizione dell'azoto nella pirimidina si lega al nucleoside?
Quale tipo di legame è formato tra il fosfato e l'ossidrile nel processo di legame nucleotidico?
Quale tipo di legame è formato tra il fosfato e l'ossidrile nel processo di legame nucleotidico?
Quale affermazione riguardo al legame fosfodiesterico è corretta?
Quale affermazione riguardo al legame fosfodiesterico è corretta?
In quale condizione si verifica il legame a idrogeno tra adenina e timina?
In quale condizione si verifica il legame a idrogeno tra adenina e timina?
Qual è la funzione dei legami covalenti ad alta energia durante la sintesi nucleotidica?
Qual è la funzione dei legami covalenti ad alta energia durante la sintesi nucleotidica?
Cosa distingue l'uracile dalla timina?
Cosa distingue l'uracile dalla timina?
Quale delle seguenti opzioni rappresenta una vera affermazione sui nucleotidi trifosfati?
Quale delle seguenti opzioni rappresenta una vera affermazione sui nucleotidi trifosfati?
Qual è la forma della timina che si appaia normalmente con l'adenina?
Qual è la forma della timina che si appaia normalmente con l'adenina?
Qual è la lettura della catena di RNA o DNA durante la sintesi?
Qual è la lettura della catena di RNA o DNA durante la sintesi?
Qual è la principale caratteristica del solco maggiore del DNA?
Qual è la principale caratteristica del solco maggiore del DNA?
Cosa implica il fenomeno del BASE FLIPPING nel DNA?
Cosa implica il fenomeno del BASE FLIPPING nel DNA?
Quale affermazione è corretta riguardo all'ambiente in cui si trova il DNA nella cellula eucariota?
Quale affermazione è corretta riguardo all'ambiente in cui si trova il DNA nella cellula eucariota?
Qual è la funzione principale del solco minore nel DNA?
Qual è la funzione principale del solco minore nel DNA?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla timina in forma enolica?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla timina in forma enolica?
Come avviene l'interazione della proteina con il DNA?
Come avviene l'interazione della proteina con il DNA?
Qual è una delle conseguenze della presenza di un solco maggiore nel DNA?
Qual è una delle conseguenze della presenza di un solco maggiore nel DNA?
Che cosa si intende con il termine 'idrofobiche' in riferimento alla membrana cellulare?
Che cosa si intende con il termine 'idrofobiche' in riferimento alla membrana cellulare?
Qual è il ruolo della sliding clamp nella replicazione del DNA?
Qual è il ruolo della sliding clamp nella replicazione del DNA?
Cosa caratterizza i filamenti continuo e discontinuo nella replicazione del DNA?
Cosa caratterizza i filamenti continuo e discontinuo nella replicazione del DNA?
Qual è la funzione principale della primasi durante la replicazione del DNA?
Qual è la funzione principale della primasi durante la replicazione del DNA?
Cosa implica il modello a trombone nella replicazione del DNA?
Cosa implica il modello a trombone nella replicazione del DNA?
Qual è la principale sfida associata alla rottura del DNA durante la replicazione?
Qual è la principale sfida associata alla rottura del DNA durante la replicazione?
Qual è il principale fattore che determina la processività della DNA polimerasi?
Qual è il principale fattore che determina la processività della DNA polimerasi?
Qual è l'attività della DNA polimerasi che consente di correggere nucleotide sbagliati?
Qual è l'attività della DNA polimerasi che consente di correggere nucleotide sbagliati?
Cosa provoca un errore nella polimerizzazione del DNA?
Cosa provoca un errore nella polimerizzazione del DNA?
Qual è la principale caratteristica dell'attività di proofreading della DNA polimerasi?
Qual è la principale caratteristica dell'attività di proofreading della DNA polimerasi?
Quale interazione aumenta la processività della DNA polimerasi?
Quale interazione aumenta la processività della DNA polimerasi?
Cosa accade all'ossidrile OH della DNA polimerasi in caso di appaiamento scorretto?
Cosa accade all'ossidrile OH della DNA polimerasi in caso di appaiamento scorretto?
Dove avviene l'attività esonucleasica della DNA polimerasi?
Dove avviene l'attività esonucleasica della DNA polimerasi?
Qual è la probabilità di errore della DNA polimerasi durante la sintesi?
Qual è la probabilità di errore della DNA polimerasi durante la sintesi?
Cosa avviene quando la DNA polimerasi stacca un nucleotide errato?
Cosa avviene quando la DNA polimerasi stacca un nucleotide errato?
Quale elemento non è coinvolto nella processività della DNA polimerasi?
Quale elemento non è coinvolto nella processività della DNA polimerasi?
Quale affermazione riguardo alla DNA polimerasi I è corretta?
Quale affermazione riguardo alla DNA polimerasi I è corretta?
Qual è il principale enzima responsabile della rimozione dei primer negli eucarioti?
Qual è il principale enzima responsabile della rimozione dei primer negli eucarioti?
Cosa rimane dopo la rimozione del primer da parte dell'RNAasi H?
Cosa rimane dopo la rimozione del primer da parte dell'RNAasi H?
Quale ruolo ha l'enzima DNA ligasi nella riparazione del DNA?
Quale ruolo ha l'enzima DNA ligasi nella riparazione del DNA?
Quali sono le caratteristiche dell'enzima ELICASI?
Quali sono le caratteristiche dell'enzima ELICASI?
Qual è la funzione principale delle DNA polimerasi?
Qual è la funzione principale delle DNA polimerasi?
Quale enzioma è utilizzato per la chiusura dei filamenti di DNA dopo la rimozione dei primer?
Quale enzioma è utilizzato per la chiusura dei filamenti di DNA dopo la rimozione dei primer?
Quali filamenti di DNA mostrano polarità opposta?
Quali filamenti di DNA mostrano polarità opposta?
Cosa caratterizza la parte Klenow della DNA polimerasi I?
Cosa caratterizza la parte Klenow della DNA polimerasi I?
Che cosa è incapace di fare una DNA polimerasi?
Che cosa è incapace di fare una DNA polimerasi?
Qual è la direzione della polimerizzazione dei nucleotidi nel DNA?
Qual è la direzione della polimerizzazione dei nucleotidi nel DNA?
Qual è l'energia totale necessaria per la polimerizzazione in base ai legami fosfodiesterici?
Qual è l'energia totale necessaria per la polimerizzazione in base ai legami fosfodiesterici?
Quale analogo di nucleotide viene incorporato nel DNA come se fosse timina?
Quale analogo di nucleotide viene incorporato nel DNA come se fosse timina?
Quale meccanismo utilizza l'aciclovir per bloccare la replicazione virale?
Quale meccanismo utilizza l'aciclovir per bloccare la replicazione virale?
Perché la citosina arabinoside (AraC) è considerata un analogo di nucleotide efficace ma problematico?
Perché la citosina arabinoside (AraC) è considerata un analogo di nucleotide efficace ma problematico?
Qual è l'effetto collaterale comune dei farmaci chemioterapici basati su analoghi nucleotidici?
Qual è l'effetto collaterale comune dei farmaci chemioterapici basati su analoghi nucleotidici?
Qual è la principale differenza strutturale tra l'arabinosio e il desossiribosio, come visibile nella citosina arabinoside?
Qual è la principale differenza strutturale tra l'arabinosio e il desossiribosio, come visibile nella citosina arabinoside?
Quali sono le possibili vie di somministrazione dell'aciclovir?
Quali sono le possibili vie di somministrazione dell'aciclovir?
Qual è la funzione principale della primasi nei procarioti durante la replicazione del DNA?
Qual è la funzione principale della primasi nei procarioti durante la replicazione del DNA?
Qual è il corretto ordine di sintesi tra i filamenti di DNA durante la replicazione?
Qual è il corretto ordine di sintesi tra i filamenti di DNA durante la replicazione?
Cosa caratterizza i frammenti di Okazaki durante la replicazione del DNA?
Cosa caratterizza i frammenti di Okazaki durante la replicazione del DNA?
Cosa determina l'antiparallelismo della doppia elica del DNA durante la replicazione?
Cosa determina l'antiparallelismo della doppia elica del DNA durante la replicazione?
Quali sono le polimerasi coinvolte nella replicazione del DNA negli eucarioti?
Quali sono le polimerasi coinvolte nella replicazione del DNA negli eucarioti?
Qual è la differenza principale tra il filamento guida e il filamento ritardato nella replicazione del DNA?
Qual è la differenza principale tra il filamento guida e il filamento ritardato nella replicazione del DNA?
Quali polimerasi sono presenti nei procarioti e quali sono le loro funzioni?
Quali polimerasi sono presenti nei procarioti e quali sono le loro funzioni?
Qual è il ruolo della forcella replicativa durante la replicazione del DNA?
Qual è il ruolo della forcella replicativa durante la replicazione del DNA?
Qual è la lunghezza tipica dei frammenti di Okazaki negli eucarioti?
Qual è la lunghezza tipica dei frammenti di Okazaki negli eucarioti?
Cosa avviene quando un nucleotide singolo errato viene distaccato durante la replicazione del DNA?
Cosa avviene quando un nucleotide singolo errato viene distaccato durante la replicazione del DNA?
Quale mutazione è associata alla resistenza all'acido nalidixico?
Quale mutazione è associata alla resistenza all'acido nalidixico?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla trasformazione naturale è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla trasformazione naturale è corretta?
Quale gene è responsabile della maggiore repressione delle proteine tossiche?
Quale gene è responsabile della maggiore repressione delle proteine tossiche?
Quale mutazione impedisce il trasferimento di F e la mobilizzazione di altri plasmidi?
Quale mutazione impedisce il trasferimento di F e la mobilizzazione di altri plasmidi?
Quale condizione deve essere soddisfatta affinché il DNA clonato non venga digerito da endonucleasi endogene?
Quale condizione deve essere soddisfatta affinché il DNA clonato non venga digerito da endonucleasi endogene?
Qual è il tasso di errore associato alla polimerasi Taq?
Qual è il tasso di errore associato alla polimerasi Taq?
Qual è la funzione principale della Pfu polymerase rispetto alla Taq?
Qual è la funzione principale della Pfu polymerase rispetto alla Taq?
Cosa determina la necessità di riaggiungere la polimerasi dell' E. coli ad ogni ciclo?
Cosa determina la necessità di riaggiungere la polimerasi dell' E. coli ad ogni ciclo?
Quale affermazione è corretta riguardo alla temperatura di annealing nel processo di amplificazione del DNA?
Quale affermazione è corretta riguardo alla temperatura di annealing nel processo di amplificazione del DNA?
Qual è la principale caratteristica della polimerasi Taq rispetto alla Pfu?
Qual è la principale caratteristica della polimerasi Taq rispetto alla Pfu?
Quando si utilizza la regola di Wallance per calcolare la temperatura di annealing?
Quando si utilizza la regola di Wallance per calcolare la temperatura di annealing?
Quale componente non è necessario nel processo di amplificazione del DNA in vitro?
Quale componente non è necessario nel processo di amplificazione del DNA in vitro?
Quale affermazione è vero riguardo alla temperatura di melting (Tm)?
Quale affermazione è vero riguardo alla temperatura di melting (Tm)?
Qual è il rapporto molare corretto tra vettore e inserto per facilitare la reazione di ligazione?
Qual è il rapporto molare corretto tra vettore e inserto per facilitare la reazione di ligazione?
A quale temperatura ottimale lavora principalmente la T4 DNA ligasi?
A quale temperatura ottimale lavora principalmente la T4 DNA ligasi?
Qual è il peso molecolare medio di un nucleotide nel contesto descritto?
Qual è il peso molecolare medio di un nucleotide nel contesto descritto?
Qual è la quantità di ng di frammento necessaria per la ligazione per mantenere il rapporto 1:6?
Qual è la quantità di ng di frammento necessaria per la ligazione per mantenere il rapporto 1:6?
Perché è importante avere estremità protrudenti in 5' come sticky ends?
Perché è importante avere estremità protrudenti in 5' come sticky ends?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla ligazione del DNA è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla ligazione del DNA è corretta?
Cosa succede all'appaiamento tra le basi delle estremità coesive a 37°C?
Cosa succede all'appaiamento tra le basi delle estremità coesive a 37°C?
Qual è il volume ideale di soluzione in cui si lavora con T4 DNA ligasi?
Qual è il volume ideale di soluzione in cui si lavora con T4 DNA ligasi?
Qual è la massa molare del plasmide PM descritto?
Qual è la massa molare del plasmide PM descritto?
Qual è il tempo ideale di incubazione per la reazione di ligazione?
Qual è il tempo ideale di incubazione per la reazione di ligazione?
Qual è il principale motivo per cui la quantità di DNA smette di crescere esponenzialmente dopo 30/40 cicli?
Qual è il principale motivo per cui la quantità di DNA smette di crescere esponenzialmente dopo 30/40 cicli?
Quale delle seguenti affermazioni sul sequenziamento di DNA secondo il metodo di Sanger è vera?
Quale delle seguenti affermazioni sul sequenziamento di DNA secondo il metodo di Sanger è vera?
Quale affermazione descrive meglio gli effetti delle temperature non ottimali durante l'appaiamento del DNA?
Quale affermazione descrive meglio gli effetti delle temperature non ottimali durante l'appaiamento del DNA?
Quale di queste tecniche non è considerata utilizzata nel sequenziamento di DNA?
Quale di queste tecniche non è considerata utilizzata nel sequenziamento di DNA?
Qual è la funzione principale della DNA polimerasi nel sequenziamento di DNA?
Qual è la funzione principale della DNA polimerasi nel sequenziamento di DNA?
Quale delle seguenti affermazioni definisce meglio l'etimologia dell'acronimo PCR?
Quale delle seguenti affermazioni definisce meglio l'etimologia dell'acronimo PCR?
Quale utilizzo della tecnologia DNA è applicato nella diagnostica prenatale?
Quale utilizzo della tecnologia DNA è applicato nella diagnostica prenatale?
Qual è la caratteristica fondamentale della DNA polimerasi Klenow di E.coli?
Qual è la caratteristica fondamentale della DNA polimerasi Klenow di E.coli?
Quale affermazione è corretta riguardo alla crescita delle molecole di DNA durante il processo di replicazione?
Quale affermazione è corretta riguardo alla crescita delle molecole di DNA durante il processo di replicazione?
Quale processo permette di ottenere grandi quantità di un frammento di DNA?
Quale processo permette di ottenere grandi quantità di un frammento di DNA?
Quale molecola è responsabile per la sintesi di RNA antisenso nei plasmidi?
Quale molecola è responsabile per la sintesi di RNA antisenso nei plasmidi?
Cosa succede all'RNA II durante il processo di trascrizione?
Cosa succede all'RNA II durante il processo di trascrizione?
Qual è la funzione principale di ParC durante la divisione cellulare?
Qual è la funzione principale di ParC durante la divisione cellulare?
Che effetto ha il feedback negativo nella replicazione dei plasmidi?
Che effetto ha il feedback negativo nella replicazione dei plasmidi?
Quale dei seguenti comportamenti è legato allo stato di metilazione del DNA?
Quale dei seguenti comportamenti è legato allo stato di metilazione del DNA?
Qual è la regione del plasmide Col E1 necessaria per la replicazione?
Qual è la regione del plasmide Col E1 necessaria per la replicazione?
Quale ruolo ha la proteina Rop nella regolazione della replicazione plasmidica?
Quale ruolo ha la proteina Rop nella regolazione della replicazione plasmidica?
Che funzione svolge l'RNAasi durante il processo di replicazione?
Che funzione svolge l'RNAasi durante il processo di replicazione?
Qual è l'effetto della divisione cellulare sui plasmidi?
Qual è l'effetto della divisione cellulare sui plasmidi?
Cosa caratterizza la regione OriC nella replicazione del DNA?
Cosa caratterizza la regione OriC nella replicazione del DNA?
Quale affermazione è corretta riguardo al ruolo della PCNA nella replicazione del DNA?
Quale affermazione è corretta riguardo al ruolo della PCNA nella replicazione del DNA?
Quale tipo di danno al DNA è principalmente correlato alle radiazioni ionizzanti?
Quale tipo di danno al DNA è principalmente correlato alle radiazioni ionizzanti?
Quale enzima è coinvolto nel riconoscimento e riparazione delle rotture a singolo filamento del DNA?
Quale enzima è coinvolto nel riconoscimento e riparazione delle rotture a singolo filamento del DNA?
Cosa implica il collasso della forca replicativa a causa di rotture nel DNA?
Cosa implica il collasso della forca replicativa a causa di rotture nel DNA?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla polimerasi ε non è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla polimerasi ε non è corretta?
Quale proteina gioca un ruolo fondamentale nell'appaiamento della giunzione di Holliday durante la ricombinazione del DNA?
Quale proteina gioca un ruolo fondamentale nell'appaiamento della giunzione di Holliday durante la ricombinazione del DNA?
In quale fase del ciclo cellulare le rotture del DNA vengono principalmente riparate?
In quale fase del ciclo cellulare le rotture del DNA vengono principalmente riparate?
Quale sequenza nucleotidica è identificata come hotspot di crossover nella ricombinazione del DNA?
Quale sequenza nucleotidica è identificata come hotspot di crossover nella ricombinazione del DNA?
Quale agente chimico è noto per causare rotture a doppio filamento nel DNA?
Quale agente chimico è noto per causare rotture a doppio filamento nel DNA?
Qual è la principale funzione del complesso RecBCD durante la ricombinazione del DNA?
Qual è la principale funzione del complesso RecBCD durante la ricombinazione del DNA?
Quale ruolo ha la poly ADP-ribose polimerase nella risposta al danno del DNA?
Quale ruolo ha la poly ADP-ribose polimerase nella risposta al danno del DNA?
Quale delle seguenti opzioni non rappresenta un metodo di riparazione del DNA?
Quale delle seguenti opzioni non rappresenta un metodo di riparazione del DNA?
Quale delle seguenti affermazioni sulla polimerasi durante la ricombinazione del DNA è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni sulla polimerasi durante la ricombinazione del DNA è corretta?
Cosa determina la stabilità della polimerasi ε dopo il legame alla PCNA?
Cosa determina la stabilità della polimerasi ε dopo il legame alla PCNA?
Come funziona RecB nella ricombinazione del DNA?
Come funziona RecB nella ricombinazione del DNA?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo ai tumori della pelle e l'esposizione ai raggi UV?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo ai tumori della pelle e l'esposizione ai raggi UV?
Cosa succede alla RNA polimerasi quando si verifica un danno a causa di dimeri di timina durante la trascrizione?
Cosa succede alla RNA polimerasi quando si verifica un danno a causa di dimeri di timina durante la trascrizione?
Quale sistema si attiva per riparare il danno causato dai dimeri di timina?
Quale sistema si attiva per riparare il danno causato dai dimeri di timina?
Qual è la conseguenza diretta dell'impossibilità di completare la replicazione del DNA a causa dei dimeri di timina?
Qual è la conseguenza diretta dell'impossibilità di completare la replicazione del DNA a causa dei dimeri di timina?
Qual è il ruolo di PCNA quando si verifica uno stallo durante la replicazione del DNA?
Qual è il ruolo di PCNA quando si verifica uno stallo durante la replicazione del DNA?
Qual è la conseguenza della modificazione di PCNA da parte dell'ubiquitina durante la riparazione del DNA?
Qual è la conseguenza della modificazione di PCNA da parte dell'ubiquitina durante la riparazione del DNA?
Quale affermazione sui dimeri di timina è corretta?
Quale affermazione sui dimeri di timina è corretta?
Cosa determina l'impossibilità di completare il ciclo cellulare in presenza di dimeri di timina?
Cosa determina l'impossibilità di completare il ciclo cellulare in presenza di dimeri di timina?
Quale meccanismo aiuta a superare il blocco causato dai danni al DNA durante la replicazione?
Quale meccanismo aiuta a superare il blocco causato dai danni al DNA durante la replicazione?
Qual è il meccanismo principale attraverso il quale MutS riconosce un appaiamento scorretto nel DNA?
Qual è il meccanismo principale attraverso il quale MutS riconosce un appaiamento scorretto nel DNA?
Qual è il ruolo di MutL nel processo di riparazione del DNA?
Qual è il ruolo di MutL nel processo di riparazione del DNA?
Quale affermazione riguardo alla DNA ligasi è corretta?
Quale affermazione riguardo alla DNA ligasi è corretta?
Cosa provoca la deaminazione della citosina nel DNA?
Cosa provoca la deaminazione della citosina nel DNA?
Qual è l'ipotesi riguardo alla riparazione dei mismatch nelle cellule eucariotiche?
Qual è l'ipotesi riguardo alla riparazione dei mismatch nelle cellule eucariotiche?
Qual è la conseguenza di una deaminazione dell'adenina?
Qual è la conseguenza di una deaminazione dell'adenina?
Qual è la differenza sostanziale nel riconoscimento dei filamenti di DNA tra procarioti ed eucarioti?
Qual è la differenza sostanziale nel riconoscimento dei filamenti di DNA tra procarioti ed eucarioti?
Qual è l'effetto finale della deaminazione sulla 5-metilcitosina?
Qual è l'effetto finale della deaminazione sulla 5-metilcitosina?
Qual è il principale ruolo della proteina XRCC1 nel processo di riparazione del DNA?
Qual è il principale ruolo della proteina XRCC1 nel processo di riparazione del DNA?
Cosa succede se il danno al DNA è troppo grave?
Cosa succede se il danno al DNA è troppo grave?
Qual è il risultato della giunzione delle estremità non omologhe nel DNA?
Qual è il risultato della giunzione delle estremità non omologhe nel DNA?
Quale proteina è responsabile della fosforilazione in seguito alla rottura del DNA?
Quale proteina è responsabile della fosforilazione in seguito alla rottura del DNA?
Quale enzima è coinvolto nella fase finale di riparazione del DNA non omologo?
Quale enzima è coinvolto nella fase finale di riparazione del DNA non omologo?
Quale affermazione è corretta riguardo alla rottura del doppio filamento di DNA?
Quale affermazione è corretta riguardo alla rottura del doppio filamento di DNA?
Che ruolo hanno le proteine Ku70/80 nel processo di riparazione del DNA?
Che ruolo hanno le proteine Ku70/80 nel processo di riparazione del DNA?
Quale di queste affermazioni è falsa riguardo alla funzione di PARP?
Quale di queste affermazioni è falsa riguardo alla funzione di PARP?
Quale delle seguenti opzioni descrive meglio il ruolo di Artemide nel processo di riparazione del DNA?
Quale delle seguenti opzioni descrive meglio il ruolo di Artemide nel processo di riparazione del DNA?
Cosa indica il termine 'riparazione non omologa' nel contesto del DNA?
Cosa indica il termine 'riparazione non omologa' nel contesto del DNA?
Quale affermazione riguardo all'ansa nel DNA è corretta?
Quale affermazione riguardo all'ansa nel DNA è corretta?
Qual è il ruolo principale della Cre ricombinasi negli eucarioti?
Qual è il ruolo principale della Cre ricombinasi negli eucarioti?
Come la Salmonella consegue l'elusione del sistema immunitario?
Come la Salmonella consegue l'elusione del sistema immunitario?
Quale meccanismo è coinvolto nel legame della ricombinasi Hin?
Quale meccanismo è coinvolto nel legame della ricombinasi Hin?
Qual è la funzione dei siti loxP inseriti in un esone?
Qual è la funzione dei siti loxP inseriti in un esone?
Qual è un effetto delle sequenze invertite nella Salmonella?
Qual è un effetto delle sequenze invertite nella Salmonella?
Quale affermazione descrive meglio il ruolo degli esoni nei geni?
Quale affermazione descrive meglio il ruolo degli esoni nei geni?
Che tipo di sequenze consentono la ricombinazione nei batteri come Salmonella?
Che tipo di sequenze consentono la ricombinazione nei batteri come Salmonella?
Quale processo è fondamentale oltre alla trasposasi per completare il meccanismo descritto?
Quale processo è fondamentale oltre alla trasposasi per completare il meccanismo descritto?
Cosa genera il taglio del trasposone sul filamento superiore durante la trasposasi?
Cosa genera il taglio del trasposone sul filamento superiore durante la trasposasi?
Qual è il ruolo della DNApol nel processo descritto?
Qual è il ruolo della DNApol nel processo descritto?
Quale risultato si ottiene una volta completato il processo di trasposizione e risoluzione?
Quale risultato si ottiene una volta completato il processo di trasposizione e risoluzione?
Qual è stato il primo passo nel meccanismo di trasposizione descritto?
Qual è stato il primo passo nel meccanismo di trasposizione descritto?
Qual è la funzione principale di Cre ricombinasi nel contesto del nucleo?
Qual è la funzione principale di Cre ricombinasi nel contesto del nucleo?
Cosa accade ai fattori di trascrizione legati agli estrogeni quando l'ormone è presente?
Cosa accade ai fattori di trascrizione legati agli estrogeni quando l'ormone è presente?
Qual è l'effetto dell'inserimento di ATG in un gene con Cre ricombinasi?
Qual è l'effetto dell'inserimento di ATG in un gene con Cre ricombinasi?
Qual è il risultato dell'accoppiamento di Cre con segnali ormonali?
Qual è il risultato dell'accoppiamento di Cre con segnali ormonali?
Come si comportano le freccette opposte nella ricombinazione mediata da Cre?
Come si comportano le freccette opposte nella ricombinazione mediata da Cre?
Qual è il vantaggio di avere linee di topi che esprimono Cre in tessuti specifici?
Qual è il vantaggio di avere linee di topi che esprimono Cre in tessuti specifici?
Qual è una conseguenza dell'utilizzo di Cre ricombinasi in laboratorio?
Qual è una conseguenza dell'utilizzo di Cre ricombinasi in laboratorio?
Che ruolo ha il codone di stop in relazione all'uso di Cre?
Che ruolo ha il codone di stop in relazione all'uso di Cre?
Qual è l'importanza dell'ingresso di Cre nel nucleo?
Qual è l'importanza dell'ingresso di Cre nel nucleo?
In che modo la Cre ricombinasi è utilizzata nella genetica avanzata?
In che modo la Cre ricombinasi è utilizzata nella genetica avanzata?
Quale affermazione è corretta riguardo alla formazione dei topi chimera?
Quale affermazione è corretta riguardo alla formazione dei topi chimera?
Quale metodo è utilizzato per identificare il DNA genomico contenente il transgene?
Quale metodo è utilizzato per identificare il DNA genomico contenente il transgene?
Qual è il numero previsto di topi che potrebbero contenere il transgene?
Qual è il numero previsto di topi che potrebbero contenere il transgene?
Cosa accade quando un maschio chimera è incrociato con una topa nera?
Cosa accade quando un maschio chimera è incrociato con una topa nera?
Quale discrimine genetico è utilizzato nella selezione dei topi agouti?
Quale discrimine genetico è utilizzato nella selezione dei topi agouti?
Qual è l'importanza della genetica mendeliana in questo processo?
Qual è l'importanza della genetica mendeliana in questo processo?
Qual è l'effetto della ricombinazione cellulare nel contesto dell'embrione?
Qual è l'effetto della ricombinazione cellulare nel contesto dell'embrione?
Quale varietà di topi è utilizzata come base per il processo di selezione?
Quale varietà di topi è utilizzata come base per il processo di selezione?
Qual è il ruolo principale della mappa di restrizione nel processo di ricombinazione del DNA?
Qual è il ruolo principale della mappa di restrizione nel processo di ricombinazione del DNA?
Che tipo di incrocio distingue i topi per il fenotipo dominante?
Che tipo di incrocio distingue i topi per il fenotipo dominante?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo al Southern blotting è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo al Southern blotting è corretta?
Cosa si verifica quando si utilizza XbaI su un'allele in caso di ricombinazione omologa?
Cosa si verifica quando si utilizza XbaI su un'allele in caso di ricombinazione omologa?
Qual è il principale vantaggio del Southern blotting nella genetica forense?
Qual è il principale vantaggio del Southern blotting nella genetica forense?
Quale metodo consente di visualizzare il DNA dopo la migrazione in gel di agarosio?
Quale metodo consente di visualizzare il DNA dopo la migrazione in gel di agarosio?
Quali di queste affermazioni descrive meglio l'utilizzo di sonde nel Southern blotting?
Quali di queste affermazioni descrive meglio l'utilizzo di sonde nel Southern blotting?
Quale affermazione riguardante la digestione del DNA è vera?
Quale affermazione riguardante la digestione del DNA è vera?
Qual è l'importanza della membrana di nitrocellulosa nel Southern blotting?
Qual è l'importanza della membrana di nitrocellulosa nel Southern blotting?
Come si comportano i frammenti di DNA durante la migrazione in gel di agarosio?
Come si comportano i frammenti di DNA durante la migrazione in gel di agarosio?
Quale affermazione è corretta riguardo alla scoperta degli introni?
Quale affermazione è corretta riguardo alla scoperta degli introni?
Quali fattori proteici sono coinvolti nel trasporto dell'mRNA dal nucleo al citoplasma?
Quali fattori proteici sono coinvolti nel trasporto dell'mRNA dal nucleo al citoplasma?
Qual è l'importanza della scoperta che l'mRNA rimane legato alle proteine dello splicing?
Qual è l'importanza della scoperta che l'mRNA rimane legato alle proteine dello splicing?
Cosa deve essere fatto prima della clonazione dell'mRNA in cellule eucariotiche?
Cosa deve essere fatto prima della clonazione dell'mRNA in cellule eucariotiche?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo al processo di splicing dell'mRNA?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo al processo di splicing dell'mRNA?
Quale innovazione ha reso più efficiente la produzione di proteine in cellule eucariotiche?
Quale innovazione ha reso più efficiente la produzione di proteine in cellule eucariotiche?
Qual è il ruolo principale di U5 nel processo di catalisi?
Qual è il ruolo principale di U5 nel processo di catalisi?
Cosa garantisce la presenza di proteine SR durante il processo di splicing?
Cosa garantisce la presenza di proteine SR durante il processo di splicing?
Qual è la sequenza specifica riconosciuta dagli enzimi RNAasi e CPSF durante il reclutamento?
Qual è la sequenza specifica riconosciuta dagli enzimi RNAasi e CPSF durante il reclutamento?
Quale complesso è responsabile della formazione del sito attivo nella catalisi?
Quale complesso è responsabile della formazione del sito attivo nella catalisi?
Quale enzima è responsabile della polimerizzazione delle A durante la poliadenilazione?
Quale enzima è responsabile della polimerizzazione delle A durante la poliadenilazione?
Cosa succede dopo che l'RNA viene tagliato e poliadenilato?
Cosa succede dopo che l'RNA viene tagliato e poliadenilato?
Qual è una caratteristica distintiva dello spliceosoma alternativo rispetto al modello canonico?
Qual è una caratteristica distintiva dello spliceosoma alternativo rispetto al modello canonico?
Quali sono le funzioni specifiche di CSTF e CPSF nel contesto della poliadenilazione?
Quali sono le funzioni specifiche di CSTF e CPSF nel contesto della poliadenilazione?
Qual è il significato di ESE nel contesto dello splicing?
Qual è il significato di ESE nel contesto dello splicing?
Cosa accade durante la transesterificazione nel processo di splicing?
Cosa accade durante la transesterificazione nel processo di splicing?
Qual è il ruolo della proteina poly-A-binding-protein dopo la poliadenilazione?
Qual è il ruolo della proteina poly-A-binding-protein dopo la poliadenilazione?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo a U11 e U12 è corretta?
Quale delle seguenti affermazioni riguardo a U11 e U12 è corretta?
Quanto è lunga tipicamente la sequenza CA che segue la poliadenilazione?
Quanto è lunga tipicamente la sequenza CA che segue la poliadenilazione?
Cosa significa la sigla snRNP nel contesto dello splicing?
Cosa significa la sigla snRNP nel contesto dello splicing?
Quale componente è cruciale per il riconoscimento della sequenza per il taglio dell'RNA?
Quale componente è cruciale per il riconoscimento della sequenza per il taglio dell'RNA?
Cosa caratterizza la regione a valle della poliadenilazione?
Cosa caratterizza la regione a valle della poliadenilazione?
Quali mutazioni su snRNA minori sono state associate a patologie?
Quali mutazioni su snRNA minori sono state associate a patologie?
Quale struttura facilita l'interazione tra il sito di splicing 5' e il punto di ramificazione?
Quale struttura facilita l'interazione tra il sito di splicing 5' e il punto di ramificazione?
Che tipo di enzima è CSTF?
Che tipo di enzima è CSTF?
Qual è la principale funzione dell'acido ribonucleico messaggero (mRNA)?
Qual è la principale funzione dell'acido ribonucleico messaggero (mRNA)?
Quali mutazioni causano tipicamente il nanismo accompagnato da microcefalia e osteodisplasia?
Quali mutazioni causano tipicamente il nanismo accompagnato da microcefalia e osteodisplasia?
Quale componente proteico è principalmente associato all'Atrofia Muscolare Spinale (SMA)?
Quale componente proteico è principalmente associato all'Atrofia Muscolare Spinale (SMA)?
Quale affermazione descrive meglio il ruolo dell'RNA polimerasi durante la trascrizione?
Quale affermazione descrive meglio il ruolo dell'RNA polimerasi durante la trascrizione?
Qual è l'effetto delle mutazioni puntiformi patologiche sullo splicing?
Qual è l'effetto delle mutazioni puntiformi patologiche sullo splicing?
In che modo l'RNA è trascritto rispetto al DNA?
In che modo l'RNA è trascritto rispetto al DNA?
In chi ha un apparato di splicing minore, quale sequenza è utilizzata come etichetta al sito donatore?
In chi ha un apparato di splicing minore, quale sequenza è utilizzata come etichetta al sito donatore?
Qual è la funzione principale dello ione magnesio nell'RNA polimerasi?
Qual è la funzione principale dello ione magnesio nell'RNA polimerasi?
Qual è il significato del branch site nello splicing dell'mRNA?
Qual è il significato del branch site nello splicing dell'mRNA?
Cosa può avvenire se una mutazione attiva un sito criptico di splicing?
Cosa può avvenire se una mutazione attiva un sito criptico di splicing?
Cosa caratterizza la struttura a forcina dell'RNA?
Cosa caratterizza la struttura a forcina dell'RNA?
Qual è il ruolo della subunità omega nell'RNA polimerasi?
Qual è il ruolo della subunità omega nell'RNA polimerasi?
Quale tra le seguenti affermazioni è vera riguardo ai promotori e allo splicing alternativo?
Quale tra le seguenti affermazioni è vera riguardo ai promotori e allo splicing alternativo?
Qual è l'effetto della perdita dell'esone 4 durante lo splicing alternativo?
Qual è l'effetto della perdita dell'esone 4 durante lo splicing alternativo?
Qual è l'effetto delle sequenze specifiche nel DNA a monte durante la trascrizione?
Qual è l'effetto delle sequenze specifiche nel DNA a monte durante la trascrizione?
Quale affermazione è vera riguardo alla differenza tra filamento di DNA e filamento di RNA?
Quale affermazione è vera riguardo alla differenza tra filamento di DNA e filamento di RNA?
Quale delle seguenti affermazioni riguarda il contenuto del preRNA?
Quale delle seguenti affermazioni riguarda il contenuto del preRNA?
Quale delle seguenti affermazioni descrive meglio la direzione di sintesi dell'RNA?
Quale delle seguenti affermazioni descrive meglio la direzione di sintesi dell'RNA?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo ai fattori di trascrizione specifici presenti in alcune cellule?
Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo ai fattori di trascrizione specifici presenti in alcune cellule?
Qual è il ruolo della ferritina nel contesto della tossicità degli ioni ferro nelle cellule?
Qual è il ruolo della ferritina nel contesto della tossicità degli ioni ferro nelle cellule?
Qual è la conseguenza di un'elevata sovraespressione di eIF4E?
Qual è la conseguenza di un'elevata sovraespressione di eIF4E?
Cosa provoca il legame di IRP all'IRE nel caso di bassa disponibilità di Fe2+?
Cosa provoca il legame di IRP all'IRE nel caso di bassa disponibilità di Fe2+?
In cosa consiste la funzione di tmRNA SSrA nei procarioti quando si verifica un danno all'mRNA?
In cosa consiste la funzione di tmRNA SSrA nei procarioti quando si verifica un danno all'mRNA?
Qual è la funzione della porzione allungata di tmRNA dopo che si lega al ribosoma?
Qual è la funzione della porzione allungata di tmRNA dopo che si lega al ribosoma?
Quale affermazione descrive meglio il metodo dell'ibridazione in situ su embrioni interi?
Quale affermazione descrive meglio il metodo dell'ibridazione in situ su embrioni interi?
Qual è il principale vantaggio dell'uso di microarrays cDNA nella caratterizzazione genica?
Qual è il principale vantaggio dell'uso di microarrays cDNA nella caratterizzazione genica?
Cosa implica il progetto IMAGE nella ricerca trascrittomica?
Cosa implica il progetto IMAGE nella ricerca trascrittomica?
Qual è il ruolo della retrotrascrizione con cDNA nei microarrays?
Qual è il ruolo della retrotrascrizione con cDNA nei microarrays?
Qual è una limitazione significativa nel confronto tra il genoma tumorale e quello normale?
Qual è una limitazione significativa nel confronto tra il genoma tumorale e quello normale?
In che modo i database contribuiscono allo studio del trascrittoma?
In che modo i database contribuiscono allo studio del trascrittoma?
Qual è il principale limite del microarray rispetto ad altre tecniche di analisi genica?
Qual è il principale limite del microarray rispetto ad altre tecniche di analisi genica?
Quale approccio permette di analizzare tutti gli RNA prodotti in un tessuto specifico?
Quale approccio permette di analizzare tutti gli RNA prodotti in un tessuto specifico?
Qual è il ruolo del complesso EFG-GDP nella traduzione?
Qual è il ruolo del complesso EFG-GDP nella traduzione?
Cosa accade al complesso EFG dopo che GDP è rilasciato?
Cosa accade al complesso EFG dopo che GDP è rilasciato?
Qual è la funzione principale dei fattori di rilascio nella terminazione della traduzione?
Qual è la funzione principale dei fattori di rilascio nella terminazione della traduzione?
Cosa caratterizza la differenza tra RF1 e eRF1?
Cosa caratterizza la differenza tra RF1 e eRF1?
Che tipo di interazione avviene tra i fattori di rilascio e i codoni di stop?
Che tipo di interazione avviene tra i fattori di rilascio e i codoni di stop?
Quale affermazione descrive il mimetismo molecolare all'interno del ciclo della traduzione?
Quale affermazione descrive il mimetismo molecolare all'interno del ciclo della traduzione?
Qual è la conseguenza dell'arrivo di un codone di stop nella traduzione?
Qual è la conseguenza dell'arrivo di un codone di stop nella traduzione?
Qual è la principale differenza tra gli EFG nei procarioti e negli eucarioti?
Qual è la principale differenza tra gli EFG nei procarioti e negli eucarioti?
Cosa succede alla subunità minore del ribosoma durante la traduzione?
Cosa succede alla subunità minore del ribosoma durante la traduzione?
Qual è il ruolo principale di EF-Tu nel processo di allungamento della traduzione?
Qual è il ruolo principale di EF-Tu nel processo di allungamento della traduzione?
Cosa accade quando EF-Tu si stacca dal transfer?
Cosa accade quando EF-Tu si stacca dal transfer?
Qual è l'impatto dell'errore nel posizionamento del tRNA sul processo di traduzione?
Qual è l'impatto dell'errore nel posizionamento del tRNA sul processo di traduzione?
Quale fattore è coinvolto nel ciclo di estensione del processo di traduzione?
Quale fattore è coinvolto nel ciclo di estensione del processo di traduzione?
Quale descrizione è corretta riguardo al posizionamento del tRNA nel ribosoma?
Quale descrizione è corretta riguardo al posizionamento del tRNA nel ribosoma?
Come si verificano gli errori nel legame codone-anticodone?
Come si verificano gli errori nel legame codone-anticodone?
Qual è il risultato finale del legame della peptidil transferasi nel processo di traduzione?
Qual è il risultato finale del legame della peptidil transferasi nel processo di traduzione?
Qual è l'effetto del rilascio di fosfato durante l'attività GTP-asica?
Qual è l'effetto del rilascio di fosfato durante l'attività GTP-asica?
Qual è la funzione di EFG durante il ciclo di estensione?
Qual è la funzione di EFG durante il ciclo di estensione?
Cosa stabilizza il legame codone-anticodone anche in situazioni di errore?
Cosa stabilizza il legame codone-anticodone anche in situazioni di errore?
Quale dei seguenti aminoacidi è codificato da una singola tripletta?
Quale dei seguenti aminoacidi è codificato da una singola tripletta?
Quale codone è considerato uno dei tre codoni di stop?
Quale codone è considerato uno dei tre codoni di stop?
Quale affermazione riguardante il codice degenerate è corretta?
Quale affermazione riguardante il codice degenerate è corretta?
Cosa indica la presenza di polimorfismi in una proteina?
Cosa indica la presenza di polimorfismi in una proteina?
Qual è una caratteristica del codice genetico mitocondriale rispetto a quello nucleare?
Qual è una caratteristica del codice genetico mitocondriale rispetto a quello nucleare?
Cosa può accadere a seguito di una mutazione nel terzo nucleotide di un codone?
Cosa può accadere a seguito di una mutazione nel terzo nucleotide di un codone?
Quale affermazione descrive meglio la Open Reading Frame (ORF)?
Quale affermazione descrive meglio la Open Reading Frame (ORF)?
Qual è la relazione tra i primi due nucleotidi e l'effetto delle mutazioni sugli aminoacidi codificati?
Qual è la relazione tra i primi due nucleotidi e l'effetto delle mutazioni sugli aminoacidi codificati?
Quale degli aminoacidi elencati ha più di un codone che lo codifica?
Quale degli aminoacidi elencati ha più di un codone che lo codifica?
Qual è la principale funzione dei domini di attivazione trascrizionale?
Qual è la principale funzione dei domini di attivazione trascrizionale?
Cosa caratterizza il complesso di mediatore nella trascrizione?
Cosa caratterizza il complesso di mediatore nella trascrizione?
Qual è la relazione tra l'alfa-elica acida di Gcn4 e Gal11 nel mediatore?
Qual è la relazione tra l'alfa-elica acida di Gcn4 e Gal11 nel mediatore?
Come influisce il numero di unità nei domini di attivazione sulla capacità di attivazione?
Come influisce il numero di unità nei domini di attivazione sulla capacità di attivazione?
Che tipo di proteine sono i fattori di trascrizione descritti come blu nel contesto?
Che tipo di proteine sono i fattori di trascrizione descritti come blu nel contesto?
Qual è una caratteristica dei complessi di attivatori come GAL4?
Qual è una caratteristica dei complessi di attivatori come GAL4?
Cosa implica una ripiegatura della cromatina durante il processo di trascrizione?
Cosa implica una ripiegatura della cromatina durante il processo di trascrizione?
Perché i domini di attivazione sono considerati 'sticky'?
Perché i domini di attivazione sono considerati 'sticky'?
Quale metodo può essere utilizzato per generare delezioni nel DNA?
Quale metodo può essere utilizzato per generare delezioni nel DNA?
Qual è la funzione principale dei frammenti di sequenza prelevati durante l'analisi del promotore?
Qual è la funzione principale dei frammenti di sequenza prelevati durante l'analisi del promotore?
Cosa si intende per promotore minimo nel contesto della regolazione della trascrizione?
Cosa si intende per promotore minimo nel contesto della regolazione della trascrizione?
Qual è il principale obiettivo dell'analisi delle delezioni in un promotore?
Qual è il principale obiettivo dell'analisi delle delezioni in un promotore?
Quale affermazione descrive meglio il processo di sequenziamento in relazione alle delezioni?
Quale affermazione descrive meglio il processo di sequenziamento in relazione alle delezioni?
Qual è il ruolo dell'RNA polimerasi nell'attività del promotore?
Qual è il ruolo dell'RNA polimerasi nell'attività del promotore?
Perché è importante la sequenza del promotore nella regolazione dell'espressione genica?
Perché è importante la sequenza del promotore nella regolazione dell'espressione genica?
Quali fattori possono influenzare l'attività di un promotore forte?
Quali fattori possono influenzare l'attività di un promotore forte?
Qual è l'effetto della riduzione della dimensione della sequenza di un promotore?
Qual è l'effetto della riduzione della dimensione della sequenza di un promotore?
Qual è il significato della deviazione standard in un esperimento che implica l'analisi della luciferasi di Renilla?
Qual è il significato della deviazione standard in un esperimento che implica l'analisi della luciferasi di Renilla?
Cosa svolge la Celenterazina durante l'analisi della luciferasi?
Cosa svolge la Celenterazina durante l'analisi della luciferasi?
Quali elementi sono essenziali per la costruzione di un vettore di clonaggio per l'espressione di luciferasi?
Quali elementi sono essenziali per la costruzione di un vettore di clonaggio per l'espressione di luciferasi?
Qual è il ruolo del promotore sintetico nello studio dell'enancher?
Qual è il ruolo del promotore sintetico nello studio dell'enancher?
Qual è l'importanza della luciferina e dell'ATP nell'analisi della luciferasi?
Qual è l'importanza della luciferina e dell'ATP nell'analisi della luciferasi?
Cosa si ottiene dalla combinazione della luciferasi di lucciola e di Renilla durante l'esperimento?
Cosa si ottiene dalla combinazione della luciferasi di lucciola e di Renilla durante l'esperimento?
Qual è la funzione del segnale di poliadenilazione derivato da virus nel clonaggio?
Qual è la funzione del segnale di poliadenilazione derivato da virus nel clonaggio?
In che modo si esegue l'analisi di un enancher?
In che modo si esegue l'analisi di un enancher?
Cosa accade quando si mischiano plasmidi con diverse molecole di DNA in cellule?
Cosa accade quando si mischiano plasmidi con diverse molecole di DNA in cellule?
Qual è il numero totale di fattori di trascrizione e siti di legame considerati dal software?
Qual è il numero totale di fattori di trascrizione e siti di legame considerati dal software?
Quale affermazione descrive meglio l'effetto di minimizzare i falsi positivi e negativi nella matrice?
Quale affermazione descrive meglio l'effetto di minimizzare i falsi positivi e negativi nella matrice?
Quale tipo di cellule si deve utilizzare se si studiano gli adipociti?
Quale tipo di cellule si deve utilizzare se si studiano gli adipociti?
Cosa consente di specificare il software oltre ai fattori di trascrizione?
Cosa consente di specificare il software oltre ai fattori di trascrizione?
Qual è il principale vantaggio dei software che fanno un match tra sequenze e fattori di trascrizione?
Qual è il principale vantaggio dei software che fanno un match tra sequenze e fattori di trascrizione?
Qual è il ruolo dei lipidi cationici nella trasfezione?
Qual è il ruolo dei lipidi cationici nella trasfezione?
Cosa comporta l'utilizzo di valori percentuali nei pesi delle basi durante l'analisi delle sequenze?
Cosa comporta l'utilizzo di valori percentuali nei pesi delle basi durante l'analisi delle sequenze?
Quale affermazione riguardante la sequenza consenso è corretta?
Quale affermazione riguardante la sequenza consenso è corretta?
Quale affermazione è corretta riguardo ai risultati ottenuti dalla tabella generata dal software?
Quale affermazione è corretta riguardo ai risultati ottenuti dalla tabella generata dal software?
Quale dei seguenti passaggi è essenziale per mutagenizzare il DNA?
Quale dei seguenti passaggi è essenziale per mutagenizzare il DNA?
Qual è l'importanza di considerare gli organismi specifici, come la Drosophila, durante l'analisi delle sequenze?
Qual è l'importanza di considerare gli organismi specifici, come la Drosophila, durante l'analisi delle sequenze?
Quale ruolo svolge il fattore di trascrizione negli adipociti?
Quale ruolo svolge il fattore di trascrizione negli adipociti?
Cosa comporta l'utilizzo di un enzima che taglia solo la catena di DNA metilata?
Cosa comporta l'utilizzo di un enzima che taglia solo la catena di DNA metilata?
Qual è l'importanza della sequenza mutagenizzata gialla nel processo di legame?
Qual è l'importanza della sequenza mutagenizzata gialla nel processo di legame?
Study Notes
Regolazione dell’Espressione Genica
- Geni del genoma non sempre espressi, attivati o repressi secondo necessità.
- Differenti tipi di RNA: messaggero (mRNA), regolatori (non tradotti), ribosomiale.
- Organismi unicellulari rispondono rapidamente agli stimoli attivando/ripremendo l’espressione genica.
- Organismi pluricellulari hanno cellule specializzate, stesso genoma, ma trascrittoma diverso.
- Un promotore forte produce alta quantità di RNA, influenzato da stimoli extracellulari.
- Relazione tra mRNA e produzione di proteine, influenzata da regolazione post-trascrizionale.
- Tecniche biochimiche complesse usate per definire quantità di proteina.
Procarioti
- Esistono attivatori (regolatori positivi) che facilitano la trascrizione e repressori (regolatori negativi) che la inibiscono.
- Repressori autoregolano la loro concentrazione e devono essere degradati per attivare il ciclo litico.
- Il fattore Cro previene la trascrizione del gene CI, influenzando l'alternanza tra ciclo litico e lisogenico.
- Condizioni fisiologiche (danni al DNA) possono attivare il ciclo lisogenico tramite la degradazione del repressore CI.
Ciclo Litico e Lisogenico
- Bassi livelli di fagi portano a ciclo litico, mentre alti livelli favoriscono il ciclo lisogenico.
- Elevata concentrazione di CI inattiva i geni del ciclo litico, permettendo integrazione nel genoma batterico.
- Plasmidi derivanti dal fago conservano geni per ciclo litico o lisogenico a seconda delle necessità.
Eucarioti
- Eucarioti multicellulari hanno pochi geni regolabili ambientali; l'eccezione è S. cerevisiae.
- Controllo dell'espressione genica cruciale in sviluppo e differenziamento cellulare.
- Nella trascrizione eucariotica, fattori generali sono necessari per il legame RNA polimerasi-DNA.
- Il DNA è organizzato in cromatina, dove i nucleosomi possono ostacolare la trascrizione.
Elementi di un Promotore Eucariotico
- Sito di inizio trascrizione e TATA box, legata da TBP (parte di TFIID).
- Elementi bre legati a monte e a valle; DPE coinvolto nella legatura da parte di TFIID.
- Utilizzo di selezione con antibiotici per ottenere resistenza al gene Bla per ampicillina.
Selezione nei Lieviti
- Lieviti auxotrofi richiedono aminoacidi essenziali, possono essere selezionati dopo introduzione di DNA esogeno per sintetizzarli.
- Efficacia della trasformazione spesso bassa, necessità di sistemi di selezione per cellule trasformate.
Mappa del Plasmide e Clonazione nei Lieviti
- Plasmide per clonaggio in lieviti include siti ColE1 e ampR.
- Gene TRP1 permette metabolismo di triptofano; GAL1 funzione come promotore forte.
- Sistema a due ibridi per studiare interazione tra proteine, utilizzando GAL4 come fattore di trascrizione.
- Reporter GAL1-LacZ indica attivazione trascrizionale, essenziale per la sopravvivenza cellulare.
Componenti del Plasmide
- Plasmide X contiene regione codificante per proteina X e geni per sintesi autonoma di triptofano.
- Plasmide senza codone di STOP permette la selezione di lieviti che possiedono il mini-gene per il triptofano.
Replicazione e Metilazione del DNA
- Il DNA non metilato può essere ottenuto tramite PCR in vitro.
- La metilasi può inibire l'azione degli enzimi di restrizione se il sito di riconoscimento è sovrapposto.
- L’enzima StuI è bloccato se la sequenza AGGCCT è seguita da GG, ma non da AA, che non è metilata.
- DNA isolato da E. coli Dam+ è resistente al taglio di MboI ma non di Sau3AI, nonostante entrambi riconoscano la sequenza GATC.
- E. coli Dam- e Dcm- disponibili per esperimenti con enzimi sensibili alla metilazione.
- La metilazione del DNA plasmidico può ridurre l'efficienza di trasformazione in ceppi specifici di E. coli.
- Plasmidi modificati da Dam o Dcm possono avere difficoltà nella trasformazione in specie diverse.
- Enzimi per biologia molecolare devono essere puri e privi di contaminazione da esonucleasi e fosfatasi.
Controllo degli Enzimi
- Controllo dell'attività enzimatica mediante digestione del DNA ed utilizzo di DNA ligasi per ricucire e ridigerire i frammenti.
- Unità dienzima: quantità necessaria per digerire 1 µg di DNA in 1 ora.
- Gli enzimi sono conservati in glicerolo per ridurre il congelamento, ma devono essere diluiti per avere reazioni ottimali.
Tipi di Plasmidi
- Plasmidi rilassati: presenti in alta copia all'interno della cellula, si replicano facilmente.
- Plasmidi stringenti: presenti in bassa copia, la replicazione è limitata.
- DNA supercoiled si forma con l'interazione di girasi e topoisomerasi.
Conformazioni e Visualizzazione del DNA
- Introduzione dell’Etidio Bromuro porta a perdita di superavvolgimento nel DNA superavvolto.
- Diverse forme di DNA circolare: CCC (circolari chiusi covalentemente), OC (circolari aperti), linearizzato.
- Superavvolgere il DNA modifica le sue proprietà e rende difficile analizzarne il peso fino a rottura.
Esperimenti e Sintesi Proteica
- Esperimento di Ingram evidenzia il legame tra geni e proteine mediante la sostituzione di amminoacidi in pazienti con anemia falciforme.
- La sintesi proteica può avvenire in assenza di DNA; non avviene trascrizione diretta.
Tipi di RNA e Struttura Molecolare
- Esistono diversi tipi di RNA: rRNA rappresenta l'85% e predomina in cellule con intensa sintesi proteica.
- Struttura di RNA differente rispetto a DNA: zucchero ribosio o desossiribosio influenza splicing.
- Nucleosidi: zucchero + base azotata, legami glicolisidici coinvolti.
Legami Molecolari
- Legame fosfodiesterico forma una catena tra nucleotidi, da 5' a 3'.
- Legami covalenti ad alta energia, mentre legami a idrogeno più deboli stabilizzano le strutture.
Interazioni tra Proteine e DNA
- Proteine interagiscono specificamente con DNA attraverso legami a idrogeno e interazioni con solchi grazie a gruppi donatori e accettori.
- Il solco maggiore predilige interazioni con proteine a struttura ad alfa-elica, il solco minore è meno specifico.
Struttura del DNA
- Il DNA è solitamente in conformazione B in ambienti acquosi; ogni giro dell'elica è composto da 10 nucleotidi.
- In bassa umidità, il DNA può assumere una conformazione che porta ad avere 11 nucleotidi per giro; DNA-Z ha una struttura più allungata.
Dinamiche della Replicazione del DNA
- Il pirofosfato rilasciato durante la polimerizzazione consente la rottura del legame fosfodiesterico.
- La polimerizzazione avviene in direzione 5’-3’, aggiungendo nucleotidi sulla estremità 3’.
- Energia totale per la formazione del legame è di 7 kcal/mol, con una costante di equilibrio Keq di 10^5.
Tipi di Analoghi di Nucleotidi
- La bromodeossiuridina (BrdU) si incorpora nel DNA come timina, ma presenta un bromo al posto del metile, compromettendo i legami a idrogeno.
- Farmaci chemioterapici utilizzano analoghi nucleotidici, come l'arabinosio nella citosina arabinoside (AraC), per bloccare la sintesi di DNA tumorale.
- L'aciclovir è un antivirale efficace contro virus come Herpes Simplex, bloccando l'attività della DNA polimerasi.
Processività della DNA Polimerasi
- La DNA polimerasi ha una velocità costante di sintesi di 1 base/ms, ma la sua processività varia (fino a >50000 basi) in base alla probabilità di distacco dallo stampo.
- Interazioni elettrostatiche con il DNA aumentano la processività, consentendo una sintesi fluida e costante.
- La correzione di bozze (proofreading) riduce gli errori a 1 su 10^10 grazie all'attività esonucleasica 3’-5’.
Formazione del Primer
- La primasi produce un primer di RNA che offre un gruppo -OH libero per l'inizio della sintesi del DNA.
- Negli eucarioti, la polimerasi alpha e altre possono sintetizzare un primer RNA, seguito dalla sintesi del DNA.
Forcella Replicativa e Sintesi dei Filamenti
- La replicazione avviene in due modalità: filamento guida (leading strand) e filamento ritardato (lagging strand), quest'ultimo costruito in frammenti di Okazaki.
- Lunghezza dei frammenti: 1000-2000 basi nei batteri; 100-400 basi negli eucarioti.
- La DNA polimerasi I rimuove i primer e chiude i frammenti lasciati, ripristinando un filamento continuo.
Ruolo delle DNA Polimerasi
- DNA polimerasi I: rimuove primer e completa spazi vuoti; ha attività esonucleasica 5’-3’ e 3’-5’.
- DNA polimerasi II: svolge funzioni di riparazione.
- DNA polimerasi III: principale enzima per la replicazione e correzione di bozze.
Rimozione e Riparazione del Primer
- La RNAasi H rimuove i primer RNA durante la replicazione degli eucarioti.
- Rimozione lascia un gap che viene riempito dalla DNA polimerasi; rimane un legame fosfodiesterico interrotto (nick).
- La DNA ligasi chiude il filamento utilizzando ATP o NAD.
Dinamiche di Denaturazione e Replicazione
- La denaturazione del DNA è effettuata dall'elicasi, che richiede ATP, separando le due catene di nucleotidi.
- Il complesso di replicazione (replisoma) coordina la sintesi simultanea di entrambi i filamenti.
- La sliding clamp assicura una interazione efficace con le proteine necessarie per la replicazione.
Meccanismo di Sintesi
- Il modello a trombone descrive il movimento della DNA polimerasi durante la sintesi sui filamenti lagging, mentre l'elicasi continua ad aprire la doppia elica.
- La primasi sintetizza i primer, stabilendo l'inizio dei frammenti di Okazaki; la loro lunghezza è regolata da interazione con l'elicasi.
Considerazioni Finali
- La replicazione del DNA è un processo altamente regolato che richiede diversi enzimi e interazioni molecolari complesse.
- La continua ricerca e studio di questi meccanismi è fondamentale per lo sviluppo di terapie e farmaci mirati.
Primer e Temperatura di Annealing
- I primer inferiore e superiore sono identici e devono avere temperature di annealing simili.
- La temperatura di annealing ottimale facilita l'accoppiamento dei nucleotidi, generando nuove molecole di DNA.
- La regola di Wallace calcola la temperatura necessaria: +4°C per ogni G e C, +2°C per ogni A e T.
Polimerasi e Correzione di Bozza
- La polimerasi Klenow di E. coli ha attività esonucleasica ma non è termostabile e si denatura a temperature elevate.
- La Taq, derivata da Thermus aquaticus, non ha attività correttiva e presenta un alto tasso di errore (da 1 x 10^-4 a 2 x 10^-5 errori per paio di basi).
- La Pfu, proveniente dal Pyrococcus furiosus, garantisce bassa percentuale di errori (circa 1.5 x 10^-6 errori per paio di basi) e resistenza al calore.
Crescita Esponenziale del DNA
- La replicazione del DNA avviene in cicli, producendo un numero esponenziale di molecole di DNA fino a un plateau a causa di fattori come esaurimento dei nucleotidi.
- La temperatura ottimale per l'appaiamento è 45°C; temperature non ottimali portano a DNA eterogeneo.
Utilizzi della Tecnica
- Ottenimento di grandi quantità di DNA.
- Analisi di RNA messaggero (mRNA).
- Identificazione di mutazioni nelle diagnosi.
- Diagnostica prenatale e infezioni virali o batteriche.
- Genotipizzazione in medicina forense e analisi paleontologiche.
Sequenziamento del DNA
- Il sequenziamento del DNA inizia negli anni '70 con Wu e Taylor (1971) e Sanger (1977).
- Metodi di sequenziamento includono reattivi chimici (Maxam & Gilbert) e la terminazione con dideossinucleotidi (Sanger).
Metodo di Sanger
- Utilizza la polimerasi Klenow e il fago T7 "Sequenase" per un sequenziamento efficace.
- Regolazione del numero di copie di plasmidi tramite RNA antisenso e interazione con proteine specifiche.
Divisione dei Plasmidi
- I plasmidi si distribuiscono stabilmente alle cellule figlie attraverso regioni ParC e ParM.
- L'interazione tra le sequenze regola il numero di copie di plasmidi.
Ligazione del DNA
- Si formano estremità coesive che possono appaiarsi; un rapporto molare di 1:6 tra vettore e inserto è ottimale.
- T4 DNA ligasi preferisce una temperatura attorno ai 16°C per l'attività enzimatica.
Mutazioni e Regolazione
- F’ contiene episomi e mutazioni che influenzano funzioni come la resistenza agli antibiotici e la regolazione della trascrizione.
- Trattamento con CaCl2 rende E. coli capace di assorbire DNA esogeno, facilitando la trasformazione genetica.
Riparazione del DNA nei Procarioti
- MutS riconosce appaiamenti scorretti nel DNA, attivando un processo riparativo.
- MutL si unisce a MutS e recluta MutH, che può quindi effettuare un taglio a singolo filamento.
- Si utilizza una ligasi con un sito attivo di lisina per ripristinare il legame fosfodiesterico.
Riparazione del DNA negli Eucarioti
- Nessun omologo di MutH è presente; la riparazione è basata su un filamento discontinuo.
- PCNA può reclutare un sistema MSH simile a MutS; in caso di mismatch, MMH genera un NICK per sostituire la regione danneggiata.
Tipi di Danni al DNA
- Danni possono includere basi modificate con errori di appaiamento e rotture.
- Deaminazione: idrolisi di citosine o adenine, causando mutazioni (es. da citosina a uracile).
- La deaminazione della 5-metil-citosina porta al passaggio da timina, favorendo appaiamenti scorretti.
Danno da Radiazioni e Dimeri
- Dimeri di timina causati da esposizione UV possono bloccare la RNA polimerasi, impedendo la trascrizione genica.
- Durante la trascrizione, danni portano all'attivazione di un sistema per la riparazione, richiamato grazie alla distorsione dell'elica.
Sintesi del DNA in Presenza di Danni
- In caso di dimero di timina, la DNA polimerasi δ/ε si blocca, portando alla sollecitazione di sistemi di riparazione.
- Ubiquitinazione di PCNA modifica la sua struttura, favorendo l'attività della polimerasi ε, meno fedele nel copiare il DNA.
Rotture di Filamenti nel DNA
- Rotture singolo e doppio filamento possono derivare da radiazioni ionizzanti o agenti chimici (es. bleomicina).
- RIPARAZIONE SINGOLO FILAMENTO: PARP rileva e segna i danni per richiamare il sistema di riparazione (es. BER).
- RIPARAZIONE DOPPIO FILAMENTO: si utilizza un approccio omologo o non omologo per riparare i danni.
Rottura Doppio Filamento
- Danni possono causare apoptosi e richiedono aiuto da parte di proteine come Ku70/80 per rilevare la rottura.
- DNA-PKcs attiva il processo di riparazione legando nucleotidi e permettendo l'accoppiamento.
Riparazione nei Procarioti (Escherichia coli)
- Inizia con complesso RecBCD, formato da tre proteine che processano il DNA rotto.
- RecB e RecD operano come elicasi per aprire i filamenti, e RecC si lega a sequenze Chi per sincronizzare la ricombinazione.
- La proteina RecA media l'invasione dei filamenti omologhi, formando una giunzione di Holliday.
Riepilogo dei Meccanismi di Riparazione
- Riparazione dei mismatch tramite sistemi dediti.
- Prevenzione delle mutazioni tramite corrette attività di enzimi di riparazione.
- Importanza di sistemi di riparazione per mantenere l'integrità del genoma e prevenire malattie, come il cancro.
Ricombinazione del DNA
- La formazione di un'ansa permette scambi di DNA; se le direzioni sono parallele, si ha escissione del DNA.
- Se le direzioni sono opposte, l'ansa ruota la regione del genoma, fondamentale per la ricombinazione.
- Negli eucarioti, la ricombinazione non avviene naturalmente; è necessario introdurre sequenze specifiche.
- Gli esoni, che compongono i geni, possono essere manipolati attraverso siti loxP e l'enzima Cre-lox per eseguire knock-out di geni.
Batterio Salmonella
- Salmonella elude il sistema immunitario inibendo l'espressione di geni per il flagello tramite sequenze invertite.
- Presenta due siti di ricombinazione, HixL e HixR, con un promotore che regola l'espressione delle flagelline H1 e H2.
- La flagellina H2 è immunogenica e la sua espressione deve essere bloccata per nascondersi dagli anticorpi.
Verifica della ricombinazione
- La mappa di restrizione è essenziale per verificare la ricombinazione attraverso il taglio del DNA con enzimi specifici (es. XbaI).
- La Southern blotting permette di identificare specifici frammenti di DNA attraverso sonde sintetiche complementari.
Southern Blotting
- È una metodologia chiave in biologia molecolare per localizzare geni, definire delezioni correlate a malattie genetiche e identificare transgeni.
- Permette il clonaggio di geni eucariotici e la scoperta degli introni.
- Utilizzata anche per studi di RFLP e fingerprinting genetico.
Selezione e chimerismo nei topi
- La selezione genetica mira a massimizzare la presentazione del gene modificato utilizzando spermatozoi di topi agouti.
- La presenza dell'allele dominante agouti produce diverse colorazioni nei topolini.
- Only a small percentage (5-40%) dei topi porta il transgene, influenzato dal grado di chimerismo.
Induzione della Cre ricombinasi
- La Cre ricombinasi non entra nel nucleo; quindi, si usa un sistema inducibile tramite fattori di trascrizione legati a estrogeni.
- Trattamenti con estrogeni permettono la ricombinazione sito-specifica quando Cre è nel nucleo.
- È possibile invertire specifiche sezioni del genoma utilizzando direzioni opposte delle sequenze di ricombinazione.
Trasposizione e risoluzione
- La trasposizione richiede sia la trasposasi che una resolvasi.
- La trasposasi taglia il DNA alle estremità del trasposone; la resolvasi apre il DNA, consentendo due copie del trasposone nel cromosoma batterico.
- Gli intermedi formati durante la trasposizione vengono riparati tramite DNA polimerasi che sintetizza nuovo DNA.
Appaiamenti e Struttura dell'RNA
- Negli appaiamenti tra basi RNA, la timina (T) è sostituita dall'uracile (U).
- Il solco maggiore dell'RNA è più ampio, servendo come punto cruciale di interazione.
- L'RNA spesso adotta strutture a forcina; la parte iniziale è a doppia elica, mentre le basi finali possono formare interazioni non classiche.
Struttura dell'RNA Polimerasi
- Composta da 5 subunità:
- 2 alfa
- 1 ß
- 1 ß’ (formano una chela contenente ione magnesio per la polimerizzazione)
- 1 omega (funzione non ben definita)
Inizio della Trascrizione
- L'RNA polimerasi inizia alla regione +1 dell'esone, con precisione guidata dalle sequenze specifiche nel DNA a monte.
- Il riconoscimento del promotore è mediato dai fattori di trascrizione, in particolare sigma70.
- Si crea una bolla per la trascrizione del DNA, registrando l'RNA dal filamento complementare (5’-3’).
- CTD della polII è coinvolto nel reclutamento degli enzimi necessari alla trascrizione.
Poliadenilazione
- Riconoscimento della sequenza poliadenilazione (AAUAAA) essenziale per il reclutamento degli enzimi:
- RNAasi (CSTF) che taglia l'RNA.
- CPSF che aggiunge adenine.
- La coda poli-A è protetta da una proteina poli-A-binding, preservando la stabilità del messaggero.
Splicing e Catalisi
- Durante la trascrizione, il pre-mRNA subisce splicing per rimuovere introni e unire esoni.
- Il complesso di splicing interagisce per formare il sito attivo catalitico; U4 viene rimosso da U5, facilitando la transesterificazione.
- Le proteine SR favoriscono il posizionamento di U2AF e U1 tramite legami con sequenze specifiche (ESE).
Splicing Alternativo
- Alcuni geni utilizzano un apparato minore (U11 e U12) riconoscendo sequenze di splicing diverse (AU e AC).
- U4 e U6 nel complesso minore sono snRNPs diversificate.
- Mutazioni nei componenti dello splicing possono portare a patologie genetiche come nanismo o atrofia muscolare spinale (SMA).
Trasporto dell'mRNA nel Citoplasma
- L'mRNA deve attraversare il poro nucleare legandosi a specifiche proteine (poli-A binding proteins, splicing particles).
- La presenza di queste proteine facilita il trasporto e la stabilità dell'mRNA durante il passaggio dal nucleo al citoplasma.
- Nelle biotecnologie, il legame dell'mRNA a proteine dello splicing è cruciale per la produzione di proteine in cellule eucariotiche.
Produzione di Proteine in Eucarioti
- Evoluzione delle tecniche di clonazione per la produzione di proteine funzionali.
- L'utilizzo di promotori eucariotici e l'ottimizzazione del cDNA aumenta l'efficienza di espressione proteica.
- Possibilità di inserire esoni non codificanti senza influenzare il processo di traduzione.
Denaturazione e Trascrizione
- La denaturazione del DNA permette l'accesso alla RNA polimerasi, che si lega al filamento stampo da 3' a 5'.
- La RNA polimerasi genera una sonda complementare utilizzando UTP modificato.
Livelli di Analisi di Ibridazione
- Ibridazione in situ su embrioni interi (whole mount) è limitata agli stadi precoci dello sviluppo.
- Ibridazione in situ su sezioni consente l'analisi di embrioni interi o tessuti adulti.
Trascrittoma e Microarrays
- Il TRASCRITTOMA permette l'analisi simultanea di tutti gli RNA prodotti in un esperimento.
- Microarrays cDNA possono analizzare un gran numero di geni, coprendo circa 20.000 geni umani.
- Le sonde su microarray corrispondono a frammenti di circa 100 bp per l'ibridazione con RNA.
Progetto IMAGE e Genoma
- Il progetto IMAGE ha sequenziato cDNA da RNAm di cuore, cervello e fegato, evidenziando le differenze di espressione genica nei vari tessuti.
- La metionina è codificata da AUG e il triptofano da UGG; esistono 3 codoni di stop: UAA, UGA, UAG.
Codice Degenerato
- Gli aminoacidi sono codificati da codoni diversi; la variazione avviene solo nella terza posizione.
- Mutazioni nel terzo nucleotide hanno spesso effetti silenti o poco rilevanti.
Aspetti del Codice Genetico
- Nei mitocondri, il codice genetico presenta variazioni, come un codone di stop che codifica per il triptofano.
- Gli RNA messaggeri sono sintetizzati in cDNA per l'analisi; i database contengono informazioni utili.
ORF e Cornici di Lettura
- Ogni DNA ha 3 cornici di lettura (ORF): lettura del primo nucleotide con AUG avvia la traduzione.
- Il mantenimento della corretta cornice di lettura è essenziale per la sintesi proteica e richiede fattori di allungamento.
Fattori di Allungamento
- Due principale fattori di allungamento: EF-Tu e EFG.
- EF-Tu trasporta tRNA al ribosoma e previene legami peptidici indesiderati; l'attivazione di EFG facilita il movimento ribosomiale.
Appaiamento Codone-Anticodone
- L'appaiamento correttamente richiede solo i primi due nucleotidi; il terzo può legarsi in modo impreciso.
- Gli errori nell'appaiamento avvengono con una frequenza di 1 su 1000 amminoacidi.
Ciclo di Estensione
- La traslocazione è mediata da EFG, che attiva il cambio di conformazione del ribosoma.
- Il trasferimento del peptide dal sito A al sito P è cruciale per la continuità della sintesi proteica.
Mimetismo Molecolare
- Il mimetismo molecolare si riferisce alla somiglianza tra diverse molecole, come transfer e fattori di rilascio.
- L'affinità di EFG con GDP favorisce il riciclo delle molecole.
Terminazione della Traduzione
- I fattori di rilascio attivano l'idrolisi del polipeptide quando si incontra un codone di stop.
- Nei procarioti, RF1 e RF2 riconoscono diversi codoni di stop, mentre negli eucarioti opera solo eRF1.
Danni a mRNA
- Mutazioni senza codoni di stop causano arresto della traduzione nei procarioti, richiedendo l'intervento di tmRNA SSrA.
- tmRNA funge da transfer e messaggero, permettendo il rilascio dell'mRNA danneggiato.
Fattori di trascrizione e mediatori
- I GTF si legano a promotori minimi o basali, e anche a elementi regolatori distanti.
- La cromatina si ripiega permettendo interazioni tra elementi lontani, facilitando l’attivazione della trascrizione.
- Il mediatore è un complesso proteico che interagisce con GTF e TAF, permettendo attivazioni trascrizionali.
Dinamica dei domini di attivazione
- Comportano unità ripetute (sticky) che aumentano la capacità di attivazione all’aumentare delle ripetizioni.
- GAL4 è un attivatore forte, costituito da aminoacidi acidi e idrofobici, interagisce dinamicamente con il mediatore.
- Interazioni dinamiche tra domini e proteine del mediatore favoriscono l'attivazione della trascrizione.
Esperimenti di trasfezione e analisi dell'attività promotoriale
- Uso di plasmidi per cotrasfettare luciferasi di lucciola e luciferasi di renilla per misurare l'attività trascrizionale.
- L'emissione di segnali luminosi a lunghezze d'onda specifiche permette il calcolo di rapporti quantificabili.
- Elementi di selezione come il gene Neo sono utilizzati per identificare cellule non transfettate.
Clonazione e analisi di enhancer
- Promotori sintetici possono essere utilizzati in esperimenti per analizzare attività specifiche.
- Sequenze responsabili per la regolazione della trascrizione vengono identificate tramite frammentazione e delezione di sequenze.
- Esonucleasi può generare delezioni casuali per studiare la funzionalità dei promotori.
Metodi di identificazione dei fattori di trascrizione
- Shoctando la trascrizione di geni in varie cellule, viene valutato il fattore di trascrizione e l'espressione specifica di tessuto.
- Software analitici confrontano e identificano fattori di trascrizione in 7000 sequenze.
Mutagenesi e legame proteina-DNA
- La mutagenesi avviene attraverso l’uso di primer modificate per alterare le sequenze di legame.
- La replicazione porta alla formazione di DNA non metilato che può essere selezionato tramite enzimi specifici.
- Ryanza assicura l’identificazione di sequenze critiche per l'attivazione genica negli adipociti.
EMSA
- L’Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) viene utilizzato per testare il legame tra fattori di trascrizione e sequenze target.
- Sequenze mutagenizzate possono rivelarsi critiche per il legame con i fattori di trascrizione identificati.
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
Questo quiz esplora i concetti fondamentali della regolazione dell'espressione genica. Discuteremo dei diversi tipi di RNA, tra cui RNA messaggero, RNA regolatori e RNA ribosomiale. Impara come i geni possono essere accesi o spenti in base alle necessità cellulari.