Biologia Molecolare: Trascrizione Eucariotica
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Questions and Answers

Qual è la funzione primaria della TBP (TATA-binding protein) nel processo di trascrizione?

  • Denaturare il DNA per iniziare la trascrizione
  • Riconoscere specificamente la TATA box (correct)
  • Stabilizzare il legame della polimerasi al DNA
  • Inibire l'attività di altri fattori trascrizionali

Qual è il ruolo del fattore generale della trascrizione TFII D?

  • Iniziare l'attivazione della trascrizione
  • Riconoscere il promotore tramite la TATA box (correct)
  • Creare la bolla di trascrizione a partire dal nucleotide +1
  • Stabilizzare il legame della TBP al DNA

Cosa accade quando TFII H si lega al complesso di pre-inizio?

  • Il DNA viene denaturato per creare la bolla di trascrizione (correct)
  • La polimerasi inizia la trascrizione immediatamente
  • Il complesso diventa inertato e non attiva
  • Viene impedito il legame di TFII B

Quale affermazione riguardante il processo di attivazione della trascrizione è corretta?

<p>Il legame di TFII B è stabilizzato da altri fattori generali (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il primo passo dell'attivazione della trascrizione?

<p>Il riconoscimento della TBP alla TATA box (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione degli enhancer e dei silencers nel contesto della trascrizione eucariotica?

<p>Legano molecole specifiche che agiscono a distanza sul promotore. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo della TATA box nella trascrizione eucariotica?

<p>Costituisce un sito ricco di adenina e timina fondamentale per il legame della polimerasi. (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa rappresenta il DNA looping in relazione al controllo della trascrizione?

<p>Una conformazione tridimensionale della cromatina che facilita controlli remoti. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è un elemento fondamentale per la formazione del complesso di preinizio nella trascrizione?

<p>Il reclutamento di tutti i fattori generali a ridosso del sito di inizio. (B)</p> Signup and view all the answers

I fattori di trascrizione agiscono principalmente per:

<p>Legarsi a specifiche sequenze distali nella cromatina. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è l'effetto della presenza di residui di prolina sulla struttura della coda dell'RNA polimerasi II?

<p>Causa un ripiegamento irregolare con angoli netti. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo di TFIIH nell'attivazione dell'RNA polimerasi II?

<p>Denatura il DNA e fosforila specifici amminoacidi. (C)</p> Signup and view all the answers

Perché la struttura peptidica con angoli acuti è considerata più antigenica?

<p>Perché la forma irregolare è più facilmente riconoscibile. (C)</p> Signup and view all the answers

Quali amminoacidi sono più facilmente fosforilabili dall'enzima TFIIH?

<p>Serina, treonina e tirosina. (B)</p> Signup and view all the answers

Quali processi di modificazione post-traduzionale sono associati all'RNA polimerasi II nelle cellule eucariotiche?

<p>Capping, splicing e poliadeninazione. (B)</p> Signup and view all the answers

Quale affermazione descrive correttamente l'azione del mediatore nella formazione di un complesso attivo?

<p>Interagisce con il CTD della Polimerasi II e stimola la sua fosforilazione. (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale di TFIIH durante il processo di trascrizione?

<p>Agire come una chinasi per fosforilare il CTD dell'RNA pol II. (D)</p> Signup and view all the answers

Perché la sequenza di aminoacidi presente sulla coda carbossiterminale dell'RNA pol II è considerata antigenica?

<p>Per la presenza di prolina che causa ripiegamenti nella struttura. (D)</p> Signup and view all the answers

Che ruolo ha la fosforilazione della coda carbossiterminale dell'RNA pol II?

<p>Consentire la dissociazione del mediatore dalla Polimerasi II. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la struttura caratteristica degli amminoacidi presenti nella coda carbossiterminale dell'RNA pol II?

<p>Una sequenza di sette amminoacidi che crea un zig-zag a causa della prolina. (A)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Regolazione distale della trascrizione

Controllo dell'attività trascrizionale di un gene da parte di elementi (enhancer e silencer) localizzati a grande distanza dal promotore.

DNA looping

Meccanismo strutturale del DNA che permette ai regolatori distali (enhancer e silencer) di interagire con il promotore, anche se molto distanti, portando alla conformazione tridimensionale della cromatina.

Promuotore eucariote

Sequenza di DNA a monte dell'inizio di un gene che funge da sito di attacco per i fattori di trascrizione e per l'RNA polimerasi.

Fattori generali della trascrizione

Proteine che si legano al promotore e reclutano l'RNA polimerasi, necessari all'inizio della trascrizione.

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Enhancer e silencers

Elementi di regolazione distale della trascrizione, che possono attivare (enhancer) o reprimere (silencers) l'attività dei geni.

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TATA box

Sequenza di DNA che segnala il punto di inizio della trascrizione.

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TFII D

Fattore generale della trascrizione che lega la TATA box.

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Bolletta di trascrizione

Apertura a doppia elica del DNA creata dai fattori generali per la trascrizione necessaria per l'avvio della trascrizione.

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TFII H

Fattore generale della trascrizione che denatura il DNA e attiva la trascrizione.

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Promotore

Sequenza di DNA che regola l'inizio della trascrizione.

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Coda C-terminale della RNA polimerasi II

La regione terminale della RNA polimerasi II che contiene una sequenza di 7 amminoacidi ripetuta, ricca di proline e fosforilabile. Questa regione è cruciale per l'attivazione della trascrizione.

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Proline nella coda C-terminale

I residui di prolina nella coda C-terminale della RNA polimerasi II causano ripiegamenti e angolature nella struttura, rendendola antigenica e riconoscibile da altre proteine.

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Antigenicità

La capacità di una molecola di essere riconosciuta dal sistema immunitario o da altre proteine, come ad esempio nel caso della coda C-terminale della RNA polimerasi II.

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Fosforilazione della coda C-terminale

Il processo di attivazione della RNA polimerasi II mediante l'aggiunta di gruppi fosfato alla coda C-terminale da parte della chinasi TFIIH.

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Coda C-terminale RNA Pol II

La porzione terminale della RNA polimerasi II, caratterizzata da una sequenza ripetuta di 7 amminoacidi (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser), ricca di proline e serine. Questa regione è altamente antigenica e funge da sito di fosforilazione per attivare la trascrizione.

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Antigenicità della coda C-terminale

La capacità della coda C-terminale della RNA polimerasi II di essere riconosciuta da altre proteine, come gli anticorpi, grazie alla sua struttura rigida e ripiegata.

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Ruolo del mediatore nella trascrizione

Il mediatore è una proteina che interagisce con TFIID per assemblare un complesso attivo che attiva la trascrizione. Il mediatore interagisce con la coda C-terminale della RNA polimerasi II e stimola la sua fosforilazione da parte di TFIIH, portando alla dissociazione del mediatore stesso.

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Study Notes

Biologia Molecolare - Trascrizione Eucariotica

  • Inizio Trascrizione: Un volontario illustra l'immagine del promotore eucariotico, evidenziando l'importanza degli elementi regolatori (silencers ed enhancers). Questi elementi influenzano la polimerasi tramite un mediatore, attivandola o disattivandola. A monte della TATA box, si trova un'altra sequenza a -35 basi. Regolazione tramite attivatori e repressori per replicazione. Il complesso due è la polimerasi.

Trascrizione Negli Eucarioti: Meccanismo

  • Regolazione Remota: La cromatina presenta regioni del genoma distanti dal promotore coinvolte nella regolazione dell'enzima trascrizionale (polimerasi), grazie al DNA looping. Questo controllo è possibile grazie alla conformazione tridimensionale della cromatina.

  • Regolazione Prossimale: Enhancers e silencers agiscono insieme a fattori di trascrizione, per regolazione tessuto-specifica o ubiquitaria.

  • Complessazione Pre-inizio: Fattori generali della trascrizione si legano al promotore, in prossimità del sito di inizio.

  • Formazione del Complesso di Pre-inizio: Attivazione del reclutamento dei fattori generali della trascrizione sul promotore. Il mediatore trasmette segnali positivi o negativi al complesso enzimatico per la trascrizione.

Inizio Trascrizione - Passaggi Chiave

  • Riconoscimento del Promotore: La TATA box è riconosciuta dalla TBP (TATA-binding protein), un fattore generale della trascrizione.
  • Legame TFII D: La TBP lega il DNA, creando la bolla di trascrizione ottimale.
  • Stabilizzazione del Legami: TFII B e altri fattori prevengono l'inibizione della trascrizione.
  • Legame della Polimerasi: La polimerasi si lega ai fattori generali in un punto preciso.
  • TFII H & Bolla Di Trascrizione: TFII H completa il legame, denatura il DNA e crea la bolla di trascrizione.

Fosforilazione della Coda Carbossi-Terminale (CTD) dell'RNA pol II

  • CTD (Coda Carbossi-terminale): Una sequenza presente solo nell'RNA polimerasi II, con 7 amminoacidi ripetuti. Questa sequenza è estremamente antigenica (riconoscibile) per le molecole circostanti.
  • Fosforilazione del CTD: TFIIH modifica la CTD, tramite fosforilazione, essenziale per lanciare il processo di trascrizione. Questo evento fa dissociare il mediatore dalla polimerasi, rendendo disponibile il promotore per altri cicli.

Allungamento

  • Meccanismo simile ai procarioti: Aggiunta di ribonucleotidi corrispondenti al filamento stampo, per estendere la catena dell'RNA.
  • Selezione Ribonucleotidi: La polimerasi distingue tra ribonucleotidi e desossiribonucleotidi, assicurando che solo ribonucleotidi siano integrati.
  • Rimodellamento della Cromatina: La cromatina interagisce con complessi proteici che influenzano la trascrizione. Il rimodellamento delle posizioni dei nucleosomi agevola il riconoscimento del DNA e quindi l'accessibilità.

Regolazione Epigenetica

  • Modifiche Post-Traduzionali: Alterazioni chimiche (acetilazione, fosforilazione, etc.) degli istoni influenzano l'accessibilità del DNA e quindi la trascrizione.
  • Regolazione a Lungo Termine: Le modifiche degli istoni modulano l'attività della polimerasi su un livello ereditabile.

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Description

Questo quiz esplora in dettaglio la trascrizione negli eucarioti, evidenziando il ruolo fondamentale degli elementi regolatori come silencers ed enhancers. Scoprirai come la cromatina e la strutturazione del DNA influenzano l'attività della polimerasi e la regolazione dell'espressione genica. Approfondisci le dinamiche della regolazione remota e prossimale nella trascrizione eucariotica.

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