Questions and Answers
Welche Aminosäure enthält anstelle von Schwefel Selen?
Was ist eine Besonderheit von Lysin und Arginin?
Was ist eine Funktion von Histidin?
Warum haben Asparaginsäure und Glutaminsäure einen sauren Charakter?
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Was sind Schwefelhaltige Aminosäuren?
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Wozu werden Aminosäuren benötigt?
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Wie viele proteinogene Aminosäuren gibt es?
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Wo wird Selenocystein gefunden?
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Welche der folgenden Enzyme wird im Magen exprimiert?
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Welche Form des Pepsins ist inaktiv?
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Wie wird die Autoaktivierung von Pepsin ausgelöst?
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Welche der folgenden Enzyme wird durch Enteropeptidase aktiviert?
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Wodurch wird die Aktivierung von Proteasen des Verdauungstraktes reguliert?
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Welche Funktion haben Pepsin und Pankreas-Proteasen?
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Welche der folgenden Enzyme wird nicht im Pankreas exprimiert?
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Wie werden die inaktiven Vorstufen von Proteasen des Verdauungstraktes bezeichnet?
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Wie viel Prozent des CO2-Transports im Plasma erfolgt als Bicarbonat?
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Was ist der Bohr-Effekt?
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Welche Bindung stabilisiert Deoxy-Hb und fördert O2-Abgabe?
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Was ist die Funktion von 2,3-BPG?
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Wie viel Prozent des CO2-Transports im Erythyrozyten erfolgt als Carbamino-Hb?
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Was ist ein allosterischer Effektor?
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Was passiert, wenn der pH-Wert sinkt?
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Wie viele Genmutationen sind bei Hämoglobinopathien bekannt?
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Woran hängt die Effizienz der Resorption von Eisen ab?
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Wie viel Eisen geht bei einer Entbindung verloren?
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Welche Blutwerte können bei Eisenmangel-Anämie verändert sein?
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Was ist ein Zeichen für Eisenmangel-Anämie?
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Was ist die Funktion von Bromodomänen in Proteinen?
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Was passiert bei Eisenmangel-Anämie mit den Eisenspeichern?
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Wie viele Gene enthält das menschliche Genom?
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Was bestimmt die zelluläre Identität im menschlichen Körper?
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Wofür wird Eisen im Körper benötigt?
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Was ist die Funktion von Promotoren in der Genregulation?
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Wie entstehen verschiedene Proteine aus einem Gen?
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Was ist die Funktion von Transkriptionsfaktoren?
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Was bedeutet der Begriff 'Spleißen' im Kontext der Genexpression?
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Was ist die Auswirkung von Umweltveränderungen auf die Genaktivität?
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Wie bindet der Pepsininhibitor an Pepsin?
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Aus welchen Aminosäuren besteht Glutathion?
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Was ist eine Eigenschaft von alpha-1-Antitrypsin?
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Was ist die Funktion von Glutathion im Körper?
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Was ist die Funktion des Proteasoms?
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Wie wird Glutathion-Disulfid regeneriert?
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Was ist Ubiquitin?
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Wie viele Enzymklassen gibt es für die Ubiquitin-Aktivierung?
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Was ist Heparin?
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Wie wirkt Heparin auf die Blutgerinnung?
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Wie werden Substrate vom Proteasom erkannt?
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Wozu wird Aussalzen verwendet?
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Wo befindet sich die proteolytische Aktivität im Proteasom?
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Wie wird Ubiquitin an ein Substrat übertragen?
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Wie viel Prozent der Proteine im Plasma werden in der Leber synthetisiert?
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Wie viel Prozent der Proteine im Plasma betragen?
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Was ist die Besonderheit von Glycin?
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Was passiert bei neuem pH-Wert mit dem Zwitterion einer Aminosäure?
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Welche Gruppe von Aminosäuren neigen dazu, miteinander zu assoziieren?
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Was ist eine Funktion von Aminosäuren?
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Wie viele Gruppen von Aminosäuren gibt es aufgrund chemischer Eigenschaften ihrer Seitenketten?
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Was ist eine Eigenschaft von Prolin?
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Was passiert bei Aminosäuren mit ungeladenen Seitenketten?
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Was ist eine Funktion von Aminosäuren im Körper?
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Welcher Pepsininhibitor bindet an Pepsin über Salzbrücken?
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Was ist eine Eigenschaft von alpha-1-Antitrypsin?
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Wie viele Enzymklassen gibt es für die Ubiquitin-Aktivierung?
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Was ist die Funktion des Proteasoms?
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Wie werden Substrate vom Proteasom erkannt?
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Was ist Ubiquitin?
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Wie wird Ubiquitin aktiviert?
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Was ist die Funktion von Ubiquitin-Ligase?
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Was ist der isoelektrische Punkt einer Aminosäure?
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Welche Aminosäure hat eine Ringstruktur ohne freie Aminogruppe?
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Wodurch wirken Aminosäuren als Puffer?
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Welche Aminosäure hat eine Schwefelhaltige Thioestergruppe?
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Wie viele proteinogene Aminosäuren gibt es?
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Welche Aminosäuren sind hydrophob?
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Warum neigen hydrophobe Aminosäuren dazu, miteinander zu assoziieren?
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Wie können Aminosäuren klassifiziert werden?
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Welches Antioxidans spielt eine wichtige Rolle in allen Zellen?
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Was wird benötigt, um Glutathion-Disulfid zu regenerieren?
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Welches Enzym enthält Selenocystein?
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Wie viel Prozent des Blutvolumens besteht aus Plasma?
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Was ist die Funktion von Heparin?
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Wie wird Glutathion chemisch beschrieben?
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Was ist die Funktion von Polykation Protamin?
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Wo werden die meisten Plasmaproteine synthetisiert?
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Study Notes
Aminosäuren
- Selenocystein: enthält Selen statt Schwefel
- Positiv geladene Aminosäuren:
- Lysin (Lys/K): basisch, kann posttranslational modifiziert werden (Acetylierung, Methylierung)
- Arginin (Arg/R): basisch, kann posttranslational modifiziert werden (Acetylierung, Methylierung)
- Histidin (His/H): teilweise protoniert bei physiologischem pH-Wert, gute Pufferfähigkeit, bindet oft an Metallionen
- Negativ geladene Aminosäuren:
- Asparaginsäure (Asp/D): sauer, verliert leicht ein Proton, bildet Anionen (Aspartat) -> saurer Charakter
- Glutaminsäure (Glu/E): sauer, verliert leicht ein Proton, bildet Anionen (Glutamat) -> saurer Charakter
Aufgaben von Aminosäuren
- Energiegewinnung: Beitrag zum Energiestoffwechsel
- Synthese von N-haltigen Molekülen:
- Basen der Nucleinsäuren
- fast alle Neurotransmitter
- Häm des Hämoglobins
- Proteinogene Aminosäuren: 20/21 Aminosäuren, die bei der Proteinbiosynthese als Proteinbausteine zum Einsatz kommen
Proteasen des Verdauungstrakts
- Funktion: Pepsin und Pankreas-Proteasen spalten ihre Substrate nahezu un spezifisch und komplett -> vollständige Proteolyse
- Regulation: Aktivierung erfolgt durch limitierte Proteolyse durch Abspaltung von Peptiden aus inaktiven Vorstufen (=Zymogene)
- Aktivierung: autokatalytisch (Pepsin, Trypsin) oder durch andere Proteasen (z.B. Endopeptidasen)
Transport von CO2
- CO2-Bindung stabilisiert die Deoxy-Hb-Form -> erleichtert die Freisetzung von O2
- CO2 ist ein allosterischer Effektor
- CO2-Transport im Plasma: ~10% in physikalischer Lösung, ~50% als Bicarbonat
- CO2-Transport im Ery: ~15% als Carbamino-Hb, ~25% als Bicarbonat
Hämoglobin
- Bohr-Effekt: Abhängigkeit zwischen der O2-Bindungsaффinität von Hämoglobin und dem Säuredruck der Umgebung (H+ und CO2)
- Der Bohr-Effekt und die kooperative Bindung von O2 machen Hb zum idealen Sauerstofftransporter
Hämoglobinopathien
- zählen zu den häufigsten Erbkrankheiten -> mehr als 1000 Genmutationen bekannt
Eisenmangel
- Diagnostik:
- MCH - Mean Corpuscular Hemoglobin
- Hk - Anteil der Erys am Blutvolumen
- MCV - Mean Corpuscular Volume
- MCHC - Mean Corpuscular Hb Concentration
- Serum-Eisen
- Transferrin
- Transferrinbeladung
- Serumferritin
- Symptome: mikrozytäre, hypochrome Eisenmangel-Anämie (Erys klein, zentrale Hb-arme blasse Zone)
Gene und Genexpression
- Die versch. Zelltypen in unserem Körper entstehen durch ein differenziertes Ablesen des Genoms und insbesondere der Proteinkodierenden Gene
- Zelluläre Identität ergibt sich aus:
- genetischer Vielfalt
- selektivem Auslesen unseres Genoms
- Aufrechterhalten der genetischen Programme
- zellulärer Plastizität
- Genregulation:
- Transkription ist regulierbar
- die meisten Gene in einer Zelle sind inaktiv
- es erfolgt selektive Transkription und Translation
- epigenetisches Ein/Ausschalten von Genen
- Umweltveränderungen ändern die Genaktivität
Protease-Inhibitoren
- Pepsininhibitor: Spaltprodukt von Pepsinogen, bindet an Pepsin über Salzbrücken bei neutralem pH
- Pankreas-Trypsininhibitor: Substrat-Analogon mit hoher Affinität für Trypsin
- alpha-1-Antitrypsin (Serpin): bindet an Trypsin und Elastase, kovalente und irreversible Bindung, starke Konformationsänderung
Proteasom
- intrazelluläre Abbaumaschinerie
- Kompartiment-ähnlicher multimerer Komplex: 20S (zylindrische Tonne) und 19S (regulierbarer Deckel)
- nur beta-Einheiten sind proteolytisch aktiv mit Chymotrypsin-ähnlicher, Trypsin-ähnlicher und PGPH-Aktivität
Ubiquitin
- hochkonserviertes 76 AS Protein, ubiquitär in allen eukaryotischen Zellen
- globuläre, stabile Proteinstruktur (ubiquitin-fold)
- kovalente Verknüpfung über C-terminale Gly-Seitenkette an das Substrat
- Ubiquitin wird über eine Enzym-Kaskade aktiviert: E1 (ATP-abhängige Aktivierung), E2 (Übertragung), E3 (Substratbindung)
Glutathion
- atypisches Tripeptid: Glutamat — Cystein — Glycin
- Cystein kann Disulfidbrücken bilden, Glutamat ist über eine Isopeptidbindung mit Cystein verbunden
- Funktionen: wichtiges Antioxidans, wichtiger Schutz vor O2-Radikalen, wichtig bei Entgiftungsreaktionen
Praktikum II
Versuch 1: Bestimmung des Hämatokrit
- Männer: 42-52%, Frauen: 37-47%
- Heparin: Mucopolysaccharid, stark negativ geladenes Polyanion, gerinnungshemmend, hemmt indirekt II, X, IX, XI, XII und direkt Thrombin
Versuch 2: Anreicherung der gamma Globuline durch Aussalzen
- Aussalzen: Salzionen konkurrieren um Hydratisierung durch Wasserionen, spezifische Ladung ist für Salzionen höher als für Proteine
- Löslichkeit ist von Struktur der Proteine und der Salzkonzentration der Lösung abhängig, Fällung ist reversibel
Versuch 3: Quantitative Proteinbestimmung
- Plasma des Blutes: 7,5 g/dl Proteine, die meisten Plasmaproteine werden in der Leber synthetisiert
- AS sind in Lösung bei neutralem pH-Wert vorwiegend ionisiert, dipolares Zwitterion: NH3+ und COO-
Aminosäuren
- Klassifizierung in 4 Gruppen: hydrophobe AS, polare AS, positiv geladene AS, negativ geladene AS
- Hydrophobe AS: Glycin, Alanin, Prolin, Valin, Leucin, Isoleucin, Methionin, neigen zu Assoziation und bilden kompakte Strukturen mit wenig Zwischenräumen
Protease-Inhibitoren
- Pepsininhibitor: Spaltprodukt von Pepsinogen, bindet an Pepsin über Salzbrücken bei neutralem pH
- Pankreas-Trypsininhibitor: Substrat-Analogon mit hoher Affinität für Trypsin
- alpha-1-Antitrypsin (Serpin): bindet an Trypsin und Elastase, kovalente und irreversible Bindung, starke Konformationsänderung
Proteasom
- intrazelluläre Abbaumaschinerie
- besteht aus:
- 20S (core): 2 Ringe mit je 7 alpha-Untereinheiten, 2 Ringe mit je 7 beta-Untereinheiten, nur beta-Einheiten sind proteolytisch aktiv
- 19S (lid): regulatorischer Deckel, Erkennung von Substanzen, Protein-Entfaltungsenzyme (ATPasen)
Ubiquitin
- hochkonserviertes 76 AS Protein
- in allen eukaryotischen Zellen (ubiquitär)
- globuläre, stabile Proteinstruktur (ubiquitin-fold)
- 3 AS-Unterschiede zwischen Mensch und Hefe
- kovalente Verknüpfung über C-terminale Gly-Seitenkette an das Substrat
- Aktivierung durch Enzym-Kaskade:
- Enzym 1: ATP-abhängige Aktivierung
- Enzym 2: Übertragung (Konjugation)
- Enzym 3: Substratbindung (Ligation)
Glutathion
- atypisches Tripeptid aus Glutamat, Cystein und Glycin
- Cystein kann durch SH-Gruppe Disulfidbrücke bilden
- Glutamat ist über eine Isopeptidbindung mit Cystein verbunden
- Funktionen:
- wichtiges Antioxidans in allen Zellen
- wichtigster Schutz vor O2-Radikalen in Erythrozyten
- wichtig bei Entgiftungsreaktionen
- Regeneration durch Glutathion-Reduktase, benötigt NADPH als Elektronendonator
Praktikum II
Versuch 1
- Bestimmung des Hämatokrit
- Männer: 42 - 52%, Frauen: 37 - 47%
- Heparin: Mucopolysaccharid, extrem negativ geladenes Polyanion, gerinnungshemmend
Versuch 2
- Anreicherung von gamma Globulinen durch Aussalzen
- Aussalzen: Salzionen konkurrieren um Hydratisierung durch Wasserionen, spezifische Ladung ist für Salzionen höher als für Proteine
Versuch 3
- Quantitative Proteinbestimmung
- Plasma des Blutes: 7,5 g/dl Proteine
- Die meisten Plasmaproteine werden in der Leber synthetisiert (außer Immunglobuline: Plasmazellen)
Aminosäuren
- AS sind in Lösung bei neutralem pH-Wert vorwiegend ionisiert
- dipolares Zwitterion: Aminogruppe ist protoniert (NH3+), Carboxylgruppe ist dissoziiert/deprotoniert (COO-)
- AS sind Ampholyte und wirken als Puffer
- der isoelektrische Punkt Ip einer Aminosäure ist der pH-Wert, an dem das Zwitterion keine Nettoladung mehr trägt
- Klassifizierung der 21 proteinogenen AS in 4 Gruppen:
- Hydrophobe AS mit einer nichtpolaren Seitenkette
- Polare AS mit einer neutralen Seitenkette
- Positiv geladene AS mit einer Seitenkette, die beim physiologischen pH-Wert eine positive Ladung trägt
- Negativ geladene AS mit einer Seitenkette, die beim physiologischen pH-Wert eine negative Ladung trägt
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Lernen Sie die Eigenschaften und posttranslationalen Modifikationen von Aminosäuren wie Selenocystein, Lysin, Arginin und Histidin kennen.