Diversité du Vivant_BA_L1_2024 Cours 4 (1) PDF
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Université de Poitiers
2024
Pr. Pierre Grève
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This document is a set of lecture notes focused on the diversity of living organisms. It's intended for university students in their first year of a life sciences program. The notes cover a range of topics, including various animal phyla, focusing on characteristics, evolutionary relationships, and examples of organisms within each group.
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≪ Diversite du Vivant 1 ≫ - Elements de cours – 2024 – 2025 Ce document n’est pas public. Il est destiné uniquement aux étudiant.e.s de l’UFR Sciences Fondamentales et Appliquées de l’université de Poitiers i...
≪ Diversite du Vivant 1 ≫ - Elements de cours – 2024 – 2025 Ce document n’est pas public. Il est destiné uniquement aux étudiant.e.s de l’UFR Sciences Fondamentales et Appliquées de l’université de Poitiers inscrits administrativement en L1 Sciences de la Vie portail SVT et Accès Santé ou L1 Sciences de la Terre portail SVT et Accès Santé et inscrits pédagogiquement à l’UE ≪ Diversité du Vivant 1 ≫ Pr. Pierre Grève Bâtiment B31 Laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions - UMR CNRS 7267 Equipe Ecologie Evolution Symbiose 3 Rue Jacques Fort TSA 51106 Tel. 05 49 45 39 79 email : [email protected] Les Euglénobiontes : a. rassemblent des algues et des parasites Vrai b. sont pour certains photosynthétiques Vrai (Euglène) c. sont pour certains parasites Vrai (Leishmania…) d. sont pour certains véhiculés par un insecte Vrai (Rhodnius…) piqueur e. Aucune des propositions précédentes n'est juste Faux Les Trypanosomes : a. sont photosynthétiques Faux b. sont des Actinopodes Faux c. sont des Euglénobiontes Vrai d. ont une ciliature présente sur toute la surface Faux membranaire e. Aucune des propositions précédentes n'est juste Faux Naegleria fowleri : a. est un organisme de type amibien pouvant passer faux à une forme pluricellulaire b. est un organisme de type amibien pouvant passer Vrai (Percolozoaires) à une forme flagellée c. est photosensible Faux d. est un parasite Vrai e. Aucune des propositions précédentes n'est juste Faux 2 Les Métamonadines : a. possèdent tous des mitochondries Faux b. n’ont pas de mitochondrie Vrai c. peuvent être parasite Vrai (ou commensaux) d. n’ont pas de flagelle Faux (4 flagelles) e. Aucune des propositions précédentes n'est juste Faux Les Rhizopodes : a. se nourrissent par phagocytose Vrai b. ne sont jamais parasites Faux (Entamoeba) c. possèdent parfois une thèque protectrice Vrai d. ont une ciliature présente sur toute la surface Faux membranaire e. Aucune des propositions précédentes n'est juste Faux Les protistes amitochondriaux : a. ont tous des chloroplastes Faux b. sont les premières lignées à émerger dans l’arbre Faux des Eucaryotes c. sont paraphylétiques Vrai d. possèdent parfois des structures vestiges de Vrai (mitosomes ou mitochondries Hydrogénosomes) e. Aucune des propositions précédentes n'est juste Faux 3 Les Métazoaires Ils sont issus d’une cellule œuf 4 Les Métazoaires Ils sont issus d’une cellule œuf Animaux pluricellulaires Placozoaires et éponges : pas de « vrais » tissus Tissus (cellules liées par du collagène) : Eumétazoaires 5 Spongiaires 10 000 Métazoaires Placozoaires 1 211 612 Cnidaires Eumétazoaires 9000 Cténophores 100 Protostomiens 1 132 930 Bilatériens Deutérostomiens Échinodermes 58 331 6 000 Lophotrochozoaires Cuticulates Hémichordés 85 Eutrochozoaires Lophophorates 52 246 Chordés Ecdysozoaires Plathelminthes 13 780 Nématodes Urochordés Euarthropodes 20 000 Annélides 956 414 1 300 14 360 Mollusques Céphalochordés … 117 495 13 Rotifères Mandibulates Chélicérates Acanthocéphales (ou Antennates) 880 964 74 450 Crâniates Myriapodes 51 066 10 050 Myxinoïdes Pancrustacés Arachnides Mérostomes 22 868 914 74 445 5 Vertébrés 50 911 Insectes 830 075 Crustacés 37 885 6 … Choano-organismes 8000 Démosponges Métazoaires Placozoaires 1 (Éponge de toilette) Éponges 1000 Myxozoaires 1200 (Asconema, Hyalonema) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 (béroé, ceinture de vénus) Éponges calcaires 1000 Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Hydrozoaires (hydre, obélie, physalie) Scyphozoaires Anthozoaires Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 50 58 331 Mésozoaires 7 Les Placozoaires Trichoplax adhaerens (jusqu’à 8 espèces?) Ne contient pas de tissu : 2 couches de cellules Déplacement par battements ciliaires cod, cov: couche dorsale, ventrale cef: cellule fibre 2mm ceg: cellule glandulaire mic: microvillosités 8 Les Placozoaires Nutrition par exodigestion dans une cavité transitoire Reproduction asexuée (fission ou bourgeonnement) et reproduction sexuée 9 … Choano-organismes 8000 Démosponges Métazoaires Placozoaires 1 (Éponge de toilette) Éponges 1000 Myxozoaires 1200 hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 (béroé, ceinture de vénus) Éponges calcaires 1000 Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Hydrozoaires Scyphozoaires Anthozoaires Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 50 58 331 Mésozoaires 10 Les Spongiaires Ancien groupe des Porifères Deux feuillets embryonnaires (diploblastiques), pas de véritable tissu Pas de symétrie, pas de système nerveux, pas de tube digestif Symbiotes et commensaux très nombreux Phylogénie basée sur l’ARN 18S : groupe paraphylétique 11 Les Spongiaires Spicules siliceux ou calcaires, présents dans la mésoglée, sorte de gelée comportant parfois des cellules nerveuses ou musculaires Présence de choanocytes 12 Les Spongiaires 13 Les Spongiaires https://www.youtube.com/watch?v=pTZ211cIjX8 https://www.youtube.com/watch?v=8ueKlShb9Ls 14 Les Spongiaires Les démosponges Spicules siliceux à 1-4 pointes Présence de spongine : forme de collagène structuré en larges fibres Euspongia officinalis 15 Les Spongiaires Les hexactinellides Spicules siliceux à 6 pointes Strictement marines Commune dans les eaux profondes Euplectella aspergillum (l’éponge de verre ou le panier de Vénus) 16 Les Spongiaires Les éponges calcaires Spicules calcaires Éponges strictement marines 17 … Choano-organismes 8000 Démosponges Métazoaires Placozoaires 1 (Éponge de toilette) Éponges 1000 Myxozoaires 1200 (Asconema, Hyalonema) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 (béroé, ceinture de vénus) Éponges calcaires 1000 Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Hydrozoaires Scyphozoaires Anthozoaires Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 50 58 331 Mésozoaires 18 Les Eumétazoaires Système nerveux : présence de synapses chimiques Différenciation cellulaire complexe (cellules musculaires, nerveuses, sensorielles) Cavité digestive différenciée Véritables feuillets embryonnaires (cellules liées par du collagène) 19 … Choano-organismes 8000 Démosponges Métazoaires Placozoaires 1 (Éponge de toilette) Éponges 1000 Myxozoaires 1200 (Asconema, Hyalonema) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 (béroé, ceinture de vénus) Éponges calcaires 1000 Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Hydrozoaires Scyphozoaires Anthozoaires Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 50 58 331 Mésozoaires 20 Les Cténophores Organismes marins prédateurs (quelques centimètres) à symétrie biradiaire, hermaphrodites, diploblastiques Animaux du zooplancton (macroplancton), pélagique 8 palettes natatoires ciliées, présence de colloblastes 21 https://www.youtube.com/watch?v=eDS_NMrPPKc … Choano-organismes 8000 Desmosponges Métazoaires Placozoaires 1 (Éponge de toilette) Éponges 1000 Myxozoaires 1200 (Asconema, Hyalonema) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 (béroé, ceinture de vénus) Éponges calcaires 1000 Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Hydrozoaires Scyphozoaires Anthozoaires Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 50 58 331 Mésozoaires 22 Les Cnidaires Groupe des hydres, anémones, coraux, méduses Diploblastiques, à symétrie radiaire (tentacules) Larve typique: larve planula Pas d’appareil circulatoire Pas d’appareil excréteur https://www.youtube.com/watch?v=HZIl16ttenY 23 Cycle de vie des Cnidaires Scyphozoaires: Larve planula Les autres Aurelia sp ectoderme mésoglée endoderme archentéron Hydrozoaires: Obelia sp Cycle Polypede vieméduses avec d’un polype en Gonade développement Méduse RAS RS RS RAS Zygote Planula 24 Les Cnidaires Cnidocyte (cnidoblaste): cellule urticante servant à l’attaque et à la défense Cnidocil Tube cnidocyste = nématocyste L’ensemble Noyau = cnidocyte 25 Les Cnidaires Hydrozoaires : coloniales Hydra sp. Scyphozoaires : pélagiques Aurelia Physalia aurita physalis Anthozoaires : coloniales Actinia Corallium equina rubrum 26 Actinia fragacea … Choano-organismes Desmosponges Placozoaires 8000 Métazoaires 1 (Trichoplax adhaerens) 1000 Myxozoaires 1200 Éponges - Symétrie bilatérale (2 axes de polarité) (parasites microscopiques) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 - Tube digestif complet - Apparition d’un 3éme feuillet embryonnaire (triploblastiques) (béroé, ceinture de vénus) 1000 Éponges calcaires - Système nerveux central et céphalisation Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 58 331 Axe antéro- postérieur 27 … Choano-organismes Desmosponges Placozoaires 8000 Métazoaires 1 (Éponge de toilette) (Trichoplax adhaerens) 1000 Myxozoaires 1200 Éponges - Symétrie bilatérale (2 axes de polarité) (parasites microscopiques) (Asconema, Hyalonema) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 - Tube digestif complet - Apparition d’un 3éme feuillet embryonnaire (triploblastiques) (béroé, ceinture de vénus) 1000 Éponges calcaires - Système nerveux central et céphalisation Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 58 331 - Le blastopore correspond à la bouche, - Le blastopore correspond à l’anus, la l’anus étant formé simultanément ou bouche étant formée secondairement secondairement - Le système nerveux est - Le système nerveux est ventral - dorsal (épineuriens) ou (hyponeuriens) - diffus (épithélioneuriens) 28 Protostomiens 100 Chaetognathes Lophotrochozoaires Cuticulates Ecdysozoaires Cuticule Mue de 430 croissance Lophophorates Eutrochozoaires Gastrotriches Lophophore Larve trochophore 4 500 Ectoproctes 1150 Phoronozoaires Syndermates Acanthocéphales 1800 335 15 Rotifères Brachiopodes Phoronidiens Couronne de cils autour de la bouche Couronne de cils autour de la bouche 900 Spiraliens Parenchymiens Némertes 13 780 Plathelminthes 14 360 117 495 150 320 Entoproctes Siponcles Annélides Mollusques Planaires/parasites Système circulatoire clos Manteau - 29 Métamérie Radula Les Lophotrochozoaires = un groupe monophylétique Ils possèdent : - soit un Lophophore = couronne de tentacule entourant la bouche => Lophophorates Brachiopodes Lophophore Bouche Brachiopodes 30 Les Lophotrochozoaires = un groupe monophylétique Ils possèdent : - soit une larve trochophore => Eutrochozoaires Bouche Bande de cil Anus Eutrochozoaires : - rotifères - plathelminthes - mollusques - annélides 31 Les rotifères Etymo : Lat. rota (roue) et fere (porter) Couronne de cils Vie planctonique en eau douce Glande adhésive 32 https://www.youtube.com/watch?v=hhJ53cItIKM Les plathelminthes Etymo : Gr. platus (large, plat), helmins (ver) Acoelomates Tube digestif aveugle Turbellariés Formes libres Trématodes Cestodes Planaire Tous parasites Monogènes Douve du foie Schistosomes Cestode 33 Les mollusques Etymo : mollis (mou) Caractères dérivés propres : - tégument spécialisé = manteau => sécrète des formations calcaires : spicule, plaque ou coquille - structure buccale chitineuse = radula https://www.youtube.com/watch?v=zcPepiUcOAw 34 Les mollusques Escargot Moule Poulpe Gastéropodes Lamellibranches Céphalopodes Lièvre de mer Nautilus Gastéropodes Céphalopodes 35 Les annélides Caractères dérivés propres : - seuls protostomiens à système circulatoire clos (avec les céphalopodes) - les organes ne baignent pas directement dans l’hémolymphe Vaisseau dorsal Vaisseau ventral - métamérie visible même au stade larvaire 36 Les annélides Vers de terre Un tégument s Nereis Arénicoles Polychètes Oligochètes Sangsues 37 Protostomiens Lophotrochozoaires Cuticulates Ecdysozoaires Cuticule - mue Mue de croissance Lophophorates Eutrochozoaires Lophophore Larve trochophore 1150 Syndermates Acanthocéphales 1800 335 Rotifères Brachiopodes Spiraliens Parenchymiens 13 780 Plathelminthes 14 360 117 495 Planaires/parasites Annélides Mollusques Système circulatoire clos Manteau - radula Métamérie 38 … Cuticulates Ecdysozoaires 20 500 Panarthropodes Introvertés Céphalorhynches 80 Onychophores Nématozoaires 600 Tardigrades Perte de la chitine cuticulaire 956 414 Euarthropodes… Appendices articulés 20 000 325 Exosquelette subdivisé en sclérites Nématodes Nématomorphes Gordius sp. Pseudocoelomates Oxyure 39 Caenorhabditis elegans … Panarthropodes Chélicériformes Euarthropodes 10 050 Chélicérates Mandibulates Myriapodes 5 74 445 Mérostomes Arachnides 868 914 15 214 Pancrustacés 830 075 Hexapodes Maxillopodes 22 671 Malacostracés 5650 9 Ostracodes 900 Cirripèdes Céphalocarides 10 Mystacocarides Ascothoracidés 11 Rémipèdes 8405 Acrothoraciques Copépodes 150 Rhizocéphales 934 Branchioures Branchiopodes 4 Tantulocarides Thoraciques 95 Pentastomides 40 … Panarthropodes Chélicériformes Euarthropodes 10 050 Chélicérates Mandibulates Myriapodes Prosome/Opisthosome – chélicères - Mandibules Une paire de pédipalpes - 4 paires de pattes marcheuses Antennes pattes / segment 5 74 445 Mérostomes Arachnides 868 914 15 214 Pancrustacés 830 075 Hexapodes Maxillopodes larve nauplius (sauf insectes) Trois paires de pattes 22 671 Malacostracés Céphalo-thorax, abdomen 934 Branchiopodes 41 Les mandibulates ou antennates = un groupe monophylétique Antennes Mandibules Caractéres dérivés propres : - Mandibules - Antennes 42 Les myriapodes = un groupe monophylétique Scolopendre = Chilopodes Iule = Scutigères = Prédateurs diplopodes Chilopodes Herbivores Prédateurs 43 Les pancrustacés = un groupe monophylétique Insectes et « crustacés » = pancrustacés Crustacés ont une larve nauplius 44 Les « crustacés » = un groupe paraphylétique ? Cyclops Crabe Cloporte Pagure Anatife = Bernard l'Hermite Balane 45 Les hexapodes = un groupe monophylétique Caractéres dérivés propres - 3 paires de pattes 46 Les hexapodes = un groupe monophylétique Fourmis = Hyménoptères (à Glossine= Diptères membrane) Mante, termites, blattes = Dictyoptères (en filet) Criquet = Papillon = Orthoptères Lépidoptères (droites) (ailes à écailles) Scarabée = 47 Coléoptères (cachées) … Choano-organismes Desmosponges Placozoaires 8000 Métazoaires 1 (Éponge de toilette) (Trichoplax adhaerens) 1000 Myxozoaires 1200 Éponges - Symétrie bilatérale (2 axes de polarité) (parasites microscopiques) (Asconema, Hyalonema) hexactinellides Eumétazoaires Cténophores 100 - Tube digestif complet - Apparition d’un 3éme feuillet embryonnaire (triploblastiques) (béroé, ceinture de vénus) 1000 Éponges calcaires - Système nerveux central et céphalisation Cnidaires 9000 (Sycon, Leucosolenia) Bilatériens Protostomiens … Deutérostomiens … 1 132 930 58 331 - Le blastopore correspond à la bouche, - Le blastopore correspond à l’anus, la l’anus étant formé simultanément ou bouche étant formée secondairement secondairement - Le système nerveux est - Le système nerveux est ventral - dorsal (épineuriens) ou (hyponeuriens) - diffus (épithélioneuriens) 48 … Bilatériens 6 000 Deutérostomiens Échinodermes 52 331 Pharyngotrèmes 85 Chordés Hémichordés Urochordés Crâniates Céphalochordés Myxinoïdes22 Vertébrés Pétromyzontides 38 Gnathostomes Actinoptérygiens Sarcoptérygiens 846 Chondrichthyens Ostéichthyens 49 https://www.youtube.com/watch?v=qfehgjBQIgg … Bilatériens 6 000 Deutérostomiens Échinodermes - Larve nageuse à symétrie bilatérale - Squelette (externe) : avec cristaux de calcite - Acquisition d’une symétrie pentaradiée chez l’adulte Asterias sp. Diadema setosum Ophiura sp Cucumaria sp 50 … Bilatériens 6 000 Deutérostomiens Échinodermes 52 331 Pharyngotrèmes Chordés … voir TD1 51