SIMULACRO TEST TEMA 4E MÉTODOS EXTRACCIÓN  PURIFICACIÓN ACIDOS NUCLEICOS
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Questions and Answers

Con independencia del tipo de muestra utilizada para la extracción, es una técnica minuciosa, que involucra lisis de la célula ...:

  • Separación, purificación, precipitación, lavado y disolución (correct)
  • Separación, purificación, precipitación y disolución
  • Separación, purificación, lavado y disolución
  • Purificación, precipitación, lavado y disolución
  • En la extracción del ARN debe considerarse:

  • Todas ellas (correct)
  • Uso de guantes para impedir la degradación de la muestra con nucleasas provenientes del ambiente y sudor
  • El uso de material nuevo
  • Material estéril, libre de ADNsas y ARNsas
  • Durante la lisis celular se procede a la destrucción de las estructuras formadas por lípidos y proteínas permitiendo la liberación de los ácidos nucleicos del núcleo celular. La disgregación del tejido y su homogeneización se llevan a cabo en un buffer de lisis ...:

  • Que contiene sales, un detergente y proteinasa K, que libera el ADN de las histonas con las que se encuentra empaquetado y proteoliza proteínas celulares (correct)
  • Todas incorrectas
  • Que contiene sales, un detergente y anticoagulante (EDTA 0.1 M al 0.02% V/V), que libera el ADN de las histonas con las que se encuentra empaquetado y proteoliza proteínas celulares
  • Que contiene sales, y proteinasa K, que libera el ADN de las histonas con las que se encuentra empaquetado y proteoliza proteínas celulares
  • Tras la lisis celular y la eliminación de las proteínas de la muestra, se precipitan los ácidos nucleicos añadiendo................................. . Este método permite la obtención de ADN de gran pureza y presenta la ventaja de que las soluciones utilizadas son muy seguras para la salud del personal técnico que realiza la extracción:

    <p>Isopropanol o etanol</p> Signup and view all the answers

    En la extracción de ácidos nucleicos que involucra solventes orgánicos, una vez que estos últimos son añadidos se forman dos fases según el dibujo de arriba ... :

    <p>La fase fenólica, ubicada en la parte inferior de tubo, la cual contiene proteínas y lípidos. A su vez, la fase superior es la acuosa, donde se ubica el ADN o ARN, según sea el caso</p> Signup and view all the answers

    Para facilitar la precipitación también suelen añadirse cationes monovalentes... :

    <p>a la solución de ácidos nucleicos cargados negativamente, con el fin de generar sales insolubles en alcohol de fácil precipitación</p> Signup and view all the answers

    Señale la incorrecta:

    <p>Se prefiere disolver el ARN en aguadietil pirocarbonato (DEPC) al 1%, lo que evita cualquier interferencia de las sales de las soluciones amortiguadoras y lo preserva de las ADNsas</p> Signup and view all the answers

    La relación de las absorbancias .............................................. permite conocer si el ADN obtenido está contaminado por la presencia de compuestos aromáticos:

    <p>A260/A280</p> Signup and view all the answers

    Esta relación anterior es muy estable y en general se considera que el ADN es de calidad óptima cuando la relación anterior es mayor de:

    <p>1,8</p> Signup and view all the answers

    Cuándo se considera que la muestra está contaminada por proteínas o fenoles:

    <p>Si la anterior relación es &lt; 1,6</p> Signup and view all the answers

    Señale la falsa respecto a la integridad del ADN. :

    <p>Si una muestra es íntegra presentará una banda de ADN única perfectamente definida en la parte inferior del gel de agarosa</p> Signup and view all the answers

    Extracción de ADN genómico mediante precipitación por sales, un reactivo indicado no es necesario:

    <p>Buffer fosfato a pH 2</p> Signup and view all the answers

    Extracción de ADN genómico mediante método de extracción de ADN con solventes orgánicos, se emplean habitualmente:

    <p>Fenol y cloroformo</p> Signup and view all the answers

    El principio de extracción en columna de sílice se basa en la capacidad de adsorción de los ácidos nucleicos en una columna de sílice ante la presencia de altas concentraciones de sales caotrópicas, entre ellas se encuentran:

    <p>Todas correctas</p> Signup and view all the answers

    Los contaminantes de la muestra, en la extracción en columna de sílice, son eliminados con posteriores lavados de la columna y finalmente el ADN es eluído con H20 o un tampón de resuspensión ...:

    <p>De baja fuerza iónica a pH neutro o ligeramente alcalino</p> Signup and view all the answers

    Método de purificación por unión a microesferas magnéticas, señale la correcta:

    <p>Este método utiliza esferas magnéticas cuya superficie está recubierta con polímeros naturales o sintéticos que presentan una alta afinidad por los ácidos nucleicos</p> Signup and view all the answers

    En la metodología anterior, el rendimiento obtenido para muestras de sangre total se sitúa en un rango de entre ................................... ADN/ ml de sangre:

    <p>25 y 33 µg</p> Signup and view all the answers

    En la extracción de ARN, la resina consiste en cuentas de sílica con superficie hidrofílica con tamaño de partícula reducido, hechas con cantidades elevadas de grupos dietilaminoetil (DEAE). La purificación se basa en la interacción de estos grupos DEAE cargados ...:

    <p>positivamente con los grupos fosfatos (cargados negativamente) del ARN</p> Signup and view all the answers

    Es muy importante tomar precauciones para evitar la contaminación con ARNsas exógenas, por ejemplo, tratar el agua y soluciones salinas con inhibidores de ARNsas, como el DEPC al ....:

    <p>0,1 %</p> Signup and view all the answers

    posteriormente el ARN ea purificado a partir de la fase acuosa mediante precipitación a baja temperatura con isopropanol- centrifugación....simililar como se hace con ADN

    <p>Posteriormente, el ARN es purificado a partir de la fase orgánica mediante precipitación a alta temperatura con isopropanol y con ayuda de una centrifugación de manera similar a como se hace con ADN.</p> Signup and view all the answers

    La Cromatografía por exclusión de tamaño se fundamenta en la separación de ácidos nucleicos de acuerdo con su peso molecular, empleando una columna empaquetada con una matriz de gel conformada por partículas poliméricas orgánicas o de sílice; ambos materiales, mecánica y químicamente estables y con un contenido bajo en grupos iónicos, originan una red de poros hidrofílicos uniformes. Indique la falsa:

    <p>Las moléculas de menor tamaño penetrarán en los poros del polímero, por lo que migran más rápidamente que las de gran tamaño</p> Signup and view all the answers

    Una técnica muy empleada en la purificación de AANN es la extracción por gradientes de densidad de:

    <p>CsCl</p> Signup and view all the answers

    Teniendo en cuenta que cada molécula absorbe la luz a una longitud de onda específica (los ácidos nucleicos a ........................... nm), es posible calcular su concentración en una muestra:

    <p>260 nm</p> Signup and view all the answers

    Con arreglo a la ley de Lambert-Beer, existe una relación lineal entre la absorbancia A y la concentración de la molécula de AANN, conforme a la siguiente ecuación:

    <p>A = ε x l x c</p> Signup and view all the answers

    Se mide la absorbancia de la muestra con un aparato llamado espectrofotómetro. El aparato funciona conforme a un principio sencillo: se irradia una muestra con una radiación luminosa de longitud de onda conocida y se mide la energía luminosa . .................................. con una célula fotoeléctrica situada detrás de la muestra:

    <p>Transmitida</p> Signup and view all the answers

    Indique la falsa:

    <p>La luz será absorbida de manera inversamente proporcional de acuerdo a la concentración de la muestra</p> Signup and view all the answers

    Se dispone de un stock de ADN, y usted lo diluye serialmente en una solución buffer de fosfato de sodio dibásico a pH 5,2. El stock original es de 300 uM de ADN, y se diluye primeramente 1:20, y posteriormente de la solución así obtenida, se toman 10 uL y se mezclan con 90 uL frescos del buffer indicado, qué concentración final de ADN tenemos? b (300/20 = 15 uM. Después se toman de la solución de 15 uM 10 uL en 100 uL totales (10+90), es decir se diluye 1/10, así que finalmente tenemos 15/10 = 1,5 uM ADN)

    <p>1,5 uM</p> Signup and view all the answers

    El índice que indica contaminación por fenol es:

    <p>260/270</p> Signup and view all the answers

    Señale la incorrecta acerca de la fluorimetría:

    <p>Esta metodología se basa en la unión específica de colorantes fluorescentes al ácido nucleico, que absorbe luz de una determinada longitud de onda y emite luz de una longitud de onda superior (de menor energía). La relación entre la concentración del ácido nucleico y la intensidad de emisión fluorescente es inversamente proporcional</p> Signup and view all the answers

    Para la cuantificación de ARN, se realiza un pretratamiento con ADNsas, y suele emplearse RiboGreen, un colorante que absorbe a ...:

    <p>~500 nm y emitir a ~525 nm</p> Signup and view all the answers

    En la figura anterior se considera que la muestra de ADN íntegra es:

    <p>1</p> Signup and view all the answers

    En la figura anterior, se considera que la muestra de ARN íntegra es:

    <p>4</p> Signup and view all the answers

    En este caso en lugar de ser un material poroso lo que dificulta la movilidad de los ácidos nucleicos es una corriente de cargas que arrastra la muestra o fuerza electroendosmótica, hablamos de la técnica ....:

    <p>Electroforesis capilar</p> Signup and view all the answers

    Los plásmidos son moléculas de....:

    <p>Todas ellas</p> Signup and view all the answers

    Un tamaño clásico y aproximado, como ejemplo, en un plásmido es:

    <p>5800 pb</p> Signup and view all the answers

    Existen muchos plásmidos disponibles para usar con este fin y la mayoría contienen al menos los siguientes elementos:

    <p>Un origen de replicación autónomo para E. coli</p> Signup and view all the answers

    En la purificación de ADN plasmídico, qué solución se emplea:

    <p>Todas las anteriores</p> Signup and view all the answers

    Para el estudio del plásmido purificado, se emplea electroforesis en gel de agarosa al.....:

    <p>1 %</p> Signup and view all the answers

    Las células se someten a un tratamiento para ser transformadas por AFN presente en el medio externo, las células así tratadas reciben el nombre de:

    <p>Competentes</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué son las endonucleasas de restricción?

    <p>Enzimas que reconocen secuencias específicas de ADN de doble cadena y cortan ambas hebras de la molécula originando fragmentos con extremos romos o cohesivos</p> Signup and view all the answers

    En el procedimiento de digestión con endonucleasas de restricción, se añade la mezcla enzimática ....:

    <p>Agua, buffer y enzimas en proporción 7:2:1, respectivamente</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Técnicas de Extracción de Ácidos Nucleicos

    • La extracción de ácidos nucleicos es una técnica minuciosa que involucra lisis de célula y liberación de los ácidos nucleicos del núcleo celular.
    • Durante la lisis celular, se destruyen las estructuras formadas por lípidos y proteínas, permitiendo la liberación de los ácidos nucleicos.

    Lisis Celular y Precipitación de Ácidos Nucleicos

    • La disgregación del tejido y su homogeneización se llevan a cabo en un buffer de lisis.
    • Tras la lisis celular y la eliminación de las proteínas de la muestra, se precipitan los ácidos nucleicos añadiendo un reactivo.

    Precipitación con Solventes Orgánicos

    • En la extracción de ácidos nucleicos que involucra solventes orgánicos, se forman dos fases y se precipitan los ácidos nucleicos.
    • Para facilitar la precipitación, también suelen añadirse cationes monovalentes.

    Calidad del ADN

    • La relación de las absorbancias permite conocer si el ADN obtenido está contaminado por la presencia de compuestos aromáticos.
    • La relación anterior es muy estable y en general se considera que el ADN es de calidad óptima cuando la relación es mayor de 1,8.

    Extracción de ADN Genómico

    • La extracción de ADN genómico mediante precipitación por sales no requiere un reactivo indicado.
    • La extracción de ADN genómico mediante método de extracción de ADN con solventes orgánicos se emplea habitualmente.

    Extracción en Columna de Sílice

    • El principio de extracción en columna de sílice se basa en la capacidad de adsorción de los ácidos nucleicos en una columna de sílice ante la presencia de altas concentraciones de sales caotrópicas.
    • Los contaminantes de la muestra son eliminados con posteriores lavados de la columna y finalmente el ADN es eluído con H2O o un tampón de resuspensión.

    Métodos de Purificación

    • La purificación por unión a microesferas magnéticas permite la obtención de ADN de gran pureza.
    • La Cromatografía por exclusión de tamaño se fundamenta en la separación de ácidos nucleicos según su peso molecular, empleando una columna empaquetada con una matriz de gel.

    Extracción de ARN

    • En la extracción de ARN, la resina consiste en cuentas de sílica con superficie hidrofílica con tamaño de partícula reducido, hechas con cantidades elevadas de grupos dietilaminoetil (DEAE).
    • Es muy importante tomar precauciones para evitar la contaminación con ARNsas exógenas, por ejemplo, tratar el agua y soluciones salinas con inhibidores de ARNsas, como el DEPC.

    Cuantificación de ADN y ARN

    • La concentración de ADN y ARN se puede calcular mediante la medición de la absorbancia a una longitud de onda específica (260 nm).
    • La ley de Lambert-Beer establece una relación lineal entre la absorbancia A y la concentración de la molécula de ADN o ARN.

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    Description

    Este cuestionario pone a prueba tu conocimiento sobre la técnica de extracción de muestras, que implica procesos como purificación, precipitación, lavado y disolución. Debes seleccionar la secuencia correcta de pasos involucrados en esta técnica.

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