Podcast
Questions and Answers
Tam enzim nedir?
Tam enzim nedir?
Prostetik grup, enzimlerde protein kısmıdır.
Prostetik grup, enzimlerde protein kısmıdır.
False
Apoenzimin görevini açıklayınız.
Apoenzimin görevini açıklayınız.
Apoenzim, enzimlerin protein kısmını temsil eder ve enzim aktivitesinde önemli bir rol oynar.
Tam enzim, ______ + kofaktör = holoenzim şeklinde tanımlanır.
Tam enzim, ______ + kofaktör = holoenzim şeklinde tanımlanır.
Signup and view all the answers
Aşağıdaki terimleri tanımlarıyla eşleştiriniz:
Aşağıdaki terimleri tanımlarıyla eşleştiriniz:
Signup and view all the answers
Polimorfizm nedir?
Polimorfizm nedir?
Signup and view all the answers
Alfa heliksin daha fazla görülmesi, internal H bağlarının optimal kullanımını sağlamaktadır.
Alfa heliksin daha fazla görülmesi, internal H bağlarının optimal kullanımını sağlamaktadır.
Signup and view all the answers
Sanger tarafından hangi protein ile aa dizisi belirlenmiştir?
Sanger tarafından hangi protein ile aa dizisi belirlenmiştir?
Signup and view all the answers
Farklı türlerden benzer fonksiyona sahip proteinlerin amino asit dizisi genellikle ___ olur.
Farklı türlerden benzer fonksiyona sahip proteinlerin amino asit dizisi genellikle ___ olur.
Signup and view all the answers
Aşağıdaki protein yapıları ile özelliklerini eşleştiriniz:
Aşağıdaki protein yapıları ile özelliklerini eşleştiriniz:
Signup and view all the answers
Proteinler hangi yapısal sınıflara ayrılır?
Proteinler hangi yapısal sınıflara ayrılır?
Signup and view all the answers
Sekonder yapılar, proteinlerin katlanma sürecinde rol oynamaz.
Sekonder yapılar, proteinlerin katlanma sürecinde rol oynamaz.
Signup and view all the answers
Proteinlerin katlanma sürecinin amacı nedir?
Proteinlerin katlanma sürecinin amacı nedir?
Signup and view all the answers
Proteinin temel yapı taşları _______ olarak adlandırılır.
Proteinin temel yapı taşları _______ olarak adlandırılır.
Signup and view all the answers
Aşağıdaki terimleri ilgili alanları ile eşleştiriniz:
Aşağıdaki terimleri ilgili alanları ile eşleştiriniz:
Signup and view all the answers
Study Notes
Protein Yapısı
- Protein mutasyonları, prion, Alzheimer, Parkinson, amiloidoz gibi hastalıklara neden olur.
- İlk amino asit (aa) 1806'da Asparagin'dir.
- Treonin 1938'de tanımlanmıştır.
- 1986'da 21. aa Selenosistein (Sec)'dir.
- 2002'de Methanosrcina barkeri'nde Pirolizin (Pyl) bulundu.
- Selenosistein'in kodu UGA'dır.
- Pirolizin'in kodu UAG'dır.
- Nadir amino asitler:
- Bitki hücre duvarlarında bulunan 4-hidroksiprolin, prolin türevidir.
- Kolajen doku ve fibriller bağ dokuda bulunan 5-hidroksilizin, lizin türevidir.
- Ornithin ve sitrülin, üre döngüsü ve arginin biyosentezinde ara metabolitlerdir.
Amino Asit Genel Formülü
- Amino asitler, elektrik yükü, hidrofilik veya hidrofobik gibi özellikler katar.
R Grupları
- R grupları (yan zincirler), amino asitlere elektrik yükü, hidrofilik veya hidrofobik gibi özellikler katar.
Glişin Dışındaki Amino Asitlerin Alfa Karbonu
- Glişin dışındaki amino asitlerde alfa karbonu 4 farklı grupla bağ yapmıştır.
- Karboksil grubu
- Amino grubu
- R grubu
- H atomu
Kiral Merkez
- Kiral merkez taşıyan tüm moleküller optikçe aktiftir ve polarize ışık düzlemini sağa veya sola çevirirler.
- Sulu çözeltileri de optikçe aktiftir.
- D-izomeri sağa, L-izomeri sola doğru çevirir.
- İkisinden eşit miktarda varsa rasemik karışım oluşur.
- Not: Optikçe aktif bileşiklerin optik izomer sayısı 2n formülüyle bulunur, burada n asimetrik karbon sayısıdır.
Amino Asitlerin Sınıflandırılması
-
1- Nanpolar Alifatik R Grupları:
- Nanpolar ve hidrofobiklerdir.
- Alanin, valin, lösin ve izolösin küme oluşturma eğilimindedir ve yapıyı stabilize eder.
- Glişin en basit yapılı amino asittir.
- Metiyonin sülfür içerir.
- Prolin yan zinciri halkasal yapıdadır.
-
2- Nanpolar Aromatik R Grupları:
- Phenylalanine, Tyrosine, Tryptophan
-
3- Polar ve Yüksüz R Grupları:
- Serin, Treonin, Sistein, Asparagin, Glutamin
-
4- Pozitif (Bazik) R Grupları:
- Lizin, Arginin, Histidin
-
5- Negatif (Asidik) R Grupları:
- Aspartat, Glutamat
Amino Asit Titrasyonu
- Amino asitler asit ve baz gibi davranabilir; ortamın pH değeri değiştiğinde alfa karbon atomuna bağlı gruplar iyonlaşır ve amino asit yükü değişir.
- İzoelektrik nokta (pI): Amino asidin net yükünün sıfır olduğu pH değeri; bu pH'de amino asit elektrik alanında hareketsizdir.
Protein Yapısı
- Proteinlerin üç temel yapısı vardır
- Primer yapı: amino asit dizisidir.
- Sekonder yapı: α-heliks, β-tabaka, vb. düzenli tekrarlayan yapılar.
- Tersiyer yapı: proteinin 3 boyutlu yapısıdır.
- Kuarterner yapı: iki veya daha fazla polipeptit zincirinin etkileşimidir.
Peptid Yapısı
- Bir amino asit ile diğer amino asit arasındaki kovalent bağ peptid bağıdır.
- Bu bağlar, bir H₂O molekülünün çıkmasıyla (dehidrasyon reaksiyonu) meydana gelir.
Protein Konformasyonu
- Protein konformasyonu, proteinin atom düzenlemesidir.
- Doğal konformasyon, protein için en düşük serbest enerjiye sahip konformasyondur.
- Protein stabilite, çevre ve kuvvetlerle (hidrojen bağları, hidrofobik etkileşimler, iyonik etkileşimler, disülfid bağları) korunur.
- Proteinler farklı katlanmalar gösterir, bu farklı katlanmalar "motif" yapısı olarak tanımlanır.
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
Bu quiz, protein yapısı ve amino asitlerin özellikleri hakkında bilgi vermektedir. Amino asitlerin keşfi, yapısı ve çeşitli mutasyonlar ile ilişkili hastalıklar üzerine odaklanmaktadır. Ayrıca, nadir amino asitlerin ve R gruplarının özellikleri de ele alınmaktadır.
