Tema 2 Obtención y purificación de ácidos nucleicos
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Tema 2 Obtención y purificación de ácidos nucleicos

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@SmilingBegonia

Questions and Answers

¿Cuál es el primer paso en el proceso descrito para preparar la levadura para PCR?

  • Transferir la levadura al agua y agitar suavemente (correct)
  • Agregar la mezcla maestra de PCR
  • Centrifugar los tubos con levadura
  • Congelar la levadura a -20ºC
  • A qué temperatura se mantiene la levadura tras su calentamiento en la máquina de PCR para preservarla?

  • 99ºC
  • 5ºC
  • -20ºC
  • 4ºC (correct)
  • Qué se debe hacer justo antes de agregar las células a las reacciones de PCR?

  • Agitar suavemente las células en vórtex (correct)
  • Congelar las células a -20ºC
  • Centrifugar los tubos con las células
  • Hacer una mezcla maestra de PCR
  • Qué tipo de DNA está presente en las células preparadas para la PCR según el procedimiento?

    <p>DNA genómico puro</p> Signup and view all the answers

    Cuál es el propósito de la centrifugación rápida de los tubos después de la PCR?

    <p>Concentrar el DNA en el fondo del tubo</p> Signup and view all the answers

    Cuál es el objetivo principal de la mezcla maestra de PCR?

    <p>Facilitar la amplificación del DNA</p> Signup and view all the answers

    Qué se recomienda hacer con la levadura calentada si no se utiliza inmediatamente?

    <p>Congelarla a -20ºC</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es el objetivo principal de la obtención de DNA según el contenido?

    <p>Clonación de fragmentos de DNA genómico</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué técnicas se utilizan para obtener DNA que se utilizará como molde para PCR?

    <p>Calentamiento a alta temperatura y permeabilización celular</p> Signup and view all the answers

    En el contexto de la PCR de colonia, ¿cuál es el procedimiento que implica la temperatura y el tiempo?

    <p>Calentamiento a 100 °C durante 5 minutos seguido de congelación a -20 °C</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es uno de los análisis que se puede realizar con el DNA extraído?

    <p>Análisis RFPL</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es una de las principales diferencias entre los métodos ultra-rápidos y los métodos estándar de extracción de DNA?

    <p>Las temperaturas aplicadas y el uso de congelación</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué volumen de la mezcla se utiliza para la amplificación por PCR después de la extracción del DNA?

    <p>5 µL</p> Signup and view all the answers

    En el procedimiento de PCR de colonia con levaduras, ¿qué se debe evitar realizar con el agar?

    <p>Tocar el agar</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál de las siguientes es una finalidad de la obtención de vectores de clonación?

    <p>Construcción de genotecas</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué tipo de bacterias se mencionan en relación a los métodos ultra-rápidos de extracción de DNA?

    <p>S. suis</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál de los siguientes métodos es utilizado para la obtención rápida de DNA de una colonia?

    <p>Obtención de DNA con discos de celulosa</p> Signup and view all the answers

    En la extracción orgánica de ácidos nucleicos, ¿qué mezcla se utiliza comúnmente?

    <p>Fenol:cloroformo</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es el principal componente en la lisis celular durante la extracción de ácidos nucleicos?

    <p>Buffer de lisis</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué técnica se utiliza para determinar la concentración de ácidos nucleicos?

    <p>Cuantificación espectrofotométrica</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la hibridación de sondas es correcta?

    <p>Las sondas se utilizan para identificar secuencias específicas</p> Signup and view all the answers

    En el procedimiento de lisis alcalina, ¿cuál es el objetivo principal de este método?

    <p>Romper las células para liberar plásmidos</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es un criterio de pureza importante que se evalúa en la cuantificación espectrofotométrica?

    <p>Absorbancia a 260 nm y 280 nm</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué método se utiliza para purificar fragmentos de DNA a partir de geles?

    <p>Purificación con perlas magnéticas</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál de los siguientes es un método de marcaje usado en la preparación de sondas de DNA?

    <p>Marcaje terminal</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Procesamiento de Levadura para PCR

    • Transferir levadura al agua, agitando suavemente para suspender células.
    • Calentar en PCR: 99ºC durante 5 minutos; luego mantener a 4ºC.
    • Centrifugar y enfriar en hielo; levadura lista para usar o congelar a -20ºC.
    • Antes de usar, agitar la suspensión celular en vórtex; el DNA está en las células.

    Métodos Rápidos de Extracción de DNA

    • Existen diferentes tipos de extracción según el propósito (clonación, análisis, etc.).
    • Los métodos rápidos implican calentar células a alta temperatura o permeabilizarlas para acceder al DNA.

    Métodos Ultra-Rápidos

    • Protocolo de PCR rápida de colonias: tomar una colonia y mezclar con agua nuclease-free, hervir y congelar.
    • Alternativa: pre-calentar colonia a 95ºC, enfriar y utilizar para PCR.

    Extracción de DNA de Colonias

    • Para PCR, preparar alícuotas de 50 µL de agua en tubos de PCR.
    • Recoger cantidad pequeña de levadura con pipeta, evitando contacto con el agar.

    Procedimientos de Lisis Celular

    • Existen métodos estándar para la obtención de ácidos nucleicos enfocados en la lisis celular y medio de extracción.
    • La extracción orgánica con fenol: cloroformo o Trizol, son comunes.

    Purificación y Concentración de Ácidos Nucleicos

    • Uso de alcohol isopropílico para la precipitación durante la concentración.
    • Métodos de purificación incluyen adsorción a sílice y uso de perlas magnéticas.

    Análisis Cuantitativo y Cualitativo

    • Cuantificación espectrofotométrica y criterios de pureza basados en absorbancia.
    • Electroforesis en gel de agarosa para estudios cualitativos; permite visualizar patrones de tamaño de ácidos nucleicos.

    Extracción Orgánica de Ácidos Nucleicos

    • Usar fenol a pH neutro o ácido afecta la separación de RNA y DNA.
    • En pH ácido, el RNA es preferentemente recuperado en la fase acuosa, mientras fragmentos de DNA pequeños fraccionan en la fase orgánica.

    Reactivo Trizol para Aislamiento de RNA

    • Trizol es una solución monofásica para aislamiento de RNA total; mantiene la integridad del RNA durante la lisis celular.
    • La centrifugación separa soluciones en fases acuosa y orgánica; el RNA se recupera de la fase acuosa mediante precipitación.

    Propósito de la Extracción

    • El objetivo es obtener DNA (o RNA) libre de contaminantes; retener calidad para aplicaciones posteriores como PCR.
    • Importancia del uso de reactivos seguros para evitar daños en las muestras.

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    En este quiz aprenderás los pasos clave para transferir levadura al agua y los procedimientos adecuados para el tratamiento térmico antes de la PCR. Conocerás la importancia de la temperatura y la centrifugación en el proceso. ¡Pon a prueba tus conocimientos sobre biotecnología y técnicas de laboratorio!

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