Glycosylation et modifications post-traductionnelles

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Questions and Answers

Quel acide aminé est spécifiquement mentionné comme étant impliqué dans la O-glycosylation du collagène?

Hydroxylysine (correct)

Cystéine

Phénylalanine

Arginine

Quelle enzyme est principalement responsable de l'hydroxyation des lysines et prolines co-traductionnelles?

Glycogen synthase

GalNac transférase

Proline hydroxylase (correct)

Transglycosylase

Quelle caractéristique des chaînes glucidiques résultant de la O-glycosylation est correcte?

Elles sont plus longues que celles résultant de la N-glycosylation.

Elles ne contiennent que des résidus osidiques identiques.

Elles sont souvent permanentes.

Elles sont plus variées et plus courtes que celles de la N-glycosylation. (correct)

Quel est le type de liaison formé lors de la O-glycosylation?

Liaison O-glycosidique Signup and view all the answers

Quel sucre est impliqué dans la O-glycosylation au niveau du collagène?

Galactose Signup and view all the answers

Quel est le motif de glycosylation N-glycosylation?

ASN-X-Ser/Thr Signup and view all the answers

Quelle modification post-traductionnelle est considérée comme irréversible?

Coupures de pré-protéines Signup and view all the answers

Laquelle de ces modifications n'est pas une forme de glycosylation?

Ubiquitinylation Signup and view all the answers

Quel acide aminé est lié à la formation de ponts covalents par l’allysine?

Lysine Signup and view all the answers

Quelle est la fonction principale de la phosphorylation dans la maturation des protéines?

Modification de l'activité enzymatique Signup and view all the answers

Parmi ces acides aminés, lequel peut subir une hydroxylation?

Lysine Signup and view all the answers

Quelle modification post-traductionnelle implique l’ajout d'un groupe aldéhyde?

Formation de l’allysine Signup and view all the answers

Quel processus est associé à l'élimination d'acides aminés tels que la méthionine?

Clivage de chaînes polypeptidiques Signup and view all the answers

Quel est le rôle des résidus à chaîne latérale réactive dans la MEC ?

Renforcer la cohésion entre les molécules d'élastine ou de collagène Signup and view all the answers

Quel pourcentage des protéines des cellules procaryotes et eucaryotes a la méthionine au N-terminal ?

50% Signup and view all the answers

Quelle enzyme est responsable de l'élimination du groupement formyl de la méthionine chez les procaryotes ?

Deformylase Signup and view all the answers

Quelle réaction est catalysée par la Met-aminopeptidase ?

L'élimination de la méthionine Signup and view all the answers

Quel type de protéines est acétylé au N-terminal par une N-acétyl transférase ?

Protéines cytoplasmiques Signup and view all the answers

Quelle est l’importance de la nature des premiers acides aminés dans l'acétylation ?

Elle est importante mais difficile à déterminer. Signup and view all the answers

Quel est le produit de la réaction catalysée par la deformylase ?

Formate et peptide méthionyl Signup and view all the answers

Quel est le type d'enzyme qui catalyse l'acétylation des histones ?

Transférase Signup and view all the answers

Quel enzyme catalyse l'addition de résidus Glc lors de la synthèse des N-glycanes?

ALG3 Signup and view all the answers

Quelle est la première étape dans la biosynthèse des N-glycanes?

Transfert de GlcNAc-1-P au Dol-P Signup and view all the answers

Quel est le rôle principal du système ERAD dans le contrôle qualité des glycoprotéines?

Reconnaître et dégrader les glycoprotéines mal pliées Signup and view all the answers

Quel est l'effet de la tunicamycine sur la synthèse des N-glycanes?

Elle bloque la synthèse des N-glycanes Signup and view all the answers

Quel enzyme est responsable de l'élimination du dernier résidu Glc dans le processus de maturation des protéines?

GII Signup and view all the answers

Quelle enzyme est impliquée dans la régénération de GlcMan9GlcNAc2 pour les glycoprotéines mal repliées?

UGGT Signup and view all the answers

Quel résidu est éliminé par GII pour générer GlcMan9GlcNAc2?

Glucose Signup and view all the answers

Quel est le rôle des protéines CNX/CRT dans le processus des glycoprotéines?

Recruter des chaperonnes pour le repliement Signup and view all the answers

Quel est le rôle principal de Calnexine et Calréticuline dans le repliement des glycoprotéines?

Elles facilitent le repliement des glycoprotéines. Signup and view all the answers

Quel effet l'UDP-glucose:glycoprotéine glucosyltransférase (UGGT) a-t-elle sur une glycoprotéine avec Man9GlcNAc2?

Elle décide de son repliement. Signup and view all the answers

Les résidus mannoses sont principalement éliminés dans le Golgi par quelles enzymes?

Alpha-mannosidases. Signup and view all the answers

Quel est le produit final de l'action d'MGAT1 sur Man5GlcNAc2?

GlcNAcMan5GlcNAc2. Signup and view all the answers

Quel inhibiteur bloque l'action de l'α-mannosidase II?

Swainsonine. Signup and view all the answers

Chez les mutants Lec8 CHO, quel est le résultat de l'inaction du transporteur UDP-Gal?

Formation de N-glycanes complexes terminés par GlcNAc. Signup and view all the answers

Quel est le rôle d'EDEM dans la dégradation des glycoprotéines mal repliées?

Elle coupe le mannose, facilitant la dégradation. Signup and view all the answers

Quelle enzyme est responsable de la formation de N-glycanes complexes à deux branches?

MGAT2. Signup and view all the answers

Quel type de liaison est impliqué dans la première étape de la glycosylation?

Liaison α-GalNAc sur une sérine ou thréonine Signup and view all the answers

Quel est un motif consensus pour la glycosylation N-liée?

Asn-X-Ser/Thr Signup and view all the answers

Quels acides aminés sont typiquement associés aux domaines riches en O-glycosylation?

Ser, Thr, Pro, Gly, Ala Signup and view all the answers

Quels gènes codent pour les GALNT chez l'humain?

20 gènes Signup and view all the answers

Quels types d'organismes ne possèdent pas de gènes GALNT?

Bactéries, levures et plantes Signup and view all the answers

Quel est le type de liaison dans le motif EGF?

Cys-X-X-G-X-Ser/Thr Signup and view all the answers

Quelle enzyme est responsable de l'ajout de GalNAc lors de la glycosylation?

GalNAc-transférase Signup and view all the answers

Quel acide aminé est exclu du motif défini pour la glycosylation N-liée?

Pro Signup and view all the answers

Study Notes

Licence BMP Biochimie Structurale II

Cours dispensé par Dr. Mârouf BABA AHMED
Année universitaire 2023/2024
Sujet: Biochimie Structurale II, Licence BMP

Plan du Cours

Biosynthèse des protéines
Maturation et modifications post-traductionnelles
Protéolyse et pathologies structurales

Biosynthèse des protéines

Origine des acides aminés chez l'Homme: Alimentation (50-100g), Secrétion (50g), protéines environ 10 kg (principalement muscles).
Intestin: Synthèse protéique (300-400g), Absorption d'acides aminés libres (jusqu'à 150g).
Sang: 100g
Catabolisme: Acides cétoniques (20-35g), Glucose, Corps cétoniques, lipides, Urée.
Diversité des fonctions des protéines: structure (collagène, kératine), enzymes (métabolisme), Hormones et neuromédiateurs, motrices (actine, myosine), transport (albumine, hémoglobine), transduction (récepteurs, signalisation), immunité (cytokines), régulation de l'expression du génome (facteurs de transcription).
Étapes de la biosynthèse protéique: Transcription (ARN polymérase II reconnaît une séquence spécifique d'ADN en amont du gène. La transcription se localise dans le noyau de la cellule). Le code génétique= séquence ADN → séquence AA, 3 bases = 1 codon, 64 types et 20 AA, synonymes (le code est dit « dégénéré » et ubiquitaire). 3 codons stop. ADN → ARNm grâce à l'ARN-polymérase, ARNm pr« transcrit primaire», seuls les exons sont exprimés dans l'ARNm mature (« épissage »).
Régulation de la synthèse protéique par des facteurs de transcription: Doigts de zinc, fermeture éclaire à leucine, Hélice-boucle-hélice (HLH), Hélice-tour-hélice (HTH).
Le génome humain compte environ 30 000 gènes.
Le protéome humain est estimé entre 100 000 et 1 000 000 de protéines.
Epissage normal: élimination des introns et jonction des exons.
Epissage alternatif produit des ARNm différents à partir du même ARN pré-messager, exemple: calcitonine et CGRP (Calcitonine Gene Related Peptide).

Modifications post-traductionnelles et maturation

Acquisition des structures 2aire, 3aire et 4aire (ponts S-S).
N-glycosylation : sur le motif ASN-X-Ser/Thr (NH2 de l'ASN peut être glycosylée).
O-glycosylations sur les Ser et Thr.
Acquisition de signaux pour l'adressage (noyau, MP, mitochondries, lysosomes...).
Modification irréversible: Coupures de pré-protéines (ex: pro-insuline → insuline).
Modification réversible : Modification de l'activité enzymatique.
Modifications d'acides aminés (His → 3MH, Pro → OH-Pro).
Exemples: Clivage de chaînes polypeptidiques, élimination d'acides aminés (Méthionine), acétylation, hydroxylation, biotinylation, sulfonation d'acides aminés, formation de ponts covalents, ancrage lipidique, glycosylations, phosphorylation, modifications accidentelles (atteinte par les radicaux libres).
Translocation des protéines solubles dans la membrane du RE (peptide signal, translocon, signal-peptidase).
Ancrage lipidique: Myristoylation (liaison à la glycine), palmitoylation (liaison à la cystéine), farnésylation (liaison d'un lipide Farnesyl), glypiation.

Protéolyse et pathologies structurales

Définition, systèmes protéolytiques (Voie lysosomale, voie calcium dépendante, voie ubiquitine-protéasome).
Lysosomes: compartiment hétérogène riche en hydrolases acides (nucléases, protéases, glycosidases, lipases, phosphatases, sulfatases, phospholipases).
Le rôle de la calpaïne dans la dégradation des protéines du cytosquelette ; mécanisme de la dégradation.
La dégradation des protéines par la voie ubiquitine-protéasome, Ubiquitination, complexe 19S, 26S, E1, E2, E3.
Conclusions sur les différents voies de protéolyse, des signal protéiques et leur durée de vie, implication dans la pathologie.

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Description

Testez vos connaissances sur la glycosylation et les modifications post-traductionnelles des protéines, notamment le collagène. Ce quiz aborde des sujets tels que l'O-glycosylation, la phosphorylation et bien d'autres. Répondez aux questions pour évaluer votre compréhension de ces processus biochimiques critiques.