Fusarium oxysporum en Sandía en México

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Questions and Answers

¿Qué método se utilizó para identificar los aislados UESFON01, UESFON02 y UESFON03?

Inoculación diferencial

Amplificación con primers específicos (correct)

Secuenciación de ADN

Aislamiento en cultivo

¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta sobre la raza 1 de Fusarium oxysporum f.sp.niveum?

Amplifica tres pares de primers. (correct)

No se puede identificar con primers específicos.

No es responsable de la marchitez de plantas.

Es resistente a la virulencia.

¿Qué caracteriza a la proteína efectora SIX6 en términos de virulencia?

Está presente en todas las razas.

Aumenta la virulencia en plantas. (correct)

Es responsable de la compatibilidad genética.

Favorece la resistencia en plantas.

¿Qué acción se debe realizar para identificar la raza 0 de Fusarium oxysporum?

Implementar una inoculación diferencial. Signup and view all the answers

¿Cuál es el resultado de la presencia del cromosoma de patogenicidad en las razas de Fusarium mencionadas?

Está ausente en la raza 3. Signup and view all the answers

¿Cuál es el objetivo principal en el estudio de Fusarium oxysporum f.sp.niveum en sandías?

Identificar la raza causante de marchitez en sandías. Signup and view all the answers

¿Qué método se utiliza para la identificación molecular de las razas de Fusarium?

Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Signup and view all the answers

¿A qué temperatura se incuban los fragmentos de tejido para el aislamiento del Fusarium?

28 °C Signup and view all the answers

¿Cuál es la característica de la Raza 1 de Fusarium oxysporum f.sp.niveum?

Puede afectar al 100% del cultivo de un día a otro. Signup and view all the answers

¿Qué tipo de cultivares se inoculan para la identificación de Fusarium oxysporum en sandía?

Cultivares de sandía diferenciales. Signup and view all the answers

¿Qué se utiliza para cultivar puros a partir de una sola espora durante el aislamiento?

Medio PDA. Signup and view all the answers

¿Cuál es la principal consecuencia de la marchitez vascular causada por Fusarium oxysporum en sandías?

Necrosis vascular y muerte de las plantas. Signup and view all the answers

¿Qué equipo se usa para la identificación en el proceso de aislamiento de Fusarium?

Microscopio óptico. Signup and view all the answers

Cuál es el propósito de la maceración del micelio en el proceso de extracción de DNA?

Facilitar la ruptura celular para liberar el DNA Signup and view all the answers

Qué separación se utiliza en el proceso de extracción de DNA antes del lavado con etanol?

Precipitación utilizando isopropanol Signup and view all the answers

Cuál es la temperatura y duración de la desnaturalización inicial en el protocolo PCR usando los primers Fon-1 y Fon-2?

94 °C por 90 s Signup and view all the answers

Qué gel se utiliza para analizar los productos de PCR y qué colorante se aplica?

Gel de agarosa con bromuro de etidio Signup and view all the answers

Qué se busca confirmar con los primers específicos UESFON01, UESFON02 y UESFON3?

La identidad del organismo como Fusarium oxysporum f.sp.niveum Signup and view all the answers

Cuál es la función de la RNasa A en el protocolo de extracción de DNA?

Degradar el RNA presente en la muestra Signup and view all the answers

En el proceso de amplificación por PCR, qué parámetro se establece para regular la incorporación de dNTPs?

Concentración de cada nucleótido trifosfatado Signup and view all the answers

Qué condición sigue después de la desnaturalización en cada ciclo de PCR?

Hibridación a 62 °C Signup and view all the answers

Cuál es el propósito de realizar la secuenciación de los amplicones obtenidos?

Determinar la identidad del organismo Signup and view all the answers

Qué significa un porcentaje de similitud del 98 a 100% en el análisis de secuencias obtenidas?

Las secuencias son idénticas Signup and view all the answers

Study Notes

Primer reporte de Fusarium oxysporum f. sp. niveum raza 1 en México

El estudio reporta el primer caso de Fusarium oxysporum f. sp. niveum raza 1 como agente causal de marchitez vascular en sandía en México.
Los autores son un equipo multidisciplinario de investigadores mexicanos, de las universidades y centros de investigación de Sonora, Guanajuato, y Penjamo
El estudio se enfoca en la identificación de la raza causante de la enfermedad en el municipio de Hermosillo, Sonora, México.

Objetivo del Estudio

Identificar la raza de Fusarium oxysporum f. sp. niveum causante de la marchitez y muerte de plantas de sandía en Sonora, México.
Se utilizaron métodos de identificación molecular utilizando primers específicos, y la inoculación de los aislados en cultivares diferenciales de sandía disponibles comercialmente.

Métodos

Aislamiento e Identificación: Se recogieron muestras de plantas con marchitez vascular. Se sembraron fragmentos de tejido en medio PDA y se incubaron a 28 °C por 5 días. Se obtuvieron cultivos puros de una sola espora (UESFON01, UESFON02 y UESFON03). Se emplearon microscopía óptica (40X) para la observación.
Extracción de ADN: Se realizaron maceraciones con buffer de extracción CTAB 3% de los micelios de los tres aislados fúngicos. Se realizó incubaciones a 60 °C por treinta minutos y a 37°C durante 10 minutos. Se precipito ADN con isopropanol a -20° C
PCR: Se utilizaron primers específicos (Fon-1, Fon-2, FONSIX6F, FONSIX6R, FNR3-F y FNR3-R)
Análisis de PCR: Se realizaron electroforesis en geles de agarosa al 1% con tinción de bromuro de etidio, para la visualización de los productos.
- Tamaños (bp) : Fon-1/Fon-2 (174 pb), FONSIX6F/R (453 pb), FNR3-F/R(511 pb)
Secuenciación: Los amplicones se purificaron y secuenciaron en ambas direcciones. Se utilizó un secuenciador automatizado
BLAST: Las secuencias obtenidas se compararon con la base de datos NCBI para las homologías y se obtuvieron porcentajes de similitud (98-100%)

Resultados

La identificación molecular demostró que los aislados UESFON01, UESFON02 y UESFON03 pertenecen a la raza 1 de Fusarium oxysporum f. sp. niveum
Los resultados mostraron amplificación con los primers específicos, incluyendo los fragmentos de 511 y 453 pb
Las secuencias de los amplicones coincidieron con un alto grado de similitud con la raza 1, usando la base de datos NCBI.

Conclusiones

Se identificó a Fusarium oxysporum f. sp. niveum raza 1 como el agente causal de la marchitez y la muerte de plantas de sandía en Hermosillo, Sonora, México.
Se identificaron los aislamientos correspondientes a la raza 1 pero para la raza 0 se requiere inoculación diferencial.

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Description

Este estudio presenta el primer reporte de Fusarium oxysporum f. sp. niveum raza 1 en México, como causante de marchitez vascular en sandía. Se analizan métodos de identificación molecular y la efectividad de cultivares diferenciales. Un equipo multidisciplinario de investigadores de diversas universidades contribuyó a este hallazgo en Hermosillo, Sonora.