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Questions and Answers
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre los SNPs es correcta?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre los SNPs es correcta?
En estudios de asociación genómica, ¿qué indica un desvío del equilibrio de Hardy-Weinberg en una población de casos?
En estudios de asociación genómica, ¿qué indica un desvío del equilibrio de Hardy-Weinberg en una población de casos?
Considerando las técnicas de detección de variación genética, ¿cuál de las siguientes afirmaciones es falsa?
Considerando las técnicas de detección de variación genética, ¿cuál de las siguientes afirmaciones es falsa?
Sobre el análisis por hibridación in situ, ¿qué afirmación es incorrecta?
Sobre el análisis por hibridación in situ, ¿qué afirmación es incorrecta?
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¿Cuántos haplotipos se esperarían obtener si cada una de las 7 posiciones tiene dos variantes posibles?
¿Cuántos haplotipos se esperarían obtener si cada una de las 7 posiciones tiene dos variantes posibles?
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¿Qué representa el término 'SNP' en el contexto de los haplotipos?
¿Qué representa el término 'SNP' en el contexto de los haplotipos?
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¿Cuál es el término que describe la combinación de variantes para distintos loci en una misma molécula de ADN?
¿Cuál es el término que describe la combinación de variantes para distintos loci en una misma molécula de ADN?
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¿Qué significa el término 'desequilibrio de ligamiento' mencionado en la población?
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¿Cuántos haplotipos diferentes se encontraron en la población bajo análisis?
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En el análisis de un SNP, ¿cuáles son las opciones de haplotipos que se mencionan?
En el análisis de un SNP, ¿cuáles son las opciones de haplotipos que se mencionan?
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¿Qué se utiliza para visualizar el gen y sus componentes como exones e intrones?
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¿Qué representa un haplotipo en términos de genética?
¿Qué representa un haplotipo en términos de genética?
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¿Qué implica que un SNP esté clasificado en Nivel A según el CPIC?
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¿Cuál es una de las ventajas de los SNPs mencionadas?
¿Cuál es una de las ventajas de los SNPs mencionadas?
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Según el proyecto 1000 genomas, ¿cuántas variantes tiene cada persona en promedio con respecto al genoma de referencia?
Según el proyecto 1000 genomas, ¿cuántas variantes tiene cada persona en promedio con respecto al genoma de referencia?
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¿Cuál de las siguientes opciones es cierta sobre los microsatélites?
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¿Qué representa una variante cromosómica en la variación genética?
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¿Qué es un polimorfismo de único nucleótido (SNP)?
¿Qué es un polimorfismo de único nucleótido (SNP)?
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¿Cuál es la afirmación correcta sobre las enfermedades mendelianas según el proyecto 1000 genomas?
¿Cuál es la afirmación correcta sobre las enfermedades mendelianas según el proyecto 1000 genomas?
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¿Qué tipo de polimorfismos se analizan principalmente en un estudio de asociación genómico?
¿Qué tipo de polimorfismos se analizan principalmente en un estudio de asociación genómico?
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¿Cuál es la función del equilibrio de Hardy-Weinberg en un estudio de asociación genómico?
¿Cuál es la función del equilibrio de Hardy-Weinberg en un estudio de asociación genómico?
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¿Qué describe un haplotipo?
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¿Qué sucede si un marcador no está relacionado con una enfermedad en el contexto de un GWAS?
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¿Cuál es la implicación de un valor D positivo (D > 0) en el análisis de ligamiento?
¿Cuál es la implicación de un valor D positivo (D > 0) en el análisis de ligamiento?
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¿Cuántas variantes identificó el Proyecto 1.000 Genomas en el genoma de los individuos estudiados?
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¿Qué permite analizar el desequilibrio en el ligamiento en estudios de GWAS?
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¿Qué establece la frecuencia de recombinación en el análisis genético?
¿Qué establece la frecuencia de recombinación en el análisis genético?
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En un análisis de frecuencias alélicas, ¿qué fenómeno ocurre con los alelos en condiciones de desequilibrio genético?
En un análisis de frecuencias alélicas, ¿qué fenómeno ocurre con los alelos en condiciones de desequilibrio genético?
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¿Cuántos SNPs se pueden analizar simultáneamente con el tipo de Arrays mencionados?
¿Cuántos SNPs se pueden analizar simultáneamente con el tipo de Arrays mencionados?
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Al analizar el genoma humano inicialmente, ¿qué se buscó de manera primordial?
Al analizar el genoma humano inicialmente, ¿qué se buscó de manera primordial?
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¿Cuál es el resultado de un valor D negativo (D < 0) en el contexto de la genética de poblaciones?
¿Cuál es el resultado de un valor D negativo (D < 0) en el contexto de la genética de poblaciones?
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¿Qué relación existe entre la frecuencia del alelo de riesgo y la salud de una población en un GWAS?
¿Qué relación existe entre la frecuencia del alelo de riesgo y la salud de una población en un GWAS?
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¿Qué sucede con las frecuencias de los gametos cuando las frecuencias alélicas son insuficientes para explicar las frecuencias genéticas?
¿Qué sucede con las frecuencias de los gametos cuando las frecuencias alélicas son insuficientes para explicar las frecuencias genéticas?
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¿Cuál es la utilidad de estimar el desequilibrio genético en estudios de genoma?
¿Cuál es la utilidad de estimar el desequilibrio genético en estudios de genoma?
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En el contexto de las frecuencias de gametos en exceso, ¿qué combinación es correcta cuando se estiman estas frecuencias?
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¿Cuál de las siguientes afirmaciones describe correctamente el desequilibrio de alelos?
¿Cuál de las siguientes afirmaciones describe correctamente el desequilibrio de alelos?
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Qué implica un marcador D igual a cero en el contexto de desequilibrio de alelos?
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Cuál es una de las principales ventajas de identificar genes de susceptibilidad?
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En los estudios de asociación, qué caracteriza un estudio dirigido de genes candidatos?
En los estudios de asociación, qué caracteriza un estudio dirigido de genes candidatos?
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Qué papel tiene la calima en la identificación de factores de riesgo según el contenido?
Qué papel tiene la calima en la identificación de factores de riesgo según el contenido?
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Qué se busca mediante la identificación de dianas terapéuticas?
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Cuál es un ejemplo de una hipótesis que se podría estudiar en genética según el contenido?
Cuál es un ejemplo de una hipótesis que se podría estudiar en genética según el contenido?
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Qué indica una relación positiva entre las combinaciones de alelos A-b y a-B?
Qué indica una relación positiva entre las combinaciones de alelos A-b y a-B?
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Study Notes
Estudio de Diseño de Estudios Genéticos y Asociación con Enfermedad
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Haplotipo: Combinación de variantes genéticas en un mismo segmento de ADN (cromosoma o gameto). Ejemplo: ATCCGAT.
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Desequilibrio genético (o de ligamiento): Diferencia entre las frecuencias observadas de haplotipos y las esperadas según las frecuencias alélicas individuales. Este desequilibrio indica que ciertos alelos tienden a heredarse juntos con más o menos frecuencia de lo esperado al azar.
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D (desequilibrio de ligamiento): Mide la desviación de las frecuencias esperadas de haplotipos. Un valor diferente de 0 indica desequilibrio. Valores positivos indican que la frecuencia observada del haplotipo es mayor que la esperada, mientras que valores negativos indican lo contrario.
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R² (coeficiente de correlación): Mide la fuerza del desequilibrio de ligamiento. Valores entre 0 y 1, donde un valor cercano a 1 indica un fuerte desequilibrio de ligamiento.
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Estudios de genes candidatos vs. GWAS (Genome-Wide Association Studies): Estudios de genes candidatos tienen una hipótesis previa sobre el gen involucrado, mientras que los GWAS examinan todo el genoma en busca de variantes asociadas a una enfermedad.
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Importancia de la identificación de genes de susceptibilidad: Facilita la prevención, el diagnóstico y el pronóstico, además de identificar factores de riesgo ambientales y otras variantes genéticas. Permite la identificación de dianas terapéuticas.
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Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs): Variantes genéticas en una sola posición de nucleótido del ADN. Son la herramienta principal para identificar genes de susceptibilidad en los estudios de asociación.
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Arrays de genotipados: Tecnología que permite analizar simultáneamente miles de SNPs en una muestra, acelerando el proceso de estudios de asociación genómica.
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Selección de marcadores : TagSNPs son marcadores que definen otros SNPs ligados. Permite estudiar la asociación de varias variantes.
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Controles de calidad para GWAS: Son cruciales para minimizar o excluir posibles errores de genotipado, asegurarse que la muestra de estudio es representativa y que no existan errores en los datos.
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Tasa de genotipado (menor de 95%): Una tasa de genotipado menor a 95% indica la necesidad de descartar parte de la información por presentar problemas con el método de análisis.
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Concordancia de sexo en estudios: Se utiliza la información genética del cromosoma X para identificar discrepancias que puedan indicar errores en el estudio.
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Análisis de asociación GWAS: Una vez superados los controles de calidad, se analizan los resultados para detectar asociaciones entre las variantes genéticas y la enfermedad.
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Cantidad de alelos, frecuencias: Medición de la frecuencia de cada alelo para determinar diferencias significativas entre grupos (ej: casos y controles). Una herramienta para determinar asociaciones entre un grupo de personas con o sin enfermedad.
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Prueba de independencia (Chi-cuadrado): Se utiliza para determinar si existe independencia entre las variantes genéticas en las poblaciones que se están estudiando.
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Aplicación Clínica (CPIC): Un consorcio que busca aplicar los resultados de la investigación genética sobre salud. Se prioriza los resultados de los estudios a nivel de práctica clínica. Están clasificados de nivel A a D dependiendo de la rigurosidad de la evidencia.
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Description
Este cuestionario aborda conceptos clave en estudios genéticos y su asociación con enfermedades. Se discutirán temas como haplotipos, desequilibrio de ligamiento y métricas como D y R². Completa el cuestionario para evaluar tu comprensión sobre estas importantes herramientas en genética.