27 - Estudio de Diseño de Estudios Genéticos
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Questions and Answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre los SNPs es correcta?

  • Los SNPs son variaciones de un solo nucleótido que se observan en regiones no codificantes.
  • Los SNPs son un tipo de polimorfismo exclusivamente en regiones intergénicas.
  • Los SNPs pueden afectar la expresión de genes codificantes. (correct)
  • Los SNPs son fragmentos de ADN que se repiten en tándem.
  • En estudios de asociación genómica, ¿qué indica un desvío del equilibrio de Hardy-Weinberg en una población de casos?

  • La presencia de un sesgo de muestreo.
  • Un error en las mediciones genéticas.
  • Que el marcador está asociado con una enfermedad. (correct)
  • Un aumento en la variabilidad genética de la muestra.
  • Considerando las técnicas de detección de variación genética, ¿cuál de las siguientes afirmaciones es falsa?

  • La PCR en tiempo real requiere fluoróforos adicionales en su mezcla de reacción.
  • La secuenciación de ADN de tercera generación ofrece lecturas largas de hasta 350 pb.
  • El análisis FISH utiliza sondas que se hibridan con ADN sin marcaje previo. (correct)
  • Los arrays de genotipado pueden analizar millones de SNPs simultáneamente.
  • Sobre el análisis por hibridación in situ, ¿qué afirmación es incorrecta?

    <p>No puede ser utilizado para detectar variaciones genéticas.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuántos haplotipos se esperarían obtener si cada una de las 7 posiciones tiene dos variantes posibles?

    <p>128</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué representa el término 'SNP' en el contexto de los haplotipos?

    <p>Sustitución de nucleótido polimórfico</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es el término que describe la combinación de variantes para distintos loci en una misma molécula de ADN?

    <p>Haplotipo</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué significa el término 'desequilibrio de ligamiento' mencionado en la población?

    <p>Asociación entre alelos que limita recombinación</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuántos haplotipos diferentes se encontraron en la población bajo análisis?

    <p>5</p> Signup and view all the answers

    En el análisis de un SNP, ¿cuáles son las opciones de haplotipos que se mencionan?

    <p>Arg y Ser</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué se utiliza para visualizar el gen y sus componentes como exones e intrones?

    <p>Una representación gráfica</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué representa un haplotipo en términos de genética?

    <p>La combinación de variantes de SNPs en varios loci</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué implica que un SNP esté clasificado en Nivel A según el CPIC?

    <p>Es obligatorio analizar la información genética antes de prescribir un fármaco.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es una de las ventajas de los SNPs mencionadas?

    <p>Son abundantes y están distribuidos a lo largo de todo el genoma.</p> Signup and view all the answers

    Según el proyecto 1000 genomas, ¿cuántas variantes tiene cada persona en promedio con respecto al genoma de referencia?

    <p>Entre 40 y 50 millones.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál de las siguientes opciones es cierta sobre los microsatélites?

    <p>Son altamente polimórficos y útiles en genética de poblaciones.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué representa una variante cromosómica en la variación genética?

    <p>Una minoría de la variación genética.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué es un polimorfismo de único nucleótido (SNP)?

    <p>Es un cambio de una purina por una pirimidina.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es la afirmación correcta sobre las enfermedades mendelianas según el proyecto 1000 genomas?

    <p>Cada persona tiene de media unas 24-30 enfermedades mendelianas.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué tipo de polimorfismos se analizan principalmente en un estudio de asociación genómico?

    <p>Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs)</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es la función del equilibrio de Hardy-Weinberg en un estudio de asociación genómico?

    <p>Determinar la co-ocurrencia de un alelo y una enfermedad</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué describe un haplotipo?

    <p>La combinación de variantes genéticas para distintos loci en una misma molécula de ADN.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué sucede si un marcador no está relacionado con una enfermedad en el contexto de un GWAS?

    <p>Se espera que la frecuencia en ambas poblaciones sea igual.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es la implicación de un valor D positivo (D > 0) en el análisis de ligamiento?

    <p>Los gametos de la primera parte de la ecuación están en exceso.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuántas variantes identificó el Proyecto 1.000 Genomas en el genoma de los individuos estudiados?

    <p>84,7 millones de variantes</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué permite analizar el desequilibrio en el ligamiento en estudios de GWAS?

    <p>El uso de arrays de genotipados.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué establece la frecuencia de recombinación en el análisis genético?

    <p>La distancia entre dos genes en un cromosoma.</p> Signup and view all the answers

    En un análisis de frecuencias alélicas, ¿qué fenómeno ocurre con los alelos en condiciones de desequilibrio genético?

    <p>Se evidencian combinaciones de alelos que aparecen más frecuentemente de lo esperado.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuántos SNPs se pueden analizar simultáneamente con el tipo de Arrays mencionados?

    <p>5 millones de SNPs</p> Signup and view all the answers

    Al analizar el genoma humano inicialmente, ¿qué se buscó de manera primordial?

    <p>SNPs o sitios polimórficos</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es el resultado de un valor D negativo (D < 0) en el contexto de la genética de poblaciones?

    <p>Los gametos de la primera parte de la ecuación están en menor cantidad.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué relación existe entre la frecuencia del alelo de riesgo y la salud de una población en un GWAS?

    <p>Es más frecuente en casos que en controles.</p> Signup and view all the answers

    ¿Qué sucede con las frecuencias de los gametos cuando las frecuencias alélicas son insuficientes para explicar las frecuencias genéticas?

    <p>La recombinación juega un papel importante en la asociación de variantes genéticas.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál es la utilidad de estimar el desequilibrio genético en estudios de genoma?

    <p>Comprender la relación entre alelos en la herencia genética.</p> Signup and view all the answers

    En el contexto de las frecuencias de gametos en exceso, ¿qué combinación es correcta cuando se estiman estas frecuencias?

    <p>La combinación T-A, C-G es típicamente más frecuente.</p> Signup and view all the answers

    ¿Cuál de las siguientes afirmaciones describe correctamente el desequilibrio de alelos?

    <p>Los alelos A y b tienen una mayor frecuencia juntos de lo esperado por azar.</p> Signup and view all the answers

    Qué implica un marcador D igual a cero en el contexto de desequilibrio de alelos?

    <p>Las frecuencias de los gametos coinciden con lo esperado en la población.</p> Signup and view all the answers

    Cuál es una de las principales ventajas de identificar genes de susceptibilidad?

    <p>Permite una medicina personalizada o de precisión.</p> Signup and view all the answers

    En los estudios de asociación, qué caracteriza un estudio dirigido de genes candidatos?

    <p>Se centra en genes específicos basados en una hipótesis previa.</p> Signup and view all the answers

    Qué papel tiene la calima en la identificación de factores de riesgo según el contenido?

    <p>Se considera un nuevo factor ambiental que puede interaccionar con genes de susceptibilidad.</p> Signup and view all the answers

    Qué se busca mediante la identificación de dianas terapéuticas?

    <p>Bloquear genes determinados que influyen en enfermedades.</p> Signup and view all the answers

    Cuál es un ejemplo de una hipótesis que se podría estudiar en genética según el contenido?

    <p>La acción cooperativa de dos genes en la penetración del covid.</p> Signup and view all the answers

    Qué indica una relación positiva entre las combinaciones de alelos A-b y a-B?

    <p>Si un gameto lleva el alelo A, es probable que también lleve el alelo b.</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Estudio de Diseño de Estudios Genéticos y Asociación con Enfermedad

    • Haplotipo: Combinación de variantes genéticas en un mismo segmento de ADN (cromosoma o gameto). Ejemplo: ATCCGAT.

    • Desequilibrio genético (o de ligamiento): Diferencia entre las frecuencias observadas de haplotipos y las esperadas según las frecuencias alélicas individuales. Este desequilibrio indica que ciertos alelos tienden a heredarse juntos con más o menos frecuencia de lo esperado al azar.

    • D (desequilibrio de ligamiento): Mide la desviación de las frecuencias esperadas de haplotipos. Un valor diferente de 0 indica desequilibrio. Valores positivos indican que la frecuencia observada del haplotipo es mayor que la esperada, mientras que valores negativos indican lo contrario.

    • R² (coeficiente de correlación): Mide la fuerza del desequilibrio de ligamiento. Valores entre 0 y 1, donde un valor cercano a 1 indica un fuerte desequilibrio de ligamiento.

    • Estudios de genes candidatos vs. GWAS (Genome-Wide Association Studies): Estudios de genes candidatos tienen una hipótesis previa sobre el gen involucrado, mientras que los GWAS examinan todo el genoma en busca de variantes asociadas a una enfermedad.

    • Importancia de la identificación de genes de susceptibilidad: Facilita la prevención, el diagnóstico y el pronóstico, además de identificar factores de riesgo ambientales y otras variantes genéticas. Permite la identificación de dianas terapéuticas.

    • Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs): Variantes genéticas en una sola posición de nucleótido del ADN. Son la herramienta principal para identificar genes de susceptibilidad en los estudios de asociación.

    • Arrays de genotipados: Tecnología que permite analizar simultáneamente miles de SNPs en una muestra, acelerando el proceso de estudios de asociación genómica.

    • Selección de marcadores : TagSNPs son marcadores que definen otros SNPs ligados. Permite estudiar la asociación de varias variantes.

    • Controles de calidad para GWAS: Son cruciales para minimizar o excluir posibles errores de genotipado, asegurarse que la muestra de estudio es representativa y que no existan errores en los datos.

    • Tasa de genotipado (menor de 95%): Una tasa de genotipado menor a 95% indica la necesidad de descartar parte de la información por presentar problemas con el método de análisis.

    • Concordancia de sexo en estudios: Se utiliza la información genética del cromosoma X para identificar discrepancias que puedan indicar errores en el estudio.

    • Análisis de asociación GWAS: Una vez superados los controles de calidad, se analizan los resultados para detectar asociaciones entre las variantes genéticas y la enfermedad.

    • Cantidad de alelos, frecuencias: Medición de la frecuencia de cada alelo para determinar diferencias significativas entre grupos (ej: casos y controles). Una herramienta para determinar asociaciones entre un grupo de personas con o sin enfermedad.

    • Prueba de independencia (Chi-cuadrado): Se utiliza para determinar si existe independencia entre las variantes genéticas en las poblaciones que se están estudiando.

    • Aplicación Clínica (CPIC): Un consorcio que busca aplicar los resultados de la investigación genética sobre salud. Se prioriza los resultados de los estudios a nivel de práctica clínica. Están clasificados de nivel A a D dependiendo de la rigurosidad de la evidencia.

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    Este cuestionario aborda conceptos clave en estudios genéticos y su asociación con enfermedades. Se discutirán temas como haplotipos, desequilibrio de ligamiento y métricas como D y R². Completa el cuestionario para evaluar tu comprensión sobre estas importantes herramientas en genética.

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