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Questions and Answers
¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre los intrones bacterianos es correcta?
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¿Qué papel desempeña el snARN U1 en el mecanismo de corte y empalme del espliceosoma?
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¿Cuál es una característica distintiva de los intrones de espliceosoma respecto a los intrones bacterianos?
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¿Qué sucede después de que las snRNP U1 y U2 se han unido durante el ensamblaje del espliceosoma?
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¿Cuál es la función del 2’-OH de la adenosina específica del intrón en el mecanismo de empalme?
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¿Cuál es el principal factor que afecta la expresión génica en relación con el ARNm?
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¿Qué estructuras estabilizan los tránscritos en eucariotas?
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¿Cuál es la vida media promedio de los ARNm en vertebrados?
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¿Qué modificación se realiza en el extremo 5’ del ARNt específico de la tirosina?
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¿Cuál de las siguientes enzimas cataliza la hidrólisis del enlace fosfodiéster?
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¿Cuántos nucleósidos modificados se han encontrado típicamente en el ARNt?
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¿Qué tipo de ribonucleasa es responsable del procesamiento de intrones en algunos ARN?
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¿Qué tipo de enzima es considerado un ribozima?
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¿Cuál es la función del casquete en 5' del ARNm?
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¿Qué caracterizan los intrones de grupo II?
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¿Cuál es la longitud más frecuente de los exones en los eucariotas?
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¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre los intrones es correcta?
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¿Cuál es la composición del casquete en 5' del ARNm?
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¿Qué se entiende por 'splicing' en el contexto del ARNm?
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¿Qué papel desempeñan los complejos proteicos en la maduración del ARN?
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¿Cuántos residuos típicamente contiene la cola poli(A) del ARNm?
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¿Qué es el empalme alternativo en el contexto de las inmunoglobulinas?
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¿Cuál es la función de las regiones no traducidas (UTR) en el ADN genómico?
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¿En qué organismo se ha observado una maduración diferencial del transcrito del gen de la calcitonina?
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¿Qué permite la existencia de dos sitios de poliadenilación en un transcrito?
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¿Qué características tienen los distintos ARN mensajeros derivados de un mismo transcrito primario?
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¿Cuál de las siguientes opciones describe mejor el resultado de los patrones de corte y empalme alternativos?
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¿Cuál es la importancia de las regiones que se transcriben pero no se traducen en el ADN?
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¿Qué rol desempeña el codón de terminación en la traducción?
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¿Cuál es el papel del 3’-OH del exón 5’ en la formación del enlace fosfodiéster?
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¿Qué función tiene la cola de poli(A) en el ARNm maduro?
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¿Qué requiere el mecanismo de corte y empalme en los intrones de tipo II?
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¿Cómo se caracteriza la maduración diferencial del ARN?
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¿Cuál es la función del espliceosoma en el proceso de corte y empalme?
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¿Cuál es una característica de los transcritos complejos de ARN?
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¿Qué hace la enzima poliadenilato polimerasa durante la maduración del ARN?
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¿Qué implica la señal de poliadenilación en el ARN?
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¿Qué ocurre con el intrón una vez que se ha formado el enlace fosfodiéster entre exones?
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¿Qué tipo de síntesis realiza la transcriptasa inversa?
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¿Cuál es uno de los principales efectos de la enzima telomerasa en los telómeros?
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¿Qué ocurre con los telómeros en células somáticas?
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¿Qué tipo de reacción no cataliza la transcriptasa inversa?
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¿Cuál es la tasa de error de la transcriptasa inversa al añadir nucleótidos?
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¿Qué relación tiene la telomerasa con el envejecimiento celular?
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¿Qué nucleótidos son añadidos por la telomerasa al cebador TG?
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En el contexto del cáncer, ¿qué papel desempeña la telomerasa?
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¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la telomerasa es correcta?
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¿Qué tipo de molécula se requiere como cebador para la acción de la transcriptasa inversa?
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Study Notes
Maduración del ARN
- El ARN mensajero (ARNm) eucariota sufre un proceso de maduración para convertirse en un ARNm maduro.
- El transcrito primario se procesa mediante tres pasos principales:
- Splicing: Eliminación de intrones.
- Casquete en 5': Adición de un casquete en el extremo 5' para protegerlo de la degradación.
- Cola poli(A) en 3': Adición de una cola poliadenina en el extremo 3' para protegerlo de la degradación y facilitar su trasnporte al citoplasma.
- La maduración acoplada al transporte del ARNm al citoplasma.
Casquete 5' del ARNm
- Residuo de 7-metilguanosina unido al extremo 5'.
- Enlace 5',5'-trifosfato protege al ARNm de las ribonucleasas.
- Participa en la unión del ARNm al ribosoma.
Intrones y Exones
- La mayoría de los genes de vertebrados contienen intrones.
- Exones: Menor tamaño (100-200 nucleótidos), menos de 1.000 nucleótidos.
- Intrones: Tamaño grande (50-20.000 nucleótidos).
- Más ADN en intrones que en exones.
- Genes de las histonas son una excepción.
Tipos de Intrones
- Grupo I
- Grupo II
- De espliceosoma
- De corte y empalme
- Nucleares
- Grupo IV
Intrones grupo I y II
- Intrones grupo I: Presentes en ADN nuclear, mitocondrial y de cloroplastos.
- Intrones grupo II: Transcritos primarios de ARNm de mitocondrias y cloroplastos en hongos, algas y plantas.
- Los dos grupos no necesitan enzimas, son ribozimas y no necesitan cofactores de alta energía (ATP).
Intrones de Espliceosoma
- Grupo más numeroso de intrones en eucariotas.
- En transcritos primarios del ARNm nuclear.
- No se auto cortan y empalman.
- Eliminados por el espliceosoma.
- Complejo ARN-proteínas denominado snRNP.
- Pequeños ARN nucleares (snRNA).
- U1, U2, U4, U5 y U6 (100-200 nt)
- Proteínas muy conservadas.
Mecanismo de Corte y Empalme de Intrones del Espliceosoma
- snRNP U1 se aparea junto al extremo 5' del intrón para definir el sitio de corte.
- snRNP U2 se aparea en una región que contiene un residuo A, que actúa como nucleófilo.
- Dinucleótidos específicos en los extremos 5' y 3' del intrón.
- El apareamiento de U2 produce una protuberancia que activa a la A, formando un lazo.
Ensamblaje del Espliceosoma
- Primeramente se unen snRNP U1 y U2.
- Continuando, se unen las restantes snRNP para formar el espliceosoma inactivo.
- Reordenamiento y liberación de U1 y U4 y forma el espliceosoma activo.
- U6 está apareado simultáneamente con el lugar de corte 5' y con U2.
Mecanismo del proceso de corte y empalme.
Cola de Poli(A) en el extremo 3'
- 80 a 250 residuos A en el extremo 3'.
- Sitio de unión de proteínas específicas en traducción.
- Protegen al ARNm de la destrucción enzimática.
- Señal de poliadenilación.
- El transcrito se extiende más allá del sitio donde debe añadirse la cola de poli(A).
- Complejo enzimático reconoce la secuencia señal.
Cuarta clase de intrones
- Presente en ciertos ARNt de eucariotas y arqueobacterias.
- Requiere ATP y una endonucleasa corta los extremos del intrón.
- Los dos exones se unen por un mecanismo similar al de la ADN ligasa.
Maduración diferencial del ARN
- Un único transcrito primario puede dar lugar a diferentes ARNm y, consecuentemente, a diferentes proteínas.
- Los factores de maduración son proteínas de unión al ARN que promueven una ruta determinada.
- Los transcritos complejos pueden tener: * Más de un sitio de corte y poliadenilación.* Patrones de corte y empalme alternativos.
Patrones de corte y poliadenilación alternativos
- Dos sitios de poliadenilación, los cuales determinan el tamaño del ARNm maduro.
Patrones de corte y empalme alternativos
- Dos sitios diferentes de corte en 3'.
- Diferentes ARNm maduros a partir del mismo transcrito primario.
Maduración diferencial del transcrito del gen de la calcitonina en ratas
- Dos sitios de poliadenilación: uno en el tejido tiroideo y otro en el cerebro.
- Esplicing alternativo que da lugar a dos ARNm maduros diferentes.
UTR: Regiones no traducidas
- Presentes en el ADN genómico.
- Se transcriben pero no se traducen.
- Importantes en la regulación de la expresión génica.
- Regiones 5'UTR y 3'UTR en el ARNm maduro.
Degradación celular de los ARN
- Un factor crucial en la expresión génica es la concentración celular del ARNm.
- Velocidad de síntesis y degradación.
- En equilibrio: Concentración estacionaria.
- Tasa de degradación de ARNm variable → vida media promedio 3 h.
- Procariotas: Cortes por una endonucleasa y exorribonucleasas 3'→5'.
- Eucariotas: Acortamiento cola poli(A), pérdida de casquete 5’, y exorribonucleasas 5'→3' y 3'→5'.
Modificaciones postranscripcionales en ARNr y ARNt
- Los ARNr y los ARNt se forman a partir de precursores de mayor longitud.
- Estos ARN pueden contener bases modificadas como resultado de reacciones postranscripcionales.
- Se han encontrado hasta 96 nucleósidos modificados diferentes: 81 en ARNt y 30 en ARNr.
Maduración del ARNt específico de la tirosina de levadura
- Modificaciones en los extremos 5' y 3'.
- Adición del CCA en el extremo 3'.
RIBOZIMAS: Enzimas de ARN
-
Catalizan dos reacciones fundamentales: transesterificación e hidrólisis del enlace fosfodiéster.
-
Intrones del grupo I, RNasa P, Ribozima en cabeza de martillo.
-
Sustrato: ARN (a veces integrante del ribozima).
-
Aprovecha las interacciones de apareamiento de bases para llevar a cabo su función.
-
Tamaño variable: 400 (intrones grupo I) - 41 (ribozima en cabeza de martillo).
-
Estructura tridimensional importante para la función.
Otras polimerasas
-
Transcriptasa inversa.
- Cataliza 3 reacciones diferentes: Síntesis de ADN dependiente de ARN, degradación de ARN y síntesis de ADN dependiente de ADN.
- Máxima actividad con ARN propio (podrían usar otros).
- Requiere un cebador ARNt (huésped)
- Secuencia en 3' complementaria al ARN vírico.
- Síntesis ADN dirección 5'→ 3'.
- No exonucleasa 3'→5' correctora de pruebas, tasa de mutación altas.
-
Telomerasa.
- Incorpora telómeros a los extremos de los cromosomas.
- Formada por proteínas + ARN: 150 nucleótidos y 1,5 copias repetición CA₄.
- Molde interno de ARN.
- Añade residuos Ty G al extremo 3'.
Telomerasa - Envejecimiento
- Perdida de la telomerasa → acortamiento gradual de los telómeros → muerte de la línea celular.
- Células germinales → actividad telomerasa → mantienen la longitud de sus telómeros.
- Células somáticas → carecen de telomerasa → acortan gradualmente los telómeros.
- Longitud de los telómeros → Edad del individuo.
Telomerasa - Cáncer
- La telomerasa no actúa como un oncogén, aunque favorece la selección de células malignas con mutaciones.
- La longitud telomérica es una barrera para la progresión tumoral.
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Description
Este cuestionario explora conceptos clave sobre intrones, el mecanismo de corte y empalme, y las funciones del ARNm y el ARNt en la biología molecular. Se abordan temas como el papel del snARN U1 y la estabilización de tránscritos en eucariotas. Ideal para estudiantes que desean afianzar su conocimiento en el campo de la genética y la biología celular.