Vragen en Opdrachten "Structuur en Functie Eiwitten" 2024 PDF

**Vragen en opdrachten "Structuur en functie eiwitten"** Voor alle vragen geldt dat de pH 7 is, tenzij anders vermeld! 1. Schrijf de structuurformule van cysteïne op. 2. Teken de structuur van lysine bij pH 12. De meeste zijketens hoef je niet uit je hoofd te kennen, want die kan je opzoeken....

**Vragen en opdrachten "Structuur en functie eiwitten"** Voor alle vragen geldt dat de pH 7 is, tenzij anders vermeld! 1. Schrijf de structuurformule van cysteïne op. 2. Teken de structuur van lysine bij pH 12. De meeste zijketens hoef je niet uit je hoofd te kennen, want die kan je opzoeken. 3. Schrijf de structuurformule van alanylcysteine op. Geef aan waar de peptidebinding zit. Waar zit een vlak deel in het peptide-molecuul? Beargumenteer of alanylcysteine hetzelfde is als cysteinylalanine. 4. Zoek ook de zijketen van proline op. Wat zijn de gevolgen van de aanwezigheid van prolines voor de structuur van een eiwit? 5. Beschouw het decapeptide Lys-Met-Leu-Ser-Tyr-Phe-Asp-Arg-Thr-Glu. a. Geef bovenstaand decapeptide weer gebruikmakend van de 1-lettercodes. b. Hoeveel geladen groepen heeft het molecuul en hoeveel van elke soort? c. Wat is de nettolading? d. Op hoeveel plaatsen in het molecuul zou een fosforylering kunnen optreden? e. Welke van de aminozuren hebben een polaire zijketen en welke een apolaire? f. Beredeneer of dit peptide oplosbaar is in water. Een tabel met aminozuren en hun eigenschappen kan je vinden op: https://www.biology-pages.info/A/AminoAcids.html Als je op de naam van een aminozuur klikt, krijg je ook de betreffende structuur te zien. 6. Geef een beschrijving van de volgende begrippen: primaire structuur, secundaire structuur, tertiaire structuur, quaternaire structuur, denaturatie en renaturatie. Beredeneer hoe denaturatie de verschillende structuurniveaus beïnvloedt. 7. Door welke krachten wordt de secundaire structuur bepaald? En door welke de tertiaire structuur? 8. ***5-minutenpraatje: Anfinsen's dogma*** *Christian Anfinsen was een Amerikaanse biochemicus, die in 1972 de Nobelprijs voor de Scheikunde ontving. Hij onderzocht de activiteit van ribonuclease nadat het was gedenatureerd en vervolgens opnieuw was gevouwen. De inzichten die hij uit deze experimenten afleidde zijn vervat in Anfinsen's dogma. Zoek op internet wat men verstaat onder Anfinsen's dogma.* *Extra: Andere wetenschappers hadden vergelijkbare experimenten gedaan, maar trokken niet dezelfde conclusies. Op Brightspace vind je hierover een artikel met de toepasselijke titel: "How Hard It Is Seeing What Is in Front of Your Eyes" (link in mapje "Extra informatie").*