Microbiología General PDF
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These notes provide a foundational overview of general microbiology. Key concepts like taxonomy, classification, and the diversity of microorganisms are discussed.
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## Microbiologia general ### Corte 2 ### Gelula - Arbol filogenetica de la vida - Procariotas - Bacteria - Aquifex - Thermodesulfobacterium - Thermotoga - Favobacterias - Cianobacteria - Cloroplasto -...
## Microbiologia general ### Corte 2 ### Gelula - Arbol filogenetica de la vida - Procariotas - Bacteria - Aquifex - Thermodesulfobacterium - Thermotoga - Favobacterias - Cianobacteria - Cloroplasto - Proteobacteria - Mitocondria - Gram positiva - Bacterias verdes no del azufre - Arquea - Pyrodictum - Thermopretus - _To Celer_ - Methanococcus - Methanosarcing - Methanobacterium - Holófilicos - Eucariotas - Eucarya - Diplomónadas - Microsporidios - Tricomónadas - Flagelados - Giliados - Plantas - Entamebas - Hongos - Hongos mucosas - Animales ### Taxonomia - Taxis: Estructuración y ordenar - Nomos: Ley distribuir o gobernar - Neimein: - La teoría y la práctica de clasificar organismos ### Clasificación - Organización en función de sus semejanzas ### Nomenclatura - Generar un nombre de acuerdo a las normas ### Identificación - Determinar que un aislamiento particular pertenece a un taxon reconocido ### Sistematica - Hace parte de la taxonomia, caracterizar y agrupar de forma ordenada. - Importancia: - Organizar el conocimiento. - Agrupar por características compartidas y diferenciales. - Caracteriza aislamientos. - Evolución. - Microbiologia clínica. - Nombres precisos (comunicación eficiente). La taxonomia estudia la clasificación de los seres vivos de acuerdo con su historia evolutiva, sus bases son en los trabajos de Darwin, linneo. Utiliza caracteres morfológicos, anatómicos, paleontológicos y biogeograficos, la clasificación puede ser natural o artificial. ### Nomenclatura - Reglas - Genero (mayúscula inicial), familia (minúscula inicial) - Ambos de origen latino. - Nomenclatura binomial (2 términos). - Ejemplo: *Sthaphylococcos aureus* - Generos en familias, familias en clases, clases en tipos. - Existe solo un nombre correcto para cada microorganismo. - Nombres que induzcan o confusión deben rechazarse. - El nombre de genero y especie mensionadas juntos estan sub-rayados o en itálica. - Los nombres podrán ser cambiados cuando: - Se transfiere una especie de un genero a otro. - Se encuentra una cepa que referencia pertenece a otro genero. - Un microorganismo incluye 2 o más generos. | Especie | Candidatus | Identificación | |---|---|---| | Genero | Existen algunas especies que no recibiran su nombre de forma valida, esto debido a que los requisitos basicos del codigo procariota no se pueden satisfacer aunque son especies reales y de sumą importancia. Asi que los taxonomistas crearon el termino candidatus para apoyar el nombramiento tentativo. | Si hay pigmentos o no. <br> Hemolisis alfa, beta, gamma. <br> Si hay esporas o no y la ubicación de estas. <br> Orden - ates <br> Clase - ias <br> Familia - aceaef | | Familia | | | | Orden | | | | Clase | | | | Filo o división | | | | Reino | | | | Dominio | | | ### Especie - Categoría que circunscribe un grupo genómicamente coherente de aislados individuales que comparten un alto grado de similitud. - Célula - Unidad anatomica y funcional ### Diversidad Fisiologica | Energia | Organicos | Inorgnicos | ATP | | ---------- | -------------------------------------------------------- | -------------------------------- | --------------------------------------- | | Compuestos quimicas (Quimiotrofia) | Quimiorganotrofos | Quimiolitotrofos | Adenositrifosfato | | Luz (Fototropia) | - Fototrofos | | | | Oxigeno | | Carbono | | --------------------------- | -------------------------------------------------------------------- | ------------------------------ | | Aerobios estrictos -> Necesitan oxigeno para vivir | | Heterotrofos - No producen lo que consumen | | Anaerobios estrictos -> No pueden vivir en presencia de oxigeno | | Autotrofos - Producen su propio alimento (LO2) | | Anaerobios aeroterantes -> No necesitan oxigeno para vivir pero lo toleran | | | | Facultativos -> Pueden vivir con o sin oxigeno | | | | Microgerofilos -> Necesitan poco oxigeno | | | ### Tolerancia Ambiental - Alcalófilo -> Psicrófilo -> Hipertermófilo - PH7 - 25°C - Acidófilo -> Halófilos -> Barófilos ### Archea - Extremófilos, no todas. - Quimiotrofas. - *Halobacterium:* Luz, pigmentos fotosensibles. - Metanógenos angerobios estrictos. - Y O2. - Termoacidófilos: Sin pared. ### Terminos - Enfermedad. Alteración más o menos grave de la salud. - Patogeno. Microorganismo que desarrolla una enfermedad. - Patogenicidad. Capacidad de producir pra enfermedad en hospedero suceptible. - Virulencia. Grado de patogenicidad del microorganismo. ### Germenes y enfermedad - Teoría del germen da la enfermedad - Teurgica. Castigo divino - Miasmática. Pestilencia, calles, basura, cuerpos enfermos en descomposición - Contagium fomites. Objeto inanimado, persona enferma - Contagium vivo. Persona - Teoria microbiana de la enfermedad - Fuerzas intangibles, invisibles y misteriosas. - Presencia e intrusión temporal de cuerpos extraños o espíritus malvados. - Magia y religión. - Teoria cosmica y sideral. - Teoria húmoral - Universo formado espacio, aire o viento, fuego, agua y tierra. - Teoría del miasmah - "Todo hedor es enfermedad" - Greencias Pasado ### Dominios y Reinos | Dominio | Reino | Tipo celular | Ejemplo | | -------- | --------- | ------------- | -------------- | | Archaea | Archaea | Procariota | Arqueas | | Bacteria | Bacteria | Procariota | Bacterias | | Eukaria | Protozoa | Eucariota | Oomicetos, algas | | | Fungila | Eucariota | Levaduras, mohos, setas | | | Plantae | Eucariota | Musgos, hepatica, coniferas, plantas con flores | | | Animalia | Eucariota | Esponjas, corales, gusanos, moluscos, insectos, vertebrados | ### Celula eucariota - Pared celular: - No esta presente en animales superiores, ni en protozoarios. Se evidencia en células vegetales, algas, hongos. - Funciones. - Protege los contenidos de la celula. - Da rigidez a la estructura celular. - Es mediadora en todas las relaciones de la célula con el entorno. - En el caso de los hongos y plantas, define la estructura y otorga soporte a los tejidos. - Actua como compartimento celular. - Esta compuesta por una red de carbohidratos estructurales empapados en una matriz gelatinosa compuesta por otros carbohidratos y proteinas. | Organismo | Tipo de constituyente | | ------------ | ----------------------------------------------------------------------- | | Plantas | Celulosa, pectina, ligning y/o sobering. <br> Proteinas estructurales. | | Hongos | Quitina y glucanos | | Algas | Glicoproteinas y polisacaridos (celulosa) <br> en algunas dioxido de silicio. Polisacaridos sulfonados (agarosa), Manosyl, ácido alginico. | - Membrana citoplasmatica - Estructura laminar formada por lípidos (con cabeza hidrofó-lica y cola hidrofóbica) y proteinas que engloban a las células. - Define los limites de la célula y contribuye a mantener el equilibrio entre el medio intracelular y el extracelular. - En eucariotas esta constituida por esteroles, que corresponden al 5-25% del total de lípidos. - Esterdes son moléculas rígidas y planas. - Hacen más estable pero menos flexible a la membrana, cosa importante ya que las eucariotas son sometidos a tensiones físicas por su tamaño. ### Retículo endoplasmático - Red interconectada de tubos aplanados y sáculos comunicados entre si. - Interviene en funciones relacionadas con la sintesis proteica, metabolismo de lípidos, carbohidratos y esterales, así como el transporte intracelular proteinas. - Permite el contacto entre el núdeo y los ribosomas del citoplasma. | Retículo endoplasmático | | ------------- | | Rugoso - Tiene adherido a su membrana ribosomas, su función es la sintesis de proteinas | | Liso - No tiene ribosomas, participa en el metabolismo de lípidos | | Ribosoma eucariota | Ribosoma procariota | | -------- | -------- | | Subunidad mayor 605 <br> -49 proteinas <br> + <br> ARNr 185 <br> + <br> 28 S <br> ARNr 5,85 <br> 55 | Subunidad mayor 505 <br> -34 proteinas <br> + <br> ARN 235 <br> 55 | | Subunidad menor 40S <br> -33 proteinas | Subunidad menor 305 <br> 21 proteings | | | + <br> ARN 165 | ### Aparato de golgi - Glicosilación. - Sintesis de esfingolipidos. - Centro de reparto de moléculas. - Almacenamiento de calcio. - Señalización intracelular - Control de la concentración de esteroles ### Mitocondrias - Respiración y fosforilación oxidativa. - El número y tamaño depende de la célula. - Sistema de doble membrang, menos rígida y sin esteroles. - Participan en la producción de ATP. - Proteinas de transporte. - Enzimas responsables de la oxidación de compuestos organicos. ### Hidrogenosomas - Garecen de las enzimaş del ciclo del ácido cítrico. - Tambien carecen de crestas. - Proceso fermentativo. - Ejemplo, Trichomonas. ### Cloroplastos - Gontienen dorofila. - Fotosintesis. - Contiene clorofila localizada en los tilacoides y se encuentra en eucariotas que realizan la fotosintesis. - Su número varia y su tamaño es más grande que el de las bacterias. ### Microtubulos - 25 nm. - Tubulina. Mantenimiento de la forma celular y la motilidad celular mediante oilios y flagelos. - Movimiento de cromosomas durante la mitosis. - Movimiento de organulos ### Microfilamentos - 7nm. - Polimeroz de 2 hebras entrelazadas de la proteína acting. - Mantenimiento o cambio de la forma. ### Filamentos intermediarios - Proteinas de querating fibrosa que se forman en fibras de 8 a 12 nm de diametro. | Caracteristicas | Procariotas | Eucariotas | | -------- | -------- | -------- | | Estructura | Simple | Compleja | | Organelos | No | Diferentes tipos | | Nucleo | ADN en contacto con el citoplasma | Membrana nuclear y huso mitotico | | Tiempo de división | 15 minutos | 18 a 24 horas | | Composición lipidos complejos de fosfolipidos y esfingolipidos | Muy frecuente | Común | | Gsteroles | Solo en micoplasmas | Siempre | | Caracteristicas | Procariotas | Eucariotas | | -------- | -------- | -------- | | Pared celular | Peptidoglicano con ácido murámico | Ausente o de pared de celulosa, quitina | | Membranas intracelulares | Ausentes | Presentes | | Cromosomas | 1, the Circular | Muchos, lineales | | Diploides | Haploide | Si | | Genes | Expresados en grupos | Expresados individualmente | | Histonas y nucleosomas | Ausentes | Presentes | | División celular | fisión Ginaria | Mitosis | ### Membrana citoplasmatica - Procariotas - 8 nm de grosor. - Proteínas y lipidas en diversas proporciones. - Lípidos más en procariotasiM. - Lípidos asimétricas con extremos polares (hidrofilicos) y no polares (hidrofóticos). - Bicapalípídica. - Archaea Monocapa. - Diferentes tipos de proteinas. - Proteinas periféricas: 20-30%. Debilmente unidas, solubles en aqua. - Proteinas integrales: 70-80%. Insolubles y no se extraen facilmente. - Impresindible en todo ser vivo. - Interacción ambiente (selectiva). - Mantener su interior en estado constante. - Sitio de unión. - Sitio sintesis de fosfolipidos. ### Transporte - Proteinas transportadoras. - Acumulan solutos dentro de la célula en contra de un gradiente de concentración. - Transporte facilitado. - Transporte activo. - Transporte pasivo. - Uniporte. Transporte de una sola molécula. - Cotransporte. Transporte de más de una molécula. - Simporte - Misma dirección. - Antsporte - Dirección contraria. ### Citoplasma - Sustancia situada entre la membrana plasmatica y d nucleoide. - Compuesta por agua 70%. - Procariotas carece de orgánulos determinados por membrang. - Contiene gran cantidad de proteinas, sales y metabolitos. ### Cuerpos de inclusión - Material organico e inorganico. - Reserua, reducir la presión osmótica mediante la energia de agregación de moleculas en forma particulada. - Libres en el citoplasma. - Membrana no unitaria 2,4 mm de grosor. ### Ribosomas - 70S. - Citoplasma lleno de ellos, unidos a membrana. - Sintesis de proteinas. - Menor tamaño que eucariotas. - Unidad Suedberg. - Gran número en el citoplasma. - Proteinas y ARN. ### Nucleoide - Diferencia más caracteristica entre procariotas y eucariotas. - Organización, número, tamaño 1 μm. - Material genetico en el citoplasma. - No delimitado. - Cromosoma lineal vibrio y Borrelia. - Región nuclear. - Plasmidos. - Conjugacion. - Episomas. - Lineales. - 1-ma de 40 copias. ### Pared celular - Confiere a la bacteria una forma rigida y las protege frente a la lisis en soluciones diluidas. - 20-80 nm de grosor. - Gram positivas y gram negativas. - Determina la forma celular. ### Peptidoglicano - N-acetil muramico. - N-Glucosaming. - Acidos tercoicos. - Polimeros hidrosolubles de glicerol o ribitol. - Esterificados por puentes fosfato. ### Membrana externa - Fosfotipiolas, polisacáridas y proteinas. - LPS: Gipidos y polísácáridos. - KDO: CetodeskToctonato. - Hep: Heptosa. ### Diversidad eucariota - Las primeras celulas que aparecieron fueron las procariotas. - Evolución de 1500 a 2000 millones de años. - Transición evolutiva. - Complejidad morfologica. - Incorporación genoma. ### Hipotesis endosimbiotica - Las mitocondrias y los cloroplastos contienen ADN, el ADN es circular. - El nucleo eucariota contiene genes derivados de bacterias. - Ribosomas organulos y su filogenia. - Especifidad antibiótica. - Hidrogenosomas (no los tienen todas las celulas, pero en las que los tienen se encargan del ATP, por medio de fermentación). - Endosimbiosis primaria - Célula procariata entra en célula eucariota (fagocitacis) - Endosimbiosis secundaria - Algas rojas y verdes. Son fagocitados por otras celulas que les favorecen cloroplastos. ### Chaperones - Proteinas de choque térmico. - Protegen a la estructura secundaria. ### Protistas - Eucariotas microbianos fototróficos y no fototróficos. - Ampliamente distribuidos en la naturaleza. - Morfologia diversa - Diversidad filogenetica - Diplomónadas y parabasálidos - Unicelulares - Flagelados - Sin mitocondria ni cloroplastos - Anaerobicos - Habitan en el intestino de los animales - Simbiontes o parasitos - Obtienen energia por fermentación | Diplomónadas | Parabasálidos | | -------- | -------- | | 2 nudeos del mismo tamaño | Cuerpo parabasal, soporte a golgi | | Mitosomas | Hidrageno | | Genoma compacto | Tracto gastrointestinal y urogenital | | *Giardia intestinalis* | *Trichomonas vaginalis* | | Enfermedad intestinal transmitida por agua | Movil por flajelos <br> Enfermedad sexual | ### Euglenozoos - Son flajelados. - De vida libre o parasitos. - Algunos patogenos tienen cinetoplasto (ADN en la única mitocondria). - Los euglenidos son moviles, no patogenos, fotótrofos o quimiotrofos. | Cinetoplastidos | Euglenidos | | -------------- | -------------- | | Ginetoplasto | No son patogenos | | Mitocondria única | Quimiotrofos o fotótrofos | | Ambientes quáticos, algunos patogenos | Ambientes de agua dulce o salada | | *Trypanosoma brucer, T. cruzi, leishmania* | Pueden alimentarse de bacterias por fagocitosis | | 1 nucleo, lash mania | Fotosintesis | ### Alveolados - Se caracterizan por sus alveolos ubicados debajo de la membrana citoplasmatica. - La función del alueolo es desconocida pero puede ayudar a mantener balance osmoticon. - Endosimbiontes secundarios. - Fototroficos = Cloroplastas. | Ciliados | Dinoflageladas | Apicomplejos | | -------- | -------- | -------- | | En algun momento touteron cilios. Los susan para moverse y alimentarse | Fototroficos agua duke. <br> Endosimbiosis secundaria. <br> Flagelos con movimiento de giro. <br> Vida libre o simbioticos. <br> Los simbioticon se asocian con arrecifes de coral. | No fotótrofos. <br> Parasitos obligados de animales. <br> Producen esporozoitor transmisores del parasito. | | Vacuola alimenticia | Intercambian habitad protegido por carbono neurotoxing. <br> *Gonyaulax exic* <br> *Pfieteriq* -> neurotoxing afecta moui-miento y destruye la piel | Proviene de la presencia de organuios localizados en un extremo de esporozoito. <br> Son cloroplasta degenerados. <br> *Plasmodum* <br> *Taxoplasma* <br> *Gimera*| | Micronucleo - reprodación. Macronucleo - Regular. | | | | *Balantidium coli* | | | | *Paramecium* | | | | 2 nucleos | | | | | ### Estramenopilos - Stramen: paja pilus: pelo - Microorganismos quimiorganotróficos y fototróficos y macroorganismos. | Oomycetos | Diatomea | Grisopitas | | -------- | -------- | -------- | | Hongos acuáticos. <br> Crecimiento filamentoso. <br> Cenocīticos. <br> Pared celular de celulosa. <br> fitopatógenos. <br> *Pytophthora* <br> *Pythium* | Fototrofos unicelulares. <br> fitoplancton agua dulce y marina. <br> Pared celular con silice, polisacaridos y profeinos. <br> Resistentes a la descomposición | Quimiorganotrofas. <br> Bifalageladas. <br> Unicelulares. <br> Pigmentos fucoxanting. <br> Carecen de ficobilinas. <br> *Ochromongs* 10-2 cloroplasta. <br> *Dinobryon* | ### Algas pardas - Marings. - Pluricelulares. - Macroscopico. - Marrones o marrón verdoso. - *Macrocystis* 50 m. - *Fucus* 2 m.