Introduction Mycologie 19 PDF

Généralités Champignons et mycoses Pr Mame Cheikh SECK Parasitologie-Mycologie 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 1 Plan Champignons Mycoses  Définition  Définition  Morphologie  Localisation  Modalités de croissance  Classification  Reproduction  Physiologie  Classification Déf...

Généralités Champignons et mycoses Pr Mame Cheikh SECK Parasitologie-Mycologie 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 1 Plan Champignons Mycoses  Définition  Définition  Morphologie  Localisation  Modalités de croissance  Classification  Reproduction  Physiologie  Classification Définition Les champignons (mycètes) sont des eucaryotes, dépourvus de chlorophylle; Incapables de photosynthèse Ils ne peuvent donc composer leurs propres substances qu’à partir de substances organiques Ils ne comportent ni feuilles, ni tiges, ni racine Ils sont donc hétérotrophes , se nourrissent par absorption Master 1 Pharmacie 3 Définition Champignons d’intérêt médical : microscopiques ou micromycètes Il existe environ 100 000 espèces de micromycètes dans la nature Moins d’une centaine d’entre eux sont impliquées en pathologie humaine Elles provoquent des maladies parasitaires appelées mycoses 4 Morphologie des Champignons 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 5 Caractères généraux  Les champignons sont constitués par un thalle qu’on appelle aussi mycélium Le thalle comporte deux parties :  Un appareil végétatif : assure le développement et la nutrition  Un appareil reproducteur : qui est chargé de la formation de tous les organes reproducteurs (spores) 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 6 Thalle  On distingue deux types de thalle - le thalle filamenteux - le thalle non filamenteux 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 7 Thalle filamenteux  Il est formé de filaments ou hyphes  Les filaments sont des tubes flexueux ou sinueux, de 2 à 5 µm de diamètre, limité par une paroi résistante et contenant une masse cytoplasmique renfermant un ou plusieurs noyaux  On distingue : 2 types - le thalle filamenteux cloisonné (ou septé) - le thalle filamenteux non cloisonné 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 8 Thalle filamenteux cloisonné  Tubule à l’intérieur duquel, à intervalles plus ou moins réguliers, on observe des cloisons Cloisons transversales appelées septums  Ces cloisons possèdent un pore central Pore permettant le passage de la matière nutritive, d’un segment à l’autre Noyau  Ce thalle s’observe chez les champignons supérieurs (anc. Septomycètes) Cytoplasme 9 Thalle filamenteux non cloisonné (coenocytique, siphoné)  Pas de cloisons transversales dans le tubule, de sorte que le cytoplasme et les noyaux peuvent y circuler librement Noyau  On le compare à un siphon Ce thalle s’observe chez les champignons inférieurs (anc. Siphomycètes) 06/10/2023 Master 1 Pharmacie Cytoplasme 10 Thalle non filamenteux On distingue 3 types : Thalle levuriforme Thalle fumagoïde Thalle en grain 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 11 Thalle levuriforme  Il est formé d’une cellule à noyau unique, arrondie ou ovalaire qui représente la totalité de l’organisme fongique :  C’est la levure 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 12 Thalle fumagoïde C’est un mycélium dissocié constitue d’éléments arrondis isolés ou en groupe, à membrane épaisse et de couleur noirâtre Ce thalle est caractéristique des champignons noirs, agents de la chromomycose 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 13 Thalle en grain  Il est caractéristique des tumeurs mycosiques appelées mycétomes  Les grains sont formés de filaments mycéliens enchevêtrés réunis par un Filaments mycéliens enchevêtrés ciment plus ou moins compact  Ils sont de taille variable ;  Leur surface est hérissée de filaments ou de massue 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 14 Modalités de croissance du thalle 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 15 Croissance du thalle filamenteux Le thalle filamenteux se développe à partir d’une spore par émission d’un tube germinatif et par croissance de la seule cellule terminale 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 16 Croissance du thalle levuriforme Le thalle levuriforme croit par bourgeonnement Il grossit au dépens de celle-ci jusqu’à un volume semblable au sien, puis il se détache finalement de la cellule-mère qui lui a donné naissance 17 Pseudomycelium Chez quelques espèces de levures comme les Candida, les bourgeons peuvent s’allonger sans se détacher de la cellule-mère, bourgeonnant à leur tour, tout en restant attachés les uns aux autres  Structure semblable au mycélium des thalles filamenteux : Pseudomycélium 06/10/2023 18 Champignons dimorphiques Ils se présentent sous 2 formes : - Levure : dans l’organisme humain ou animal - Filaments : en culture in vitro 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 19 Reproduction des champignons Les champignons se multiplient par : voie asexuée et voie sexuée  Grâce à des spores : Spores asexuées et spores sexuées 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 20 Reproduction asexuée  Elle est encore qualifiée d’imparfaite ou d’incomplète (Anamorphe), parce qu’il n’y a pas de fécondation Elle s’effectue grâce à la production de spores asexuées ou imparfaites On distingue trois types de spores asexuées : Thallospores, Conidiospores et Sporangiospores 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 21 Thallospores  Elles sont formées au dépend du thalle, par transformation d’un ou plusieurs segments de filament pré-existants ;  Elles sont terminales ou intercalaires  Elles sont intimement liées au filament et ont peu tendance à s’en détacher. Elles sont donc non caduques • On distingue 4 types de thallospores : arthrospores, blastospores, chlamydospores et aleuriospores 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 22 Arthrospores Ce sont des spores de forme rectangulaire, formées par dislocation du filament mycélien en articles Arthrospores Elles sont produites par les Geotrichum 06/10/2023 Filament Master 1 Pharmacie 23 Blastospores - Elles se forment par bourgeonnement d’un Blastospores élément préexistant - Le bourgeon se développe aux dépens de la cellule-mère - Il s’en détache après avoir atteint la même taille qu’elle - C’est le mécanisme qu’on observe chez les levures du genre Candida 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 24 Chlamydospores  Formes de résistance et de conservation des Terminales champignons  Leur paroi est épaisse et leur cytoplasme très dense, chargé de matières de réserve  Elles se forment au niveau d’un filament ; Intercalaires •Elles peuvent être intercalaire ou terminales 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 25 Aleuriospores (aleuries)  Ce sont de petites spores externes, formées Aleuries par bourgeonnement du filament  Elles sont souvent disposées en acladium (de part et d’autre du filament), en grappe ou en buisson  Elles jouent le rôle de conservation et de propagation En acladium  Elles ne se rencontrent que chez les dermatophytes 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 26 Conidiospores (conidies) Ce sont des spores qui naissent sur un filament dont elles ne font pas partie  Elles sont caduques et se séparent donc facilement du filament qui leur a donné naissance On distingue 2 types : - Microconidies (ou petites conidies) - Macroconidies (ou grandes conidies) Master 1 Pharmacie 27 Microconidies  Spores microscopiques  2 à 3 µ de diamètre  Sphériques, ovoïdes, ou piriformes  Produites par de nombreux champignons 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 28 Macroconidies  Spores en forme de fuseau  150 µ de diamètre,  Cytoplasme cloisonné  Leur paroi épaisse  Produites par les dermatophytes 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 29 Sporangiospores Sporangiospores  Spores internes qui se forment dans un sac appelé sporange, Sporange  Le sporange est formé par le renflement terminal d’un filament appelé sporangiophore Sporangiophore  Caractéristique des champignons inférieurs (anc. Siphomycètes) 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 30 La Phialide  Article souvent renflé en forme de bouteille, qui Conidies laisse échapper des conidies  Celles-ci peuvent, soit rester accollées, en petites boules par un mucus, soit être disposées en chainettes non ramifiées  Elles sont isolées ou groupées à l’extrémité d’un filament 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 31 La Pycnide  C’est un organe clos ou ouvert par un Conidies col, arrondi ou en forme de bouteille  Elle peut atteindre quelques centaines de microns  Elle est limitée par une paroi épaisse  Elle renferme des conidiophores producteurs de conidies souvent en très grand nombre 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 32 Reproduction sexuée  La reproduction sexuée est encore appelée reproduction parfaite (Téléomorphe), car elle résulte de la fusion de gamètes mâle et femelles  C’est donc à l’issu d’une véritable fécondation que sont produites les spores dites sexuées ou parfaites On distingue 3 types de spores sexuées : - Zygospores, Ascospores et Basidiospores 33 Zygospore (Zygote)  Spore unique, de grande taille, avec Filament ♂ une paroi épaisse souvent très Filament ♀ verruqueuse,  Elle est formée par la fusion de 2 gamétanges ( filaments différenciés en gamètes) Œuf (zygote)  Elle est caractéristique des Zygomycètes Master 1 Pharmacie 34 Ascospores  Ce sont des spores internes, habituellement au Ascospores nombre de 8  Elles sont contenues dans un sac allongé appelé asque,  L’asque se forme par dilatation de l’extrémité d’un filament fertile  Les ascospores sont caractéristiques des Asque champignons de la classe des Ascomycètes 35 Asques Les asques peuvent être soit isolés, soit enfermés dans des organes appelés ascocarpes  Il existe 3 types d’ascocarpe : - Le périthèce - Le cléistothèce - L’apothécie Master 1 Pharmacie 36 Le Périthèce  C’est une structure mesurant quelques Ostiole centaines de micron, dont la paroi est formée de filaments mycéliens Paroi enchevêtrés  Il est prolongé par un col qui a une ouverture à l’extérieur (ostiole)  A maturité, la paroi se lyse pour libérer les asques Asques Master 1 Pharmacie 37 Le cléistothèce Paroi  Le cléistothèce ressemble au périthèce mails il est complétement fermé Asques 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 38 L’apothécie C’est un ascocarpe ouvert en forme de coupe, au fond de laquelle se trouvent des asques Asques 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 39 Basidiospores  Ce sont des spores externes, généralement par groupe de 4, formées 4 basidiospores dans une baside.  La baside est une structure dilatée, qui se Baside forme à l’extrémité distale d’un filament fertile  Les basidiospores sont caractéristiques des champignons de la classe des Basidiomycètes Master 1 Pharmacie 40 Physiologie des champignons 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 41 Physiologie  Les champignons exigent pour leur développement : - du carbone sous forme d’hydrates de carbone (glucose, maltose) ; - de l’azote, exceptionnellement sous forme d’azote libre, généralement sous forme de nitrates, de sels d’ammonium (peptone) ou sous forme d’acides aminés - de facteurs de croissance dont ils ne réalisent pas la synthèse et qui sont notamment des acides aminés - Ils ont, en outre, besoin d’éléments minéraux tels que le phosphore, le potassium, le manganèse, le soufre et le calcium  Les champignons sont généralement aérobies (vivent en présence d’oxygène) 42 Physiologie  Ils croissent entre 20 et 30° C (pour les champ. superficiels de la peau) et 37° (pour les champ. des muqueuses et des organes profonds)  Ils supportent des variations de pH considérables, la neutralité leur convenant très bien  Tous les champignons pathogènes poussent aisément sur le milieu de Sabouraud (gélose, peptone, glucose ou maltose), où ils trouvent tout ce dont ils ont besoin pour leur croissance  Certaines levures assimilent les sucres : caractère est utilisé pour l’identification des espèces ( Auxanogramme ) Master 1 Pharmacie 43 Classification des champignons 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 44  La classification des champignons repose sur la reproduction sexuée  Actuellement on distingue 4 grands phylums selon Kwon Chung et Bennet (1992) - Zygomycotina - Ascomycotina - Basidiomycotina - Deuteromycotina 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 45 Zygomycotina  Leur thalle est siphoné (coenocytique)  Leur reproduction sexuée est assurée par des zygospores  Leur reproduction asexuée par des sporanges  Une classe : Zygomycète  2 ordres : - Mucorales ( genres : Absidia, Mucor, Rhizopus ) - Entomophtorales ( genres : Conodiobolus, Basidiobolus ) 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 46 Ascomycotina  Leur thalle est cloisonné  Leur reproduction sexuée s’effectue par des ascospores  Classe : Ascomycètes - Dermatophytes (3 genres : Tricophyton, Microsporum,Epidermophyton) - Aspergillus, - Pénicillium - etc. 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 47 Basidiomycotina Leur thalle est cloisonné  Leur reproduction sexuée s’effectue par des basidiospores  Classe : Basidiomycètes  Peu d’espèces pathogènes pour l’homme ou l’animal Master 1 Pharmacie 48 Deuteromycotina Encore appelés Fungi imperfecti car ils n’ont pas de formes parfaites (ou sexuées)  Classe des Blastomycètes  Genres : Candida, Cryptococcus 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 49 LES MYCOSES 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 50 Mycoses Définition : Les mycoses sont des affections dues aux champignons microscopiques  Dans la nature, il existe environ 100 000 espèces de champignons  Mais on considère que seuls 90 champignons sont pathogènes pour l’homme. Parmi eux on dénombre : - 50 agents de mycoses superficielles - 20 agents de mycoses sous-cutanées - 20 agents de mycoses viscérales 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 51 Habitat  La plupart des champignons vivent en saprophytes dans la nature (champignons exogènes). On les retrouve sur les plantes et dans le sol : - sol enrichi en fientes de pigeon (Cryptocoque), - en excrément de chauves-souris (Histoplasmes) - sol des piscines (Dermatophytes : T. mentagrophytes, T. rubrum, Epidermophyton floccosum)  Ils peuvent pénétrer dans l’organisme par voie digestive, respiratoire ou cutanée et s’y développer en provoquant des lésions locales ou générales  Ces mycoses sont le plus souvent sporadiques Master 1 Pharmacie 52 Habitat - D’autres champignons vivent dans l’organisme en saprophytes ( champignons endogènes ) - C’est le cas de Candida albicans, levures vivant en petite quantité dans le tube digestif - Enfin, d’autres champignons, très répandus dans la nature, saprophytes, inoffensifs habituellement, ne deviennent qu’occasionnellement pathogènes, lorsque les conditions favorables se présentent dans l’organisme – hôte - Ce sont des champignons opportunistes (Candida, Cryptococcus, Aspergillus) 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 53 Classification des mycoses On distingue trois types de mycose : Mycoses superficielles  Mycoses sous-cutanées Mycoses profondes (ou systemiques) 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 54 Mycoses superficielles Le champignon reste cantonné à la surface de la peau et des muqueuses. On distingue :  Candidoses superficielles  Dermatophyties (teignes)  Pityriasis versicolor 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 55 Mycoses sous-cutanées Le champignon pénètre profondément à travers la peau ou les muqueuses provoquant des ulcérations, des abcès, des nodules. On distingue :  Chromomycose  Sporotrichose  Mycétomes  Histoplasmose africaine 06/10/2023 56 Master 1 Pharmacie Mycoses profondes (systémiques) • Après pénétration dans l’organisme, le champignon se dissémine par voie sanguine dans les organes profonds (cœur, cerveau, reins).  Histoplasmose classique  Candidose profonde  Cryptococcose  Aspergillose  Blastomycose  Coccidioïdomycose et Paracoccidioïdomycose  Zygomycoses Master 1 Pharmacie 57 Questions ? 06/10/2023 Master 1 Pharmacie 58