Identification Of Prokaryotes PDF

‫تحديد بدائيات النوى‬ IDENTIFICATION OF PROKARYOTES  ‫التصنيف‬ TAXONOMY The study and grouping of organisms ‫ دراسة وتجميع الكائنات الحية‬ Three separate but interrelated areas ‫ ث?ثة مجا=ت منفصلة ولكن مترابطة‬ Identification ‫ ت...

‫تحديد بدائيات النوى‬ IDENTIFICATION OF PROKARYOTES  ‫التصنيف‬ TAXONOMY The study and grouping of organisms ‫ دراسة وتجميع الكائنات الحية‬ Three separate but interrelated areas ‫ ث?ثة مجا=ت منفصلة ولكن مترابطة‬ Identification ‫ تعريف‬ Process of characterizing organisms ‫ عملية توصيف الكائنات الحية‬ Classification ‫ تصنيف‬ Arrangement of organisms into groups ‫ ترتيب الكائنات الحية في مجموعات‬ Nomenclature ‫ التسميات‬ Assignment of a specific name ‫ تخصيص اسم محدد‬  TAXONOMY ‫التصنيف‬ ‫ولي للكائنات الحية الدقيقة إلى تصنيفها‬R‫ يؤدي التحديد ا‬ Initial identification of microorganisms results in their classification Based on evolutionary relationships ‫ بناء على الع?قات التطورية‬ ‫ التعرف على الكائنات الحية‬ Identification of microorganisms in particular ‫الدقيقة على وجه الخصوص‬ ‫تظل البيئات مهم‬ environments remains important e.g., Microbial contaminants can spoil food e.g., Identification of microbes present in a clinical patient is important in determining treatment ‫يكروبية أن تفسد الطعام‬a‫ يمكن للملوثات ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫ريض السريري مهم في تحديد الع?ج‬a‫وجودة في ا‬a‫يكروبات ا‬a‫ تحديد ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬  ‫تحديد هوية بروكاريوت‬ PROKARYOTE IDENTIFICATION Various techniques are employed to characterize and identify microorganisms ‫ يتم استخدام تقنيات مختلفة لتوصيف وتحديد الكائنات الحية الدقيقة‬ Phenotypic characteristics ‫ظهرية‬a‫ الخصائص ا‬ Microscopic morphology ‫جهري‬a‫ التشكل ا‬ Metabolic differences ‫يضية‬R‫ ا=خت?فات ا‬ Serology ‫مصال‬R‫ ا‬ Fatty acid analysis ‫حماض الدهنية‬R‫ تحليل ا‬ Genotypic characteristics ‫ الخصائص الوراثية‬ Nucleic acid probes DNA amplification ‫ مجسات الحمض النووي‬ ‫ تضخيم الحمض النووي‬ rRNA sequencing ‫ تسلسل الرنا الريباسي‬  ‫ظهرية‬a‫الخصائص ا‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫جهري‬a‫التشكل ا‬ Microscopic morphology Size and shape ‫الحجم والشكل‬ Readily determined by microscopic examination of a wet mount ‫جهري للتركيبة الرطبة‬a‫ يتم تحديده بسهولة عن طريق الفحص ا‬ Can determine whether the microbe is a prokaryote, fungus, or protozoan ‫والي‬R‫ أو ا‬،‫ أو الفطريات‬،‫يكروب هو بدائيات النوى‬a‫ يمكن تحديد ما إذا كان ا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Microscopic morphology Size and shape Often sufficient for clinical ،‫ غالبا ً ما تكون كافية للتشخيص السريري‬ diagnosis e.g., ‫بيضات في‬a‫شعرات مقابل ا‬a‫ ا‬،‫ثال‬a‫على سبيل ا‬ ‫هبلية‬a‫فرازات ا‬y‫ا‬ Trichomonas vs. Candida in vaginal secretions ‫ستديرة في‬a‫ بيض الدودة ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ e.g., Roundworm eggs in ‫البراز‬ stool Size, shape, and other features often sufficient for identification ‫خرى غالبا ما تكون كافية‬R‫يزات ا‬a‫ الحجم والشكل وا‬ ً ‫لتحديد الهوية‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫لتصقة ببعضها البعض بعد‬a‫ الخ?يا ا‬ ‫ا=نشطار الثنائي غالبا ما تشكل‬ Microscopic morphology ‫ترتيبات مميزة‬ Cell groupings ‫ مجموعات الخ?يا‬ Cells adhering to one another following binary fission often form characteristic arrangements e.g., Neisseria gonorrhoeae typically displays a diplococcus arrangement ‫مزدوجا‬ ً ‫ تظهر النيسرية البنية عادة ترتيبًا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ e.g., Most Streptococcus species form long chains e.g., Most Staphylococcus species form grapelike clusters e.g., Sarcina species for cubical packets ‫كورات العقدية س?سل طويلة‬a‫ تشكل معظم أنواع ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫كورات العنقودية مجموعات تشبه‬a‫ تشكل معظم أنواع ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫العنب‬ ‫كعبة‬a‫ للحزم ا‬Sarcina ‫ أنواع‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Microscopic morphology Cell groupings ‫مجموعات الخ?يا‬ Cells adhering to one another ‫لتصقة ببعضها البعض بعد ا=نشطار‬a‫ الخ?يا ا‬ following binary fission often ‫الثنائي غالبا ما تشكل ترتيبات مميزة‬ form characteristic arrangements e.g., Neisseria gonorrhoeae ‫ النيسرية البنية‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ typically displays a diplococcus ‫مزدوجا‬ ً ‫يعرض عادةً ترتيبًا‬ arrangement e.g., Most Streptococcus species form long chains e.g., Most Staphylococcus species form grapelike clusters e.g., Sarcina species for cubical packets ‫كورات العقدية س?سل طويلة‬a‫ تشكل معظم أنواع ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫كورات العنقودية مجموعات تشبه العنب‬a‫ تشكل معظم أنواع ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫كعبة‬a‫ للحزم ا‬Sarcina ‫ أنواع‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Microscopic morphology Gram stain Differential stain ‫ التمييز ب| البكتيريا‬ ‫إيجابية الجرام وسالبة‬ distinguishing between ‫الجرام‬ gram-positive and gram-negative bacteria Narrows possible identities of an organism ‫حتملة للكائن الحي‬a‫ يضيق الهويات ا‬ Excludes many possibilities ‫ يستبعد العديد من ا=حتما=ت‬ Generally insufficient alone for diagnosis ‫ عموما غير كافية وحدها للتشخيص‬ e.g., E. coli and Salmonella gram stains look alike ‫شريكية‬y‫ تشابه بقع ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ?‫وني‬a‫القولونية والسا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Microscopic morphology Gram stain Sometimes highly suggestive of ‫حيان توحي بشدة‬R‫ في بعض ا‬ |‫بوجود كائن حي دقيق مع‬ a particular microorganism e.g., Gram-negative rods in urine ‫ العصيات سالبة الجرام في البول‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ E. coli UTI ← → E. coli UTI e.g., Gram-positive encapsulated ‫غلفة‬a‫كورات الثنائية ا‬a‫ ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ diplococci and numerous white ‫إيجابية الجرام والعديد من خ?يا الدم البيضاء‬ blood cells in sputum ‫في البلغم ← العقدية الرئوية‬ → Streptococcus pneumoniae Sometimes enough for complete diagnosis ‫حيان يكفي للتشخيص الكامل‬R‫ في بعض ا‬ e.g., Gram-negative diplococci clustered in white blood cells of male urethral secretions → Neisseria gonorrhoeae ‫تجمعة في خ?يا الدم‬a‫كورات الثنائية سلبية الجرام ا‬a‫ ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫البيضاء في إفرازات مجرى البول الذكورية ← النيسرية البنية‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Microscopic morphology Special stains ‫ البقع الخاصة‬ Some microbes have ‫يكروبات‬a‫ تتمتع بعض ا‬ unique characteristics ‫بخصائص فريدة يمكن‬ that can be detected ‫اكتشافها بإجراءات صبغ‬ ‫خاصة‬ with special staining procedures ‫ تعتبر بكتيريا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ Filobasidiella e.g., Filobasidiella (Cryptococcus) neoformans is one of a few (Cryptococcus) neoformans types of capsule-forming yeast ‫نواع القليلة من الخميرة‬R‫واحدة من ا‬ ‫التي تشكل الكبسولة‬ Capsule stain on cerebrospinal fluid is diagnostic for cryptococcal meningitis ‫وجودة على السائل النخاعي تشخيصية =لتهاب السحايا‬a‫ تعتبر وصمة الكبسولة ا‬ ‫ستخفيات‬a‫با‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Microscopic morphology Special stains Some microbes have unique characteristics that can be ‫يكروبات بخصائص فريدة يمكن‬a‫تتمتع بعض ا‬ detected with special staining procedures ‫اكتشافها بإجراءات صبغ خاصة‬ e.g., Mycobacterium ‫ تمتلك‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ species possess cell ‫تفطرة جدرانًا‬a‫أنواع ا‬ walls with a high lipid ‫خلوية تحتوي على نسبة‬ ‫عالية من الدهون‬ content Acid-fast stain on ‫قاومة‬a‫ تعتبر البقع ا‬ sputum is diagnostic ‫للحمض على البلغم بمثابة‬ for tuberculosis ‫رض السل‬a ‫تشخيص‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Colony morphology Colonies can exhibit ‫ يمكن للمستعمرات أن تظهر‬ ‫اخت?فات مجهرية‬ macroscopic Pseudomonas aeruginosa differences e.g., Colonies of streptococci generally form fairly small colonies ‫كورات العقدية عمو ًما مستعمرات صغيرة إلى حد ما‬a‫ تشكل مستعمرات ا‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ e.g., Colonies of Serratia marcescens produce a pigment ‫ تنتج‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫مستعمرات السراتية الذابلة‬ and are often red when incubated at 22oC ‫صبغة وغالبًا ما تكون حمراء عند‬ e.g., Colonies of Pseudomonas aeruginosa often produce 22 ‫حضنها عند درجة حرارة‬ a soluble greenish pigment.‫درجة مئوية‬ Pseudomonas ‫ غالبًا ما تنتج مستعمرات‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫ صبغة خضراء قابلة للذوبان‬aeruginosa  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫يضية‬R‫ا=خت?فات ا‬ Metabolic differences Culture characteristics ‫ خصائص الثقافة‬ Selective and differential media can aid in the identification of microbes ‫يكروبات‬a‫ يمكن للوسائط ا=نتقائية والتفاضلية أن تساعد في تحديد ا‬ Selective media favors the growth of certain types of microbes ‫يكروبات‬a‫ تفضل الوسائط ا=نتقائية نمو أنواع معينة من ا‬ by inhibiting the growth of others ‫عن طريق تثبيط نمو أنواع أخرى‬ Differential media contains a substance that certain bacteria change in a recognizable way ‫ تحتوي الوسائط التفاضلية على مادة تتغير فيها بعض البكتيريا بطريقة يمكن‬ ‫التعرف عليها‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences ‫يضية‬R‫ا=خت?فات ا‬ Culture characteristics ‫خصائص الثقافة‬ MacConkey agar is both ‫ أجار ماكونكي هو أجار‬ selective and differential ‫انتقائي وتفاضلي‬ Bile salts and dyes inhibit ‫صباغ الصفراوية على تثبيط‬R‫م?ح وا‬R‫ تعمل ا‬ all but certain gram- ‫جميع العصيات السالبة لجرام ما عدا بعض أنواعها‬ negative rods “Selective” ‫ "انتقائية‬ ‫القادرة على‬ Acid produced by bacteria able to ferment lactose‫البكتيريا‬ ‫الذي تنتجه‬ will turn a pH‫ الحمض‬ ‫تخمير ال?كتوز سوف يحول مؤشر الرقم‬ indicator red and form red colonies ‫حمر ويشكل‬R‫الهيدروجيني إلى اللون ا‬ “Differential” "‫ "التفاضلي‬ ‫مستعمرات حمراء‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫يضية‬R‫ا=خت?فات ا‬ Metabolic differences Culture characteristics ‫خصائص الثقافة‬ Blood agar can be used to detect ‫ يمكن استخدام أجار الدم للكشف عن البكتيريا‬ ‫نتجة للدم‬a‫ا‬ bacteria producing hemolysins e.g., Harmless Streptococcus ‫ العقدية غير الضارة‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ species residing in the throat often ‫وجودة في الحلق انح?ل الدم‬a‫نواع ا‬R‫غالبًا ما تسبب ا‬ cause alpha-hemolysis ‫ألفا‬ Greenish clearing around colonies ‫ستعمرات‬a‫ مساحات خضراء حول ا‬ e.g., “Strep throat”-causing ‫ الذي‬- "‫ "التهاب الحلق‬،‫ثال‬a‫على سبيل ا‬ Streptococcus pyogenes causes ‫قيحة ويؤدي إلى‬a‫كورات العقدية ا‬a‫يسبب ا‬ beta-hemolysis ‫انح?ل الدم بيتا‬ Clear zone around colonies ‫ستعمرات‬a‫ منطقة واضحة حول ا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Culture characteristics Media lacking nitrogen can be used to detect nitrogen-fixing bacteria ‫ يمكن استخدام الوسائط التي تفتقر إلى النيتروج| للكشف عن‬ e.g., Azotobacter |‫ثبتة للنيتروج‬a‫البكتيريا ا‬ ‫ يمكن‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ can be identified ‫التعرف على البكتيريا‬ from soil samples ‫اˆزوتوباكتر من عينات‬ incubated ‫حتضنة هوائ ًيا في‬a‫التربة ا‬ aerobically on ‫مثل هذه الوسائط‬ such media  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫يضية‬R‫ا=خت?فات ا‬ Metabolic differences Biochemical tests ‫ا=ختبارات البيوكيميائية‬ Generally necessary for more conclusive identification ‫ ضروري بشكل عام لتحديد هوية أكثر حسما‬ Most rely on pH indicator or color change when a compound is degraded ‫ركب‬a‫ يعتمد معظمها على مؤشر الرقم الهيدروجيني أو تغير اللون عند تحلل ا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Biochemical tests ‫ا=ختبارات البيوكيميائية‬ Sugar fermentation ‫ تخمير السكر‬ ‫ ال?كتوز‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬e.g., Lactose, sucrose,.‫ وما إلى ذلك‬،‫والسكروز والجلوكوز‬ glucose, etc. ‫ يؤدي التخمير إلى‬ Fermentation results in ‫إنتاج الحمض‬ acid production ‫ يتغير لون مؤشر الرقم الهيدروجيني‬pH indicator changes color Pink → yellow ‫صفر‬R‫ الوردي → ا‬ Inverted tube (Durham tube) collects any gas produced ‫ أنبوب مقلوب )أنبوب دورهام( يجمع أي غاز يتم إنتاجه‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Biochemical tests Urease detection ‫كشف اليوريا‬ Enzyme degrading urea |‫ه‬a‫ إنزيم اليوريا ا‬ Urea → CO2 & NH3 NH3‫ اليوريا ← ثاني أكسيد الكربون و‬ pH indicator turns ‫ يتحول مؤشر الرقم الهيدروجيني‬ bright pink in alkaline ‫إلى اللون الوردي الفاتح في‬ ‫الظروف القلوية‬ conditions Helicobacter pylori can be detected using a breath test ‫ يمكن الكشف عن بكتيريا هيليكوباكتر بيلوري باستخدام اختبار التنفس‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Biochemical tests Urease detection ‫يمكن الكشف عن بكتيريا‬ Helicobacter pylori can be detected using a ‫هيليكوباكتر بيلوري باستخدام‬ breath test ‫اختبار التنفس‬ Causative agent of most stomach ulcers ‫عدة‬a‫عظم قرح ا‬a ‫سبب‬a‫العامل ا‬ Culturing not necessary ‫ زراعة ليست ضرورية‬ ‫ريض محلول يحتوي‬a‫يشرب ا‬ Patient drinks solution containing 14C-labeled urea C ‫ يوريا ذات ع?مة‬14 ‫على‬ 14C in expired are indicates presence of urease ‫ درجة مئوية منتهية الص?حية تشير إلى وجود اليوريا‬14  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Biochemical tests Catalase ‫الكات?ز‬ Commonly occurring enzyme ‫نزيم الشائع‬y‫ ا‬ Possessed by most bacteria growing in the presence of oxygen |‫كسج‬R‫ تمتلكها معظم البكتيريا التي تنمو في وجود ا‬ Absent in lactic acid bacteria ‫ غائب في بكتيريا حمض ال?كتيك‬ e.g., Streptococcus ‫ العقدية‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ Beta-hemolytic catalase-negative bacteria from a throat culture may be Streptococcus pyogenes ‫أخوذة من‬a‫ قد تكون البكتيريا سالبة الكاتا=ز الحالة للدم بيتا ا‬ Streptococcus pyogenes ‫مزرعة الحلق عبارة عن بكتريا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Biochemical tests Catalase Simple assay ‫فحص بسيط‬ H2O2 → H2O & O2 O2 bubbles are visible ‫ فقاعات مرئية‬O 2  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫يتم التعرف على‬ ‫الكائنات الحية‬ Organisms are identified using a ‫باستخدام مفتاح‬ ‫ثنائي‬ dichotomous key ‫ عادةً ما تكون هناك‬ Multiple biochemical and other ‫حاجة إلى اختبارات‬ tests are typically required ‫كيميائية حيوية متعددة‬ ‫واختبارات أخرى‬ Multiple tests are generally run concurrently Avoids waiting for incubation time ‫ يتم عمو ًما إجراء‬ for each test ‫اختبارات متعددة بشكل‬ ‫متزامن‬ ‫ تجنب انتظار وقت الحضانة لكل اختبار‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Metabolic differences Biochemical tests ‫التعدي?ت التجارية ل?ختبارات البيوكيميائية التقليدية‬ Commercial modifications of traditional biochemical tests e.g., APITM system, EnterotubeTM PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫مصال‬R‫ا‬ Serology ‫يمكن للبروتينات والسكريات‬ Proteins and polysaccharides of some bacteria can ‫وجودة في بعض البكتيريا‬a‫ا‬ function as identifying markers ‫أن تعمل كع?مات تعريف‬ Generally molecules on surface structures ‫ عموما جزيئات على الهياكل السطحية‬ e.g., Cell wall, glycocalyx, flagella, pili ‫شعار‬R‫ وا‬،‫ والسوط‬،‫ والجليكالوكسي‬،‫ جدار الخلية‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ Detection is based upon the ‫ويستند الكشف على‬ specific interaction between ‫ضادة‬a‫جسام ا‬R‫تفاعل محدد ب| ا‬ ‫ستضدات‬a‫وهذه ا‬ antibodies and these antigens e.g., Rapid detection of Streptococcus pyogenes ‫ الكشف السريع‬،‫ثال‬a‫ على سبيل ا‬ ‫قيحة‬a‫كورات العقدية ا‬a‫عن ا‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS ‫حماض الدهنية‬R‫تحليل ا‬ Fatty Acid Analysis Bacteria differ in the type and relative quantity of fatty acids that comprise their membranes ‫تختلف البكتيريا في النوع والكمية النسبية ل حماض الدهنية التي تتكون منها أغشيتها‬ Can function as an identifying marker ‫يمكن أن تعمل كع?مة تعريف‬ ‫تمتلك البكتيريا سالبة الجرام‬ Gram-negative bacteria possess fatty acids in both of their membranes ‫أحماض دهنية في ك? أغشيتها‬ Gram-positive bacteria possess only a single membrane ‫تمتلك البكتيريا إيجابية الجرام غشا ًء واح ًدا فقط‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Fatty Acid Analysis ‫حماض الدهنية‬R‫تحليل ا‬ Cells are treated with NaOH and methanol ‫يثانول‬a‫ وا‬NaOH ‫تتم معالجة الخ?يا باستخدام‬ Fatty acids are released and converted into methyl esters Methyl esters ‫حماض الدهنية‬R‫ يتم إط?ق ا‬ ‫يثيل عن‬a‫ تحليل استرات ا‬ ‫يثيل‬a‫وتحويلها إلى استرات ا‬ analyzed via gas ‫طريق الفصل اللوني للغاز‬ chromatography Profile compared to those of known species ‫مقارنة تلك الخاصة‬ ‫عروفة‬a‫نواع ا‬R‫با‬  GENOTYPIC CHARACTERISTICS Nucleic acid probes ‫مجسات الحمض النووي‬ Used to locate unique sequences ‫تستخدم لتحديد تسلس?ت فريدة من نوعها‬ Single-stranded DNA (or RNA) (‫فرد الذي تقطعت به السبل )أو الحمض النووي الريبي‬a‫الحمض النووي ا‬ Generally labeled (radioactive or fluorescent) (‫مصنف بشكل عام )مشع أو فلورسنت‬ Complementary to the sequence of interest ‫تسلسل مكمل للفائدة‬ Observe and identify intact microorganisms ‫مراقبة وتحديد الكائنات الحية الدقيقة السليمة‬ Fluorescence in situ hybridization (FISH) (FISH) ‫وقع‬a‫التهج| الفلوري في ا‬ Observe and identify samples ‫مراقبة وتحديد العينات‬ Generally preceded by DNA amplification ‫يسبقه عموما تضخيم الحمض النووي‬  PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Polymerase chain reaction ‫تسلسل‬a‫تفاعل البوليميراز ا‬ Amplifies specific nucleotide sequences ‫يعمل على تضخيم تسلس?ت نيوكليوتيدات معينة‬ DNA can be obtained from many sources ‫يمكن الحصول على الحمض النووي من عدة مصادر‬ e.g., Body fluids, soil, food, water, etc. ‫ وما إلى ذلك‬،‫اء‬a‫ وا‬،‫ والغذاء‬،‫ والتربة‬،‫ سوائل الجسم‬،‫ثال‬a‫على سبيل ا‬ Useful in detecting microbes present in extremely small numbers ‫يكروبات‬a‫مفيد في الكشف عن ا‬ Useful in detecting microbes that are difficult to culture ‫وجودة بأعداد صغيرة للغاية‬a‫ا‬ Amplified DNA can be analyzed ‫يكروبات التي يصعب زراعتها‬a‫مفيد في الكشف عن ا‬ ‫ضخم‬a‫يمكن تحليل الحمض النووي ا‬ PHENOTYPIC CHARACTERISTICS Polymerase chain reaction Procedure DNA is isolated, then denatured ‫يتم عزل الحمض النووي ثم تغيير طبيعةه‬ Complementary primers are ‫يتم إطالة البادئات التكميلية‬ lengthened DNA is doubled ‫يتم مضاعفة الحمض النووي‬ Repeat ~30 times ‫ مرة‬30 ~ ‫كرر‬ GENOTYPIC CHARACTERISTICS Polymerase chain reaction Procedure DNA is isolated, then denatured ‫ ثم التشويه‬،‫يتم عزل الحمض النووي‬ Complementary primers are lengthened ‫يتم إطالة البادئات التكميلية‬ DNA is ‫يتم مضاعفة‬ doubled ‫الحمض النووي‬ Repeat ~30 times GENOTYPIC CHARACTERISTICS Sequencing ribosomal RNA genes ‫ موجودة في‬rRNAs ‫ث?ثة‬ Three rRNAs present in 70S bacterial ribosomes 70S ‫الريبوسومات البكتيرية‬ 5S, 16S, and 23S Evolutionarily highly ‫جينات محفوظة بدرجة عالية‬ ‫من الناحية التطورية‬ conserved genes Variable regions are used ‫يتم استخدام مناطق متغيرة‬ to identify an organism ‫لتحديد هوية الكائن الحي‬ Particularly useful in identifying microbes that are difficult to culture ‫مفيد بشكل خاص في تحديد‬ ‫يكروبات التي يصعب زراعتها‬a‫ا‬ GENOTYPIC CHARACTERISTICS