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Università San Raffaele Roma

Carlotta Giromini

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Animal production epigenetics nutrition biology

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This document appears to be lecture notes on animal production, focusing on the topics of nutrition and epigenetics. It includes various diagrams, graphs, and tables related to these concepts. It was presented at Università San Raffaele Roma.

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Insegnamento Produzioni Animali Professore Carlotta Giromini Argomento Nutrizione ed epigenetica II Carlotta Giromini La dieta modula l’espressione dei geni e determinando...

Insegnamento Produzioni Animali Professore Carlotta Giromini Argomento Nutrizione ed epigenetica II Carlotta Giromini La dieta modula l’espressione dei geni e determinando diverso fenotipo Nutrizione ed Epigenetica 2014 Nutrizione ed epigenetica II 2 di 17 Carlotta Giromini APE OPERAIA E APE REGINA Ape operaia ha identico DNA dell’ ape regina CH3 legati alla sequenza di DNA cambiano l’espressione di alcuni geni Ruolo chiave della dieta ( Royal Jelly) nello stato larvale dell’animale 550 geni hanno mostrato differenti siti metilati nel DNA delle operaie rispetto all’ape regina Piccola parte del DNA è metilato rispetto al DNA umano Kucharski R., Maleszka J., Foret S., Maleszka R. Nutritional Control of Reproductive Status in Honeybees via DNA Methylation (2008). Science, 319: 1827-1830 Nutrizione ed epigenetica II Nutrizione ed Epigenetica 3 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica La dieta povera in metionina (methyl- deficient diet MDD), colina e folati riduce significativamente la quantità di DNA metilato nel fegato del topo Quantità di DNA ipometilato nel fegato di topi alimentati per 18 giorni con dieta Methyl adequate MAD (barre grigie) e topi alimentati con dieta povera in metionina (MDD) Nutrizione ed epigenetica II 4 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica CTR (MAD) Methyl- deficient diet (MDD) La dieta povera in metionina (methyl- deficient diet MDD), colina e folati induce steatosi epatica Nutrizione ed epigenetica II 5 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Male Fisher 344 - Colina + Colina - Acido folico + Acido folico (2mg/kg) Low met (0,18%) 118753 LOMBARDI CHOLINE DEFICIENT DIET 118754 LOMBARDI CHOLINE SUPPLEMENTED DIET MDD MSD (CTR) Estrazione DNA da fegato Estrazione DNA da fegato Nutrizione ed epigenetica II 6 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Effect of the methyl-deficient diet on damage of hepatic DNA Aumento 8OH-dG e 3’OH-end significativo rispetto al CTR (MSD) Nutrizione ed epigenetica II 7 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Effect of the methyl-deficient diet on damage of hepatic DNA + espressione dei geni coinvolti nei processi di riparazione del DNA ( BER genes) Nutrizione ed epigenetica II 8 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Effect of the methyl-deficient diet on the status of DNA methylation STATO DI METILAZIONE (CITOSINA) NEL FEGATO DI RATTI TRATTATI CON DIETA MDD E CONTROLLO 9 settimane 18 settimane CTR 3129±416 3406±536 Global ipomethylation A MDD 5068±492* 6232±738* CTR 6220±840 5986±764 Global ipomethylation B MDD 9516±1022* 11320±1780* Nutrizione ed epigenetica II 9 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Dopo 9 sett / MDD Status DNA damage after re- feeding a methyl-sufficient diet Riduzione del danno al DNA con re-feeding Dopo 18 sett / MDD Normalizzazione dell’espressione dei geni BER Nutrizione ed epigenetica II 10 di 17 Carlotta Giromini Status DNA methylation after re-feeding a methyl- Nutrizione ed epigenetica sufficient diet After 9 week of MDD Normalizzazione dello stato di metilazione dopo 9 settimane di MDD After 18 week of MDD Dopo 18 settimane di trattamento MDD il DNA rimane IPOMETILATO Nutrizione ed epigenetica II 11 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica MDD provoca danno al DNA e alterazioni pattern di metilazione cellulare nel tessuto Re-introduzione dell’adeguato quantitativo di metionina nella dieta : epatico v Dopo 9 settimane MDD/ MSD : temporali alterazioni alla molecola di DNA delle cellule del tessuto epatico e alterazioni al pattern di metilazione del DNA v Dopo 18 settimane MDD / MSD : riparazione delle lesioni del DNA , persistenza dell’alterata metilazione del DNA Metilazione al DNA aspetto importante nello sviluppo di neoplasie Nutrizione ed epigenetica II 12 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica v -- non significativa 5mC v ++ non significativo 8OH-dG v Sistema di compensazione di SAM- SAH?? v Ruolo essenziale della dieta Nutrizione ed epigenetica II 13 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Supplemento di acidi grassi essenziali Estrazione DNA / RNA da tessuto intestinale RT-PCR ChIP Nutrizione ed epigenetica II 14 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica v Espressione del gene SI (sucrase-isomaltase) nell’intestino del topo alimentato con dieta High carbo / High fat v Gene SI partecipa alla digestione amido e saccarosio Nutrizione ed epigenetica II 15 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Tecnica ChIP per la quantificazione degli istoni acetilati H3 e H4 del gene SI Nutrizione ed epigenetica II 16 di 17 Carlotta Giromini Nutrizione ed epigenetica Nutrizione ed epigenetica II 17 di 17

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