Statistiques pour Médecins: Revue systématique et méta-analyse PDF
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Faculté de Médecine
Christophe Combescure Angèle Gayet-Ageron
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Summary
Ce document présente un aperçu des statistiques pour les médecins, avec un accent particulier sur les revues systématiques et les méta-analyses. Il explore les mesures d'association, les biais possibles dans les analyses, et les différentes méthodes pour réaliser une revue systématique, ainsi que leur intérêt et biais. Le document contient des exemples, des définitions et des tests statistiques, et évoque la hiérarchie des preuves dans les études.
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STATISTIQUES POUR MEDECINS Revue systématique et méta-analyse Christophe Combescure Angèle Gayet-Ageron Unité d’Appui Méthodologique du CRC FACULTÉ DE MÉDECINE Revue dernière séance Mesures d’association – utile pour i...
STATISTIQUES POUR MEDECINS Revue systématique et méta-analyse Christophe Combescure Angèle Gayet-Ageron Unité d’Appui Méthodologique du CRC FACULTÉ DE MÉDECINE Revue dernière séance Mesures d’association – utile pour interpréter l’effet d’une intervention, la relation entre un facteur d’exposition et le problème de santé – dépend de la nature des variables étudiées – odds ratio, risque relatif, différence de risque, différence de moyennes, hazard ratio, … Cinq explications possibles pour une association: – causalité, causalité inverse, effet de confusion, biais, hasard Biais (erreur systématique) vs hasard (erreur aléatoire) Principaux biais: – biais de sélection, biais d’information 2 Revue dernière séance Exemple d’effet de confusion Consommation Décès de café Candidats: Consommation de tabac Z Consommation d’alcool Facteur de confusion Activité physique Consommation de fruits Consommation de viande rouge Pour neutraliser les effets de confusion: – randomisation (essais cliniques) – appariement (certaines études cas-témoins) – stratification – ajustement statistique (modèle multiple) 3 Objectifs Comprendre les notions suivantes: – revue systématique d’essais cliniques randomisés sur un thème donné – méta-analyse – effet commun (odds ratio, différence de moyenne,…) – hétérogénéité – biais de publication Chapitres Petrie/Sabin 43: Méta-analyse 4 Comment résoudre une question clinique ? A partir de quelles informations ? Improviser Demander à un collègue expérimenté Relire un textbook Faire une recherche rapide sur Pubmed 30 000 journaux référencés! 37 millions d’articles référencés! Revue (systématique) narrative Revue systématique avec analyse statistique synthétisant les études retenues (méta-analyse) 5 Exemple d’une situation clinique Vous vous demandez si l’ergothérapie améliore la récupération après un accident vasculaire cérébral (AVC) 6 Mots clés 7 Recherche d’articles « vite fait bien fait » Limites: – mots clés très restrictifs: risque de rater des articles intéressants trop vagues: liste de références très longue – trop d’études à résumer et à combiner de manière improvisée – lecture non détaillée des articles par manque de temps – sélection de certains articles…. sur quelle base ? les plus récents ? ceux qui montrent une efficacité de l’intervention? – risque important d’une sélection non objective de l’information Risque d’une lecture partielle, fragmentée, biaisée 8 Alternative: la revue* systématique Revue systématique: – revue méthodique – consiste à trouver toutes les études analysant une question de recherche donnée évaluer et discuter ces études (qualité, méthodologie, population cible, résultats,…) – permet de avoir une vision globale des recherches faites sur une certaine question éviter les biais de sélection et d’interprétation expliquer pourquoi les résultats des différentes études varient * En bon français: recension (= examen critique et détaillé des textes ) 9 Méthode: revue systématique (1) 1) Définition d’une question clinique 10 Méthode: revue systématique (2) 2) Stratégie de recherche large et sélection des études Recherche initiale – choix des bases de données (PubMed, Embase, ISI, Cochrane,…) – choix des mots clés utilisés dans les moteurs de recherche et quels liens (et, ou, négation) – références citées dans des articles – littérature grise (rapports, thèses, …) Filtrage des résultats – sélection des études à partir de critères définis a priori (type d’intervention, outcome mesuré, population,…) 11 Méthode: revue systématique (3) 3) Description des études éligibles: caractéristiques (durée de suivi, simple/double insu ,…) et qualité des études (évaluation du risque de biais…) caractéristiques des patients résultats rapportés 4) Synthèse des résultats rapportés concernant la question de recherche seulement commentés: revue systématique narrative combinés par une analyse statistique: revue systématique et méta-analyse 12 Retour à l’exemple Question de recherche: l’ergothérapie améliore t’elle la récupération après un accident vasculaire cérébral (AVC) ? Critère PICO: – P: patients avec des problèmes dans les activités de la vie quotidienne suite à un accident vasculaire cérébral – I : ergothérapie – C: soins habituels – O: décès, ou détérioration des capacités à avoir des activités de vie quotidiennes, ou mise en institution Critères d’inclusion des études: – études correspondant au PICO – essais cliniques randomisés 13 BMJ. 2007 Nov 3;335(7626):894-5 Références bibliographiques correspondant aux mots clés Essais cliniques finalement retenus dans la revue systématique 14 Flow-chart: résultat de la procédure de recherche des études Description des études retenues dans la revue systématique 15 Résultats des essais cliniques randomisés: Groupe recevant Groupe recevant les l’ergothérapie soins classiques Nombre de patients décédés ou avec une détérioration ou placés en institution Nombre de patients suivis Outcome: décès, ou détérioration des capacités à avoir des activités de vie quotidiennes, ou mise en institution 16 Exemple de revue systématique narrative (1) Evaluation et interprétation des résultats de chaque étude retenue dans la revue systématique: 17 Exemple de revue systématique narrative (2) Synthèse narrative des résultats des études retenues dans la revue systématique: 18 Méta-analyse: principe Une méta-analyse est une synthèse quantitative des résultats des études sélectionnées dans la revue systématique Unité d’analyse statistique: l’étude, pas le patient Résultat de chaque étude résumé par une mesure d’effet (odds ratio, risque relatif, différence de risque, différence de moyenne, etc) Synthèse des études: effet commun = « moyenne » des effets estimés dans les études 19 Méta-analyse: exemple Etudes Données extraites Effet de l’intervention estimé des études dans chaque étude (IC95%) Effet commun (IC95%) Forest plot Rappel: outcome = décès, ou détérioration des capacités à avoir des activités de vie quotidiennes, ou mise en institution 20 Méta-analyse: exemple Dans cette méta-analyse: – une différence de risque (DR) négative signifie que le risque de l’outcome (décès, détérioration des capacités à avoir des activités de vie quotidiennes, mise en institution) est plus petit dans le groupe « ergothérapie » que dans le groupe contrôle (« soins habituels ») – dans les 7 études de la méta-analyse, la différence de risque varie entre -0.26 et 0.01 – la différence de risque commune est -0.09 (intervalle de confiance à 95%: -0.15 à -0.04) – conclusion tirée à partir de l’ensemble des 7 études: l’ergothérapie permet de diminuer le risque de l’outcome par rapport aux soins habituels 21 Méta-analyse: méthode statistique (1) Il ne faut pas ajouter les données individuelles: Etude 1 Etude 2 Etude 1 + Etude 2 Evt Abs evt Evt Abs evt Evt Abs evt A 10 40 A 10 0 A 20 40 B 0 10 B 40 10 B 40 20 DR=10/50-0/10=0.20 DR=10/10-40/50=0.20 DR=20/60-40/60= -0.33 Paradoxe de Simpson 22 Méta-analyse: méthode statistique (2) Le principe d’une méta-analyse est de faire une « moyenne » des effets estimés : Etude 1 Etude 2 Evt Abs evt Evt Abs evt A 10 40 A 10 0 DRCommune = 0.20 B 0 10 B 40 10 DR=0.20 DR=0.20 23 Méta-analyse: méthode statistique (3) L’effet global (θcommun) est estimé par la moyenne pondérée des effets dans chaque étude qCommun = wiqi i ▪ wi est le poids attribué à l’étude i (la somme des poids vaut 1) ▪ qi est l’effet estimé dans l’étude i (différence de risques, logarithme de l’odds ratio, logarithme du risque relatif, …) Les poids reflètent la quantité d’information apportée par une étude: le poids d’une étude de grande taille a tendance à être plus important que celui d’une étude de petite taille. 24 Méta-analyse: exemple La taille du carré est proportionnelle au poids de l’étude DRcommune = 0.128*(-0.08)+0.087*0.01+0.153*(-0.13)+… = -0.09 25 Méta-analyse: gain de précision et puissance La largeur de l’intervalle de confiance à 95% de l’effet commun (DRcommune) est plus petite que la largeur de l’intervalle de confiance à 95% de l’effet estimé dans chacun des essais => l’effet commun est plus précis que l’effet estimé dans les essais 26 Méta-analyse: gain de précision et puissance Aucun essai ne détecte un effet de l’ergothérapie (0 est dans l’IC95% des DRs) Effet commun statistiquement significatif (0 n’est pas dans l’IC95%) Dans une méta-analyse, même si aucun essai ne détecte un effet de l’intervention expérimentale, la synthèse des résultats des essais (DRcommune) peut permettre de détecter un effet global => Gain de puissance 27 Test statistique sur l’effet commun Test d’association – en plus de l’intervalle de confiance à 95% autour de l’effet commun, il existe un test statistique d’hypothèse nulle : Ho: l’effet commun est nul – par exemple, Ho: DRcommune =0 – si la valeur p de ce test est inférieure à 0.05, alors l’effet commun est statistiquement significatif – attention: la valeur p du test d’association ne donne pas le sens de l’effet 28 Test statistique sur l’effet commun Effet commun Test d’association Ho: DRcommune = 0 Comme p