Bakteriologie Vorlesungsunterlagen PDF

Taxonomie der Bakterien Handout mit prüfungsrelevanten Folien 1 Prof. Dr. habil. Sebastian Ulrich; 11.10.2024 Inhalte Systematik: ▪ Morphologie ▪ Stoffwechselleistungen ▪ Feinstruktur biochemisch ▪ Genetik...

Taxonomie der Bakterien Handout mit prüfungsrelevanten Folien 1 Prof. Dr. habil. Sebastian Ulrich; 11.10.2024 Inhalte Systematik: ▪ Morphologie ▪ Stoffwechselleistungen ▪ Feinstruktur biochemisch ▪ Genetik 2 Ableitung von Bakteriennamen Mikromorphologie Staphylococcus, Bacillus stajulh Traube; baculum Stab kokkoV Korn, Kern Eigennamen von Bakteriologen Pasteurella, Escherichia, Salmonella, Brucella biologische Eigenschaften Haemophilus, Lactobacillus, Myroides odoratus; Pseudomonas fluorescens Habitat Enterococcus; Ruminococcus; Dermatophilus; E. coli Erkrankung Erysipelothrix, T. pyogenes, H. somni, P. multocida Entdeckungsort Brucella melitensis, Francisella tularensis Wirtsspezies Streptococcus suis, S. canis; S. equi, Staphylococcus hyicus 3 Taxonomie: Hierarchie & binominale Nomenklatur Carl von Linné 1707-1778 Carl von Linné, 18. Jh: hierarchische Nomenklatur drei Reiche: Pflanzen, Tiere und Mineralien Kurzbezeichnung mit ▪ Genusnamen und ▪ Epitheton (ἐπίθετον Zusatz) (Beispiel: Linnaea borealis) um 1770: Beschreibung von Bakterienarten (Pflanzenreich) Reich: Bacteria Stämme: 25, darunter 8 mit Krankheitserregern Klasse Ordnung (-ales) Familie (-aceae) Gattung (Substantiv) Art (Adjektiv) [Rasse] > Subspecies Serotyp; Genotyp; Klon SKOFGA[R] 4 Mikromorphologie & Systematik/Taxonomie Antoni van Leeuwenhoek (1632-1723, Delft): Linsen, Vergrößerung 270 fach 1675: „animalcules“, Beschreibung von Öl Luft ▪ Bazillen ▪ Kokken ▪ Spirillen Verbesserung der Technik im 19. Jahrh., 1878: Ölimmersionsmikroskopie, 1000 fach Karl Bernhard Lehmann, Rudolf O. Neumann: Atlas und Grundriß der Bakteriologie und Lehrbuch der speziellen bakteriologischen Diagnostik. Lehmann, München 1896; 7. Auflage 1927 vier Familien: ▪ Coccaceae (kokkoV= Korn, Kern) ▪ Bacteriaceae (bakthrion=Stab) ▪ Spirillaceae (speira=Windung) 10 µm Karl Bernhard Lehmann 5 ▪ Spirochaetaceae (caith=Haar) 1858-1940; M - Wü Taxonomie: qualifizierte Adressen The Society for General Microbiology: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology bis 1999 ab 2000 David Hendricks Bergey 1860-1937 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi? (→ Instituts-Homepage) 6 Systematik: weitere phänotypische Kriterien ▪ Färbeverhalten (Ziehl- ▪ Peptidoglycan-Auf- ▪ Stoffwechselleistungen Neelsen*; Gram°;..) bau (Schleifer^,...) (bunte Reihe) ▪ Metaboliten (Fettsäuren) *Franz Ziehl, 1882: Zur Färbung des Tuberkelbacillus. Dt. Med. Wschr. 8:451; modifiziert von Friedrich Neelsen °Hans C.J. Gram 1884: Über die isolierte Färbung der Schizomyceten in Schnitt- und Trockenpräparaten. Fortschritte der Medicin 2:185-189. 7 ^K.H. Schleifer, O. Kandler 1972: Peptidoglycan types of bacterial cell walls and their taxonomic implications. Bacteriol Rev. 36(4):407-77. (Review >2000 x zitiert) Taxonomie: Genetik 16S RNA (DNS, 1542 Basen); Haushaltsgene; auch Plasmide&Transposons, Kombinationen; Gesamtgenom phylogenetischer Stammbaum mit Sequenzen der 16S RNA (Carl R. Woese 1977) 16S RNA (weiss) 30S ribosomale Nutzung in der Diagnostik: Proteine (bunt) Untereinheit von ▪ Identifizierung mit Hybridisierungssonden Thermus thermophilus ▪ Identifizierung über ribosomale Proteine (Massenspektrometrie) Intensität www.RIBOWORLD.com Jörg M. Harms 2009: Venkatraman Ramakrishnan; Masse (analog Zeit) 8 Thomas A. Steitz; Ada E. Yonath Nutzung ribosomaler Proteine zur Spezifizierung ▪ Identifizierung ribosomaler Proteine (Massenspektrometrie) Matrix assisted laser desorption/ ionization – time of flight mass spectrometry MALDI-TOF MS 16S RNA (weiss) 30S ribosomale Proteine (bunt) Untereinheit von John B. Fenn, Koichi Tanaka Chemie-NP2002 Thermus thermophilus Advanced information on the Nobel Prize in Chemistry 2002 Ramakrishnan&Steitz www.RIBOWORLD.com 9 &Yonath NP2009 Jörg M. Harms Taxonomie der Bakterien Systematikprinzipien „Blütezeit“ ▪ Morphologie [16.], Ende 19.- Anfang 20. JH ▪ Stoffwechselleistungen Mitte 20. JH ▪ Feinstruktur biochemisch 2. Hälfte 20. JH ▪ Genetik Ende 20. JH bis dato jetzt Sequenzierung des Gesamtgenoms 10 Ab hier noch zwei Folien zur Vertiefung 11 12 13