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Questions and Answers
Quel type de génome n'est pas présent parmi les six types mentionnés ?
Quel type de génome n'est pas présent parmi les six types mentionnés ?
- ADN simple brin (correct)
- ARN simple brin positif
- ADN circulaire double brin
- ARN double brin
Quel critère n'est pas utilisé pour classifier les virus ?
Quel critère n'est pas utilisé pour classifier les virus ?
- Type de capside
- Mode de multiplication
- Type de génome
- Taille des particules (correct)
Quelle méthode n'est pas une forme de détection directe des virus ?
Quelle méthode n'est pas une forme de détection directe des virus ?
- Détection de protéines virales
- Dosage d'anticorps (correct)
- Microscopie électronique
- Culture cellulaire
Quel type de cellule n'est généralement pas utilisé pour la culture de virus ?
Quel type de cellule n'est généralement pas utilisé pour la culture de virus ?
Quel rôle joue la transcriptase inverse dans le cycle des rétrovirus ?
Quel rôle joue la transcriptase inverse dans le cycle des rétrovirus ?
Quel des échantillons suivants est le moins couramment utilisé pour le diagnostic virologique ?
Quel des échantillons suivants est le moins couramment utilisé pour le diagnostic virologique ?
Qu'est-ce qu'une cellule permissive ?
Qu'est-ce qu'une cellule permissive ?
Quel type de virus se multiplie uniquement dans des cellules vivantes ?
Quel type de virus se multiplie uniquement dans des cellules vivantes ?
Quelle méthode est utilisée pour quantifier les génomes ARN?
Quelle méthode est utilisée pour quantifier les génomes ARN?
Comment la fluorescence est-elle mesurée dans un processus de qPCR?
Comment la fluorescence est-elle mesurée dans un processus de qPCR?
Quel est le rôle de SybrGreen dans la quantification de l'ADN?
Quel est le rôle de SybrGreen dans la quantification de l'ADN?
Qu'est-ce qu'un titre en PFU/mL représente?
Qu'est-ce qu'un titre en PFU/mL représente?
Quel est un des effets cytopathogènes typiques du virus VZV?
Quel est un des effets cytopathogènes typiques du virus VZV?
Quelle température est généralement utilisée pour l'assemblage des amorces durant la PCR?
Quelle température est généralement utilisée pour l'assemblage des amorces durant la PCR?
Comment se fait l'identification des virus isolés par modifications morphologiques?
Comment se fait l'identification des virus isolés par modifications morphologiques?
Quel processus indique qu'une sonde s'est fixée efficacement lors d'une PCR?
Quel processus indique qu'une sonde s'est fixée efficacement lors d'une PCR?
Quel est le rôle principal des oncogènes viraux comme les protéines LT du SV40 et E6-E7 du HPV ?
Quel est le rôle principal des oncogènes viraux comme les protéines LT du SV40 et E6-E7 du HPV ?
Dans quel contexte un promoteur viral est-il essentiel ?
Dans quel contexte un promoteur viral est-il essentiel ?
Quel est le principe fondamental de la technique ELISA ?
Quel est le principe fondamental de la technique ELISA ?
Quels anticorps sont utilisés dans l'ELISA en sandwich ?
Quels anticorps sont utilisés dans l'ELISA en sandwich ?
Quelle méthode est utilisée pour détecter la protéine virale par immunofluorescence ?
Quelle méthode est utilisée pour détecter la protéine virale par immunofluorescence ?
Quelle technique est principalement utilisée pour détecter le génome viral ?
Quelle technique est principalement utilisée pour détecter le génome viral ?
Quel est le rôle du témoin négatif lors de la migration des produits PCR ?
Quel est le rôle du témoin négatif lors de la migration des produits PCR ?
Que signifie le terme 'provirus' dans le contexte viral ?
Que signifie le terme 'provirus' dans le contexte viral ?
Quel est le titre en FFU/mL utilisé pour déterminer?
Quel est le titre en FFU/mL utilisé pour déterminer?
Quel est le but de l'hémagglutination dans le titrage des virus?
Quel est le but de l'hémagglutination dans le titrage des virus?
Qu'est-ce que le titre PRNT50 mesure?
Qu'est-ce que le titre PRNT50 mesure?
Pourquoi le ratio nombre de particules physiques / nombre de particules infectieuses est-il élevé pour la plupart des virus?
Pourquoi le ratio nombre de particules physiques / nombre de particules infectieuses est-il élevé pour la plupart des virus?
Quelle méthode est utilisée pour détecter la présence d'anticorps dans le sérum?
Quelle méthode est utilisée pour détecter la présence d'anticorps dans le sérum?
Quel facteur est lié à la dose infectieuse 50% (ECP)?
Quel facteur est lié à la dose infectieuse 50% (ECP)?
Quelle est l'utilisation d'un anticorps secondaire dans le titrage du virus?
Quelle est l'utilisation d'un anticorps secondaire dans le titrage du virus?
Quel est le rôle de l'acide sialique dans l'hémagglutination des globules rouges?
Quel est le rôle de l'acide sialique dans l'hémagglutination des globules rouges?
Flashcards
Transcriptase inverse
Transcriptase inverse
Une enzyme qui synthétise l'ADN à partir d'un modèle d'ARN.
Virus à ARN
Virus à ARN
Un virus dont le génome est composé d'ARN.
Virus à ADN
Virus à ADN
Un virus dont le génome est composé d'ADN.
Diagnostic virologique direct
Diagnostic virologique direct
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Diagnostic virologique indirect
Diagnostic virologique indirect
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Isolement des virus
Isolement des virus
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Sérologie
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Microscopie électronique
Microscopie électronique
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Transformation induite par des oncogènes viraux
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Modification de cellules pour l'expression de gènes d'intérêt
Modification de cellules pour l'expression de gènes d'intérêt
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Promoteur viral
Promoteur viral
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ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay)
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ELISA en sandwich
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ELISA direct
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Immunofluorescence (IF)
Immunofluorescence (IF)
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Sonde nucléotidique marquée
Sonde nucléotidique marquée
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RT-qPCR
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qPCR
qPCR
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Effet cytopathogène (ECP)
Effet cytopathogène (ECP)
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Plaques de lyse
Plaques de lyse
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PFU (Plaque Forming Unit)
PFU (Plaque Forming Unit)
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Ct (Cycle threshold) ou Cq
Ct (Cycle threshold) ou Cq
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Courbe standard
Courbe standard
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Dilutions en série
Dilutions en série
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Titrage viral par fluorescence
Titrage viral par fluorescence
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Titre en FFU/mL
Titre en FFU/mL
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Titrage viral par hémagglutination
Titrage viral par hémagglutination
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Titre en HA/mL
Titre en HA/mL
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Ratio particules physiques / particules infectieuses
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Dose infectieuse 50% (DI50)
Dose infectieuse 50% (DI50)
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Titre PRNT50
Titre PRNT50
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Study Notes
Virologie Diagnostique
-
Rappels CM1:
- Types de capsides : 2
- Types de génomes : 6
- Classes de Baltimore : 7
- Critères de classification des virus : 4
-
Transcriptase inverse:
- ADN polymérase ARN dépendante
- ARN+ : Génome infectieux, cycle commence par la traduction de l'ARN viral.
- ARN- : Incorporant leur polymérase dans la particule virale.
-
Cycle intracellulaire:
- Commence par la transcription d'un ARNm
- Rétrovirus : Incorporant leurs polymérases dans la particule virale, phase ADN dans leur cycle viral.
-
Détection directe:
- Détection du virus ou de ses composants
- Virus
- Protéines virales
- Génome viral
-
Détection indirecte:
- Effet sur l'hôte
- Activité enzymatique
- Effet cytopathogène
- Réponse de l'hôte (anticorps)
-
Échantillons utilisés:
- Sang
- Prélèvements par écouvillons (nasopharyngé, buccale)
- Tissus
- Urines
- Liquide amniotique
- Selles
-
Détection directe en microscopie:
- Microscopie électronique (forte concentration de virus, chronophage, coûts élevés)
-
Isolement des virus:
- Culture cellulaire (les virus ne peuvent se multiplier que dans les cellules vivantes : cellules en culture, animaux de laboratoire, œufs de poule embryonnés)
Virologie - Page 2
-
Choix des cellules:
- Dépend du virus recherché (animales, végétales, bactéries).
- Doivent être susceptibles et permissives au virus.
-
Propagation des virus:
- Découverte de nouveaux virus
- Développement de vaccins (poliomyélite, rubéole)
-
Titration des virus:
- Déterminer la quantité de particules virales dans un volume donné.
- Cellules sensibles (possèdent le récepteur)
- Cellules permises (permettent l'adsorption du virus)
- Cellules primaires (issues de tissus normaux, arrêt de la division cellulaire, pourcentage de surface couverte : confluences)
- Lignées cellulaires (immortalisées/transformées, ex: cellules HeLa)
Virologie - Page 3
- Détection du génome viral:
- Hybridation in situ (sonde marquée qui s'apparie avec la séquence complémentaire)
- PCR/RT-PCR (amorces spécifiques d'une séquence virale)
- PCR quantitative (qPCR) ou RT-qPCR (quantification de génomes ADN ou ARN)
Virologie - Page 4
- Identification des virus isolés:
- Effets cytopathogènes (ECP): modifications morphologiques des cellules infectées.
- Modifications typiques d'un virus ou d'une famille de virus.
- Titrage des virus (Plaques de lyse, unités formant des plaques (PFU), foyers fluorescents (FFU), hémagglutination).
Virologie - Page 5
- Diagnostic indirect:
- Détection des anticorps sériques (anticorps anti-Fc couplés à une enzyme, anticorps spécifiques du virus).
- Titre en anticorps neutralisant (PRNT50).
- Étapes du titre en anticorps neutralisant (dilutions de sérum, dilution ajout de virus, incubation, inoculation des cellules, incubation, révélation au crystal violet)
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