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Questions and Answers
Quel est le postulat de Koch associé à une maladie et à un micro-organisme pathogène particulier?
Les mutations synonymes ne modifient pas la protéine produite.
True
La ________ est une capacité qu'ont certaines cellules à intégrer un ADN exogène pour la transformation.
compétence
Quel est l'événement rare qui se produit chez les bactéries avec une fréquence de 10E-8 à 10E-10?
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Qu'est-ce que la technologie des plages de lyse permet de déterminer pour les bactériophages dans un échantillon?
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Quels sont les critères énoncés par Koch pour reconnaître le rôle d'un agent infectieux dans une maladie? (Sélectionnez toutes les réponses correctes)
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Les virus sont sensibles aux antibiotiques.
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Un virus ne contient qu'un seul type d'acide nucléique, qui constitue ____. (Répondez en un mot)
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Comment se reproduisent les virus à partir de leur matériel génétique?
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Quel virus se réplique dans le cytoplasme en utilisant son propre ADN polymérase?
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Quel virus largue son ARN dans le noyau de la cellule pour se répliquer?
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Quel virus se réplique dans le noyau en utilisant la transcriptase inverse avec ADN polymérase ADN dépendante?
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Quelles sont les voies de dissémination des virus? (Sélectionnez toutes les réponses correctes)
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La virémie signifie la présence de virus dans le sang.
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Quelle est la principale méthode d'échappement actif des virus? La ___.
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Associez les virus avec les voies de transmission:
- Ebola
- Grippe
- Hépatite A
A. D'un animal infecté à l'homme B. Interhumaine C. De l'environnement à l'homme
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Quelles sont les caractéristiques des moustiques domestiques? (Sélectionnez tout ce qui s'applique)
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Quelle est la principale stratégie des virus pour se multiplier?
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Le taux de reproduction de base R0 est un indicateur important pour mesurer la _____ d'un virus.
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Associez ces types de vaccins aux exemples correspondants:
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La variole a été éradiquée de la planète en 1979.
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Quelle est la taille du virus de l'hépatite B?
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Quelles sont les deux types de vaccins contre l'hépatite B mentionnés?
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Le virus de la dengue est un virus enveloppé.
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Quelle est la cible des anticorps dans le cas du virus SARS-Cov 2? Protéine de spicule (_ _ _ _ _).
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Associez les virus à leur type de génome:
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Quel est le rôle des cellules dendritiques dans le système immunitaire?
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Qu'est-ce que le TCR dans le système immunitaire?
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Le CMH-1 présente des peptides de taille variable.
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Les peptides présentés sur le CMH-2 proviennent de la __________ et de l'endocytose.
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Quelle est la fonction des LT auxiliaires (LTh = helper) en contact avec d'autres cellules?
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L'IFN-γ sécrété par les CTL inhibe la réplication virale.
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Quel est le mode d'action des anticorps dépendant de leurs isotypes?
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Les antigènes transportés via la lymphe afférente jusqu'aux ______________ où ils peuvent interagir avec les lymphocytes B activés et T activés.
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Quel processus se produit dans les centres germinatifs des ganglions lymphatiques?
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Quel est le rôle des plasmocytes dans le système immunitaire?
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Les lymphocytes mémoires résident dans la ______ et les ganglions lymphatiques.
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Associez les types de réponse immunitaire avec leurs effecteurs principaux:
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La réponse immunitaire adaptative est initiée par les cellules dendritiques.
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Qu'est-ce que la mémoire immunologique et son importance?
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Quels sont les effecteurs de la réponse immunitaire innée?
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Les lymphocytes T et B possèdent des récepteurs capables de reconnaître une diversité limitée d'antigène.
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La protection contre les pathogènes repose sur plusieurs lignes de ________.
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Study Notes
Microbiologie
- La microbiologie est la biologie des micro-organismes qui nécessite l'utilisation d'outils particuliers tels que le microscope.
- La théorie de la génération spontanée a été abandonnée en faveur de la découverte du postulat de Koch, qui établit que chaque maladie est associée à un micro-organisme pathogène spécifique.
- Le postulat de Koch est composé de quatre critères:
- Le micro-organisme pathogène est présent dans tous les animaux malades et absent des animaux sains.
- Le micro-organisme doit être cultivé en culture pure.
- Un organisme sain inoculé avec cette culture pure doit développer la maladie.
- Le micro-organisme isolé de cet organisme doit être identique au premier isolement.
- Les micro-organismes peuvent être caractérisés par des critères cytologiques tels que la forme des cellules, les modes de regroupement, la mobilité, l'ultrastructure, l'isolement et les aspects moléculaires.
- La métagénomique permet l'étude d'un grand nombre d'espèces même si elles ne peuvent pas être mises en culture.
- Les micro-organismes participent à de nombreux échanges avec l'environnement grâce aux enveloppes cellulaires telles que les membranes cytoplasmiques, les parois bactériennes et les lipopolysaccharides.
Les bactéries et leurs chromosomes
- Les bactéries ont un chromosome unique, souvent en forme de circulaire, composé d'ADN double brin.
- L'ADN bactérien code toutes les informations nécessaires à la vie de la bactérie, y compris les gènes nécessaires à la synthèse des protéines et des métabolites.
- La croissance bactérienne peut être modélisée par une courbe de croissance exponentielle.
- La turbidité, la microscopie et la comptage des cellules sont des méthodes pour mesurer la croissance bactérienne.
- Les bactéries ont des besoins nutritionnels spécifiques, tels que les sources d'énergie, de carbone et de nutriments.
- Les stratégies métaboliques des bactéries comprennent la réception d'énergie, la synthèse de molécules organiques et la dégradation de molécules organiques.
La génétique bactérienne
- Les mutations sont des changements dans la séquence génomique d'une bactérie.
- Les mutations peuvent entraîner la synthèse de protéines défectueuses ou l'absence de protéine.
- Les bactéries peuvent être transformées par l'ajout d'ADN exogène.
- La transduction est un processus par lequel un phage (virus bactérien) peut transférer de l'ADN d'une bactérie à une autre.
- Les bactéries peuvent être sélectionnées en fonction de leurs propriétés phénotypiques, telles que la résistance aux antibiotiques.
Oxydation
- L'oxydation est une perte d'électrons, tandis que la réduction est un gain d'électrons.
- Les couples oxydant/réducteur sont des paires de molécules qui peuvent échanger des électrons.
- La variation du potentiel redox (ΔE'0) est calculée par la différence du potentiel redox de l'accepteur des électrons et le potentiel redox du donneur d'électrons.
- L'oxydation complète du glucose amène à la formation de CO2, d'H2O et d'énergie.### La multiplication des virus
- Les virus ont des mécanismes et stratégies de multiplication variés en raison de leur diversité structurelle :
- Structure des virions (nus ou enveloppés, capsides icosaédrique/hélicoïdale)
- Structure des génomes (ADN/ARN, linéaire/circulaire, segmenté/non-segmenté, monocaténaire/bicaténaire)
- Localisation intracellulaire de la multiplication (nucléaire/cytoplasmique)
Le cycle de multiplication
L’entrée virale
- Absorption à la surface cellulaire :
- Interaction entre protéine virale d’attachement et récepteurs cellulaire (protéines/glycoprotéines, spécifiques)
- Tropisme viral : types cellulaires, tissus/organisme qu’un virus peut infecter, déterminé par la nature et distributions des récepteurs
- Différence entre facteur d’attachement et récepteur d’entrée :
- Facteur d’attachement : aide à concentrer le virus à la surface cellulaire et augmente l’entrée et l’infection virale - interaction peu spécifique
- Récepteur d’entrée : molécule présente à la surface cellulaire qui fixe le virus et provoque activement son entrée dans la cellule - interaction spécifique
- Modes d’entrée virale :
- Entrée par fusion à la membrane plasmique :
- Fusion de l’enveloppe virale avec la membrane plasmique
- Possible que pour les virus enveloppés
- Interaction avec le récepteur induit des changements de conformation de la protéine d’enveloppe virale et l’insertion d’un peptide de fusion dans la membrane plasmique
- Entrée par endocytose :
- Fusion des vésicules avec endosome tardif
- Puis fusion à la membrane endosomale (virus enveloppés)
- Lyse ou perméabilisation (virus nus)
- Entrée par éjection du génome :
- Libération du génome viral sans décapsidation (virus nus)
- Formation d’un pore à la membrane plasmique ou endosomale
- Entrée par fusion à la membrane plasmique :
Transport intracellulaire
- Acheminement du génome viral au site d’expression et de réplication
- Utilisation du cytosquelette cellulaire (microfilaments d’actine et microtubules grâce aux moteurs moléculaire pour se déplacer)
- Transport axonal : pour les virus neurotropes, mouvement rétrograde sur le long de l’axone
Import nucléaire du génome viral
- 4 mécanismes :
- a. Import des ribonucléoprotéines à travers les pores nucléaires (NPC)
- b. Libération du génome viral à travers le NPC en laissant la capside intacte face cytoplasmique
- c. ...### Immunologie et Virologie
Désassemblage de la capside et pénétration du génome
- La capside pénètre dans le noyau à travers le NPC et la décapsidation se produit dans le nucléoplasme
- La synthèse des protéines est toujours cytoplasmique
Expression des protéines virales
- Les virus ont besoin de compacter l'information génétique et ont développé des stratégies pour exprimer plusieurs protéines à partir d'une information génétique réduite
- Les stratégies incluent :
- Synthèse d'un précurseur protéique (polyprotéine) clivé en différentes protéines
- Synthèse d'un transcrit primaire et épissage alternatif
- Décalage du cadre de lecture pendant la traduction (Frameshift)
- Initiation alternative de la traduction et édition de l'ARNm
Stratégie de réplication des virus
- Les virus à ADN double brin (ADNdb) utilisent leur propre ADN pour produire des copies de cet ADN
- Les virus à ADN simple brin (ADNsb) doivent d'abord transformer leur ADNsb en ADNdb avant de pouvoir être répliqués
- Les virus à ARN utilisent leur ARN pour produire des protéines virales
- Les virus à ARN positif (+) ont un ARN qui peut être immédiatement traduit en protéines virales
- Les virus à ARN négatif (-) ont un ARN qui doit d'abord être converti en ARN+ par une enzyme virale avant de pouvoir être traduit en protéines
Sortie des virus
- Le génome viral est incorporé à la particule virale
- La maturation des particules virales implique le clivage protéolytique de la protéine d'enveloppe
- La sortie des virus est possible par différents mécanismes, notamment l'export du génome viral par les pores nucléaires, l'export de la capside par bourgeonnement à l'enveloppe nucléaire et l'export de la capside par rupture de l'enveloppe nucléaire
Stratégies Antivirales
- Exemples de vaccins précurseurs :
- La peste d'Athènes
- La vaccination anti-variolique
- La vaccination anti-rabique
- Les différents types de vaccins :
- Vaccins inactivés
- Vaccins atténués
- Vaccins recombinants
- Vaccins ARN
- Vaccins ADN
- Exemples de vaccins antiviraux humains communs :
- Hépatite A et B
- Rougeole, Oreillons, Rubéole (ROR)
- Poliovirus
- Rage
- Variole
- Fièvre jaune
- Papillomavirus
- SARS-CoV-2
Exemples de vaccins spécifiques
- Vaccin anti-polio : vaccin atténué ou inactivé
- Vaccin anti-Hépatite B : vaccin recombinant
- Vaccin anti-rage : vaccin recombinant
- Vaccin anti-dengue : vaccin à base de fièvre jaune
- Vaccin anti-papillomavirus : vaccin sous-unitaire
- Vaccin anti-SARS-CoV-2 : vaccin ARNm
Variabilité virale et implications
- Les virus à ADN :
- Multiplication nucléaire par l'ADN polymérase cellulaire ou virale
- Multiplication cytoplasmique par l'ADN polymérase virale
- Les virus à ARN :
- Multiplication cytoplasmique par l'ARN polymérase virale
- Les virus à génome alternativement ADN ou ARN :
- Génome ARN intermédiaire ADNc
- Génome ADN intermédiaire ARN
Mécanismes moléculaires de variabilité génétique
- Mutation :
- Substitution
- Insertion
- Délétion
- Récombinaison :
- Mécanisme réplicatif
- Mécanisme non réplicatif
- Réassortiment :
- Co-infection d'une même cellule par 2 virus à génome segmenté
Dynamique évolution population virales
- Quasi-espèce : ensemble de génomes non identiques mais apparentés qui se répliquent dans un organisme infecté
- Notion de goulot d'étranglement : population virale en présence de substance antivirale
- Sélection positive
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