Ruolo dei fattori di trascrizione

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Questions and Answers

Qual è il ruolo dei fattori di trascrizione nel processo di sintesi dell'insulina?

Regolano direttamente la produzione di RNA nucleotidico.

Inibiscono l'attività di trascrizione eseguendo l'assemblaggio del DNA.

Modificano le strutture proteiche già esistenti nel citoplasma.

Forniscono una guida per l'RNA polimerasi interagendo con il DNA. (correct)

Cosa indica una zona bianca nell'analisi di footprinting sul DNA?

La presenza di fattori di trascrizione che si legano al DNA. (correct)

Un'area di DNA non marcata.

La posizione di un gene inattivo.

Un'area di DNA danneggiato.

Qual è la struttura comune delle proteine coinvolte nella regolazione della trascrizione?

Hanno strutture completamente diverse a seconda del gene.

Agiscono solo su filamenti specifici di RNA.

Mantengono sempre la stessa struttura per legarsi al DNA. (correct)

Lavorano sempre come monomeri.

Come lavorano la maggior parte delle proteine che regolano la trascrizione?

Lavorano preferibilmente in forma dimerica. Signup and view all the answers

Qual è un metodo utilizzato per visualizzare le sequenze di legame nel DNA?

Tecnica di footprinting. Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale del mediatore nella trascrizione genica negli eucarioti?

Regolare l'attività della RNA polimerasi II Signup and view all the answers

Dove si trova il promotore minimo nelle cellule eucariote?

In prossimità del sito di inizio della trascrizione Signup and view all the answers

Quali sequenze di nucleotidi sono coinvolte nella regolazione della trascrizione?

Elementi regolatori prossimali e distali Signup and view all the answers

Cosa caratterizza i geni house keeping negli eucarioti?

Utilizzano CPG islands come promotori Signup and view all the answers

Cosa rappresenta la TATA box?

Una parte del promotore che facilita l'inizio della trascrizione Signup and view all the answers

Quali sono i fattori che influenzano direttamente la trascrizione della polimerasi?

I fattori di trascrizione specifici Signup and view all the answers

Qual è il ruolo degli elementi di regolazione distali?

Interagire con molecole attivatrici o repressori per influenzare la trascrizione Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni sui promotori privi di TATA box è corretta?

Utilizzano le CPG islands come elemento promotore Signup and view all the answers

Quale proteina è legata al GC box e stimola l'attività dell'RNA polimerasi II?

Fattore di trascrizione SP1 Signup and view all the answers

Qual è il ruolo delle CPG islands nell'espressione genica?

Promozione dell'espressione dei geni house keeping Signup and view all the answers

Che cosa consente ai fattori di trascrizione ubiquitari di legarsi a diversi promotori?

Degenerazione dei loro legami Signup and view all the answers

Quale dei seguenti elementi è riconosciuto da fattori di trascrizione tessuto specifici?

Sequenze rosse Signup and view all the answers

Cosa è necessario affinché avvenga la trascrizione del gene dell'insulina?

Occupazione di tutti i siti di legame Signup and view all the answers

Qual è l'importanza dei fattori generali di trascrizione?

Riconoscere la regione del promotore Signup and view all the answers

Quale è una caratteristica comparativa delle sequenze nei promotori studiati?

Consistenza della TATA box Signup and view all the answers

Quale enzima è implicato nella metilazione delle citosine?

Enzima di metilazione Signup and view all the answers

Le isole di Langerhans producono ______ grazie all'attività dei fattori di trascrizione.

insulina Signup and view all the answers

I fattori di trascrizione lavorano in forma ______ per interagire con il DNA.

dimerica Signup and view all the answers

Il metodo di analisi delle sequenze di legame sul DNA è denominato ______.

footprinting Signup and view all the answers

Le impronte lasciate dai fattori di trascrizione sul DNA sono visibili grazie alla marcatura ______ del genoma.

radioattiva Signup and view all the answers

I fattori di trascrizione interagiscono con i solchi maggiori o ______ del DNA.

minori Signup and view all the answers

Il fattore di trascrizione SP1 riconosce le ______ islands.

CPG Signup and view all the answers

La metilazione delle citosine è un meccanismo di ______ della cromatina.

silenziamento Signup and view all the answers

I fattori di trascrizione sono essenziali per il riconoscimento della regione del ______.

promotore Signup and view all the answers

La TATA box è una sequenza mantenuta in tutte le ______.

cellule Signup and view all the answers

I fattori di trascrizione ______ possono legarsi a sequenze presenti in tutti i geni.

ubiquitari Signup and view all the answers

Il fattore proteico PDX1 è trascritto solo nelle cellule ______ del pancreas.

β Signup and view all the answers

La trascrizione del gene dell'insulina avviene solo se tutti i siti di ______ sono occupati.

legame Signup and view all the answers

La polimerasi II necessita di ______ generali di trascrizione.

fattori Signup and view all the answers

Il mediatore è un complesso multiproteico di circa ______ subunità.

20 Signup and view all the answers

La superficie esterna del mediatore prende contatto con le molecole attivatrici e ______.

repressori Signup and view all the answers

Nelle cellule eucariote, il promotore minimo si trova a cavallo del sito di inizio della ______.

trascrizione Signup and view all the answers

La TATA box è una sequenza presente nel promotore minimo, ed è legata ai ______ di trascrizione.

fattori Signup and view all the answers

Gli elementi regolatori prossimali influenzano direttamente la trascrizione della ______.

polimerasi Signup and view all the answers

I geni definiti “house keeping” presentano promotori privi della ______.

TATA box Signup and view all the answers

Le CPG islands fungono da promotori nelle cellule ______.

eucariote Signup and view all the answers

Le sequenze GC box sono caratterizzate dalla presenza di ______ e guanina.

citosine Signup and view all the answers

Qual è la principale modalità di interazione tra i fattori di trascrizione e il DNA?

Lavorano in forma dimerica con moduli specifici che si legano ai solchi del DNA. Signup and view all the answers

Cosa determina l'importanza della tecnica di footprinting nell'analisi dell'interazione DNA-proteina?

Visualizza le impronte lasciate dai fattori di trascrizione sul DNA tramite marcatura radioattiva. Signup and view all the answers

Qual è la struttura delle proteine coinvolte nella regolazione della trascrizione?

Mantengono una struttura costante adeguata per il legame al DNA. Signup and view all the answers

Qual è il risultato della marcatura radioattiva del genoma durante l'analisi delle impronte?

Mostra le aree di interazione con i fattori di trascrizione tramite linee scure e chiare. Signup and view all the answers

Qual è il legame principale delle isole di Langerhans nella produzione di insulina?

Dipendono dall'attività dei fattori di trascrizione specifici che attivano il DNA. Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale del mediatore durante la trascrizione negli eucarioti?

Mediare l'interazione tra l'RNA polimerasi e i fattori di trascrizione Signup and view all the answers

Quali elementi sono considerati parte del promotore minimo negli eucarioti?

Sito di legame dell'RNA polimerasi e fattori di trascrizione Signup and view all the answers

Cosa caratterizza i promotori privi di TATA box?

Contengono solo CPG islands Signup and view all the answers

Quale di questi è un elemento regolatorio che influenza la trascrizione nelle cellule eucariote?

Elementi regolatori prossimali Signup and view all the answers

Qual è una caratteristica dei geni ‘house keeping’ negli eucarioti?

Sono sempre legati a CPG islands Signup and view all the answers

Qual è l'interazione tra il mediatore e l'RNA polimerasi II?

Il mediatore facilita l'associazione dell'RNA polimerasi II con i segnali di trascrizione Signup and view all the answers

Qual è il ruolo delle sequenze GC box nella regolazione della trascrizione?

Sono essenziali per la legatura di attivatori Signup and view all the answers

Quale affermazione è corretta riguardo agli elementi di regolazione distali?

Possono estendersi su decine di chilobasi Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale delle isole CPG nell'espressione genica?

Stimolare l'attività dell'RNA polimerasi II Signup and view all the answers

Quale affermazione descrive correttamente il ruolo dei fattori di trascrizione tessuto specifici?

Regolano la trascrizione in base al tipo di tessuto Signup and view all the answers

Cosa determina la specificità dei fattori di trascrizione generali durante la trascrizione?

La specificità della sequenza del promotore Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni evidenzia un errore comune riguardo alla TATA box?

La sua assenza implica sempre un'assenza di trascrizione Signup and view all the answers

Quale meccanismo di silenziamento della cromatina è associato alla regolazione delle CPG islands?

Metilazione delle citosine Signup and view all the answers

Qual è l'importanza della degenerazione nei legami dei fattori di trascrizione?

Consente di adattarsi a mutazioni nel DNA Signup and view all the answers

Qual è il significato del termine 'fattori di trascrizione ubiquitari'?

Fattori che riconoscono sequenze in tutti i geni Signup and view all the answers

Come si spiega la trascrizione specifica del gene dell'insulina nelle cellule β del pancreas?

Richiede l'occupazione di tutti i siti di legame da proteine specifiche Signup and view all the answers

Study Notes

Biologia Molecolare - Il Mediatore

Il mediatore è un complesso multiproteico (circa 20 subunità) che controlla l'attività della RNA polimerasi II durante la trascrizione.
Ha un'alta affinità per la RNA polimerasi II.
La superficie esterna del mediatore interagisce con fattori di trascrizione (attivanti/repressori) che regolano la trascrizione a livello di regioni distali.
Questi fattori trasmettono segnali, positivi o negativi, all'RNA polimerasi II attraverso il mediatore.
Questo regola l'avvio della trascrizione.

Promotore in Eucarioti

Il promotore minimo è situato attorno al sito di inizio della trascrizione.
Include una TATA-box (o UAS nei lieviti) e siti di legame per fattori di trascrizione a monte o a valle del nucleotide +1, e sito per l'RNA polimerasi.
Elementi promotori prossimali (decine di nucleotidi), riconosciuti da fattori di trascrizione specifici e altri fattori proteici che influenzano direttamente la trascrizione.
Elementi di regolazione distali, distanti decine di kb, e sono legati da fattori attivatori/repressori.
Promotori "senza TATA-box" (housekeeping): contengono isole CPG ricche di citosina e guanina (GC-box) che fungono da promotori.

Fattori di Trascrizione

La tessuto-specificità dell'espressione genica, nonostante le sequenze di DNA siano le stesse, è regolata dai fattori di trascrizione.
Fattori generali di trascrizione sono necessari per l'RNA polimerasi II e riconoscono la regione del promotore per il distacco e il funzionamento.
Alcune regioni del promotore del gene dell'insulina sono mantenute in tutte le cellule (es., TATA box) e sono riconosciute da fattori ubiquitari trascrizionali.
Altri fattori di trascrizione sono tessuto-specifici (es., PDX1 nel pancreas).

Analisi Interazioni DNA-Proteine (Footprinting)

La tecnica di footprinting visualizza le impronte lasciate dai fattori di trascrizione sul DNA marcato.
La tecnica utilizza nucleasi come DNasi I per tagliare il DNA in punti non occupati dai fattori.
Le regioni protette dal taglio (da DNasi I), identificano le posizioni specifiche in cui il fattore di trascrizione si lega.

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Description

Questo quiz esplora i fattori di trascrizione e il loro ruolo nella sintesi dell'insulina, oltre ad analizzare tecniche come il footprinting sul DNA. Abbordando la struttura e la funzione delle proteine regolatrici, il quiz offre una comprensione approfondita di questi processi biologici fondamentali.