Recombinante DNA Technologie en Restrictie-enzymen
48 Questions
0 Views

Choose a study mode

Play Quiz
Study Flashcards
Spaced Repetition
Chat to lesson

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Questions and Answers

Wat is de functie van endonucleasen in de recombinante DNA technologie?

  • Ze markeren het DNA met methylgroepen om het te beschermen.
  • Ze binden nucleotiden aan elkaar om DNA te vormen.
  • Ze knippen DNA op specifieke locaties binnenin de keten. (correct)
  • Ze breken fosfodiësterbindingen tussen nucleotiden aan het uiteinde van de keten.

    • Waarom markeren bacteriën hun eigen DNA met methylgroepen?

  • Om het DNA te beschermen tegen UV-straling.
  • Om het onherkenbaar te maken voor restrictie-enzymen. (correct)
  • Om het DNA sneller te repliceren.
  • Om het DNA beter zichtbaar te maken tijdens experimenten.

    • Wat is een voorbeeld van een restrictie-endonuclease?

  • Topoisomerase
  • DNA polymerase
  • EcoRI (correct)
  • Reverse transcriptase

    • Welke sequentie herkent het restrictie-enzym EcoRI?

    <p>GAATTC</p> Signup and view all the answers

    Wat is het gevolg van de asymmetrische knip in de herkenningssequentie door EcoRI?

    <p>Er ontstaan twee fragmenten met een 5’ overhang.</p> Signup and view all the answers

    Welke functie heeft de methylering van DNA in bacteriën?

    <p>Het beschermen tegen restrictie-enzymen.</p> Signup and view all the answers

    Welke van de volgende enzymen herkent en knipt specifieke, korte DNA-sequenties?

    <p>Endonuclease</p> Signup and view all the answers

    Wat is het belangrijkste kenmerk van restrictie-enzymen?

    <p>Ze herkennen specifieke sequenties in DNA.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de functie van de antibioticum-resistentiegenen in gist-episomale plasmiden (YEp)?

    <p>Ze helpen de plasmiden te repliceren in gistcellen.</p> Signup and view all the answers

    Welke van de volgende plasmiden heeft een centromeer en is daardoor mitotisch stabiel?

    <p>YCp</p> Signup and view all the answers

    Welke auxotrofe mutatie kan gebruikt worden om gist te selecteren die leucine mist?

    <p>LEU2</p> Signup and view all the answers

    Wat is een typisch kenmerk van Yeast Artificial Chromosomes (YACs)?

    <p>Ze zijn in staat grote DNA-sequenties te kloneren.</p> Signup and view all the answers

    Wat gebeurt er bij het knippen met SnaBI in het suppressor gen SUP4?

    <p>Het suppressor gen wordt vernietigd.</p> Signup and view all the answers

    Welke van de volgende plasmiden zijn geen shuttlevectoren voor gist?

    <p>Yeast Artificial Chromosomes</p> Signup and view all the answers

    Waarom gebruikt men geen antibiotica merkers in gist zoals in prokaryoten?

    <p>Er zijn geen geschikte antibiotica beschikbaar voor gisten.</p> Signup and view all the answers

    Wat is een belangrijk kenmerk van YRp (Yeast replicating plasmids)?

    <p>Ze zijn onstabiel in de cel.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de functie van exonucleases in DNA-verwerking?

    <p>Ze verwijderen nucleotiden één voor één aan de uiteinden van DNA.</p> Signup and view all the answers

    Welke rol spelen ligasen in de DNA-replicatie?

    <p>Ze verbinden DNA-moleculen door daarom een chemische binding te maken.</p> Signup and view all the answers

    Wat is nodig om ligase te laten functioneren?

    <p>ATP als co-substraat.</p> Signup and view all the answers

    Wat doet DNA topoisomerase I?

    <p>Het knipt één streng van het DNA om supercoiling te verminderen.</p> Signup and view all the answers

    Wat is fosforylering?

    <p>Het toevoegen van fosfaatgroepen aan een DNA-molecule.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de belangrijkste rol van DNA-polymerasen?

    <p>Ze synthetiseren nieuwe DNA-strengen.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de functie van terminaal deoxynucleotidyl transferase (TdT)?

    <p>Het aanhechten van deoxynucleotiden aan het 3' OH einde van DNA</p> Signup and view all the answers

    Welke bewering over kinasen is juist?

    <p>Ze voegen fosfaatgroepen toe aan de 5'-einde van DNA.</p> Signup and view all the answers

    Welke type recombinatie betreft de uitwisseling van genetisch materiaal tussen twee sterk gelijke moleculen?

    <p>Homologe recombinatie</p> Signup and view all the answers

    Wat is een kenmerk van T4 DNA ligase?

    <p>Het wordt vaak gebruikt bij kloneringen.</p> Signup and view all the answers

    Wat zijn de attL en attR sites?

    <p>Zij zijn de resulterende hybridesites na integratie van het bacteriofaag DNA.</p> Signup and view all the answers

    Welke rol speelt het recombinase van bacteriofaag lambda in bacteriën?

    <p>Het integreert faag DNA in het bacteriële genoom.</p> Signup and view all the answers

    Wat is een kenmerk van plaatsspecifieke recombinatie?

    <p>Uitwisseling op zeer specifieke plaatsen in het DNA.</p> Signup and view all the answers

    Wat gebeurt er wanneer de faag de lytische fase ingaat?

    <p>De faag snijdt zichzelf uit het bacteriële DNA.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de rol van Cre recombinase?

    <p>Het werkt op de loxP site voor genetische manipulatie.</p> Signup and view all the answers

    Wat is een voorbeeld van DNA transpositie?

    <p>Verplaatsing van een gen binnen het genoom.</p> Signup and view all the answers

    Welke functie heeft de cI repressor in de lysogene cyclus?

    <p>Het tijdelijk uitschakelen van faag-genen.</p> Signup and view all the answers

    Wat gebeurt er met de cI repressor bij stijgende temperatuur?

    <p>Het wordt inactief en laat de lytische cyclus toe.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de rol van de cos-eindjes tijdens de infectie van een bacteriële cel?

    <p>Ze maken het mogelijk dat het lambda-DNA lineair wordt.</p> Signup and view all the answers

    Wat gebeurt er met het lambda-DNA bij infectie van bacteriën?

    <p>Het circulariseert door overlappende cos-eindjes.</p> Signup and view all the answers

    Welke van de volgende vormen van replicatie is eerst tijdens het replicatieproces van lambda-DNA?

    <p>Theta replicatie.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de functie van de specifieke enzymen tijdens het packaging proces?

    <p>Ze knippen het DNA asymmetrisch en creëren cos-eindjes.</p> Signup and view all the answers

    Wat wordt gevormd na het inpakproces bij de lytische cyclus?

    <p>Een matuur faagdeeltje dat uit de bacterie wordt vrijgezet.</p> Signup and view all the answers

    Wat gebeurt er nadat het lambda-DNA is gerepliceerd en er kop- en staart-eiwitten zijn geproduceerd?

    <p>Het packaging proces begint.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de belangrijkste functie van de T-overhang aan de 5’ kant in een TA-vector?

    <p>Het vergemakkelijken van de aanhechting van PCR-fragmenten.</p> Signup and view all the answers

    Waarom is de aanwezigheid van restrictieplaatsen nog steeds noodzakelijk in vectoren?

    <p>Om het DNA-fragment uit de vector te kunnen verwijderen.</p> Signup and view all the answers

    Welke rol speelt het enzym topoisomerase in TA-topo klonering?

    <p>Het ligateert DNA-fragmenten snel en efficiënt aan de vector.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de reden dat PCR-fragmenten niet lang kunnen worden opgeslagen?

    <p>Ze worden snel afgebroken door enzymen.</p> Signup and view all the answers

    Wat is een faagpromotor in het context van DNA-klonering?

    <p>Een sequentie die transcriptie in bacteriën bevordert.</p> Signup and view all the answers

    Hoe wordt een PCR-fragment ingebouwd in een vector met TA-klonering?

    <p>Door verbinding te maken met complementaire overhangende basen.</p> Signup and view all the answers

    Wat is de functie van tussenvectoren in DNA-klonering?

    <p>Voor de opslag van DNA-fragmenten.</p> Signup and view all the answers

    Wat is een belangrijk element dat zorgt voor de zachtere behandeling van DNA in TA-topo klonering?

    <p>De aanwezigheid van het topoisomerase-enzym.</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Samenvatting Gentechnologie 2024-2025

    • Dit is een samenvatting van de PowerPoint-presentaties en aantekeningen uit de lessen.
    • Er worden ook examenvragen opgenomen.
    • Auteur: Lauren Donche

    Hoofdstuk 1: Enzymen uit recombinante DNA-technologie

    • Endonucleasen: Enzymen die DNA en RNA knippen door fosfodiësterbindingen te verbreken tussen nucleotiden binnen de keten.
      • Voorbeeld: restrictie-endonucleasen (specifieke DNA-sequenties knippen).
    • Restrictie-enzymen: Deze enzymen worden door bacteriën gebruikt om vreemd DNA te vernietigen.
      • Bacteriën beschermen hun eigen DNA door methylering.
      • Herkennen korte DNA-sequenties (palindromen).
      • Knippen precies op de locaties van de herkenningssequentie.
    • Exonucleasen: Enzymen die DNA en RNA knippen vanaf het einde (5'→3' of 3'→5') van de keten.
    • Ligasen: Enzymen die DNA-moleculen aan elkaar verbinden.
    • Fosfatasen en kinasen: Enzymen betrokken bij het toevoegen en verwijderen van fosfaatgroepen aan DNA.
    • DNA-polymerasen: Enzymen die nieuwe DNA-ketens synthetiseren.
    • Reserve transcriptase: Stukje RNA kopiëren naar DNA
    • Terminal deoxynucleotidyltransferase (TdT)
    • Topoisomerasen: controleren de supercoiling DNA, dit is een proces waarbij dubbelstrengig DNA zichzelf aan elkaar gaat wikkelen.
    • Recombinasen: Enzymen die DNA-moleculen met elkaar uitwisselen.

    Hoofdstuk 2: Vectoren in kloneringen

    • Plasmiden: Circulaire, dubbelstrengige DNA-moleculen die zich buiten het chromosoom in bacteriën repliceren.
      • Kunnen genen bevatten met interessante eigenschappen (vb. resistentie tegen antibiotica).
      • Worden gebruikt als kloneringsvectoren.
    • Cosmiden: Plasmiden met cos-sites van bacteriofaag lambda.
      • Hogere kloneringscapaciteit dan plasmiden.
    • Bacteriofagen: Virussen die bacteriën infecteren.
      • Kunnen gebruikt worden als vectoren (zowel lineair of circulair).

    Hoofdstuk 3: Moleculaire klonering

    • Universele klonering: Methoden om DNA-fragmenten in eukaryote of prokaryote cellen te kloneren zonder restrictie-enzymen.
    • TA-klonering: Methode waarbij DNA-fragmenten met één overhangende adenine (3'-A) aan de vector toegevoegd worden.
    • TA-topo klonering: Gebruikt topoisomerase.

    Hoofdstuk 4: Universele klonering en DNA-assemblage

    • Gibson assembly: Techniek om meerdere DNA-fragmenten aan elkaar te linken met overlappende sequenties en enzymen: DNA-polymerase, DNA-exonuclease en DNA-ligase.
    • Golden Gate assembly: Methode die gebruik van type IIs-restrictie-enzymen maakt voor assemblage van DNA-fragmenten.

    Hoofdstuk 5: Recombinante expressie in prokaryoten

    • Recombinante expressie: Expressie van een vreemd gen in een prokaryote cel.
    • Promotor: DNA-sequentie waar RNA-polymerase zich bindt om transcriptie te starten.
    • Shine-Dalgarno sequentie (RBS): Sequentie in prokaryotische mRNA die helpt met ribosoombinding.
    • Kozak sequentie: Sequentie in eukaryotische mRNA die helpt met ribosoombinding.

    Hoofdstuk 6: Recombinante expressie in eukaryoten

    • Induceerbare en represseerbare systemen: Systemen die de expressie van een gen reguleren (vb. Lac-operon, tetracycline-operon).

    Andere belangrijke informatie

    • Cos-einden: Overlappende uiteinden van sommige bacterieel bacteriofagen
    • Vector: Instrument dat een vreemd fragment kan dragen en repliceren in een cel
    • Transformatie/transfectie: Prokaryote cellen, en eventueel eukaryote (via verschillende methoden)
    • PCR: Polymerase chain reaction.

    Studying That Suits You

    Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

    Quiz Team

    Related Documents

    Samenvatting Gentechnologie (2024-2025) PDF

    Description

    Test je kennis over de rol van endonucleasen en restrictie-enzymen in de recombinante DNA-technologie. Dit quiz behandelt belangrijke concepten zoals methylering en de kenmerken van plasmiden en YACs. Ideaal voor studenten biotechnologie of moleculaire biologie.

    More Like This

    Use Quizgecko on...
    Browser
    Open
    Browser
    Browser