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Questions and Answers
La velocità d'idrolisi di un estere è influenzata solo da fattori induttivi in condizioni acide.
La velocità d'idrolisi di un estere è influenzata solo da fattori induttivi in condizioni acide.
False
Cosa quantifica il fattore sterico di Taft (Es)?
Cosa quantifica il fattore sterico di Taft (Es)?
La velocità d'idrolisi di esteri alifatici sostituiti rispetto a un estere standard.
Qual è il significato di QSAR nell'analisi chimica?
Qual è il significato di QSAR nell'analisi chimica?
Un buon allineamento strutturale è sempre possibile per molecole di classi strutturali diverse.
Un buon allineamento strutturale è sempre possibile per molecole di classi strutturali diverse.
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Qual è la funzione principale dell'atomo sonda nel 3D-QSAR?
Qual è la funzione principale dell'atomo sonda nel 3D-QSAR?
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Le interazioni elettrostatiche favorevoli sono evidenziate da una sonda di carica negativa.
Le interazioni elettrostatiche favorevoli sono evidenziate da una sonda di carica negativa.
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Qual è l'effetto della vicinanza dell'atomo sonda alla molecola?
Qual è l'effetto della vicinanza dell'atomo sonda alla molecola?
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Nella analisi strutturale, si identificano i campi elettrostatici individuando punti di griglia di uguale _______
Nella analisi strutturale, si identificano i campi elettrostatici individuando punti di griglia di uguale _______
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Cosa si ottiene confrontando i campi ottenuti per ciascuna molecola?
Cosa si ottiene confrontando i campi ottenuti per ciascuna molecola?
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Nella griglia 3D-QSAR, tutti i punti hanno la stessa energia sterica.
Nella griglia 3D-QSAR, tutti i punti hanno la stessa energia sterica.
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Quale tipo di atomo può essere utilizzato come sonda nel 3D-QSAR?
Quale tipo di atomo può essere utilizzato come sonda nel 3D-QSAR?
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Le _____ di contorno definiscono punti della griglia con uguale energia sterica.
Le _____ di contorno definiscono punti della griglia con uguale energia sterica.
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Qual è un obiettivo della analisi strutturale in QSAR?
Qual è un obiettivo della analisi strutturale in QSAR?
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Cos'è la QSAR?
Cos'è la QSAR?
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Quali proprietà chimico-fisiche vengono comunemente studiate nella QSAR?
Quali proprietà chimico-fisiche vengono comunemente studiate nella QSAR?
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Il binding _______ all'aumentare del logP
Il binding _______ all'aumentare del logP
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L'____________ di una molecola viene misurata tramite il coefficiente di partizione
L'____________ di una molecola viene misurata tramite il coefficiente di partizione
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Le equazioni QSAR sono applicabili solo a composti della stessa ______ strutturale
Le equazioni QSAR sono applicabili solo a composti della stessa ______ strutturale
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La costante di idrofobicità dei sostituenti:
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La costante di idrofobicità dei sostituenti ha:
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Il coefficiente di partizione (P) misura l'idrofobicità ___________ della molecola mentre π identifica specifiche regioni della molecola che potrebbero interagire con regioni ___________ nel sito di legame
Il coefficiente di partizione (P) misura l'idrofobicità ___________ della molecola mentre π identifica specifiche regioni della molecola che potrebbero interagire con regioni ___________ nel sito di legame
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Gli effetti elettronici vengono descritti da:
Gli effetti elettronici vengono descritti da:
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La costante di ______ è una misura dell’influenza elettron-attrattrice/donatrice dei sostituenti e viene indicata con la lettera _____
La costante di ______ è una misura dell’influenza elettron-attrattrice/donatrice dei sostituenti e viene indicata con la lettera _____
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La costante di Hammet ha:
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La costante di Hammet (sigma) dipende da:
La costante di Hammet (sigma) dipende da:
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Gli effetti _______ descritti dal fattore sterico di ____ (Es) si ottengono dalle velocità di idrolisi di esteri alifatici sostituiti con quella di un estere standard, in condizioni acide.
Gli effetti _______ descritti dal fattore sterico di ____ (Es) si ottengono dalle velocità di idrolisi di esteri alifatici sostituiti con quella di un estere standard, in condizioni acide.
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L'equazione di ______ correla varie proprietà chimico-fisiche con l'attività biologica ed è composta da logP, fattori elettronici e sterici
L'equazione di ______ correla varie proprietà chimico-fisiche con l'attività biologica ed è composta da logP, fattori elettronici e sterici
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Nell'equazione di Hansch si ha _______ di attività quando pi greco è positivo e sigma è negativo.
Nell'equazione di Hansch si ha _______ di attività quando pi greco è positivo e sigma è negativo.
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Il plot di Craig mostra i valori di due diverse proprietà chimico-fisiche per molti sostituenti.
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Per cosa viene utilizzato lo schema di Topliss?
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Nella 3D QSAR le proprietà vengono identificate come _____
Nella 3D QSAR le proprietà vengono identificate come _____
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Nella 3D QSAR il:
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Nel 3D QSAR la molecola viene inserita in una _______ dove un atomo _____ viene spostato su ciascun punto e viene misurata l'interazione sterica o elettrostatica con la molecola.
Nel 3D QSAR la molecola viene inserita in una _______ dove un atomo _____ viene spostato su ciascun punto e viene misurata l'interazione sterica o elettrostatica con la molecola.
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Gli studi QSAR indicano che esiste un valore ________ di logP per ogni classe di farmaci
Gli studi QSAR indicano che esiste un valore ________ di logP per ogni classe di farmaci
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La curva che mette in relazione l'attività con il log P ha un andamento lineare.
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Oltre il valore ottimale l'aumento dell'idrofobicità porta ad:
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Quali effetti elettronici vengono descritti dalla costante di Hammet?
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L'equazione di Hansch ha una forma:
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Qual'è la differenza principale tra QSAR e 3D QSAR?
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Quali sono le applicazioni del QSAR?
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Qual'è una delle metodologie più utilizzate nella 3D QSAR?
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Che tipi di campi vengono analizzati nella 3D QSAR?
Che tipi di campi vengono analizzati nella 3D QSAR?
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Study Notes
QSAR, 3D-QSAR e CoMFA
- QSAR: un metodo che correla l'attività biologica dei composti con le loro proprietà chimico-fisiche.
- 3D-QSAR: una tecnica computazionale basata su strutture tridimensionali per determinare le relazioni tra struttura e attività.
- CoMFA: una tecnica 3D-QSAR che analizza i campi sterici ed elettrostatici intorno a una molecola.
Analisi CoMFA
- CoMFA: utilizzata per analizzare inibitori anticolinesterasici tetraciclici che non possono essere inclusi in un'analisi QSAR convenzionale.
- Allineamento: le molecole appartenenti a classi strutturali diverse devono essere allineate correttamente secondo un modello farmacoforico comune.
- Modello farmacoforico: si basa sul complesso cristallizzato di Tacrina/enzima, che fornisce informazioni sul modo in cui la Tacrina si lega al sito di legame.
- Analisi CoMFA: dimostra che il fattore sterico svolge un ruolo fondamentale nell'attività degli analoghi di Tacrina.
Campi Sterici ed Elettrostatici
- Campi Sterici: misurati spostando un atomo sonda (un protone o un carbocatione sp3) su ciascun punto della griglia.
- Campi Elettrostatici: misurati con sonde con carica positiva: le regioni molecolari con carica positiva sono sfavorevoli, mentre quelle con carica negativa sono favorevoli per l'interazione.
- Analisi CoMFA: individua i campi sterici ed elettrostatici che favoriscono o ostacolano l'attività.
Costante di Hammett (σ)
- Costante di Hammett: misura l'effetto elettronico dei sostituenti.
- Effetti elettrondonatori: causano un valore negativo di σ, mentre gli effetti elettron-attrattori causano un valore positivo di σ.
- Effetto di risonanza: influenza il valore di σ in posizione para, mentre in posizione meta vi è solo un effetto induttivo.
Effetti sterici
- Fattore sterico di Taft (Es): misura l'effetto sterico dei sostituenti sulla velocità di idrolisi degli esteri alifatici.
- Refrattività molare (MR): misura del volume dei sostituenti.
- Effetti sterici: influenzano la velocità di idrolisi degli esteri alifatici e l'attività biologica dei composti.
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Description
Questo quiz esplora i concetti di QSAR, 3D-QSAR e CoMFA, con un focus sull'attività della Tacrina come inibitore dell'acetilcolinesterasi. Scoprirai come queste tecniche permettano di correlare l'attività biologica ai composti chimici e le loro proprietà. Analizzerai anche l'importanza dell'allineamento strutturale nelle molecole per una valutazione accurata.