5-QSAR
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5-QSAR

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Questions and Answers

La velocità d'idrolisi di un estere è influenzata solo da fattori induttivi in condizioni acide.

False

Cosa quantifica il fattore sterico di Taft (Es)?

La velocità d'idrolisi di esteri alifatici sostituiti rispetto a un estere standard.

Qual è il significato di QSAR nell'analisi chimica?

  • Quantitative Structure-Active Relationship (correct)
  • Qualitative Structure-Activity Report
  • Quantum State-Activity Relation
  • Quantitative Species-Activity Relationship

    • Un buon allineamento strutturale è sempre possibile per molecole di classi strutturali diverse.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Qual è la funzione principale dell'atomo sonda nel 3D-QSAR?

    <p>Analizzare l'interazione sterica o elettrostatica con la molecola</p> Signup and view all the answers

    Le interazioni elettrostatiche favorevoli sono evidenziate da una sonda di carica negativa.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Qual è l'effetto della vicinanza dell'atomo sonda alla molecola?

    <p>Maggiore energia sterica</p> Signup and view all the answers

    Nella analisi strutturale, si identificano i campi elettrostatici individuando punti di griglia di uguale _______

    <p>energia</p> Signup and view all the answers

    Cosa si ottiene confrontando i campi ottenuti per ciascuna molecola?

    <p>Attività biologica</p> Signup and view all the answers

    Nella griglia 3D-QSAR, tutti i punti hanno la stessa energia sterica.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quale tipo di atomo può essere utilizzato come sonda nel 3D-QSAR?

    <p>Protone o carbocatione ibridizzato sp3</p> Signup and view all the answers

    Le _____ di contorno definiscono punti della griglia con uguale energia sterica.

    <p>linee</p> Signup and view all the answers

    Qual è un obiettivo della analisi strutturale in QSAR?

    <p>Identificare campi sterici ed elettrostatici favorevoli o sfavorevoli</p> Signup and view all the answers

    Cos'è la QSAR?

    <p>analisi quantitativa della relazione tra la struttura chimica di una sostanza e la sua attività biologica</p> Signup and view all the answers

    Quali proprietà chimico-fisiche vengono comunemente studiate nella QSAR?

    <p>idrofobicità della molecola, idrofobicità di sostituenti, proprietà elettroniche dei sostituenti, proprietà steriche di sostituenti</p> Signup and view all the answers

    Il binding _______ all'aumentare del logP

    <p>aumenta</p> Signup and view all the answers

    L'____________ di una molecola viene misurata tramite il coefficiente di partizione

    <p>idrofobicità</p> Signup and view all the answers

    Le equazioni QSAR sono applicabili solo a composti della stessa ______ strutturale

    <p>classe</p> Signup and view all the answers

    La costante di idrofobicità dei sostituenti:

    <p>misura l'idrofobicità relativa di un sostituente rispetto all'idrogeno</p> Signup and view all the answers

    La costante di idrofobicità dei sostituenti ha:

    <p>valori positivi = sostituenti più idrofobici di H valori negativi = sostituenti meno idrofobici di H</p> Signup and view all the answers

    Il coefficiente di partizione (P) misura l'idrofobicità ___________ della molecola mentre π identifica specifiche regioni della molecola che potrebbero interagire con regioni ___________ nel sito di legame

    <p>complessiva, idrofobiche</p> Signup and view all the answers

    Gli effetti elettronici vengono descritti da:

    <p>costante di Hammet (sigma)</p> Signup and view all the answers

    La costante di ______ è una misura dell’influenza elettron-attrattrice/donatrice dei sostituenti e viene indicata con la lettera _____

    <p>Hammet, sigma</p> Signup and view all the answers

    La costante di Hammet ha:

    <p>valori positivi = gruppi elettron-attrattori valori negativi = gruppi elettrondonatori</p> Signup and view all the answers

    La costante di Hammet (sigma) dipende da:

    <p>Effetti induttivi (F) e di risonanza (R)</p> Signup and view all the answers

    Gli effetti _______ descritti dal fattore sterico di ____ (Es) si ottengono dalle velocità di idrolisi di esteri alifatici sostituiti con quella di un estere standard, in condizioni acide.

    <p>sterici, Taft</p> Signup and view all the answers

    L'equazione di ______ correla varie proprietà chimico-fisiche con l'attività biologica ed è composta da logP, fattori elettronici e sterici

    <p>Hansch</p> Signup and view all the answers

    Nell'equazione di Hansch si ha _______ di attività quando pi greco è positivo e sigma è negativo.

    <p>aumento</p> Signup and view all the answers

    Il plot di Craig mostra i valori di due diverse proprietà chimico-fisiche per molti sostituenti.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    Per cosa viene utilizzato lo schema di Topliss?

    <p>per decidere quali sostituenti usare per ottimizzare il lead compound</p> Signup and view all the answers

    Nella 3D QSAR le proprietà vengono identificate come _____

    <p>campi</p> Signup and view all the answers

    Nella 3D QSAR il:

    <p>Campo sterico = Definisce dimensione e forma della molecola Campo elettrostatico = Definisce regioni elettrone-ricche / povere della molecola</p> Signup and view all the answers

    Nel 3D QSAR la molecola viene inserita in una _______ dove un atomo _____ viene spostato su ciascun punto e viene misurata l'interazione sterica o elettrostatica con la molecola.

    <p>griglia, sonda</p> Signup and view all the answers

    Gli studi QSAR indicano che esiste un valore ________ di logP per ogni classe di farmaci

    <p>ottimale</p> Signup and view all the answers

    La curva che mette in relazione l'attività con il log P ha un andamento lineare.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Oltre il valore ottimale l'aumento dell'idrofobicità porta ad:

    <p>una diminuzione di attività</p> Signup and view all the answers

    Quali effetti elettronici vengono descritti dalla costante di Hammet?

    <p>effetto induttivo</p> Signup and view all the answers

    L'equazione di Hansch ha una forma:

    <p>parabolica</p> Signup and view all the answers

    Qual'è la differenza principale tra QSAR e 3D QSAR?

    <p>Il QSAR classico si basa su parametri semplici (come logP e sigma), mentre il 3D-QSAR utilizza modelli tridimensionali per studiare le interazioni steriche ed elettrostatiche.</p> Signup and view all the answers

    Quali sono le applicazioni del QSAR?

    <p>Ridurre gli effetti collaterali</p> Signup and view all the answers

    Qual'è una delle metodologie più utilizzate nella 3D QSAR?

    <p>Comparative Molecular Field Analysis</p> Signup and view all the answers

    Che tipi di campi vengono analizzati nella 3D QSAR?

    <p>campo sterico</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    QSAR, 3D-QSAR e CoMFA

    • QSAR: un metodo che correla l'attività biologica dei composti con le loro proprietà chimico-fisiche.
    • 3D-QSAR: una tecnica computazionale basata su strutture tridimensionali per determinare le relazioni tra struttura e attività.
    • CoMFA: una tecnica 3D-QSAR che analizza i campi sterici ed elettrostatici intorno a una molecola.

    Analisi CoMFA

    • CoMFA: utilizzata per analizzare inibitori anticolinesterasici tetraciclici che non possono essere inclusi in un'analisi QSAR convenzionale.
    • Allineamento: le molecole appartenenti a classi strutturali diverse devono essere allineate correttamente secondo un modello farmacoforico comune.
    • Modello farmacoforico: si basa sul complesso cristallizzato di Tacrina/enzima, che fornisce informazioni sul modo in cui la Tacrina si lega al sito di legame.
    • Analisi CoMFA: dimostra che il fattore sterico svolge un ruolo fondamentale nell'attività degli analoghi di Tacrina.

    Campi Sterici ed Elettrostatici

    • Campi Sterici: misurati spostando un atomo sonda (un protone o un carbocatione sp3) su ciascun punto della griglia.
    • Campi Elettrostatici: misurati con sonde con carica positiva: le regioni molecolari con carica positiva sono sfavorevoli, mentre quelle con carica negativa sono favorevoli per l'interazione.
    • Analisi CoMFA: individua i campi sterici ed elettrostatici che favoriscono o ostacolano l'attività.

    Costante di Hammett (σ)

    • Costante di Hammett: misura l'effetto elettronico dei sostituenti.
    • Effetti elettrondonatori: causano un valore negativo di σ, mentre gli effetti elettron-attrattori causano un valore positivo di σ.
    • Effetto di risonanza: influenza il valore di σ in posizione para, mentre in posizione meta vi è solo un effetto induttivo.

    Effetti sterici

    • Fattore sterico di Taft (Es): misura l'effetto sterico dei sostituenti sulla velocità di idrolisi degli esteri alifatici.
    • Refrattività molare (MR): misura del volume dei sostituenti.
    • Effetti sterici: influenzano la velocità di idrolisi degli esteri alifatici e l'attività biologica dei composti.

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    Description

    Questo quiz esplora i concetti di QSAR, 3D-QSAR e CoMFA, con un focus sull'attività della Tacrina come inibitore dell'acetilcolinesterasi. Scoprirai come queste tecniche permettano di correlare l'attività biologica ai composti chimici e le loro proprietà. Analizzerai anche l'importanza dell'allineamento strutturale nelle molecole per una valutazione accurata.

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