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Questions and Answers
Welches Merkmal kennzeichnet alpha-1-Antitrypsin als Serpin?
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Was ist die Hauptfunktion der Enzymklasse E2 in der Ubiquitin-Aktivierung?
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Welches Enzym ist verantwortlich für die ATP-abhängige Aktivierung von Ubiquitin?
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Welche Aktivität besitzt das Proteasom nicht?
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Was geschieht mit dem Substrat im Proteasom während der Proteolyse?
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Welche der folgenden Aussagen beschreibt den Pepsininhibitor korrekt?
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Wie funktioniert das Beispiel von intrazellulärer Proteolyse durch das Proteasom?
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Was führt zur Erkennung von Substraten durch das Proteasom?
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Welches Merkmal beschreibt die Funktion von Cystein-Proteasen?
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Welche Aussage zu Zink-Proteasen ist korrekt?
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Welche der folgenden Aussagen beschreibt die Klassifizierung von Proteasen am besten?
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Was ist ein charakteristisches Merkmal seriner Proteasen?
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Wie unterscheidet sich die spezifische Aktivität limitierter Proteasen von unspezifischen Proteasen?
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Was ist der erste Schritt im Mechanismus der Serin-Proteasen?
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Welches Enzym ist ein Beispiel für eine Cystein-Protease?
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Wie wird die reaktive Eigenschaft der OH-Gruppe von Serin in der katalytischen Triade beeinflusst?
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Was passiert während der Hydrolyse bei Cystein-Proteasen?
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Welche Funktion haben Aspartat-Proteasen im Vergleich zu Serin-Proteasen?
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Was wird im Proteasom im Cytosol hauptsächlich kontrolliert?
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Was beschreibt die katalytische Triade in Serin-Proteasen?
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Welcher der folgenden Begriffe steht nicht im direkten Zusammenhang mit der Funktionsweise von Proteasen?
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Welches der folgenden Enzyme ist für die Regulierung der Apoptose verantwortlich?
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Welches der folgenden Proteasen hat eine spezifische Funktion in der Blutgerinnung?
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Welche der folgenden Aussagen beschreibt korrekt die Funktion von Cystein-Proteasen?
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Welches Enzym ist ein Beispiel für eine Zink-Protease?
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Was charakterisiert die Substratspezifität von Endopeptidasen?
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Welches Merkmal unterscheidet Serin-Proteasen von anderen Protease-Klassen?
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Welche Aussage zu limitierter Proteolyse ist korrekt?
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Was schließt die Klassifizierung der Proteasen nach Katalysemechanismus ein?
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Welche Aussage beschreibt die Rolle der Substratbindungsstelle in Proteasen?
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Was beschreibt am besten die Funktionen von Exopeptidasen?
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Welches Enzym wird häufig mit Alzheimer in Verbindung gebracht?
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Was ist eine der Hauptfunktionen von Zink-Proteasen?
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Was sind die Hauptmerkmale von Serinproteasen?
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Welches der folgenden Enzyme ist ein Beispiel für eine Cysteinprotease?
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Was beschreibt am besten die Aktivität von Zinkproteasen?
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Welche der folgenden Aussagen beschreibt die Klassifizierung von Proteasen?
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Welches Protein ist ein Zymogen im Pankreas?
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Was ist die Hauptfunktion von Pepsin im Verdauungssystem?
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Welche Enzyme im Pankreas sind Endopeptidasen?
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Welches Element spielt eine wesentliche Rolle in der Struktur und Funktion von metallabhängigen Proteasen?
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Wie erfolgt die Aktivierung von Zymogenen im Verdauungstrakt?
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Welche Aussage über die Spezifität von Proteasen ist korrekt?
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Was ist die Hauptursache dafür, dass Proteasen reguliert werden müssen?
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Welcher Mechanismus wird von Serin-Proteasen verwendet, um die Peptidbindung zu spalten?
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Welcher der folgenden Wege aktiviert Initiator-Caspasen während der Apoptose?
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Was geschieht bei der Hydrolyse durch Cystein-Proteasen als ersten Schritt?
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Welcher der genannten Proteasen-Typen nutzt gleichzeitig Aspartat zur Polarisation von Wasser für die Spaltung?
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Welche Art von Proteasen sind sowohl Beta- als auch Gamma-Sekretasen?
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Welches Merkmal definiert limitierte Proteasen?
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Welche Aussage zur Substratspezifität von Proteasen ist korrekt?
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Was ist eine Hauptfunktion von Chymotrypsin?
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Welches Enzym ist ein Beispiel für eine Exopeptidase?
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Welche Aussage über die Aktivierung von Zymogenen ist korrekt?
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Welches der folgenden Enzyme wird nicht im Pankreas als Zymogen synthetisiert?
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Was benötigt die Autoaktivierung von Pepsin im Magen?
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Welche der folgenden Aussagen beschreibt die Funktion von Trypsin am besten?
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Wie unterscheiden sich die Spezifitäten von Endopeptidasen und Exopeptidasen?
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Welches Element beeinflusst die Aktivität von metallabhängigen Proteasen?
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Welcher Mechanismus wird zur Aktivierung von Trypsin im Duodenum eingesetzt?
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Welche Aussage über die Spaltstellen von Proteasen ist richtig?
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Was geschieht im Verdauungstrakt mit aktivierten Formen von Proteasen?
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Warum erfolgt die Aktivierung von Verdauungsenzymen in einem bedarfsabhängigen Prozess?
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Study Notes
Protease-Inhibitoren
- Protease-Inhibitoren ähneln Substraten und binden oft irreversibel an die Protease (Ausnahme: Pepsin-Inhibitor über Salzbrücken)
- Pepsininhibitoren sind Spaltprodukte von Pepsinogen und binden an Pepsin über Salzbrücken bei neutralem pH
- Pankreas-Trypsininhibitoren sind Substrat-Analoga, die das eigentliche Substrat vom Trypsin verdrängen und eine hohe Affinität für Trypsin aufweisen.
- Alpha-1-Antitrypsin (Serpin) bindet an Trypsin und Elastase durch eine kovalente und irreversible Bindung.
- Die Bindung führt zu einer starken Konformationsänderung, die das Serpin funktionslos macht.
Das Proteasom
- Das Proteasom ist die intrazelluläre Abbaumaschinerie
- Es besteht aus einem zylindrischen Kern (20S) und regulierbaren Deckeln (19S)
- Der Kern enthält zwei Ringe bestehend aus 7 alpha- und 7 beta-Untereinheiten.
- Nur die beta-UE sind proteolytisch aktiv und haben drei verschiedene Aktivitäten: Chymotrypsin-ähnlich, Trypsin-ähnlich und Peptidyl-glutamyl-Peptid-hydrolysierend.
- Die Deckel (19S) enthalten Proteinenzyme (ATPasen), die Proteine entfalten und an das Proteasom binden.
Ubiquitin
- Ubiquitin ist ein hochkonserviertes 76 Aminosäure-Protein, das in allen eukaryotischen Zellen ubiquitär vorkommt.
- Es hat eine globuläre und stabile Struktur (Ubiquitin-fold) und unterscheidet sich nur in 3 Aminosäuren zwischen Mensch und Hefe.
- Ubiquitin bindet kovalent über die C-terminale Gly-Seitenkette an Substrate.
- Die Aktivierung von Ubiquitin erfolgt über eine Enzym-Kaskade aus drei Enzymklassen: E1, E2 und E3.
- E1 aktiviert Ubiquitin mit ATP, E2 überträgt es und E3 bindet das Substrat und ermöglicht die kovalente Bindung an Lysin-Seitenketten.
Erkennung durch das Proteasom
- Nur poly-ubiquitierte Substrate werden vom Proteasom erkannt, da es keine Zwischenprodukte verwendet.
- Beispiele für poly-ubiquitierte Substrate sind Pepsin, BACE (beta-Sekretase) und Presenilin (gamma-Sekretase)
- Beta- und gamma-Sekretasen sind Asp-Proteasen, die das Amyloid-Plaques-Protein (APP) in das A-beta-Peptid spalten.
Zink-Proteasen
- Zink-Proteasen verwenden Wasser als Ligand, welches durch Zink-Ionen polarisiert wird und direkt die Peptidbindung spaltet.
- Beispiele sind Carboxypeptidase A + B (Pankreas) und Matrix-Metalloproteasen (extrazelluläre Matrix).
Protease-Klassifizierung
- Proteasen werden nach Katalyse-Mechanismus (Serin-, Cystein-, Aspartat- und Zink-Proteasen) und Substratspezifität (Exopeptidasen und Endopeptidasen) unterschieden.
- Exopeptidasen spalten am N- oder C-Terminus des Proteins (z. B. Aminopeptidase, Carboxypeptidase).
- Endopeptidasen spalten innerhalb des Proteins (z. B. Trypsin, Chymotrypsin).
Vollständige vs. limitierte Proteolyse
- Vollständige Proteolyse erfolgt durch Proteasen mit geringer Spezifität und führt zum vollständigen Abbau von Proteinen.
- Limitierte Proteolyse ist hochspezifisch für das Substrat und die zu spaltende Peptidbindung und führt zu einer kontrollierten Aktivierung von Proteinen.
Proteinabbau
- Proteinabbau ist ein wichtiger Prozess, der in verschiedenen Funktionen der Zelle eine Rolle spielt.
- Funktionen des Proteinabbaus: negative Regulation, positive Regulation und quantitative Regulation.
- Proteasomen kontrollieren die Aktivität von Proteasen durch regulierte Aktivierung, spezifische Inhibitoren und Kompartimentierung.
Proteasen in der Zelle
- Extrazelluläre Proteasen sind in folgenden Bereichen zu finden: GI-Trakt, Plasmamembran, Matrix, Blutgefäße.
- Intrazelluläre Proteasen befinden sich in Lysosomen, Nicht-lysosomalen Kompartimenten und Proteasomen.
- Die Hydrolyse von Peptidbindungen ist thermodynamisch begünstigt, kinetisch jedoch relativ stabil.
Vorgehensweise von Proteasen
- Proteasen umgehen die Stabilität von Peptidbindungen durch die Bildung eines Ester-Zwischenprodukts, das sich dann hydrolytisch spalten lässt.
Serin-Proteasen
- Serin-Proteasen enthalten Serin im katalytischen Zentrum.
- Serin bindet mit seiner -OH-Gruppe an das C=O und bildet einen kovalenten Ester.
- Die Hydrolyse des ES-Intermediats führt zur Bildung von Spaltprodukten.
- Die katalytische Triade (Asp, His, Ser) im aktiven Zentrum erhöht die Reaktivität der Serin-Seitenkette.
- Beispiele sind Trypsin, Chymotrypsin, Elastase, Gerinnungsfaktoren, Fibrinolysefaktoren und Proteasomen.
Cystein-Proteasen
- Cystein-Proteasen verwenden die -SH-Gruppe von Cystein, um eine Thioesterbindung zu bilden.
- Die Hydrolyse des ES-Intermediats führt zur Bildung von Spaltprodukten.
- Beispiele sind Kathepsine (Lysosomen) and Caspasen (Apoptose).
Aspartat-Proteasen
- Aspartat-Proteasen polarisieren Wasser mit Hilfe von Aspartat und spalten die Peptidbindung direkt.
- Beispiele sind Pepsin (Magen) und Renin (Nieren).
Aktivierung von Proenzymen
- Proenzyme (Zymogene) sind inaktive Vorstufen von Proteasen.
- Aktivierung von Zymogenen erfolgt durch limitierte proteolytische Spaltung.
- Beispiele sind Verdauungsenzyme, Gerinnungsfaktoren, Hormone und Sekretproteine.
Proteasen des Verdauungstraktes
- Der Magen produziert Pepsin, eine Endopeptidase, die im sauren Milieu aktiviert wird.
- Die Pankreas synthetisiert eine Vielzahl von Verdauungsenzymen, die im Duodenum aktiviert werden, darunter:
- Endopeptidasen (Trypsin, Chymotrypsin, Elastase)
- Exopeptidasen (Carboxypeptidase A, Carboxypeptidase B)
Aktivierung von Pankreas-Proteasen
- Pankreas-Proteasen werden als inaktive Zymogene synthetisiert.
- Die Aktivierung erfolgt durch limitierte proteolytische Spaltung im Duodenum.
- Trypsin aktiviert autokatalytisch die anderen Pankreas-Proteasen.
- Die Aktivierung erfolgt spezifisch und reguliert am Ort des Geschehens (limitierte Proteolyse).
- Die aktivierten Formen spalten ihre Substrate unseleztiv (vollständige Proteolyse).
Das Ubiquitin-Proteasom-System (UPS)
- Das UPS ist der Hauptabbauweg für intrazelluläre Proteine.
- Substrate werden durch Ubiquitin markiert und am Proteasom abgebaut.
- Die Ubiquitylierung erfolgt über eine dreistufige Enzymkaskade (E1-E2-E3).
- Die E3-Ligase ist für die Substratspezifität des Systems verantwortlich.
Funktionen des Ubiquitin-Proteasom-Systems (UPS)
- Abbau beschädigter Proteine
- DNA-Schäden-Reparatur
- Regulation der Signaltransduktion
- Qualitätskontrolle der Proteinfaltung
- Abbau von regulatorischen Proteinen
p53 und das Ubiquitin-Proteasom-System
- p53 ist ein Tumorsuppressor und Transkriptionsfaktor.
- Es wird durch DNA-Schäden aktiviert und stoppt den Zellzyklus, um DNA-Reparatur zu ermöglichen, oder initiiert Apoptose.
- In 50% aller menschlichen Krebserkrankungen ist p53 mutiert und kontinuierlich ubiquityliert und abgebaut, was eine Dysfunktion des Zellzyklus und Apoptose verhindert.
- DNA-Schäden führen zur Phosphorylierung von p53.
- Phosphoryliertes p53 wird nicht mehr von E3 erkannt und akkumuliert in der Zelle.
- Diese Akkumulation aktiviert die Genexpression und fördert die Zellzyklusregulation.
Krankheiten im Zusammenhang mit dem Ubiquitin-Proteasom-System
- DDB1: DNA damage-binding-protein, Mutationen können zu Hautkrebs führen.
- Parkin: Ubiquitinierung von mitochondrialen Proteinen, Defekte können zur Parkinson-Krankheit führen.
- CUL3-KBTBD8: Ubiquitinierung regelt die Translation und Differenzierung von Zellen während der Gesichtsbildung, Mutationen können zu craniofazialen Dysmorphien führen.
Zusammenfassung: Proteasomaler Abbau
- Das Ubiquitin-Proteasom-System (UPS) ist der Hauptabbauweg für intrazelluläre Proteine.
- Substrate werden durch Ubiquitin markiert und in den Proteasomkomplex transportiert.
- Die Ubiquitylierung erfolgt über eine dreistufige enzymatische Kaskade (E1-E2-E3).
- Die Ubiquitin-Ligase (E3) ist maßgeblich für die Substratspezifität des UPS.
Proteinabbau: Regulierung und Mechanismen
- Proteasen sind Enzyme, die Proteine spalten und deren Aktivität streng kontrolliert wird, da sie eine potentielle Gefahr für die Zelle darstellen.
- Die Kontrolle geschieht durch:
- Regulierende Aktivierung
- Spezifische Protease-Inhibitoren
- Extra- und intrazelluläre Kompartimentierung
Extrazelluläre Proteolyse
- Verdauungsenzyme im Magen-Darm-Trakt
- Sekretasen und Kollagenasen in der Plasmamembran und Matrix
- Enzyme der Blutgerinnung und Fibrinolyse in Blutgefäßen
Intrazelluläre Proteolyse
- Verdauungsenzyme in Lysosomen
- Signalpeptidasen in nicht-lysosomalen Kompartimenten
- Proteasom im Cytosol und Kern für Qualitätskontrolle und Signaltransduktion
Mechanismus der Proteolyse
- Peptidbindungen sind kinetisch stabil aufgrund der Mesomeriestabilisierung, wodurch der nucleophile Angriff erschwert wird.
- Proteasen spalten Peptidbindungen, indem sie erst eine Esterbindung bilden, die dann hydrolytisch gespalten werden kann.
Klassen von Proteasen
Serin-Proteasen
- Aktives Zentrum enthält Serin-Rest, der mit seiner -OH-Gruppe eine kovalente Esterbindung zum Substrat bildet.
- Katalytische Triade: Aspartat, Histidin und Serin bilden ein aktives Zentrum, das die Reaktivität von Serin erhöht.
- Beispiele: Chymotrypsin, Trypsin, Elastase, Gerinnungsfaktoren, Fibrinolysefaktoren, Proteasom
Cystein-Proteasen
- Aktives Zentrum enthält Cystein-Rest, der mit seiner -SH-Gruppe eine Thioesterbindung zum Substrat bildet.
- Beispiele: Kathepsine, Caspasen (Apoptose)
Aspartat-Proteasen
- Aktives Zentrum enthält Aspartat-Rest, der Wasser polarisiert und die Peptidbindung direkt spaltet (kein Zwischenprodukt).
- Beispiele: Pepsin, BACE, Presenilin
Zink-Proteasen
- Aktives Zentrum enthält Zink-Ion (Zn2+), das Wasser polarisiert und die Peptidbindung direkt spaltet (kein Zwischenprodukt).
- Beispiele: Carboxypeptidase A+B, Matrix-Metalloproteasen
Substrat-Spezifität von Proteasen
- Exopeptidasen spalten am N- oder C-Terminus des Proteins (Aminopeptidasen, Carboxypeptidasen).
- Endopeptidasen spalten innerhalb des Proteins.
- Proteasen haben eine Substratpräferenz für bestimmte Seitenketten (Substratbindungstasche), die den Zugang zum aktiven Zentrum regulieren und die Substrat-Spezifität bestimmen.
Vollständige vs. Limitierte Proteolyse
Vollständige Proteolyse
- Durch unspezifische Proteasen mit großer Spaltungsbreite.
- Beispiele: Verdauungsproteasen, lysosomale Proteasen, Kollagenasen
Limitierte Proteolyse
- Durch hochspezifische Proteasen mit kleiner Spaltungsbreite.
- Beispiele: Pankreatische Verdauungsproteasen, Blutgerinnungsfaktoren, Peptidhormone.
- Aktivierung von Proenzymen durch Abspaltung von Peptiden (Zymogene)
Kontrolle der Protease-Aktivität
Protease-Inhibitoren
- Pepsin-Inhibitor: Spaltprodukt von Pepsinogen, das an Pepsin über Salzbrücken bindet.
- Pankreas-Trypsininhibitor: Substrat-Analogon, das Trypsin kompetitiv inhibiert.
- α1-Antitrypsin (Serpin): Bindet irreversibel an Trypsin und Elastase und inaktiviert sie.
Das Proteasom
- Intrazellulärer, multimerer Protein-Komplex, der Proteine abbaut.
- Besteht aus einem zylindrischen Kern (20S) und einem regulierbaren Deckel (19S).
- Der Kern enthält proteolytisch aktive β-Untereinheiten (Chymotrypsin-, Trypsin- und PGPH-Aktivität).
- Der Deckel erkennt und entfaltet Substrate, die anschließend durch Ubiquitin markiert werden.
Ubiquitin
- Kleines, hochkonserviertes Protein, das an Substrate gebunden wird (Ubiquitylierung).
- Ubiquitylierung erfolgt über eine dreistufige enzymatische Kaskade (E1-E2-E3).
- E3 (Ubiquitin-Ligase) bestimmt die Substratspezifität.
- Nur poly-ubiquitierte Substrate werden vom Proteasom erkannt und abgebaut.
Funktionen des Ubiquitin-Proteasom-Systems
- Abbau von geschädigten Proteinen
- DNA-Schäden-Reparatur
- Regulierung von Signaltransduktionswegen
- Qualitätskontrolle der Proteinfaltung
- Regulation von Tumorsuppressor-Proteinen wie p53
Klinische Relevanz
- Fehlregulation des Ubiquitin-Proteasom-Systems ist an verschiedenen Krankheiten beteiligt, darunter:
- Krebs
- Parkinson-Krankheit
- Craniofaziale Dysmorphien
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Description
Dieses Quiz behandelt die Funktionen und Mechanismen von Protease-Inhibitoren sowie die Struktur und Aktivität des Proteasoms. Erfahren Sie mehr über wichtige Inhibitoren wie Alpha-1-Antitrypsin und deren Bindungsmechanismen. Testen Sie Ihr Wissen über diese zentralen Aspekte der Biochemie!