modifiche alla cromatina e regolazione trascrizione negli eucarioti

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Questions and Answers

Qual è l'enzima che catalizza l'acetilazione degli istoni?

Fosforilasi

Metiltransferasi

Chinasasi

Acetiltransferasi (correct)

Quale dei seguenti residui di lisina non è esclusivamente metilato nei tetrameri H3 e H4?

Lisina 4

Lisina 27

Lisina 12 (correct)

Lisina 9

Quale modificazione può portare a una carica negativa sugli istoni?

Metilazione

Fosforilazione (correct)

Glicosilazione

Acetilazione

Qual è il coenzima utilizzato dall'enzima acetiltransferasi?

Acetil coenzima A Signup and view all the answers

Che tipo di struttura riconoscono i domini proteici in seguito alle modificazioni degli istoni?

Struttura tridimensionale Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni riguardo alla metilazione è corretta?

Il gruppo metilico può essere trasferito in mono, di o trimetilazione. Signup and view all the answers

Quale dominanza proteica si lega agli istoni acetilati?

Bromodominio Signup and view all the answers

Quale affermazione descrive meglio il ruolo dell'arginina nella metilazione?

Può essere metilata in mono, di o trimetilazione. Signup and view all the answers

Qual è il ruolo principale dell'istone acetil transferasi nel processo di apertura del locus?

Acetilare gli istoni, modificando le loro code Signup and view all the answers

Cosa comporta l'acetilazione delle code istoniche?

Riduzione di interazioni tra istone e DNA Signup and view all the answers

Quale complesso viene reclutato dalla acetilazione degli istoni?

Un complesso che apre la regione del DNA Signup and view all the answers

Qual è uno dei risultati della fosforilazione durante il processo di trascrizione?

Repulsione con il DNA dovuta a cariche negative Signup and view all the answers

Qual è la funzione dei bromodomini nel TFIID?

Riconoscere gli istoni acetilati Signup and view all the answers

Qual è la sequenza di eventi che porta all'esposizione della TATA box?

Acetilazione e reclutamento di un complesso per l'apertura Signup and view all the answers

Cosa rappresenta l'enhancer nel contesto della trascrizione?

Una regione che lega fattori di trascrizione Signup and view all the answers

Quale aminoacido dell'istone H3 è frequentemente acetilato nel processo di trascrizione?

Lisina 9 Signup and view all the answers

Quale ruolo ha la TBP nel contesto dell'apertura della TATA box?

Legarsi direttamente al DNA Signup and view all the answers

Quale componente non è coinvolto nel processo di apertura del locus secondo le informazioni fornite?

Complesso di riunione dell'RNA Signup and view all the answers

Quali funzioni svolgono le istone acetiltransferasi come CBP p300?

Hanno domini di legame ai fattori di trascrizione e un dominio enzimatico. Signup and view all the answers

Come agiscono le HDAC rispetto ai fattori di trascrizione?

Operano tramite piattaforme proteiche che reclutano altri fattori. Signup and view all the answers

Qual è il ruolo di Sin3 nel contesto della trascrizione nel lievito?

Porta con sé degli istoni deacetilasi per compattare la cromatina. Signup and view all the answers

Cosa accade alla cromatina quando le istoni metil transferasi (HMT) agiscono su lisina 9 e lisina 27?

Comportano una compattazione della cromatina e silenziamento genico. Signup and view all the answers

In che modo la metilazione influisce sull'espressione genica nell'eterocromatina?

Compatta la cromatina riducendo l'attività dei fattori di trascrizione. Signup and view all the answers

Qual è la funzione dell'elemento MAR nella cromatina?

Formare un confine con lamine nucleari per la regolazione genica. Signup and view all the answers

Quali conseguenze ha la compattazione della cromatina sulla TATA box?

Chiude la TATA box in un nucleosoma riducendo l'espressione. Signup and view all the answers

Qual è la relazione tra acetilazione e attivazione della trascrizione?

L'acetilazione tende a rendere la cromatina più aperta e attiva. Signup and view all the answers

Che ruolo hanno le proteine impalcatura nella regolazione della trascrizione?

Operano per legare e reclutare le HDAC e altri fattori. Signup and view all the answers

Quale effetto ha il spreading della metilazione nella cromatina?

Silenzia l'espressione genica estendendo l'area metilata. Signup and view all the answers

Qual è il ruolo principale di un isolatore nel contesto dell'espressione genica?

Bloccare la comunicazione tra enhancer e complesso di pre-inizio Signup and view all the answers

In che modo un isolatore può influenzare l'attivazione genica da parte di un enhancer?

Consentendo l'attivazione di un altro promotore adiacente Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni è corretta riguardo alla proteina CTCF?

Crea anse nella cromatina Signup and view all the answers

Qual è la funzione delle Zn-finger nella proteina CTCF?

Consentire il riconoscimento di moduli in tandem Signup and view all the answers

Come influisce la metilazione sul sito di legame della proteina CTCF?

Regola l'accesso della CTCF al DNA Signup and view all the answers

Che effetto ha la conformazione della cromatina sull'attivazione degli geni?

Permette l'attivazione di specifici geni piuttosto che altri Signup and view all the answers

In quale situazione un enhancer può attivare un promotore differente?

Se si trova tra l'isolatore e il promotore di interesse Signup and view all the answers

Quale affermazione è vera riguardo la relazione tra enhancer e promotore?

Più enhancer possono comunicare con lo stesso promotore Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni descrive meglio il comportamento di un isolatore?

Limita l'efficacia degli enhancer su determinati promotori Signup and view all the answers

Quale ruolo hanno le regioni ricche in CG nel contesto della CTCF?

Sono cruciali per il legame della CTCF al DNA Signup and view all the answers

Quale mutazione nel gene 'antennapedia' causa la sostituzione dell’antenna in Drosophila?

Sostituzione dell’antenna con zampe Signup and view all the answers

Che ruolo ha il sistema Polycomb nel regolamento dei geni Hox durante lo sviluppo embrionale?

Mantenere una cromatina compatta e inattiva Signup and view all the answers

Durante quali fasi dello sviluppo embrionale si attiva principalmente il Global Early Enhancer (EE)?

Nelle prime fasi dello sviluppo embrionale Signup and view all the answers

Quale modifica epigenetica avviene all'inizio dello sviluppo embrionale nei geni Hox?

Trimetilazione della lisina 27 Signup and view all the answers

Qual è la funzione della Global Control Region (GCR) nel contesto della regolazione dei geni Hox?

Regolare l'espressione sequenziale dei geni Hox Signup and view all the answers

Study Notes

Modifiche degli Istoni

Acetilazione: Reazione che neutralizza la carica positiva della lisina sugli istoni, avviene in tutti gli istoni.
Fosforilazione: Aggiunta di gruppi fosfato che può avvenire in tutti gli istoni, creando cariche negative che respingono il DNA.
Metilazione: Può avvenire solo nei tetrameri H3 e H4, con particolare importanza nelle lisine 4, 9 e 27.

Enzimi e Coenzimi

Acetiltransferasi: Utilizza l'acetil coenzima A come coenzima per trasferire acetile, modificando le code istoniche; porta ad un'apertura della cromatina.
Metiltransferasi: Usa S-Metilmetionina per trasferire gruppi metilici; le modifiche possono essere monometilazione, dimetilazione o trimetilazione.

Riconoscimento delle Modifiche

Dominio Bromodominio: Riconosce istoni acetilati e facilita le interazioni con i complessi proteici per aprire il DNA.
Cromodominio: Riconosce istoni metilati, influenzando le modifiche della cromatina.

Meccanismi di Attivazione della Trascrizione

Fattori di trascrizione: Possono attivare l'istone acetiltransferasi, modificando le lisine e facilitando l'apertura della TATA box.
Effetto dell'acetilazione: Rende il DNA accessibile e promuove l'attivazione genica; ad esempio, H3 può essere acetilato sulla lisina 9.

Regolazione Trascrizionale

Repressione della Trascrizione: Le istone deacetilasi (HDAC) richiedono proteine adattatrici per reclutare complessi di repressione, compatta la cromatina.
Modifiche della Cromatina: In presenza di metilazione di lisina 9 e 27, si forma eterocromatina, silenziando l'espressione genica.

Isolatori e Enhancers

Isolatori: Blocca la comunicazione tra enhancer e promotore; non reprime ma separa le interazioni.
CTCF: Proteina che agisce da isolatore, favorendo la formazione di anse nel genoma e regolando l'accessibilità della polimerasi.

Geni Omeotici Hox

Hox Genes: Mutazioni in questi geni causano trasformazioni morfologiche; regolano la differenziazione antero-posteriore durante lo sviluppo.
Mutazioni: "Antennapedia" e "ultrabithorax" portano a risultati fenotipici distintivi come zampe al posto di antenne.

Regolazione del Locus HoxD

Global Control Region (GCR) e Global Early Enhancer (EE): Controllano attivamente l'espressione genica durante lo sviluppo embrionale, con legami sequenziali.
Sistematiche modificate: Durante lo sviluppo, si attivano regioni specifiche rimuovendo metilazione su lisina 27 e aggiungendo a 4.

Compattamento Cromatinico

Territori cromosomici: Anche se i geni sono su cromosomi diversi, le anse cromosomiche possono avvicinarsi per una regolazione coordinata.

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Description

Questo quiz esplora le modifiche delle proteine istoniche, con un focus su acetilazione, fosforilazione e metilazione. Scoprirai come queste modifiche influenzano la struttura e la funzione degli istoni e il loro ruolo nella regolazione genica. Preparati a testare la tua conoscenza su questi aspetti cruciali della biologia cellulare.