Microbiología Clínica y Genómica

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Questions and Answers

¿Qué es un electroferograma?

Un gráfico que muestra la cantidad de ADN en una muestra.

Una representación de la secuenciación de la DNA en tiempo real.

Un método de amplificación de ADN mediante PCR.

Un gráfico resultante de la fluorescencia emitida por ddNTPs en un capilar. (correct)

¿Cuál es una de las aplicaciones del Next Generation Sequencing (NGS) en microbiología clínica?

Análisis de la interacción entre virus y bacterias.

Estudio de la actividad metabólica de diversas cepas.

Detección de genes de resistencia a antibióticos. (correct)

Determinación de la estructura tridimensional de proteínas.

¿Cuál es la ventaja principal de la secuenciación masiva respecto a los métodos tradicionales?

Limita el análisis a una sola especie de microorganismo.

Permite estudiar solo un fragmento muy pequeño de ADN.

Disminuye el costo y el tiempo de análisis generando grandes cantidades de información. (correct)

Aumenta la complejidad de los datos obtenidos.

¿Qué información filogenética se obtiene de la secuenciación del genoma del SARS-CoV-2?

Evolución temporal y divergencia en clados diferenciados del virus. Signup and view all the answers

¿Cuál es el papel de la plataforma @nextrain en el seguimiento de SARS-CoV-2?

Recopilar y analizar la evolución y dispersión del virus a partir de genomas secuenciados. Signup and view all the answers

Cuál de las siguientes técnicas de diagnóstico se utiliza para observar la actividad metabólica de los órganos?

PET-TC Signup and view all the answers

Qué procedimiento se debe seguir si se sospecha de alta contagiosidad al manipular una muestra de laboratorio?

Aislar al paciente Signup and view all the answers

Cuál de las siguientes opciones describe mejor un diagnóstico de presunción?

Identificación de un síndrome febril sin foco Signup and view all the answers

Qué tipo de análisis se menciona para el estudio de meningitis con líquido claro?

Virus del West Nile Signup and view all the answers

Qué prueba puede ser sustituida por métodos genéticos como la PCR?

Seroinmunología Signup and view all the answers

Qué responsabilidad tiene el clínico al solicitar pruebas de laboratorio?

Conocer las pautas de transporte de muestras Signup and view all the answers

Cómo se debe actuar si se tiene una muestra limitada y existe una sospecha de infección en la columna vertebral?

Priorizar la recolección de una muestra de hueso Signup and view all the answers

¿Cómo se separan los analitos en un espectro de masas?

Por el tamaño de los iones. Signup and view all the answers

¿Qué permite la hibridación fluorescente in situ (FISH) en los análisis microbiológicos?

Confirmar la presencia y la identidad de microorganismos. Signup and view all the answers

¿Cuál es la principal función del sensor de AST de Reveal?

Detectar la presencia de microorganismos mediante cambios de color. Signup and view all the answers

Cuánto tiempo se tarda en obtener el diagnóstico microbiológico utilizando la técnica mencionada?

1 hora. Signup and view all the answers

¿Qué se realiza para estudiar la sensibilidad a los antibióticos en la técnica mencionada?

Microdilución en caldo. Signup and view all the answers

Cuál es el tiempo estimado para obtener datos iniciales con el sensor de AST de Reveal?

3,5 horas. Signup and view all the answers

¿Qué diferencia se evalúa al comparar la señal de una sonda específica con la de una sonda universal?

La identificación del microorganismo. Signup and view all the answers

Qué indica el cambio en el color del sensor de AST de Reveal?

La presencia de microorganismos específicos. Signup and view all the answers

¿Qué tipo de análisis se realiza para interpretar los resultados en función de los puntos de corte y sus reglas?

Análisis cuantitativos. Signup and view all the answers

Cuál es el principal uso de la técnica de hibridación fluorescente mencionada?

Identificar microorganismos en infecciones polimicrobianas. Signup and view all the answers

¿Cuáles son las principales ventajas de la técnica LAMP sobre la PCR tradicional?

No requiere termociclador y es isotérmica Signup and view all the answers

¿Cuál es la efectividad de la prueba de testosterona en términos de sensibilidad y especificidad?

100% de sensibilidad y 97% de especificidad Signup and view all the answers

¿Qué cantidad de sangre se requiere para realizar la prueba de testosterona?

4 ml Signup and view all the answers

¿Cuál es la duración típica de la amplificación en la técnica de LAMP?

30 minutos Signup and view all the answers

¿Cuál es un requisito previo para realizar un antimicrobiograma con métodos convencionales?

Que el incubador indique una muestra positiva Signup and view all the answers

¿Qué exclusividad tiene la técnica molecular T2MR en comparación con hemocultivos tradicionales?

No requiere cultivo previo de 24-72 horas Signup and view all the answers

¿Cuáles son los componentes esenciales que se requieren para un procedimiento LAMP?

ADN polimerasa y 4-6 primers Signup and view all the answers

En el contexto de pruebas de detección, ¿qué tipo de ADN no puede detectar la prueba de testosterona?

ADN libre Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes técnicas tiene la capacidad de amplificar el ADN sin pasar por un ciclo de desnaturalización?

LAMP Signup and view all the answers

¿Cuánto tiempo tarda en obtenerse un resultado utilizable con el filmarray o el accelerate?

1 hora para el nombre del microorganismo y 7 horas para la CMI Signup and view all the answers

¿Cuál es el principal objetivo de la técnica PCR en el diagnóstico de enfermedades infecciosas?

Detectar y amplificar secciones específicas de ADN. Signup and view all the answers

¿Qué temperatura se utiliza en el paso de desnaturalización de la PCR?

95°C Signup and view all the answers

¿Cuál de los siguientes componentes es esencial para la amplificación en la PCR?

Primers complementarios. Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la LAMP es correcta?

Ofrece un diagnóstico rápido y específico similar a la PCR. Signup and view all the answers

¿Qué ventaja significativa aportan las técnicas de proteómica y genómica en comparación con la microbiología tradicional?

Mayor rapidez y especificidad en los resultados. Signup and view all the answers

¿Qué tipo de información se puede obtener a través de la secuenciación de próxima generación?

El genoma completo de patógenos Signup and view all the answers

¿Cuál es el origen de la taq polimerasa utilizada en la PCR?

De la bacteria Thermus aquaticus que vive en altas temperaturas. Signup and view all the answers

En el contexto del diagnóstico molecular, ¿qué es la metagenómica?

El estudio del microbioma completo de un entorno. Signup and view all the answers

¿Qué efecto tiene la PCR en la sensibilidad del diagnóstico de patógenos?

Aumenta la sensibilidad al detectar bajas concentraciones del patógeno. Signup and view all the answers

Study Notes

Historia Clínica Infectológica

Gregorio Marañón, un reconocido médico internista, destacó la importancia de la interacción médico-paciente, enfatizando la herramienta de la silla como facilitadora de la escucha y exploración del paciente.
Desde la época de Marañón hasta la actualidad, la historia clínica ha evolucionado hacia un enfoque más digitalizado, incorporando nuevas tecnologías.
La historia clínica es el primer contacto del médico con el paciente. Su formato puede variar según la consulta, desde una exploración física detallada hasta una consulta telefónica.
La historia clínica infectológica es crucial para la comprensión de las infecciones.
La historia clínica debe incluir: anamnesis, exploración física, pruebas complementarias, conduciendo a un diagnóstico específico o empírico.

Anamnesis

La anamnesis requiere preguntar sobre alergias a medicamentos, antecedentes personales y familiares, incluyendo enfermedades crónicas y relevantes fallecimientos.
Cuestionar sobre factores de riesgo cardiovascular (como la diabetes, HTA, dislipemia, obesidad), hábitos tóxicos (consumo de tabaco, drogas) e intervenciones quirúrgicas, situación vital, y recursos familiares.
Preguntar por el motivo de consulta, fecha de inicio de los síntomas, y los fenómenos asociados a los síntomas.
El síntoma guía en enfermedades infecciosas es la fiebre.
La epidemiología, entorno que rodea al paciente (hábitos, contactos, viajes, factores ambientales) es esencial para entender la génesis de los síntomas.

Exploración Clínica

La exploración física requiere evaluar el estado general, neurológico, cardiopulmonar, abdominal, genitourinario.
En los pacientes con infecciones, se debe enfatizar la exploración cutánea, la palpación de adenopatías y la evaluación de las vías venosas.
La exploración neurológica requiere evaluar el estado de alerta, pares craneales, fuerza, marcha y equilibrio, y la revisión de signos meníngeos, en caso de sospechas.

Pruebas Complementarias

La analítica sanguínea inicial considera la velocidad de sedimentación globular (VSG), proteína C reactiva (PCR) y procalcitonina, para identificar inflamación e infección.
Otros parámetros en la analítica sanguínea pueden ser leucocitos, neutrófilos, fibrinógeno.
También se requiere un estudio urinario: microbiológico y/o sedimento, según sospecha.
Se realizan cultivos microbiológicos (de orina, exudados, hemocultivos, LCR, exudado de nasofaríngeo).
Se debe realizar serología vírica y bacteriana para identificar posibles infecciones.

Diagnóstico

Se realiza un diagnóstico de presunción, definiendo localización y sospecha de un síndrome infeccioso general o localizado, con o sin fiebre.
La etiología se determina con pruebas y estudios para identificar el agente causal.

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Description

Este cuestionario explora conceptos clave en microbiología clínica y técnicas avanzadas de secuenciación, como el Next Generation Sequencing (NGS). Se incluyen preguntas sobre aplicaciones en diagnóstico, análisis filogenético y manejo de muestras en el laboratorio. Perfecto para estudiantes y profesionales que buscan profundizar sus conocimientos en estos temas.