Méthode spectrophotométrique
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Questions and Answers

Quelle méthode est utilisée pour déterminer le résidu C-terminal?

  • Méthode de Sanger
  • Clivage enzymatique
  • Méthode d'Akatori (correct)
  • Dégradation d'Edman
  • La méthode de Sanger est utilisée pour déterminer le résidu C-terminal.

    False

    Quel est le principe de la dégradation d'Edman?

    Fixation de PITC sur le N-terminal et identification des acides aminés.

    La méthode d'Akatori permet d'identifier le résidu __-terminal.

    <p>C</p> Signup and view all the answers

    Associez les méthodes aux caractéristiques correspondantes :

    <p>Méthode d'Akatori = Identification du C-terminal Méthode de Sanger = Identification du N-terminal Dégradation d'Edman = Peptides de petite taille Fragmentation enzymatique = Clivage de la chaîne polypeptidique</p> Signup and view all the answers

    Quel est l'objectif principal de la linéarisation de Lineweaver et Burk dans l'étude de l'activité enzymatique?

    <p>Simplifier l'étude en travaillant sur une droite</p> Signup and view all the answers

    La chymotrypsine s'attaque à la glycine si de la tyrosine est présente dans le milieu.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quelles valeurs peuvent être déterminées par analyse graphique dans une étude enzymatique?

    <p>Km et Vmax</p> Signup and view all the answers

    L'activité enzymatique est caractérisée par l'affinité et l'_________.

    <p>efficacité</p> Signup and view all the answers

    Associez les termes aux descriptions correctes :

    <p>Km = Constante de Michaelis indiquant l'affinité enzymatique Vmax = Vitesse maximale de la réaction enzymatique Chymotrypsine = Enzyme digestive qui ne s'attaque pas à la glycine en présence de tyrosine Linéarisation = Méthode pour simplifier l'analyse graphique</p> Signup and view all the answers

    Quel est le rôle d'un activateur allostérique sur une enzyme?

    <p>Il augmente l'affinité de l'enzyme pour le substrat.</p> Signup and view all the answers

    Un inhibiteur allostérique déplace l'équilibre de l'enzyme vers l'état relâché.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Qu'est-ce qu'un effecteur allostérique?

    <p>C'est une molécule qui a une action sur l'enzyme.</p> Signup and view all the answers

    En cas d'hypoglycémie, l'enzyme permet d'éviter de transformer le glucose en ______.

    <p>glycogène</p> Signup and view all the answers

    Associez les types d'effecteurs avec leur effet sur l'enzyme :

    <p>Activateur allostérique = Augmente l'affinité de l'enzyme pour le substrat Inhibiteur allostérique = Diminue l'affinité de l'enzyme pour le substrat Produit terminal = Inhibiteur de la voie métabolique Précurseur = Activateur de la voie métabolique</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la conséquence d'une faible concentration de substrat sur l'activité enzymatique?

    <p>L'enzyme ne fonctionne pas ou peu.</p> Signup and view all the answers

    Le produit d'une voie métabolique inhibe la production de lui-même lorsqu'il est en excès.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    Quel type de réaction est souvent catalysé par des enzymes sensibles aux effecteurs allostériques?

    <p>La première réaction limitante d'une voie métabolique.</p> Signup and view all the answers

    Quelle enzyme est responsable de l'hydrolyse du lactose?

    <p>Lactase</p> Signup and view all the answers

    Le maltose est produit à partir de la digestion enzymatique de l'amidon et du glucose.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quel est le principal glucide du lait?

    <p>lactose</p> Signup and view all the answers

    Le ______ est une forme de stockage du glucose dans les cellules animales.

    <p>glycogène</p> Signup and view all the answers

    Associez les diholosides avec leur enzyme d'hydrolyse:

    <p>Saccharose = Saccharase Lactose = Lactase Maltose = Maltase Lactulose = Non digestible dans l'intestin grêle</p> Signup and view all the answers

    Quel est l'effet principal du lactulose dans l'intestin?

    <p>Lutte contre la constipation</p> Signup and view all the answers

    Le glycogène a une structure linéaire sans ramifications.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Nommez un exemple de diholoside ayant des propriétés cryoprotectrices.

    <p>tréhalose</p> Signup and view all the answers

    Quel est le principe de la méthode spectrophotométrique?

    <p>La concentration de la molécule affecte l'absorbance.</p> Signup and view all the answers

    Tous les acides aminés absorbent dans le domaine visible.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quel acide aminé est mentionné comme étant fluorescent?

    <p>tryptophane</p> Signup and view all the answers

    La relation de Beer-Lambert est exprimée par la formule A = ελ.C.l. Dans cette formule, A représente l'_______ dans le contexte de la spectrophotométrie.

    <p>absorbance</p> Signup and view all the answers

    Associez chaque méthode de dosage avec son type d'absorption:

    <p>Méthode spectrophotométrique directe = Concerne les acides aminés aromatiques Méthode spectrophotométrique indirecte = Nécessite une coloration Colorimétrie à la Ninhydrine = Dosage des acides aminés incolores Méthode de dosage quantitatif = Utilise la loi de Beer-Lambert</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la couleur obtenue lors de la coloration avec la Ninhydrine?

    <p>Bleu-violet</p> Signup and view all the answers

    La méthode spectrophotométrique directe est applicable à tous les types d'acides aminés.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quelle méthode est utilisée pour quantifier des acides aminés incolores?

    <p>colorimétrie à la Ninhydrine</p> Signup and view all the answers

    Quel type de TAG contient plusieurs acides gras?

    <p>TAG mixte</p> Signup and view all the answers

    Les TAG sont solubles dans l'eau.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quels sont les deux types de graisses mentionnées et leurs caractéristiques principales?

    <p>Les graisses solides (origine animale, AG saturés) et les huiles (origine végétale, AG insaturés).</p> Signup and view all the answers

    Les glycérophospholipides sont des esters d'acides gras et de glycérol avec un ______.

    <p>phosphate</p> Signup and view all the answers

    Associez les types de lipides aux caractéristiques correspondantes :

    <p>TAG = Insolubles dans l'eau Phyospholipides = Molécules amphiphiles Graisses = AG saturés Huiles = AG insaturés</p> Signup and view all the answers

    Quelle est la fonction principale d'une coenzyme dans une réaction enzymatique?

    <p>Assurer l'activité de l'enzyme</p> Signup and view all the answers

    Le NAD+ est un groupement prosthétique d'oxydoréduction.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quel coenzyme est dérivé de la vitamine B3?

    <p>Coenzyme A</p> Signup and view all the answers

    Le __________ est le groupement prosthétique lié à la protéine du cytochrome c.

    <p>hème</p> Signup and view all the answers

    Associez les coenzymes avec leur type:

    <p>NAD+ = Cosubstrat d'oxydoréduction FAD = Groupement prosthétique d'oxydoréduction Coenzyme Q = Cosubstrat d'oxydoréduction Cytochrome c = Groupement prosthétique d'oxydoréduction</p> Signup and view all the answers

    Quel est le pKa correspondant à la fonction carboxylique d'un acide aminé comme la valine?

    <p>2,3</p> Signup and view all the answers

    Les acides aminés sont uniquement de nature acide.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quel est le principe du point isoélectrique (pI) d'un acide aminé?

    <p>C'est la moyenne des pKa entourant la forme zwittérionique.</p> Signup and view all the answers

    Lorsque le pH augmente, la fonction _______ d'un acide aminé perdra son H^+^ en premier.

    <p>COOH</p> Signup and view all the answers

    Associez chaque acide aminé à son pKa correspondant:

    <p>Valine = 2,3 Alanine = 9,7 Acide aspartique = 3,9 Glutamique = 4,3</p> Signup and view all the answers

    Quel acide aminé possède un groupe R chargé?

    <p>Acide aspartique</p> Signup and view all the answers

    Quel est le pKa de la fonction amine pour un acide aminé normalement?

    <p>9,7</p> Signup and view all the answers

    Tous les acides aminés possèdent seulement deux pKa.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quelle est l'une des raisons principales de la linéarisation de Lineweaver et Burk dans l'étude de l'activité enzymatique?

    <p>Pour faciliter l'interprétation des résultats</p> Signup and view all the answers

    La présence de tyrosine dans le milieu permet à la chymotrypsine de cibler la glycine.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quelles deux valeurs peuvent être déterminées par analyse graphique dans une étude enzymatique?

    <p>Km et Vmax</p> Signup and view all the answers

    Les notions d'affinité et d'_________ caractérisent l'activité enzymatique.

    <p>efficacité</p> Signup and view all the answers

    Associez les termes avec leurs descriptions appropriées :

    <p>Km = Constante de Michaelis qui mesure l'affinité d'une enzyme pour son substrat Vmax = Vitesse maximale qu'une enzyme peut atteindre Chymotrypsine = Enzyme qui hydrolyse des peptides Linéarisation = Technique pour simplifier l'analyse graphique de l'activité enzymatique</p> Signup and view all the answers

    Quelles sont les deux phases principales de la solubilité des protéines en fonction de la force ionique du milieu ?

    <p>Salting in et Salting out</p> Signup and view all the answers

    À forte force ionique, la solubilité des protéines augmente.

    <p>False</p> Signup and view all the answers

    Quel est l'effet de l'ajout de sels dissous à faible concentration sur la solubilité des protéines ?

    <p>L'effet est un 'salting in', permettant aux protéines de rester solubles.</p> Signup and view all the answers

    La force ionique d'une solution est déterminée par la concentration en ______ dissous.

    <p>sels</p> Signup and view all the answers

    Associez les termes avec leur définition appropriée :

    <p>Salting in = Augmentation de la solubilité des protéines à faible force ionique Salting out = Diminution de la solubilité des protéines à forte force ionique Force ionique = Concentration de sels dissous dans une solution Écran ionique = Interférence des ions avec les interactions protéiques</p> Signup and view all the answers

    Quel comportement est observé chez les protéines à haute concentration en sel ?

    <p>Elles précipitent à cause de la déshydratation.</p> Signup and view all the answers

    Les ions du sel peuvent interagir directement avec les protéines et influencer leur solubilité.

    <p>True</p> Signup and view all the answers

    À quoi sert le concept de pH isoélectrique dans le contexte de la solubilité des protéines ?

    <p>Il détermine le point où la protéine ne sera pas soluble et précipitera.</p> Signup and view all the answers

    Study Notes

    Méthodes de Spectrophotométrie

    • La méthode spectrophotométrique mesure l'absorbance de la lumière par les molécules.
    • L'absorbance (A) est proportionnelle à la concentration (C) selon la relation de Beer-Lambert : A = ελ.C.l.
    • Choix de la longueur d'onde (λ) doit correspondre au λmax de la molécule pour un dosage efficace.

    Spectrophotométrie Directe et Indirecte

    • La spectrophotométrie directe ne concerne que trois acides aminés (aa) incolores, sauf les aromatiques absorbant dans l'UV, tel que le tryptophane, qui est fluorescent.
    • La spectrophotométrie indirecte nécessite une coloration, souvent utilisant la Ninhydrine pour créer une couleur bleu-violette correspondant à la concentration d’aa.

    Méthodes d'Identification des Résidus

    • Méthode d'Akatori pour identifier le résidu C-terminal.
    • Méthode de Sanger pour identifier le résidu N-terminal.
    • La fragmentation de polypeptides aide à l'identification en utilisant divers agents de clivage.

    Dégradation d'Edman

    • Permet d’analyser les petits peptides en fixant du PITC sur le N-terminal et en réalisant une hydrolyse incomplète, suivie d'une identification des aa.

    Linéarisation de l'Activité Enzymatique

    • La linéarisation permet d’interpréter les données expérimentales sur l’activité enzymatique, facilitant l'étude de Km (constante de Michaelis) et Vmax (vitesse maximale).

    Rôle des Effecteurs Allostériques

    • Les activateurs allostériques augmentent l'affinité de l'enzyme pour le substrat (S).
    • Les inhibiteurs allostériques diminuent cette affinité.
    • Les effecteurs jouent un rôle crucial dans la régulation des voies métaboliques en réponse à la concentration de substrats.

    Régulation des Voies Métaboliques

    • Les activités métaboliques s'ajustent aux besoins cellulaires, ayant un produit terminal comme inhibiteur et un précurseur comme activateur.
    • Inhibition des voies métaboliques par le produit terminal en cas d'excès.

    Hydrolyse des Disaccharides

    • Saccharose hydrolysé par la saccharase dans l'intestin.
    • Lactose hydrolysé par la lactase, avec des lactases extraites pour éviter l’intolérance.
    • Maltose produit lors de la digestion de l'amidon, hydrolysé par la maltase.

    Holosides et Polysaccharides

    • Glycogène : forme de stockage du glucose chez les animaux, structuré avec des liaisons glycosidiques α (14) et α (16), présent dans muscles et foie.
    • Tréhalose, avec des propriétés cryoprotectrices, présent chez les tardigrades, capable de survivre à des conditions extrêmes.

    Etat d'ionisation des acides aminés

    • Ampholyte : capable de se comporter à la fois comme acide et base.
    • Un acide aminé (aa) totalement protoné est désigné comme diacide.
    • Formes ioniques d'un aa :
      • Rose : forme protonée.
      • Bleu : forme non protonée.
      • Vert : fonction amine.
    • pKa de la fonction amine est généralement autour de 9 et celui de la fonction carboxylique est environ 2.

    Equation de neutralisation

    • pKa indique la « constante d'acidité » pour chaque fonction acide/base.
    • Les pKa déterminent l'ordre de perte des ions H+ dans un acide aminé.
    • Exemple : Valine avec pKaCOOH = 2,3 et pKaNH3+ = 9,7.
    • Augmentation du pH : perte de H+ du groupe COOH en premier, suivi par NH3+.

    Exemple de l'alanine

    • L'alanine présente des caractéristiques similaires aux autres acides aminés.

    Acides aminés avec groupe R chargé

    • Ce type d'acide aminé possède un troisième pKa, noté pKaR.
    • Calcul du pH isoélectrique (pHi) : moyenne des deux pKa entourant la forme zwitterionique.
    • Exemple : acide aspartique.

    Point isoélectrique (pI ou pHi)

    • Détermination du pH isoélectrique est cruciale pour l'analyse des acides aminés.
    • Exercice pratique pour le calcul du pH isoélectrique de l'acide glutamique.

    Séparation des acides aminés et des protéines

    • Les protéines précipitent quand elles ne sont pas solubles à leur pH isoélectrique.

    Techniques de séparation basées sur la solubilité

    • Influence du pH sur la solubilité des protéines.
    • Force ionique : concentration en sels dissous impacte la solubilité des protéines.
    • À faible force ionique, la solubilité augmente avec l'ajout de sels (salting in).

    Salting in et Salting out

    • Salting in : Les ions forment un écran empêchant les interactions entre protéines.
    • Salting out : À haute force ionique, le solvant devient indisponible pour les protéines, menant à leur précipitation.

    Linéarisation de Lineweaver et Burk

    • Simplifie l'étude de l'activité enzymatique en transformant les données en une droite pour l'analyse graphique.
    • Utilisation pour déterminer Km et Vmax des enzymes via des données expérimentales.

    Coenzymes et Cofacteurs

    • Cofacteur : petite molécule essentielle à l'activité enzymatique, fixée dans le site actif.
    • Coenzyme : petite molécule organique requise pour l'activité enzymatique, comme le NAD+ et le FAD.
    • Groupes prosthétiques : fixés de manière covalente ; co-substrats : molécules libres nécessaires à la réaction.

    Lipides

    • Triacylglycérols (TAG) :
      • TAG simple : mêmes acides gras.
      • TAG mixte : contient 2 ou 3 acides gras.
    • TAG sont hydrophobes et insolubles dans l'eau, formant des gouttelettes lipidiques.

    Lipides dans le corps

    • Transportés par les chylomicrons et lipoprotéines ;
    • Réserve énergétique dans les adipocytes blancs.

    Graisse vs Huiles

    • Graisse : TAG solides ou semi-solides (origine animale, acides gras saturés).
    • Huiles : TAG liquides (origine végétale, acides gras insaturés).

    Glycérophospholipides

    • Esters d'acides gras, glycérol, phosphate et autres molécules, formant des phospholipides.
    • Structures amphiphiles : une tête hydrophile et deux chaines carbonées hydrophobes.

    Lécithines (phosphatidylcholine)

    • Présentes dans le cerveau, le foie, le jaune d'œuf et le soja.
    • Cruciales pour la structure des membranes cellulaires.

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