Podcast
Questions and Answers
DNA replikasyonu için hangi model yarı koruyucu olarak adlandırılır?
DNA replikasyonu için hangi model yarı koruyucu olarak adlandırılır?
Meselson ve Stahl DNA replikasyonunu kanıtlamak için hangi izotopu kullandı?
Meselson ve Stahl DNA replikasyonunu kanıtlamak için hangi izotopu kullandı?
E.coli DNA'sının yapısı nedir?
E.coli DNA'sının yapısı nedir?
Ökaryotlarda DNA replikasyonu nerede gerçekleşir?
Ökaryotlarda DNA replikasyonu nerede gerçekleşir?
Signup and view all the answers
DNA replikasyonu nasıl başlar?
DNA replikasyonu nasıl başlar?
Signup and view all the answers
DNA yapısında bulunan temel birim nedir?
DNA yapısında bulunan temel birim nedir?
Signup and view all the answers
Hangi moleküller DNA'nın yapısında bulunmaz?
Hangi moleküller DNA'nın yapısında bulunmaz?
Signup and view all the answers
Aşağıdakilerden hangisi DNA polimerazların işlevlerinden biri değildir?
Aşağıdakilerden hangisi DNA polimerazların işlevlerinden biri değildir?
Signup and view all the answers
Hangi DNA polimeraz mitokondride bulunur?
Hangi DNA polimeraz mitokondride bulunur?
Signup and view all the answers
Deoksiribozun DNA molekülündeki yapılandırması hangi karbon atomları ile ilgilidir?
Deoksiribozun DNA molekülündeki yapılandırması hangi karbon atomları ile ilgilidir?
Signup and view all the answers
Aşağıdakilerden hangisi DNA'nın yapısında bulunan nitrojen bazları arasında yer almaz?
Aşağıdakilerden hangisi DNA'nın yapısında bulunan nitrojen bazları arasında yer almaz?
Signup and view all the answers
Aşağıdaki DNA polimerazlardan hangisi 3’-5’ ekzonukleaz aktivitesine sahip değildir?
Aşağıdaki DNA polimerazlardan hangisi 3’-5’ ekzonukleaz aktivitesine sahip değildir?
Signup and view all the answers
Hangi DNA polimeraz, replikasyon işlevinin dışında onarım işlevine de sahiptir?
Hangi DNA polimeraz, replikasyon işlevinin dışında onarım işlevine de sahiptir?
Signup and view all the answers
Hangi DNA polimeraz hiçbir şekilde 5’-3’ ekzonukleaz aktivitesine sahip değildir?
Hangi DNA polimeraz hiçbir şekilde 5’-3’ ekzonukleaz aktivitesine sahip değildir?
Signup and view all the answers
DNA replikasyonunu başlatan enzim hangisidir?
DNA replikasyonunu başlatan enzim hangisidir?
Signup and view all the answers
DNA polimeraz I'in hangi aktivitesi yanlışı düzeltmek için kullanılır?
DNA polimeraz I'in hangi aktivitesi yanlışı düzeltmek için kullanılır?
Signup and view all the answers
DNA sentezinde DNA polimeraz I'in çalışabilmesi için hangi unsurlara ihtiyaç vardır?
DNA sentezinde DNA polimeraz I'in çalışabilmesi için hangi unsurlara ihtiyaç vardır?
Signup and view all the answers
DNA polimeraz I hangi yönlerde eksonükleaz aktivitesine sahiptir?
DNA polimeraz I hangi yönlerde eksonükleaz aktivitesine sahiptir?
Signup and view all the answers
3’→5’ yönünde eksonükleaz aktivitesi hangi durumlarda ortaya çıkar?
3’→5’ yönünde eksonükleaz aktivitesi hangi durumlarda ortaya çıkar?
Signup and view all the answers
Aşağıdakilerden hangisi DNA polimeraz I’in görevleri arasında yer almaz?
Aşağıdakilerden hangisi DNA polimeraz I’in görevleri arasında yer almaz?
Signup and view all the answers
Study Notes
DNA Replikasyonu
- DNA'nın kendini eşleyerek sayısını katlama sürecidir.
- DNA replikasyonu yarı koruyucu (semikonservatif) tiptedir.
- Replikasyon sonunda genetik madde miktarı iki katına çıkar.
- Replikasyonla genetik bilginin nesilden nesile devamlılığı sağlanır.
- Replikasyon, ökaryotlarda çekirdek içinde gerçekleşir.
- Replikasyon, prokaryotlarda tek bir orijinde başlar ve tek bir replikondur.
- Replikasyon, ökaryotlarda birden fazla orijinde başlar ve çok sayıda replikondur.
Genetik Materyalin Özellikleri
- Replikasyon: Kendine benzerleri oluşturabilme özelliğidir.
- Gen Ekspresyonu: Fenotipe yansır.
- Çeşitlilik (varyasyon): Rekombinasyon ve mutasyon ile ortaya çıkar.
DNA Replikasyonu Modelleri
- Yarı koruyucu (semikonservatif) model: İlk nesilde bir iplik orijinal, diğeri yeni sentezlenmiş DNA'dan oluşur. Her replikasyonda, yeni oluşan DNA moleküllerinin her ikisi de orijinal DNA molekülünün bir ipliğini içerir.
- Koruyucu (konservatif) model: Orijinal DNA molekülü değişmeden kalır; her iki yeni molekül yeni sentezlenmiş DNA ipliklerinden oluşur.
- Dağınık (dispersif) model: Orijinal DNA'nın her iki ipliğinin parçalara ayrılması ve yeni ipliklerin oluşması ile yeni DNA moleküllerinin meydana geldiği model.
Arthur Kornberg
- 1955 yılında E. coli'de ilk DNA sentez enzimini keşfetmiştir.
- 1959'da Nobel Ödülü almıştır.
- DNA'nın kopyalanabilmesi için 4 komponentin (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) gerekli olduğunu belirlemiştir.
Replikon
- Prokaryotlarda tek, ökaryotlarda ise çok sayıdadır.
- Replikasyon orijinleri A-T baz çiftleri bakımından zengin bölümlerdir.
DNA Replikasyonunun Başlaması
- Replikasyon başlangıç noktasının (orijin) belirlenmesi.
- DNA ikili sarmalının çözülmesi ve iki DNA ipliğinin birbirinden ayrılması.
- Replikasyon çatalının oluşması. Çatalı helikaz, primaz, DNA polimeraz enzimi, ve tek ipliği bağlayan proteinler (SSBP) oluşturur.
DNA Polimeraz
- DNA sentezini gerçekleştiren enzimlerdir.
- prokaryot ve Ökaryotlarda birden fazla DNA polimeraz aktivitesinde olan enzim vardır.
- Bunlardan biri Replikaz işlevi yapar.
- Diğerlerinin replikasyonda ek görevleri vardır.
Bakteri DNA Polimerazlarının Özellikleri (Tablo)
- Enzim* | Yapı | 5'→3' Polimerizasyon | 3'→5' Eksonükleaz| 5'→3' Eksonükleaz | Kataliz hızı (nükleotid/saniye)
- --|--- |--- |--- |--- |--- Polimeraz I | Tek peptid | + | + | + | 10 Polimeraz II | ? | + | + | 0.5 Polimeraz III | Polipeptid | + | + | - | 150
DNA Polimeraz I (Kornberg enzimi)
- 1955'te Arthur Kornberg tarafından keşfedilmiştir.
- 109.000 dalton ağırlığında, 1000 amino asitten oluşmuştur.
- dNTP, Mg2+ iyonu, serbest 3' ucu bulunan DNA parçası ve kalıp DNA zinciri varlığında çalışır.
DNA Polimeraz II
- Sentezden başka eksonukleaz aktivitesi vardır.
- 3'→5' yönünde eksonukleaz aktivitesi ile yanlış nükleotidleri ortadan kaldırır ve 5'→3' yönünde eksonukleaz aktivitesi ile primer ve pirimidin dimerlerini çıkarır.
DNA Polimeraz III
- Bakterilerde polimerizasyondan sorumludur.
- E. coli'de 100 adet vardır.
- DNA Polimeraz III, DNA Polimeraz I'den 15, DNA Polimeraz II' den 300 kat daha hızlıdır.
DNA Polimerazlar (e.g.Pol I,II, III)
- Sadece bir yönde hareket edebilirler.
- DNA polimeraz I, deoksiribozun 3'-OH grubu ile dNTP'nin 5'-fosfat grubu arasındaki fosfodiester bağının oluşumunu katalizler.
- Başlangıçta 10.000 de bir hatalı nükleotid ekleme yapar ancak hatayı okuyup düzeltme özelliği vardır.
Okazaki Parçaları
- Ökaryotlarda 100-200, Prokaryotlarda 1000-2000 nükleotid uzunluğunda DNA parçalarıdır.
- RNA primerleri tarafından başlatılır ve DNA polimeraz I tarafından doldurulur.
- İki uç ligaz enzimi tarafından birleştirilerek tek bir zincir haline gelir.
DNA Ligaz
- Replikasyon sonunda Okazaki fragmanlarının uçlarını birleştiren enzimdir.
- Ard arda iki Okazaki fragmanı arasındaki 5'-PO4 ve 3'-OH grupları arasında fosfodiester bağı oluşumunu katalizler.
- ATP enerjisi gerektirir. Genetik mühendisliğinde önemlidir.
DNA Topoizomerazlar
- DNA'nın üçüncül şeklini değiştirir.
- Halkasal DNA'nın süpersarmalını giderir.
Ökaryotik DNA Polimerazlar
- DNA primerlerinden sentez başlayabilir.
- Proofreading özelliği yoktur.
- Tamir mekanizmasında görev alır.
Telomer ve Telomeraz
- Doğrusal kromozomların uçlarının replikasyonu sorunludur.
- Telomeraz enzimi, telomerlerin kısalmasını önlemek için tekrar dizilerini kromozomun ucuna ekler.
- DNA polimeraz I, telomerlerin boşluklarını doldurur.
RNA Polimeraz (DNA primaz)
- Bir kalıba uyarak sentezi başlatabilir.
- DNA kalıbına uyarak 10-15 nukleotidlik primerler sentezler.
- Gen seçiminde önemlidir.
Studying That Suits You
Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.
Related Documents
Description
Bu quiz, DNA replikasyonunun temel ilkelerini ve DNA polimerazların işlevlerini test etmektedir. DNA'nın yapısı, replikasyon süreci ve ilgili enzimler hakkında temel bilgiler edineceksiniz. DNA ile ilgili önemli sorulara yanıtlar bulacaksınız.
