Diagnosi Microbiologica: Isolamento e Reazioni

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Questions and Answers

A proposito dell'isolamento virale diresti che:

  • Il tempo di isolamento di differenti virus è sempre medesimo
  • Si fa su cellule permissive e suscettibili (correct)
  • Le cellule usate sono specie specifica dell'ospite dove circola il virus (correct)
  • Si fa su cellule solo suscettibili (correct)

Cosa diresti dell'effetto del Natalizumab in pazienti MS per riattivazione virus JPyV?

  • Solo dopo un anno di somministrazione può dare rischio per JVC (correct)
  • Aumenta la capacità di infezione primaria di JVC
  • Bastano poche dosi per riattivare il virus
  • Riattiva il virus interagendo direttamente con la proteina Vp1

Cosa diresti della piattaforma WASP?

  • È un sistema automatizzato per tipizzazione molecolare virus
  • È un sistema automatizzato per tipizzazione molecolare batterica (correct)
  • È un sistema automatizzato per semina e analisi colture batteriche
  • Serve per fare automatizzato antibiogramma per sensibilità batterica ad antibiotici

Parlando di reazioni sierologiche diresti che:

<p>Nelle reazioni di neutralizzazione la formazione dell'immunocomplesso è evidenziata dalla perdita dell'attività biologica dell'antigene (A), Le reazioni di immunoblotting utilizzano come fase solida pozzetti di micropiastre (D)</p> Signup and view all the answers

Diresti che:

<p>La reazione di neutralizzazione può essere utile per la ricerca e la titolazione di anticorpi specifici verso un agente di infezione (C), IgM falsamente negativi possono essere dovuti alla presenza del fattore reumatoide nel siero dai soggetti IgG+ e FR+ (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa non è high resolution melting analysis (HRMA):

<p>Utilizza dye di saturazione (A)</p> Signup and view all the answers

La CMI O MIC indica

<p>La concentrazione minima in cui un antibiota è in grado di inibire la crescita batterica (B)</p> Signup and view all the answers

La droplet digital PCR ddPCR, BIORAD

<p>Dà informazioni solo quantitative (A), Può utilizzare sonde TaqMan (C), Permette l'amplificazione di circa 2 milioni di goccioline (D)</p> Signup and view all the answers

Il test LFIA

<p>Serve per la ricerca di anticorpi anti virus influenza (A), Può essere utilizzato per la ricerca di antigeni batterici con risposta in 10-15 minuti (C)</p> Signup and view all the answers

Con la tecnologia MALDI TOF

<p>Si ricerca il profilo proteomico dei batteri (C)</p> Signup and view all the answers

Nel caso della CMI di un antibiotico cosa significa l'indice I

<p>Batterio sensibile ad alta concentrazione di antibiotico (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti tecniche è un saggio automatizzato per tipizzazione batterica

<p>Vitek (C)</p> Signup and view all the answers

A proposito di LAL diresti che:

<p>Si utilizza l'amebocita di limulus polyphemus (C)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti tecniche possono maggiormente servire per ricercare una mutazione puntiforme conosciuta

<p>HRMA (D)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti tecniche è meglio considerata come tecnica rapida

<p>Colorazione di Gram (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa diresti dei microarray

<p>Possono essere fatti con molecole di DNA, proteine, carboidrati (B)</p> Signup and view all the answers

I probe dei microarray non sono mai prodotti:

<p>con tecnica a getto di inchiostro (A), senza analisi della loro autofluorescenza (B)</p> Signup and view all the answers

In pazienti con sclerosi multipla in terapia con Natalizumab cosa è preferibile monitorare per il rischio di PML

<p>Con anticorpi e DNA per il virus JC nel sangue (C)</p> Signup and view all the answers

Il primo ed il secondo campione di sangue per dimostrare un aumento del titolo anticorpale nei confronti di un agente devono essere prelevati

<p>A distanza di 2-3 settimane (C)</p> Signup and view all the answers

La titolazione delle singole particelle infettanti si può fare

<p>Utilizzando il metodo delle placche (B), Utilizzando il saggio della LE50 (C), Utilizzando il saggio della TCID50 (D)</p> Signup and view all the answers

HMRA

<p>è una metodica post PCR (A), permette di identificare variazioni genetiche non note (B), utilizza il syber green come intercalante (C)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti è un test per ricerca antigenemia?

<p>ELISA (D)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti metodi non è utilizzato per l'analisi dell'attività antibiotica?

<p>Diluizione del batterio (C)</p> Signup and view all the answers

Con quale metodo si può rilevare la presenza di micobatteri in un campione?

<p>Colorazione ziehl nielsen (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa si identifica con il test API?

<p>Profilo biochimico (C)</p> Signup and view all the answers

Il test che ricerca la presenza di catalisi può discriminare?

<p>Gli stafilococchi da altri gram positivi (+) (A), Stafilococco aureus da altri stafilococchi (C)</p> Signup and view all the answers

Nell'identificazione batterica mediante analisi genotipica:

<p>Il target maggiormente utilizzato è il 16s rDNA (B)</p> Signup and view all the answers

L'identificazione genotipica batterica si effettua utilizzando:

<p>Tutti i suddetti target genetici (D)</p> Signup and view all the answers

Il pirosequenziamento e NGS sono tecniche di nuova generazione per l'analisi del DNA.

<p>True (A)</p> Signup and view all the answers

La tecnica delle shell vials permette:

<p>Tutte le suddette (C)</p> Signup and view all the answers

L'agar per produrre terreni solidi rimane liquido fino alla temperatura di:

<p>37 gradi (D)</p> Signup and view all the answers

La colorazione con inchiostro di china evidenzia:

<p>Capsula batterica (C)</p> Signup and view all the answers

Con la tecnica MALDI-TOF l'identificazione batterica è resa possibile per:

<p>Identificazione viene effettuata paragonando il profilo ottenuto con un database di profili delle varie specie batteriche (C)</p> Signup and view all the answers

I break-point clinici sono definiti sulla base:

<p>Dalla MIC di riferimento nazionale (C)</p> Signup and view all the answers

La riattivazione del JCPyV e possibile sviluppo di PML è maggiore:

<p>In individui trattati con Infliximab (D)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti metodi è un test indiretto per la ricerca virologica:

<p>Ricerca IgM specifiche per virus (B)</p> Signup and view all the answers

La ricerca genotipica della resistenza virale agli antivirali dipende:

<p>Dalla presenza di nuove mutazioni mai identificate (B), Dalla possibilità di estrarre il genoma dalle cellule in vitro (C), Dalla conoscenza delle mutazioni che inducono resistenza (D)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Isolamento virale

Si effettua su cellule permissive e suscettibili specifiche per il virus.

Effetto del Natalizumab

Riattiva il virus JCV solo dopo un anno di trattamento.

Piattaforma WASP

Sistema automatizzato per semina e analisi di colture batteriche.

Reazioni sierologiche

In neutralizzazione, immunocomplessi si formano con perdita dell'attività biologica.

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Neutralizzazione anticorpale

Utile per titolare anticorpi specifici contro un'infezione.

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High Resolution Melting Analysis (HRMA)

Tecnica post-PCR per analisi delle variazioni genetiche.

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Concentrazione Minima Inibente (CMI)

È la minima concentrazione di antibiotico che inibisce la crescita batterica.

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Droplet Digital PCR (ddPCR)

Permette l’amplificazione in milioni di goccioline e fornisce dati quantitativi.

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Test LFIA

Usato per ricerca di antigeni batterici in rapida risposta.

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Tecnologia MALDI-TOF

Identificazione batterica attraverso profili proteomici.

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Indici break-point clinici

Stabiliti da concentrazioni raggiunte nei vari distretti e studi clinici.

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Droplet PCR e identificazione

ddPCR distingue sequenze e fornisce numeri assoluti di copie target.

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Shell vials

Tecnica per rilevare rapidamente la positività virale.

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Colorazione Ziehl Nielsen

Usata per rilevare micobatteri in campioni clinici.

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Test API

Identifica profili biochimici dei batteri.

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Ricerca di catalasi

Discernere Staphylococci da altri gram positivi.

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Identificazione genotipica batterica

Utilizza il 16s rDNA come target principale.

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Analisi di attività antibiotica

Condotta con metodi come diluizione e disco di diffusione.

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Microscopia elettronica

Tecnica per osservare dettagli cellulari a risoluzione elevata.

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Metodi di titolazione

Misurano il numero di particelle infettive nei campioni.

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PCR e genotipizzazione

Usa PCR per identificare mutazioni note.

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Genotipizzazione e SNP

HRM utilizza sonde fluorescenti per genotipizzazione.

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Ricerca genotipica resistenza virale

Dipende dalla conoscenza di mutazioni per la resistenza.

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Identificazione batterica

Realizzata confrontando profili proteici con database.

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Study Notes

Diagnosi Microbiologica Domanda

  • Isolamento Virale: Cellule suscettibili necessarie, tempo di isolamento varia a seconda del virus. Cellule permissive e suscettibili sono utilizzate, le cellule utilizzate sono specifiche per l'ospite dove circola il virus.
  • Natalizumab e Virus JPyV: La somministrazione di Natalizumab può aumentare il rischio di riattivazione del virus JPyV dopo un anno di trattamento. Il virus non necessita di molte dosi per essere riattivato e interagisce direttamente con la proteina Vp1. Aumenta la capacità d'infezione primaria del virus JVC.
  • Piattaforma WASP: Sistema automatizzato per semina e analisi di colture batteriche e per la tipizzazione molecolare dei virus/batteri, automatizza antibiogramma per sensibilità batterica.
  • Reazioni Sierologiche: La formazione dell'immunocomplesso in reazioni di neutralizzazione è evidenziata dalla perdita dell'attività biologica dell'antigene. I reazioni di immunoblotting utilizzano micropiastre. La reazione di precipitazione è molto sensibile.
  • Neutralizzazione: Utile per la ricerca e la titolazione di anticorpi specifici. Nei soggetti immunocompetenti può dar luogo a falsi negativi; per esempio, IgM falsamente negativi possono essere dovuti alla presenza di fattore reumatoide nel siero. Utile per determinare la carica virale.
  • High Resolution Melting Analysis (HRMA): Tecnica post-PCR, non utilizzabile per genotipizzazione, il syber green è simile ad intercalante.
  • CMI/MIC: Concentrazione minima inibitoria (CMI) indicata come concentrazione minima di un antibiotico necessaria per inibire la crescita batterica.
  • Droplet Digital PCR (ddPCR): Tecnica utilizzata per l'amplificazione di circa 2 milioni di goccioline e permette l'identificazione di sequenze non note con sonde TaqMan.
  • LFIA: Test rapido per la ricerca di antigeni batterici in 10-15 minuti.
  • Tecnologie MALDI-TOF: Analizza il profilo proteomico dei batteri.
  • CMI e Indice I: L'indice I indica la sensibilità del batterio ad alta concentrazione di un antibiotico.
  • Tests per Tipizzazione Batterica: Il metodo Vitek è un saggio automatizzato usato per la tipizzazione batterica.
  • LAL (Limulus Amebocyte Lysate): Metodica per misurare il contenuto di enterotossine e per valutare il contenuto di antigene capsulare.
  • Tecniche per Mutazioni Puntiformi: HRMA è una metodica post-PCR.
  • Tecniche Rapide: La colorazione di Gram, la microscopia elettronica e la RT-PCR sono definite tecniche rapide in microbiologia.
  • Microarray: Possono essere utilizzati con molecole di DNA, proteine e carboidrati. Il numero dei target è minore rispetto alla PCR in tempo reale, ed è più sensibile. I probe non sono mai prodotti senza una densità opportuna di molecole.
  • PML e Natalizumab: In pazienti con sclerosi multipla trattati con Natalizumab è preferibile monitorare gli anticorpi e il DNA per il virus JC nel sangue. Utilizzo di un campione di sangue come riferimento iniziale.
  • Titolazione delle Particelle Infettanti: Metodi come il saggio TCID50 sono usati per titolare le particelle infettanti.
  • PCR e analisi del DNA: Il metodo ddPCR, è usato per determinare il numero assoluto di copie del target. L'ibridazione allele specifica è una tecnica di ibridazione su fase liquida.
  • HMR: Metodica post-PCR che permette la genotipizzazione. In questo caso il test utilizza sonde fluorescenti.
  • Test per Antigenemia: La PCR è utilizzata per la ricerca dell'antigenemia.
  • Metodi per l'attività antibiotica: La diluizione dell'antibiotico in brodo e il metodo del disco diffusione sono utilizzati.
  • Identificazione batterica (microscopia ottica): Colorazione di Ziehl-Nielsen per micobatteri, inchiostro di china.
  • Identificazione batterica (API): Profilo biochimico del microorganismo.
  • Test per la discriminazione batterica: Test che differenziano stafilococchi da altri batteri Gram-positivi e/o da batteri Gram-negativi.
  • Analisi Genotipica: Identificazione batterica basata su analisi genotipica.
  • Resistenza agli antibiotici: Target comune di analisi è il gene per la resistenza all'ampicillina.
  • Piramsequenziamento NGS: Tecnologie di nuova generazione per l'analisi del DNA.
  • Shell Vials: Tecnica per rendere più rapida la rilevazione della positività virale.
  • Terreni di coltura: L'agar deve rimanere liquido fino a 37 gradi centigradi per essere solidificato.
  • Colorazione batterica: La colorazione con inchiostro di china evidenzia la capsula batterica.
  • Metodi di identificazione: La MALDI-TOF confronta il profilo ottenuto con un database per l'identificazione batterica.
  • Break-Point clinici: Definiti sulle concentrazioni raggiunte nei vari distretti corporei basati su studi clinici e sulla MIC di riferimento nazionale.
  • Riattivazione JCPyV/PML: Maggiore riattivazione in individui affetti da HCV o HIV.
  • Ricerca Virale: Metodi indiretti per ricerca virologica come l'isolamento del virus o la ricerca di genoma.
  • Genetica resistenza virale: Dipendente dalla presenza di mutazioni che inducono resistenza.

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