Chimica dell'Acqua e RNA negli Eucarioti

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Questions and Answers

Qual è la formula chimica dell'acqua?

  • H2O2
  • OH2
  • H2O (correct)
  • O2H

Perché l'acqua è considerata un ottimo solvente per soluti ionici e polari?

  • Per la sua struttura molecolare che genera un dipolo (correct)
  • Perché è apolare
  • Per la sua bassa polarità
  • Per la sua alta temperatura di ebollizione

Qual è l'angolo di legame tra gli atomi di idrogeno nella molecola di acqua?

  • 104,5° (correct)
  • 180°
  • 120°
  • 90°

Quale affermazione sui legami a idrogeno è corretta?

<p>I legami a idrogeno si formano tra un atomo di idrogeno e un atomo elettronegativo. (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa spiega il fenomeno della coesione delle molecole d'acqua?

<p>La presenza di legami a idrogeno (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti proprietà è dovuta alla capillarità dell'acqua?

<p>Capacità di risalire nei tubi stretti (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la causa principale della differenza di potenziale nella molecola d'acqua?

<p>La diversa elettronegatività tra ossigeno e idrogeno (C)</p> Signup and view all the answers

In che modo l'adesione contribuisce alle proprietà dell'acqua?

<p>Attraverso legami a idrogeno con altre superfici polari (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è una delle principali differenze tra geni batterici ed eucariotici?

<p>Nei geni batterici, la sequenza codificante è continua. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa include la modifica dell'RNA nei eucarioti all'estremità 5'?

<p>Aggiunta di 7-metilguanosina. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale della coda poliA nell'RNA eucariotico?

<p>Proteggere l'RNA dalla degradazione. (A)</p> Signup and view all the answers

Che cosa sono gli esoni negli eucarioti?

<p>Tratti di RNA che contengono informazioni per le proteine. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica della sequenza nucleotidica nei batteri rispetto agli eucarioti?

<p>I geni sono più vicini tra di loro. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo principale degli RNA non codificanti?

<p>Regolare i livelli di espressione dei geni. (C)</p> Signup and view all the answers

Quale tipo di RNA è responsabile per la sintesi delle proteine?

<p>RNA messaggero (A)</p> Signup and view all the answers

Come agiscono i micro-RNA sull'RNA messaggero?

<p>Causano la degradazione o bloccano la traduzione dell'RNA messaggero. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa fa l'lncRNA chiamato xist?

<p>Inattiva un intero cromosoma X. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale degli RNA ribosomiali (rRNA)?

<p>Compongono i ribosomi. (C)</p> Signup and view all the answers

Quale funzione NON è associata agli RNA non codificanti?

<p>Sintesi di RNA messaggero. (A)</p> Signup and view all the answers

Quali RNA sono coinvolti nel processamento dell'RNA e nello splicing?

<p>snRNA (small nuclear RNA) (C)</p> Signup and view all the answers

In quale processo gli RNA non codificanti hanno un ruolo importante?

<p>Inattivazione di un cromosoma X. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la descrizione più accurata della struttura primaria di una proteina?

<p>La sequenza amminoacidica della catena polipeptidica (A)</p> Signup and view all the answers

Quali delle seguenti affermazioni riguardo alla struttura secondaria sono vere?

<p>Comprende le α-eliche e i β-foglietti (A)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni descrive meglio le α-eliche?

<p>Sono stabilizzate da legami a idrogeno tra gruppi NH e CO (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa determina principalmente la stabilità delle proteine globulari idrosolubili?

<p>L'orientamento delle catene laterali idrofobiche (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la caratteristica distintiva della struttura quaternaria?

<p>Involge l'associazione di più catene polipeptidiche (A)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti fattori non contribuisce alla formazione della struttura secondaria?

<p>Interazioni idrofobiche tra amminoacidi (C)</p> Signup and view all the answers

Quali basi azotate sono presenti nel DNA?

<p>Adenina, Guanina, Citosina, Timina (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la differenza principale tra il DNA e l'RNA riguardo allo zucchero?

<p>L'RNA contiene ribosio, il DNA desossiribosio. (C)</p> Signup and view all the answers

Che cos'è la struttura terziaria di una proteina?

<p>L'organizzazione tridimensionale finale della catena polipeptidica (B)</p> Signup and view all the answers

Quali basi azotate sono definite purine?

<p>Adenina e Guanina (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è il passo tipico di un'elica α?

<p>3.5 amminoacidi per giro (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa crea l'unione di una base azotata e uno zucchero?

<p>Un nucleoside (D)</p> Signup and view all the answers

Qual'è il legame che unisce i nucleotidi in una catena di DNA o RNA?

<p>Legame fosfodiesterico (B)</p> Signup and view all the answers

Quali enzimi sono coinvolti nella sintesi di DNA e RNA?

<p>Polimerasi e Nasi (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il significato del termine 'nucleotide'?

<p>Nucleoside con uno o più gruppi fosfato (D)</p> Signup and view all the answers

Chi sono stati i principali scopritori della struttura del DNA?

<p>Watson, Crick, Wilkins, Franklin (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa ci si aspetta di osservare nel terzo campione di DNA se la replicazione è semiconservativa?

<p>Due bande: una ibrida e una completamente leggera (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la direzione in cui cresce il DNA durante la replicazione?

<p>Da 5’ a 3’ (B)</p> Signup and view all the answers

Quale ruolo ha l'enzima DNA polimerasi nella sintesi del DNA?

<p>Aggiungere nucleotidi e tagliare i trifosfati (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresenta il termine 'semiconservativo' nel contesto della replicazione del DNA?

<p>Ogni nuova elica contiene un filamento originale e uno nuovo (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione dello ione pirofosfato durante la replicazione del DNA?

<p>Rilasciare energia per legare nucleotidi (D)</p> Signup and view all the answers

Dove viene aggiunto un nucleotide durante la replicazione del DNA?

<p>All'estremità 3’ OH (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa avviene quando DNA sintetizzato in presenza di azoto pesante viene replicato in azoto leggero?

<p>Si formano filamenti ibridi e leggeri (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il risultato della rottura del legame tra il fosfato 1 e 2 durante la replicazione?

<p>Si libera energia per unire nucleotidi (D)</p> Signup and view all the answers

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Flashcards

Polarità dell'acqua

La polarità delle molecole d'acqua è data da una diversa distribuzione delle cariche elettriche tra l'ossigeno e gli atomi di idrogeno, rendendola un ottimo solvente per soluti ionici e polari.

Legame covalente

Un tipo forte di legame chimico che si forma quando due atomi condividono una coppia di elettroni.

Elettronegatività

La forza con cui un atomo attira gli elettroni verso di sé.

Legame a idrogeno

Un legame debole che si forma tra un atomo di idrogeno (legato covalentemente a un atomo elettronegativo) e un atomo elettronegativo di molecole diverse o della stessa molecola.

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Adesione dell'acqua

La capacità dell'acqua di rimanere attaccata ad altre superfici, grazie ai legami a idrogeno tra l'acqua e altre sostanze polari.

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Coesione dell'acqua

La capacità dell'acqua di rimanere attaccata alle altre molecole di acqua, grazie ai legami a idrogeno.

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Capillarità

Il fenomeno per cui l'acqua tende a risalire all'interno di tubi molto stretti, contro la forza di gravità, dovuto a coesione e adesione.

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Tensione superficiale dell'acqua

La tendenza dell'acqua a resistere alla rottura della sua superficie, dovuta ai forti legami a idrogeno.

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Struttura primaria

La sequenza di amminoacidi in una catena polipeptidica. Determina tutte le altre strutture della proteina.

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Struttura secondaria

Conformazioni regolari e ripetitive che la catena polipeptidica assume nello spazio. Le due principali sono l'α-elica e il β-foglio.

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α-elica

Un tratto della proteina che si ripiega a spirale, stabilizzata da legami a idrogeno tra il gruppo NH e CO di amminoacidi adiacenti.

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β-foglio

Struttura planare formata da tratti di catena polipeptidica disposti in parallelo e tenuti insieme da legami a idrogeno.

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Struttura terziaria

La forma tridimensionale della proteina, definita dalle interazioni tra i gruppi R degli amminoacidi.

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Struttura quaternaria

L'organizzazione di più catene polipeptidiche (subunità) in una struttura complessa.

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Effetto idrofobico

La forza principale che determina il ripiegamento delle proteine globulari idrosolubili. Porta all'impacchettamento delle catene laterali idrofobiche all'interno della molecola.

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Interazioni tra gruppi R

L'interazione tra le catene laterali degli amminoacidi che contribuisce alla stabilità della struttura tridimensionale della proteina.

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Basi Azotate nel DNA e RNA

Le basi azotate sono i componenti fondamentali degli acidi nucleici, come DNA e RNA. Esistono due tipi principali: purine e pirimidine.

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Nucleosidi: Basi + Zucchero

I nucleosidi sono formati dalla combinazione di una base azotata con uno zucchero, come il ribosio o il desossiribosio.

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Nucleotidi: Nucleosidi + Fosfato

I nucleotidi sono l'unione di un nucleoside con uno o più gruppi fosfato. Sono i monomeri che costituiscono gli acidi nucleici (DNA e RNA).

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Sequenza di Basi: Informazione Genetica

La sequenza di basi azotate all'interno di un DNA o RNA determina la struttura del polimero. Ciascuna base occupa una posizione specifica e influenza la funzione.

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Desossiribosio vs Ribosio nel DNA e RNA

Nel DNA, il desossiribosio è presente come zucchero, mentre nel RNA è presente il ribosio. Questa differenza è cruciale per la struttura e la funzione dei due acidi nucleici.

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Legame Fosfodiesterico: Nucleotidi Uniti

I nucleotidi si legano tra loro tramite legami fosfodiesterici, formando una catena continua. Il legame avviene tra il gruppo fosfato al 5' di un nucleotide e il gruppo OH al 3' del successivo.

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Scoperta del DNA a doppia elica

La scoperta della struttura a doppia elica del DNA fu un risultato di molti studi che hanno permesso di chiarire la struttura e la funzione di questa molecola fondamentale.

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Significato della Struttura del DNA

La scoperta della struttura del DNA fu un passo decisivo nella comprensione dell'ereditarietà e del meccanismo di replicazione del materiale genetico.

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Replicazione semiconservativa

Un tipo di replicazione del DNA in cui ogni nuova doppia elica formata contiene un filamento originale e un filamento di nuova sintesi.

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DNA polimerasi

L'enzima responsabile della polimerizzazione del DNA, ovvero della creazione di nuove catene di DNA.

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Direzione di crescita del DNA

La direzione in cui il DNA viene sintetizzato, ovvero dall'estremità 5' all'estremità 3'.

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Nucleoside trifosfato

Un nucleotide con tre gruppi fosfato, utilizzato come unità di base per la costruzione del DNA.

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Legame fosfodiesterico

Il legame che unisce i nucleotidi in una catena di DNA.

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Estremità 3' OH

L'estremità del filamento di DNA che è sempre libera e a cui si può aggiungere un nuovo nucleotide.

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Estremità 5'

L'estremità del filamento di DNA con un gruppo fosfato

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Replicazione del DNA

Il processo in cui il DNA viene copiato durante la divisione cellulare.

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Geni batterici: sequenza continua

La sequenza di nucleotidi che codifica per una proteina in un batterio è continua, senza interruzioni. Ciò significa che tutti i nucleotidi che compongono il gene sono utilizzati per costruire la proteina finale.

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Geni eucariotici: esoni e introni

Negli eucarioti, i geni sono composti da esoni, le porzioni di DNA che codificano per la proteina, e introni, le porzioni di DNA non codificanti.

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Elaborazione dell'RNA negli eucarioti

I geni eucariotici hanno bisogno di essere processati prima di essere utilizzati per la sintesi proteica. Questo processo di elaborazione include l'aggiunta di un cappuccio 5', un'aggiunta all'estremità 5' del trascritto di RNA, e una coda poli-A, un'aggiunta all'estremità 3' del trascritto di RNA.

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Cappuccio 5' negli eucarioti

Il cappuccio 5' è un nucleotide modificato chiamato 7-metilguanosina che viene aggiunto all'estremità 5 del trascritto di RNA. Questo cappuccio svolge diverse funzioni tra cui la protezione dalla degradazione, il riconoscimento da parte del ribosoma, e la regolazione della traduzione.

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Coda poli-A negli eucarioti

La coda poli-A è un'aggiunta di diversi nucleotidi adenina (A) all'estremità 3' del trascritto di RNA. La sua funzione è la protezione dalla degradazione, il riconoscimento da parte del ribosoma e la regolazione della durata della vita del trascritto.

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RNA non codificanti

Gli RNA non codificanti sono molecole di RNA che non vengono tradotte in proteine. Svolgono un ruolo chiave nella regolazione dell'espressione genica e in altri processi cellulari.

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Quantità di RNA non codificanti

Gli RNA non codificanti sono stati trovati in un numero molto più elevato rispetto agli RNA messaggeri, circa il doppio. Questo ha portato a una ridefinizione del concetto di gene.

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Funzioni degli RNA non codificanti

Gli RNA non codificanti sono molecole di RNA con una funzione ben precisa, diverso dagli RNA messaggeri. Questi sono in grado di regolare l'attività di altri geni, modificare la struttura del cromosoma e partecipare alla creazione dei ribosomi.

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RNA ribosomiale (rRNA)

L'RNA ribosomiale (rRNA) è un componente fondamentale dei ribosomi, le strutture che traducono l'RNA messaggero in proteine.

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RNA di trasporto (tRNA)

Il tRNA è una piccola molecola di RNA che trasporta gli amminoacidi ai ribosomi durante il processo di traduzione.

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Micro-RNA (miRNA)

I microRNA (miRNA) sono piccoli RNA coinvolti nella regolazione dell'espressione genica. Possono bloccare la traduzione dei geni o degradare l'RNA messaggero.

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Long non-coding RNA (lncRNA)

I long non-coding RNA (lncRNA) sono RNA non codificanti di grandi dimensioni che possono avere diverse funzioni, tra cui la regolazione dell'espressione genica e la formazione di strutture.

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lncRNA Xist

Un esempio di lncRNA è Xist, un RNA che inattiva uno dei due cromosomi X nelle donne, determinando l'espressione genica.

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Study Notes

Introduzione

  • La biologia è la scienza che studia gli organismi viventi e le interazioni con l'ambiente.
  • Il DNA contiene le istruzioni per lo sviluppo dell'organismo.

Caratteristiche della materia vivente

  • Complessità: La biodiversità è la variabilità tra le forme di vita, un adattamento alla diversità dell'ambiente. La base di ciò risiede nel genoma, che contiene le informazioni per lo sviluppo. La riproduzione sessuata genera molta variabilità.
  • Accrescimento: La crescita è controllata e limitata. L'aumento di volume è proporzionato alla superficie, altrimenti compromette la sopravvivenza. Gli organismi unicellulari e pluricellulari crescono e si sviluppano con il nutrimento, che fornisce l'energia per le reazioni biochimiche.
  • Riproduzione: La riproduzione asessuata, come la scissione binaria, genera copie identiche. La riproduzione sessuata, invece, crea diversità genetica attraverso la combinazione di materiale genetico di genitori diversi. Ciò concede una capacità di adattamento più ampia.

L'organizzazione biologica

  • La biologia è organizzata gerarchicamente, con ogni livello che ha proprietà emergenti (non presenti a livelli inferiori)
  • Complessità a livello chimico: atomo, molecola, macromolecola, cellula, tessuti, organo e organismo..

La cellula

  • L'unità basilare della vita
  • Contiene tutti i componenti chimici della vita.
  • Gli organismi viventi possono essere unicellulari (costituiti da una singola cellula) o pluricellulari (costituiti da diverse cellule).

La cellula batterica

  • Definizione di procariote: nucleo non avvolto da membrana nucleare.
  • Composizione: acqua, ioni e composti organici (carboidrati, lipidi, amminoacidi, nucleotidi, acidi nucleici e proteine)

L'acqua

  • Importanza fondamentale per la vita
  • Polarità: è un dipolo, legami a idrogeno.
  • Coesione: legami a idrogeno tra molecole d'acqua = tensione superficiale.
  • Adesione: legami a idrogeno tra acqua ed altre sostanze polari = capillarità.
  • Alto calore specifico: permette la termoregolazione.
  • Alto calore di evaporazione: assorbimento di calore.
  • Tendenza a dissociarsi in ioni idrogeno (H+) e idrossido (OH-)

Lipidi semplici

  • Funzione principale: riserva energetica.
  • Composti da glicerolo e acidi grassi.
  • Classificati in monoglyceridi, digliceridi e trigliceridi.
  • Acid grassi possono essere saturi o insaturi (a seconda del tipo di legame)

Lipidi complessi

  • Funzione principale: composizione di membrane cellulari.
  • Composti da glicerolo, acidi grassi, fosfato e un gruppo polare.
  • Tipi: Fosfogliceridi.
  • Implicazione per le membrane biologiche, formano il doppio strato di fosfolipidi.

Steroidi

  • Importanti molecole a base di anelli di carbonio.
  • Il colesterolo: componente strutturale delle membrane cellulari.
  • Precursore della sintesi di ormoni steroidei.
  • Funzione: Ormoni sessuali e cortisolo (ormone dello stress).

Carboidrati

  • Funzione principale: fonte di energia, energia immediatamente disponibile o per deposito.
  • Classificati in base alla loro complessità: Monosaccaridi, disaccaridi, oligosaccaridi, polisaccaridi.
  • Monosaccaridi: glucosio, fruttosio...
  • I monosaccaridi si uniscono attraverso i legami glicosidici per formare disaccaridi e polisaccaridi.
  • Esempi di disaccaridi: saccarosio (zucchero da tavola), maltosio (zucchero di malto).
  • Esempi di polisaccaridi: glicogeno (animali), amido e cellulosa (piante).

Proteine

  • Le proteine sono polimeri di amminoacidi, ciascuna con una diversa composizione e funzione.
  • Enzimi: catalizzatori biologici delle reazioni chimiche.
  • Strutturale: forniscono supporto e struttura alla cellula.
  • Di deposito: riserva di nutrienti.
  • Di trasporto: trasporto di sostanze attraverso la membrana cellulare.
  • Regolatore: regolazioni di geni ed attività cellulari
  • Contrazione: proteine coinvolte nel movimento delle cellule (actina, miosina).
  • Protezione: anticorpi, proteine che combattono corpi esterni patogeni.

Amminoacidi (monomeri di proteine)

  • 20 diversi tipi di aminoacidi con differenti catene laterali.
  • Riconoscimento basato su proprietà (idrofobiche o idrofile).
  • I 20 aminoacidi possono essere classificati in base alle loro catene laterali.

Acidi nucleici

  • DNA (acido desossiribonucleico) e RNA (acido ribonucleico)

  • DNA: molecola a doppia elica che immagazzina l'informazione genetica

  • RNA: copie transitorie dell'informazione genetica, diversi tipi hanno diverse funzioni.

Dogma centrale della biologia

  • Flusso di informazioni dalle istruzioni genetiche al prodotto proteico.
  • Trascrizione (DNA in RNA)
  • Traduzione (RNA in proteina)

Ciclo Cellulare

  • Interfase (G1, S, G2): preparazione per la divisione cellulare;
  • Mitosico (fase M): divisione nucleare e divisione citoplasmatica.

Meiosi

  • Divisione riduzionale che porta a cellule aploidi dai genitori diploidi.

Mutazioni

  • Cambiamenti permanenti nel DNA, possono essere di diversi tipi (puntuali o genomiche)
  • Possono verificarsi in cellule somatiche o germinali.
  • Mutazioni puntiformi: Una sostituzione di una singola base (transizioni o trasversioni).
  • Mutazioni per inserzione e delezione: inserimento o perdita di basi.
  • Effetti delle mutazioni: missenso (cambia l'amminoacido), non sense (introduce un codone di stop), silenti (non cambia l'amminoacido).

Citoscheletro

  • Funzione: sostegno strutturale e meccanica, movimento, trasporto.
  • Composto da tre diversi tipi di filamenti:
  • Microfilamenti
  • Filamenti intermedi
  • Microtubuli

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