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Questions and Answers
Quale affermazione riguarda l'α-elica?
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Cosa caratterizza i β-foglietti?
Cosa caratterizza i β-foglietti?
Qual è un elemento stabile della struttura terziaria di una proteina?
Qual è un elemento stabile della struttura terziaria di una proteina?
Quale di queste è una caratteristica delle proteine fibrose?
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Cosa stabilizza la struttura terziaria di una proteina oltre ai legami a idrogeno?
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In quale situazione si parla di struttura quaternaria?
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Quale affermazione è vera riguardo ai β-loop?
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Quali delle seguenti interazioni NON stabilizzano la struttura terziaria di una proteina?
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Quale delle seguenti affermazioni descrive meglio il calore specifico?
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Quale affermazione è vera riguardo le molecole idrofile?
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Cosa differenzia gli amminoacidi tra loro?
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Qual è la definizione di oligopeptide?
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Quale è il punto isoelettrico di un amminoacido?
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Come si definisce la struttura primaria di una proteina?
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Quale affermazione sulla struttura secondaria delle proteine è corretta?
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Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo ai polipeptidi?
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Qual è la funzione principale dei domini strutturali nelle proteine?
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Quale termine descrive il processo di conformazione nativa di una proteina?
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Cosa sono i chaperone molecolari?
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Qual è la formula generale dei carboidrati?
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Qual è una delle funzioni primarie dei carboidrati negli organismi viventi?
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Quale di queste modifiche non è considerata una modifica post-traduzionale delle catene laterali delle proteine?
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Quali sono i monosaccaridi più comuni in termini di atomi di carbonio?
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Qual è una delle riserve energetiche dei carboidrati?
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Quale di queste affermazioni è corretta riguardo alla nomenclatura degli zuccheri?
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Quale delle seguenti affermazioni descrive correttamente un disaccaride?
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Cosa determina la configurazione D/L in un monosaccaride?
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Quale affermazione sui polisaccaridi è vera?
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Qual è la principale funzione del glicogeno negli organismi animali?
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Quale delle seguenti affermazioni è corretta riguardo all'amilosio e all'amilopectina?
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Cosa si intende per epimeri?
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Qual è la funzione principale delle glicoproteine?
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Qual è la principale differenza tra cellulosa e amilosio?
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Quale struttura è principalmente composta da peptidoglicano nei batteri Gram-positivi?
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Quali sono i componenti principali delle lunghe catene di glicosamminoglicani?
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Perché l'acido ialuronico è considerato fortemente idrofilo?
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Quale molecola è formata da un asse proteico legato a lunghe catene di glicosamminoglicani?
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Quale caratteristica non è associata ai glicosamminoglicani?
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Quale dei seguenti glicosamminoglicani è corretto?
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Qual è la funzione principale dei glicoconiugati?
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Study Notes
Calore Specifico
- Il calore specifico è la quantità di calore necessaria per aumentare la temperatura di 1 grammo di una sostanza di 1 grado Celsius.
- L'acqua ha un calore specifico elevato.
Proprietà dell'Acqua
- L'acqua è un solvente eccellente.
- Le molecole che si sciolgono in acqua sono dette idrofile.
- Le molecole che non si sciolgono in acqua sono dette idrofobe.
Monomeri e Polimeri
- I monomeri sono le unità base che formano i polimeri.
- Un omo-polimero è formato da un solo tipo di monomero.
- Un etero-polimero è formato da due o più tipi di monomeri.
Amminoacidi
- Gli amminoacidi sono i monomeri delle proteine.
- Hanno un gruppo carbossilico e un gruppo amminico legati allo stesso atomo di carbonio (Cα).
- Differiscono l'uno dall'altro per la catena laterale R.
- Il carbonio α è un centro chirale, con due enantiomeri (D/L).
- Tutti gli amminoacidi sono stereoisomeri D.
- Ogni amminoacido ha un punto isoelettrico (pI), che è il valore di pH al quale l'amminoacido esiste in forma zwitterionica con carica netta uguale a zero.
Struttura Primaria delle Proteine
- La struttura primaria di una proteina è definita dalla sequenza degli amminoacidi e dai legami covalenti che li tengono uniti.
- I legami peptidici, formati dalla reazione tra il gruppo N-terminale e il gruppo C-terminale di due amminoacidi adiacenti, costituiscono la struttura primaria.
Oligopeptidi, Polipeptidi e Proteine
- Gli oligopeptidi sono catene formate da pochi residui amminoacidici (10-20).
- I polipeptidi sono formati da 20-100 residui amminoacidici.
- Le proteine sono catene con più di 100 residui amminoacidici.
Struttura Secondaria delle Proteine
- La struttura secondaria è un ripiegamento localizzato del backbone della proteina.
- I due principali tipi di struttura secondaria sono l'α-elica e il β-foglietto.
α-elica
- L'α-elica è un'elica destrogira con le catene laterali rivolte verso l'esterno.
- Stabilizzata dai legami a idrogeno.
- La glicina e la prolina destabilizzano la struttura.
- Può essere anfipatica.
β-foglietto
- Il β-foglietto è formato da una disposizione a zig zag.
- Stabilizzata dai legami a idrogeno.
- Può essere parallela o antiparallela.
- La glicina e la prolina destabilizzano la struttura.
Β Loop
- I ripiegamenti β collegano le estremità adiacenti di due catene β antiparallele.
- Inversione della direzione delle catene.
- Hanno quattro amminoacidi a 180°.
- Stabilizzati dai legami a idrogeno.
- Ricca di glicina e prolina.
Strutture Supersecondarie
- Sono organizzazioni spaziali formate da elementi di struttura secondaria e dalle connessioni che li uniscono.
- Esempi: motivo elica-turn-elica, motivo zinc finger, motivo Tim Barrel.
Struttura Terziaria delle Proteine
- La struttura terziaria è la forma compatta tridimensionale assunta dalla catena polipeptidica.
- Stabilizzata da: interazioni di Van der Waals, ponti salini, legami a idrogeno, interazioni idrofobiche e ponti disolfuro.
Struttura Quaternaria delle Proteine
- La struttura quaternaria è formata dall'assemblaggio di più catene polipeptidiche per formare una struttura tridimensionale più grande.
- Le proteine fibrose hanno una struttura secondaria prevalente, con lunghe catene polipeptidiche disposte in fasci o foglietti, con funzione di supporto e protezione.
- Le proteine globulari hanno strutture terziarie e quaternarie, con forme compatte e sferiche, e svolgono funzioni di trasporto e catalisi.
Dominio, Subunità e Motivo
- Un dominio strutturale è una struttura tridimensionale stabile e indipendente dal resto della molecola.
- Le subunità sono singole catene polipeptidiche che compongono una struttura quaternaria.
- I motivi sono organizzazioni spaziali di elementi di struttura secondaria e dalle connessioni che li uniscono.
Folding delle Proteine
- La struttura nativa è la conformazione che consente a una proteina di svolgere correttamente la sua funzione.
- Il folding è il processo di ripiegamento della proteina per raggiungere la sua struttura nativa.
- I chaperone molecolari sono complessi proteici che assistono il folding delle proteine.
Modifiche Post-traduzionali
- Le catene laterali delle proteine possono subire modifiche post-traduzionali, come fosforilazione, metilazione, acetilazione, glicosilazione e modifiche dello scheletro peptidico.
Carboidrati
- Sono composti da carbonio, idrogeno e ossigeno (CH2O)n.
- Molto abbondanti in natura, svolgono ruoli strutturali, sono fonti di nutrimento e energia, e partecipano al riconoscimento cellulare.
Monosaccaridi
- I monosaccaridi più comuni hanno da 3 a 9 atomi di carbonio.
- Il numero di atomi di carbonio determina la nomenclatura: triosi, tetrosi, pentosi, esosi.
- Gli aldosi hanno un gruppo aldeidico, mentre i chetosi hanno un gruppo chetonico.
- L'isomeria D/L è definita dal gruppo OH del centro chirale più lontano dal gruppo carbonilico C=O.
- Gli epimeri sono zuccheri che differiscono solo per la configurazione di uno dei centri chirali.
Disaccaridi
- Si formano dall'unione di due monosaccaridi tramite un legame glicosidico.
- Il legame glicosidico può essere α1,4 o β1,4.
- Può anche essere un legame 1,6-glicosidico.
Polisaccaridi
- Possono essere omo- o etero-polisaccaridi a seconda del tipo di unità saccaridiche presenti.
- Svolgono funzioni di deposito dei monosaccaridi, struttura, adesione e riconoscimento.
Deposito dei Monosaccaridi
- L'amilosio è un polimero lineare senza ramificazioni con legami α 1,4 glicosidici.
- L'amilopectina ha ramificazioni formate da legami α 1,6 glicosidici.
- Amilosio e amilopectina compongono l'amido, una riserva di carboidrati nelle piante.
- Il glicogeno è la principale forma di accumulo di glucosio nelle cellule animali.
- Il glicogeno è altamente ramificato e contiene grandi molecole (fino a 100.000 unità di glucosio).
- La nostra riserva di glucosio è il glicogeno (circa 350 g), presente nel fegato e nei muscoli.
Struttura
- La cellulosa è simile all'amilosio, ma i legami glicosidici sono tutti β.
- La cellulosa forma fibre resistenti e compone il legno, la carta, le foglie ecc.
- Il peptidoglicano è un componente essenziale della parete cellulare dei batteri.
- È formato da catene di zuccheri alternati N-acetilglucosamina (NAG) e acido N-acetilmuramico (NAM) con legami β1,4 glicosidici.
- La parete cellulare dei batteri Gram-positivi è principalmente composta da peptidoglicano.
- Nei batteri Gram-negativi il peptidoglicano è presente in uno strato più sottile.
- I glicosamminoglicani (GAG) sono etero-polisaccaridi, componenti della matrice extracellulare dei tessuti animali.
- Formati da lunghe catene lineari di disaccaridi ripetuti, con N-acetilglucosammina come zucchero comune.
- Sono ricchi di gruppi solfato e carbossilici, conferendo una carica negativa.
Adesione e Riconoscimento
- I glicoconiugati sono molecole formate da una catena polisaccaridica legata covalentemente a una proteina o un lipide.
- Hanno ruoli biologici cruciali come trasporto, trasferimento dell’informazione, riconoscimento e adesione.
- I proteoglicani sono macromolecole composte da un asse proteico (core) a cui sono uniti covalentemente lunghi GAG.
- Sono abbondanti e svolgono ruoli nell'adesione cellulare e nell’organizzazione della matrice.
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Questo quiz esplora concetti fondamentali della chimica, come il calore specifico, le proprietà dell'acqua, e il ruolo degli amminoacidi come monomeri delle proteine. Metti alla prova la tua comprensione di questi argomenti e scopri di più sulle interazioni chimiche essenziali.