Biyoloji İkinci Yapı Quiz

İkinci (Sekonder) Yapı

• Alfa Heliks yapı, polipeptit zincirleri için en yaygın ve kararlı konformasyondur.
• Alfa heliks, spiral bir yapı oluşturur.
• Peptid bağları omurgayı oluştururken, yan zincirler dışa doğru uzanır.
• Ana zincirin NH ve C=O grupları arasındaki hidrojen bağları, alfa heliks yapısını stabilize eder.
• Her dönüş 3-6 amino asit kalıntısından oluşur ve her amino asit kalıntısı arasındaki mesafe 1.5 Å'dır.
• Alfa heliks genellikle sağ el kuralını kullanır, ancak solak alfa heliks nadirdir.
• Proteinlerde bulunan amino asitlerin L-amino asit olması, solaklığı dışlar.
• Prolin ve hidroksiprolin, alfa sarmalının oluşumuna engel olur.

İkinci (Sekonder) Yapı

• Beta kıvrımlı tabakada, polipeptit zincirleri neredeyse tamamen uzatılmıştır.
• Dansil-AA sayısı, peptit zincir sayısını gösterir.
• Polipeptit zincirindeki amino asit bileşimini belirlemek için tamamen hidroliz edilebilir ve kromatografik olarak ayrılabilir.
• Polipeptit zincirinin N-terminal ve C-terminal amino asitleri belirlenebilir.
• Spesifik enzimlerle polipeptit zincirinin sahaya özgü hidrolizi, peptit karışımı oluşturur.
• Antijen preparasyonu zor ve tehlikeli olduğu için, proteinin antijenik bölümü sentezlenir.

Proteinlerin Fiziksel Özellikleri

• Protein çözeltileri koloidal özellik gösterir, ozmotik basınç oluşturur ve ışığı dağıtır.
• Proteinlerin moleküler ağırlıkları değişkendir: İnsülin (5.700), Hemoglobin (68.000), Albümin (69.000), İmmünoglobulinler (1.50.000).

Proteinler

• Proteinler farklı şekillerde olabilir.
• Alkaloidal reaktiflerle çöktürme: Tungstik asit, fosfotungstik asit, trikloro asetik asit, pikrik asit, sülfosalisilik asit ve tannik asit gibi asitler, proteinlerin net pozitif yük taşıdığı ortamdaki pH'ı düşürür.
• Bu protein katyonları negatif yüklü iyonlarla protein-tungstat, protein-pikrat vb. bileşikler oluşturur, ancak suda çözünür.
• Hemoglobin, miyoglobin ve serum globülinleri bu gruba örnektir.

Fibröz ve Globüler Proteinler

• Fibröz proteinler:

  • Uzun ve dar bir şekle sahiptirler.
  • Yapısal işlevleri vardır.
  • Tekrarlayan amino asit dizilerine sahiptirler.
  • Örnekler: Kollajen, elastin, miyosin, fibrin, aktin, keratin.
  • Genellikle suda çözünmez.

• Globüler proteinler:

  • Yuvarlak veya küresel bir şekle sahiptirler.
  • İşlevsel roller üstlenirler.
  • Düzensiz amino asit dizilerine sahiptirler.
  • Örnekler: Enzimler, hemoglobin, insülin, immunglobulinler.
  • Genellikle suda çözünür.

Proteinlerin Sınıflandırılması

• Basit Proteinler:

  • Albumin, Globulin, Histon gibi homoproteinlerdir.

• Bileşik Proteinler:

  • Fosfo, Gliko, Nükleo, Lipo, Metallo, Flavoproteinler gibi proteinlerdir.

Basit Proteinler

• Homoproteinler olarak da bilinirler.

Bu quiz, amino asitlerin sekonder yapılarının detaylarını keşfetmenizi sağlar. Alfa heliks ve beta kıvrımlı tabakalara dair bilgilerinizi test edin. Yapıların stabilizasyonu ve amino asit bileşimi gibi konular üzerinde durulacaktır.