Biyoloji İkinci Yapı Quiz

İkinci (Sekonder) Yapı

• Alfa Heliks yapı, polipeptit zincirleri için en yaygın ve kararlı konformasyondur.
• Alfa heliks, spiral bir yapı oluşturur.
• Peptid bağları omurgayı oluştururken, yan zincirler dışa doğru uzanır.
• Ana zincirin NH ve C=O grupları arasındaki hidrojen bağları, alfa heliks yapısını stabilize eder.
• Her dönüş 3-6 amino asit kalıntısından oluşur ve her amino asit kalıntısı arasındaki mesafe 1.5 Å'dır.
• Alfa heliks genellikle sağ el kuralını kullanır, ancak solak alfa heliks nadirdir.
• Proteinlerde bulunan amino asitlerin L-amino asit olması, solaklığı dışlar.
• Prolin ve hidroksiprolin, alfa sarmalının oluşumuna engel olur.

İkinci (Sekonder) Yapı

• Beta kıvrımlı tabakada, polipeptit zincirleri neredeyse tamamen uzatılmıştır.
• Dansil-AA sayısı, peptit zincir sayısını gösterir.
• Polipeptit zincirindeki amino asit bileşimini belirlemek için tamamen hidroliz edilebilir ve kromatografik olarak ayrılabilir.
• Polipeptit zincirinin N-terminal ve C-terminal amino asitleri belirlenebilir.
• Spesifik enzimlerle polipeptit zincirinin sahaya özgü hidrolizi, peptit karışımı oluşturur.
• Antijen preparasyonu zor ve tehlikeli olduğu için, proteinin antijenik bölümü sentezlenir.

Proteinlerin Fiziksel Özellikleri

• Protein çözeltileri koloidal özellik gösterir, ozmotik basınç oluşturur ve ışığı dağıtır.
• Proteinlerin moleküler ağırlıkları değişkendir: İnsülin (5.700), Hemoglobin (68.000), Albümin (69.000), İmmünoglobulinler (1.50.000).

Proteinler

• Proteinler farklı şekillerde olabilir.
• Alkaloidal reaktiflerle çöktürme: Tungstik asit, fosfotungstik asit, trikloro asetik asit, pikrik asit, sülfosalisilik asit ve tannik asit gibi asitler, proteinlerin net pozitif yük taşıdığı ortamdaki pH'ı düşürür.
• Bu protein katyonları negatif yüklü iyonlarla protein-tungstat, protein-pikrat vb. bileşikler oluşturur, ancak suda çözünür.
• Hemoglobin, miyoglobin ve serum globülinleri bu gruba örnektir.

Fibröz ve Globüler Proteinler

• Fibröz proteinler:

  • Uzun ve dar bir şekle sahiptirler.
  • Yapısal işlevleri vardır.
  • Tekrarlayan amino asit dizilerine sahiptirler.
  • Örnekler: Kollajen, elastin, miyosin, fibrin, aktin, keratin.
  • Genellikle suda çözünmez.

• Globüler proteinler:

  • Yuvarlak veya küresel bir şekle sahiptirler.
  • İşlevsel roller üstlenirler.
  • Düzensiz amino asit dizilerine sahiptirler.
  • Örnekler: Enzimler, hemoglobin, insülin, immunglobulinler.
  • Genellikle suda çözünür.

Proteinlerin Sınıflandırılması

• Basit Proteinler:

  • Albumin, Globulin, Histon gibi homoproteinlerdir.

• Bileşik Proteinler:

  • Fosfo, Gliko, Nükleo, Lipo, Metallo, Flavoproteinler gibi proteinlerdir.

Basit Proteinler

• Homoproteinler olarak da bilinirler.