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Questions and Answers
Qual è la funzione principale degli enhancer e dei silencers nel contesto della trascrizione genica?
Qual è la funzione principale degli enhancer e dei silencers nel contesto della trascrizione genica?
- Inibire la degradazione del mRNA
- Attivare o disattivare la polimerasi (correct)
- Modificare la struttura della cromatina
- Controllare il processo di replicazione del DNA
Che cosa caratterizza la TATA box nella trascrizione eucariote?
Che cosa caratterizza la TATA box nella trascrizione eucariote?
- È una sequenza ricca di citosina e guanina
- È composta principalmente da adenina e timina (correct)
- Encapsula la polimerasi II
- È situata a -35 basi dal sito di inizio della trascrizione
In che modo il DNA looping contribuisce alla trascrizione nei eucarioti?
In che modo il DNA looping contribuisce alla trascrizione nei eucarioti?
- Modifica la sequenza del DNA
- Permette il legame diretto tra polimerasi e mRNA
- Facilita il contatto tra elementi distali e il promoter (correct)
- Inibisce l'azione dei repressori
Qual è il ruolo principale della TATA-binding protein (TBP) nel processo di trascrizione?
Qual è il ruolo principale della TATA-binding protein (TBP) nel processo di trascrizione?
Quale fattore della trascrizione è responsabile della stabilizzazione del legame di TFII D al DNA?
Quale fattore della trascrizione è responsabile della stabilizzazione del legame di TFII D al DNA?
Qual è il ruolo del mediatore durante l'inizio della trascrizione?
Qual è il ruolo del mediatore durante l'inizio della trascrizione?
Qual è il ruolo di TFII H nel complesso di pre-inizio della trascrizione?
Qual è il ruolo di TFII H nel complesso di pre-inizio della trascrizione?
Cosa descrive il termine 'consensus' nel contesto della trascrizione dell'RNA polimerasi II?
Cosa descrive il termine 'consensus' nel contesto della trascrizione dell'RNA polimerasi II?
Cosa rappresenta il nucleotide +1 nel processo di trascrizione?
Cosa rappresenta il nucleotide +1 nel processo di trascrizione?
Quale descrizione meglio si adatta al complesso di pre-inizio della trascrizione?
Quale descrizione meglio si adatta al complesso di pre-inizio della trascrizione?
Cosa determina la presenza di residui di prolina nella sequenza amminoacidica della coda di RNA polimerasi II?
Cosa determina la presenza di residui di prolina nella sequenza amminoacidica della coda di RNA polimerasi II?
Qual è il ruolo principale della chinasi TFIIH nell'attivazione dell'RNA polimerasi II?
Qual è il ruolo principale della chinasi TFIIH nell'attivazione dell'RNA polimerasi II?
Quali amminoacidi sono fosforilabili più facilmente da TFIIH?
Quali amminoacidi sono fosforilabili più facilmente da TFIIH?
Cosa implica il processo noto come “firing” nella trascrizione?
Cosa implica il processo noto come “firing” nella trascrizione?
Qual è l'importanza delle modificazioni post-traduzionali degli RNA appena trascritti?
Qual è l'importanza delle modificazioni post-traduzionali degli RNA appena trascritti?
Qual è la conseguenza di una struttura peptidica con angoli netti rispetto a una regolare?
Qual è la conseguenza di una struttura peptidica con angoli netti rispetto a una regolare?
In cosa consistono le modificazioni post-traduzionali degli RNA?
In cosa consistono le modificazioni post-traduzionali degli RNA?
Qual è la funzione principale del mediatore nel complesso di assemblaggio con TFIID?
Qual è la funzione principale del mediatore nel complesso di assemblaggio con TFIID?
Quale è il ruolo di TFIIH durante la trascrizione?
Quale è il ruolo di TFIIH durante la trascrizione?
Qual è la principale caratteristica della coda carbossiterminale dell'RNA polimerasi II?
Qual è la principale caratteristica della coda carbossiterminale dell'RNA polimerasi II?
Quale amminoacido nella sequenza della coda carbossiterminale è descritto come più ingombrante?
Quale amminoacido nella sequenza della coda carbossiterminale è descritto come più ingombrante?
Cosa determina la struttura a zig-zag nel filamento amminoacidico?
Cosa determina la struttura a zig-zag nel filamento amminoacidico?
Quale di queste affermazioni sul CTD della Polimerasi II è corretta?
Quale di queste affermazioni sul CTD della Polimerasi II è corretta?
Qual è la funzione della fosforilazione nel contesto della trascrizione?
Qual è la funzione della fosforilazione nel contesto della trascrizione?
Perché è significativo il consumo di ATP da parte di TFIIH?
Perché è significativo il consumo di ATP da parte di TFIIH?
Flashcards
Enhancer/Silencer
Enhancer/Silencer
Sequenze di DNA che si legano a fattori di trascrizione, attivano o inattivano la trascrizione di un gene, anche a distanza dal promotore.
DNA looping
DNA looping
Controllo a distanza di un gene, grazie alla conformazione tridimensionale della cromatina.
Promotore eucariote
Promotore eucariote
Sequenza di DNA a monte del gene che serve come sito di inizio della trascrizione.
Fattori di trascrizione
Fattori di trascrizione
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Complesso di pre-inizio
Complesso di pre-inizio
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TATA box
TATA box
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TFII D
TFII D
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Bolla di trascrizione
Bolla di trascrizione
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TFII H
TFII H
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Nucleotide +1
Nucleotide +1
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Mediatore
Mediatore
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Fosforilazione del CTD
Fosforilazione del CTD
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Cosa fa l'elicasica di TFIIH?
Cosa fa l'elicasica di TFIIH?
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Perché TFIIH consuma molta ATP?
Perché TFIIH consuma molta ATP?
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Coda carbossiterminale della RNA polimerasi II
Coda carbossiterminale della RNA polimerasi II
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Antigenicità della coda carbossiterminale
Antigenicità della coda carbossiterminale
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Importanza dei residui di prolina
Importanza dei residui di prolina
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Antigenicità e struttura
Antigenicità e struttura
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Fosforilazione della coda carbossi-terminale
Fosforilazione della coda carbossi-terminale
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Riconoscimento antigenico
Riconoscimento antigenico
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'Firing' della RNA polimerasi II
'Firing' della RNA polimerasi II
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Ruolo della coda carbossi-terminale nella trascrizione
Ruolo della coda carbossi-terminale nella trascrizione
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Modificazioni post-traduzionali degli RNA
Modificazioni post-traduzionali degli RNA
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Study Notes
Biologia Molecolare - Trascrizione Eucariotica
- La trascrizione eucariotica coinvolge silencers ed enhancer, molecole che interagiscono con la polimerasi tramite mediatori, attivando o disattivando la trascrizione.
- A monte della TATA box, c'è una sequenza di -35 basi, oltre a repressori e attivatori che regolano la replicazione.
- La polimerasi è il complesso proteico finale, responsabile dell'assemblaggio finale.
- La cromatina presenta punti remoti dal promotore, interagenti con molecole che controllano l'enzima trascrizionale.
- Questo controllo remoto avviene grazie al DNA looping, e alla conformazione tridimensionale della cromatina.
- Gli enhancer e i silencer agiscono in sinergia con i fattori di trascrizione, regolando la trascrizione in modo ubiquitario o tessuto-specifico.
- I consensus adiacenti alla polimerasi II legano i fattori generali della trascrizione.
- Il complesso di pre-inizio è essenziale per l'inizio della trascrizione, reclutando tutti i fattori generali sul promotore.
- Il mediatore trasmette segnali positivi e negativi da regioni remote al complesso enzimatico.
- L'assemblaggio proteico sul promotore è inerte, in attesa di attivazione.
Inizio della Trascrizione
- Il promotore è identificato dal riconoscimento della TATA box, legata alla subunità proteica TBP (TATA-binding protein).
- La TBP è un fattore generale di trascrizione essenziale per il funzionamento della polimerasi.
- Il legame del fattore TFII D crea l'intorno fisico ottimale per la trascrizione ed il ripiegamento a 80° della doppia elica.
- Il legame di TFII B è stabilizzato da altri fattori generali, impedendo il legame di potenziali inibitori.
- La polimerasi si lega e si posiziona in modo preciso, permettendo l'inizio della trascrizione dal +1.
- Il fattore TFII H (con attività elicasica) si lega al promotore, denaturando il DNA e creando la bolla di trascrizione.
Fosforilazione della Coda Carbossi-terminale (CTD) dell'RNA polimerasi II
- La CTD è caratteristica dell'RNA polimerasi II, ed è un substrato per la fosforilazione da parte di TFII H, un enzima chinasi.
- La fosforilazione della CTD è fondamentale per l'avvio del processo di trascrizione.
- La sequenza amminoacidica ripetuta della CTD con Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser è estremamente riconoscibile per altri fattori, determinando una struttura antigenica.
- Prolina crea ripiegamenti strutturali, conferendo all'enzima specificità nella trascrizione.
Allungamento
- Il processo di allungamento è simile alla trascrizione procariotica,con l'aggiunta di nucleotidi secondo la complementarità.
- La RNA polimerasi distingue RNA e DNA.
- I complessi di rimodellamento modificano la cromatina, regolando l'accessibilità alle sequenze di DNA e l'attività della polimerasi.
- Le modificazioni post-traduzionali degli istoni (acetilazioni, fosforilazioni, etc.) influenzano l'espressione genica, in modo non ereditabile geneticamente.
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