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Questions and Answers
Cosa caratterizza la transizione tra gli stati conformazionali T e R?
Cosa caratterizza la transizione tra gli stati conformazionali T e R?
Quale interazione stabilizza lo stato T del tetramero?
Quale interazione stabilizza lo stato T del tetramero?
Qual è la differenza strutturale principale tra lo stato R e lo stato T a livello del sito attivo?
Qual è la differenza strutturale principale tra lo stato R e lo stato T a livello del sito attivo?
In quali condizioni si attiva la fermentazione lattica nei muscoli?
In quali condizioni si attiva la fermentazione lattica nei muscoli?
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Qual è l'enzima chiave nella fermentazione lattica che catalizza la conversione del piruvato in lattato?
Qual è l'enzima chiave nella fermentazione lattica che catalizza la conversione del piruvato in lattato?
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Cosa si produce durante la fermentazione alcolica ad opera dei saccaromiceti?
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Qual è il ruolo del Saccharomyces cerevisiae nella panificazione?
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Cosa rappresenta la fermentazione alcolica per gli organismi anaerobi come i lieviti?
Cosa rappresenta la fermentazione alcolica per gli organismi anaerobi come i lieviti?
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Qual è l'enzima responsabile della decarbossilazione del piruvato?
Qual è l'enzima responsabile della decarbossilazione del piruvato?
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In che modo la glicogeno fosforilasi b è regolata nel muscolo?
In che modo la glicogeno fosforilasi b è regolata nel muscolo?
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Quale ormone attiva la demolizione del glicogeno nel fegato?
Quale ormone attiva la demolizione del glicogeno nel fegato?
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Cosa inibisce la glicogeno fosforilasi a nel fegato?
Cosa inibisce la glicogeno fosforilasi a nel fegato?
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Quale enzima è coinvolto nell'interconversione di zuccheri fosforilati a 3, 6 e 5 atomi di carbonio?
Quale enzima è coinvolto nell'interconversione di zuccheri fosforilati a 3, 6 e 5 atomi di carbonio?
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Qual è l'unico enzima regolato della via dell'esoso monofosfato?
Qual è l'unico enzima regolato della via dell'esoso monofosfato?
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Cosa stimola la glucoso 6-fosfato deidrogenasi?
Cosa stimola la glucoso 6-fosfato deidrogenasi?
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Qual è l'effetto dell'insulina sulla glicogeno fosforilasi?
Qual è l'effetto dell'insulina sulla glicogeno fosforilasi?
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Quale enzima è responsabile della conversione del glucosio-6-P in glucosio?
Quale enzima è responsabile della conversione del glucosio-6-P in glucosio?
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Qual è il 'mattoncino' di costruzione dell'acido grasso?
Qual è il 'mattoncino' di costruzione dell'acido grasso?
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Cosa stimola allostericamente l'enzima acetil-CoA carbossilasi?
Cosa stimola allostericamente l'enzima acetil-CoA carbossilasi?
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Quale coenzima è utilizzato nella reazione di allungamento degli acidi grassi?
Quale coenzima è utilizzato nella reazione di allungamento degli acidi grassi?
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Quale delle seguenti affermazioni descrive correttamente le transaminasi?
Quale delle seguenti affermazioni descrive correttamente le transaminasi?
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Quando avviene la degradazione degli amminoacidi in seguito a dieta ricca di proteine?
Quando avviene la degradazione degli amminoacidi in seguito a dieta ricca di proteine?
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Qual è la via metabolica inversa dell'ossidazione degli acidi grassi?
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Qual è uno dei metaboliti di partenza per la sintesi dei trigliceridi?
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Quale composto viene metilato per formare dTMP?
Quale composto viene metilato per formare dTMP?
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Qual è il precursore principale per la sintesi di adenilato (AMP)?
Qual è il precursore principale per la sintesi di adenilato (AMP)?
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Quale enzima è coinvolto nella conversione di GMP?
Quale enzima è coinvolto nella conversione di GMP?
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Quale sostanza viene utilizzata come donatore del gruppo metilico nella sintesi di dTMP?
Quale sostanza viene utilizzata come donatore del gruppo metilico nella sintesi di dTMP?
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Come viene ottenuto il composto 5-fosforibosil-1-ammina?
Come viene ottenuto il composto 5-fosforibosil-1-ammina?
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Qual è il prodotto finale della sintesi purinica?
Qual è il prodotto finale della sintesi purinica?
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Quale enzima trasferisce adenina, ipoxantina e guanina sul PRPP?
Quale enzima trasferisce adenina, ipoxantina e guanina sul PRPP?
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Quale processo permette il risparmio di energia nella sintesi delle basi puriniche?
Quale processo permette il risparmio di energia nella sintesi delle basi puriniche?
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Quale dei seguenti fattori stimola l'enzima piruvato deidrogenasi?
Quale dei seguenti fattori stimola l'enzima piruvato deidrogenasi?
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Quale composto è prodotto durante la reazione di conversione del piruvato in acetil-CoA?
Quale composto è prodotto durante la reazione di conversione del piruvato in acetil-CoA?
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Quale enzima è inibito allostericamente da ATP e NADH?
Quale enzima è inibito allostericamente da ATP e NADH?
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Qual è il principale scopo del sistema navetta malato-aspartato?
Qual è il principale scopo del sistema navetta malato-aspartato?
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Quale ormone stimola la fosforilazione delle lipasi?
Quale ormone stimola la fosforilazione delle lipasi?
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Quale processo è associato alla teoria chemiosmotica di Mitchell?
Quale processo è associato alla teoria chemiosmotica di Mitchell?
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Qual è l'enzima che catalizza la conversione di fruttosio 6-fosfato a fruttosio 1,6-bisfosfato?
Qual è l'enzima che catalizza la conversione di fruttosio 6-fosfato a fruttosio 1,6-bisfosfato?
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Quale proteina è coinvolta nel trasporto degli acidi grassi nei mitocondri?
Quale proteina è coinvolta nel trasporto degli acidi grassi nei mitocondri?
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Quale di questi composti è attivato dal glucagone per favorire la gluconeogenesi?
Quale di questi composti è attivato dal glucagone per favorire la gluconeogenesi?
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Qual è la funzione della glucosio-6-fosfatasi?
Qual è la funzione della glucosio-6-fosfatasi?
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Quale enzima è reciprocamente regolato dalla fruttosio 2,6-bisfosfato?
Quale enzima è reciprocamente regolato dalla fruttosio 2,6-bisfosfato?
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Qual è il ruolo della piruvato deidrogenasi nell'organismo?
Qual è il ruolo della piruvato deidrogenasi nell'organismo?
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La sintesi di acetil-CoA avviene in quale parte della cellula?
La sintesi di acetil-CoA avviene in quale parte della cellula?
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Cosa stimola la sintesi di ATP nella mitocondria?
Cosa stimola la sintesi di ATP nella mitocondria?
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Quale trasportatore è coinvolto nell'ingresso insulino-dipendente del glucosio nella cellula?
Quale trasportatore è coinvolto nell'ingresso insulino-dipendente del glucosio nella cellula?
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Perché il glucosio viene fosforilato una volta entrato nella cellula?
Perché il glucosio viene fosforilato una volta entrato nella cellula?
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Qual è la differenza principale tra esochinasi e glucochinasi?
Qual è la differenza principale tra esochinasi e glucochinasi?
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Cosa avviene durante la glicolisi?
Cosa avviene durante la glicolisi?
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Quale enzima è inibito dal glucosio 6-fosfato?
Quale enzima è inibito dal glucosio 6-fosfato?
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Quale composto è prodotto dalla reazione catalizzata dall'esochinasi?
Quale composto è prodotto dalla reazione catalizzata dall'esochinasi?
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Quale composto stimola la fosfofruttochinasi?
Quale composto stimola la fosfofruttochinasi?
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Cosa rappresenta ΔG nella reazione del glucosio?
Cosa rappresenta ΔG nella reazione del glucosio?
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Qual è il ruolo dell'ADP nella glicolisi?
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Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla glucochinasi?
Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo alla glucochinasi?
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Qual è l'importanza della via dei pentosi fosfati?
Qual è l'importanza della via dei pentosi fosfati?
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Cosa indica un valore negativo di ΔG?
Cosa indica un valore negativo di ΔG?
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Quale enzima catalizza la conversione del fruttosio 6-fosfato in fruttosio 1-6 bisfosfato?
Quale enzima catalizza la conversione del fruttosio 6-fosfato in fruttosio 1-6 bisfosfato?
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Come viene regolato l'ingresso del glucosio nelle cellule muscolari?
Come viene regolato l'ingresso del glucosio nelle cellule muscolari?
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Flashcards
Transizioni conformazionali
Transizioni conformazionali
Cambio tra stato T e stato R durante la formazione di legami cooperativi.
Stato T
Stato T
Condizione in cui i foglietti beta sono separati da molecole d'acqua.
Stato R
Stato R
Condizione in cui i foglietti beta formano un foglietto beta esteso grazie a legami idrogeno.
Glicolisi anaerobica
Glicolisi anaerobica
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Acido lattico
Acido lattico
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Fermentazione alcolica
Fermentazione alcolica
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Saccaromices cerevisiae
Saccaromices cerevisiae
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Lattico deidrogenasi
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Decarbossilazione
Decarbossilazione
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Riduzione di un'aldeide
Riduzione di un'aldeide
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Glicogeno fosforilasi
Glicogeno fosforilasi
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Regolazione ormonale nel fegato
Regolazione ormonale nel fegato
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Glucagone
Glucagone
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Insulina
Insulina
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Via dell’esoso monofosfato
Via dell’esoso monofosfato
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Glucoso 6-fosfato deidrogenasi
Glucoso 6-fosfato deidrogenasi
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Glucosio-6-fosfatasi
Glucosio-6-fosfatasi
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Acetil-CoA
Acetil-CoA
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Malonil-CoA
Malonil-CoA
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Acetil-CoA carbossilasi
Acetil-CoA carbossilasi
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Regolazione enzimatica
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Sintesi dei trigliceridi
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Transaminasi
Transaminasi
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Aspartato amminotransferasi
Aspartato amminotransferasi
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dTMP
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Sintesi purinica
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Inosinato (IMP)
Inosinato (IMP)
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Adenilato (AMP)
Adenilato (AMP)
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Guanilato (GMP)
Guanilato (GMP)
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Recupero delle basi puriniche
Recupero delle basi puriniche
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Adenina fosforibosiltransferasi
Adenina fosforibosiltransferasi
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Ipoxantina-guanina fosforibosiltransferasi
Ipoxantina-guanina fosforibosiltransferasi
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Piruvato deidrogenasi
Piruvato deidrogenasi
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Inibizione della piruvato deidrogenasi
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Ciclo di Krebs
Ciclo di Krebs
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Teoria chemiosmotica
Teoria chemiosmotica
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ATP sintasi
ATP sintasi
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Trigliceridi
Trigliceridi
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Attivazione degli acidi grassi
Attivazione degli acidi grassi
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Gluconeogenesi
Gluconeogenesi
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Regolazione della fruttoso-1,6-bisfosfatasi
Regolazione della fruttoso-1,6-bisfosfatasi
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Fosforilazione
Fosforilazione
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Ciclo dell'attivazione degli acidi grassi
Ciclo dell'attivazione degli acidi grassi
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Piruvato carbossilasi
Piruvato carbossilasi
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Inibitori del trasporto elettronico
Inibitori del trasporto elettronico
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Citrato sintasi
Citrato sintasi
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GLUT-1 e GLUT-2
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GLUT-4
GLUT-4
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Fosforilazione del glucosio
Fosforilazione del glucosio
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Esochinasi
Esochinasi
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Glucochinasi
Glucochinasi
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Reazione di glicolisi
Reazione di glicolisi
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Fosfofruttochinasi
Fosfofruttochinasi
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Regolazione glicolitica
Regolazione glicolitica
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Inibizione da G-6P
Inibizione da G-6P
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Stimolazione allosterica
Stimolazione allosterica
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Citrate inhibition
Citrate inhibition
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Prodotti finali della glicolisi
Prodotti finali della glicolisi
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ΔG nella glicolisi
ΔG nella glicolisi
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Equilibrio metabolico
Equilibrio metabolico
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Study Notes
Introduzione alle immagini
- Le immagini seguenti sono tratte da vari libri di Biochimica, specificatamente: Voet-Voet-Pratt Fondamenti di Biochimica-Zanichelli, Nelson-Cox-I principi di biochimica di Lehninger -Zanichelli, Berg-Tymoczko-Stryer-Biochimica - Zanichelli, Garret-Grisham – Principi di Biochimica- Piccin, e Ringe-Petsko- Struttura e funzione delle proteine- Zanichelli.
- Le immagini sono destinate esclusivamente agli studenti del Corso di Biochimica del Corso di Laurea in Scienze Biologiche dell'Università degli Studi di Genova.
Metabolismo
- Il metabolismo comprende due processi principali: catabolismo (degradazione) e anabolismo (biosintesi).
- Il catabolismo, attraverso la degradazione di molecole complesse, produce energia sotto forma di ATP e coenzimi ridotti.
- L'anabolismo utilizza l'energia di cui sopra per sintetizzare nuove molecole.
- I coenzimi ridotti vengono ri-ossidati per produrre ulteriormente ATP.
- Il metabolismo è funzionale al trasporto di energia, contrazione e produzione di calore.
Digestione degli alimenti
- Bocca (pH neutro): Gli amidi vengono parzialmente scomposti dall'amilasi salivare in oligosaccaridi e glucosio. Lattosio e cellulosa non subiscono degradazione. Le proteine e i grassi non subiscono alcun processo di digestione.
- Stomaco (pH acido): I polisaccaridi e i disaccaridi del glucosio, formati dalla bocca, passano nello stomaco inalterati. Le proteine non subiscono degradazione, mentre i carboidrati non subiscono alcun processo di digestione.
- Intestino tenue (pH neutro/basico): I carboidrati vengono idrolizzati in monosaccaridi dall'azione di enzimi come saccarasi e amilasi pancreatiche. Le proteine vengono idrolizzate in peptidi e amminoacidi dall'azione di enzimi come tripsina, chimotripsina e peptidasi. I grassi vengono emulsionati dalla bile e idrolizzati in acidi grassi e glicerolo dalle lipasi pancreatiche.
Coenzimi vitaminici
- Vari vitamine agiscono come coenzimi, catalizzando reazioni metaboliche.
- Le vitamine in elenco sono tiamina (B1), acido pantotenico (B5), piridossina (B6), biotina (H), acido folico (B9), acido nicotinico (B3) e riboflavina (B2).
- Alcuni coenzimi sono coinvolti in reazioni di trasporto di acili, altri in processi di transaminazione o carbossilazione.
Trasferimento di molecole nell'intestino
- Illustrazione della diffusione semplice, diffusione facilitata, trasporto attivo dei nutrienti assorbiti dall'intestino tenue, per la loro successiva incorporazione nel circolo sanguigno.
- Vengono mostrati due casi distinti: uno per il trasporto dei monosaccaridi e aminoacidi, e un altro caso per il trasporto di acidi grassi e altri lipidi solubili.
- Vengono indicati i sistemi di trasporto di alcune sostanze assorbite.
Adenosina trifosfato (ATP)
- L'ATP è la principale moneta energetica delle cellule.
- Struttura dell'ATP evidenziando i legami fosfoanidridici e la loro liberazione di energia durante l'idrolisi.
- Ragioni dell'elevata variazione di energia libera, durante l'idrolisi dell'ATP, come la repulsione elettrostatica tra i gruppi fosfato, la stabilizzazione per risonanza del fosfato inorganico e la solvatazione dei prodotti.
Energia d'attivazione
- Illustrazione di una curva di energia in funzione del percorso di reazione, che evidenzia l'energia di attivazione e lo stato di transizione.
- Valori rappresentativi dell'energia di attivazione di una reazione. Potenziale di trasferimento di un gruppo fosforilico.
Energia libera di idrolisi di alcuni composti ad alta energia
- Tabella con i valori di energia libera di idrolisi (AG°) di diversi composti ad alta energia.
- Le strutture dei composti sono indicate per la chimica dei composti stessi.
Carica energetica
- Formula per il calcolo della carica energetica.
- Grafico che mostra le percentuali di ATP, ADP e AMP in base alla carica energetica.
- Espiega il ruolo delle adenilato chinasi nel mantenere l'equilibrio tra queste molecole.
Strategie per la produzione di ATP
- Due strategie principali per la produzione di ATP: fosforilazione a livello di substrato e fosforilazione ossidativa.
- Descrizione della fosforilazione a livello di substrato usando es. 1,3 bisfosfoglicerato e fosfoenolpiruvato nella glicolisi.
- L'altro metodo descritto è la fosforilazione ossidativa, che si divide in due fasi: riduzione dei coenzimi e ri-ossidazione.
Fosforilazione ossidativa
- Descrizione del processo attraverso cui vengono utilizzati i coenzimi ridotti, (NADH e FADH2), all'interno dei mitocondri per produrre ATP.
- Descrizione delle due fasi che compongono la fosforilazione ossidativa: riduzione di coenzimi e ri-ossidazione di coenzimi.
- Processo energetico fondamentale per la maggior parte delle cellule.
Catena di trasporto degli elettroni
- Descrizione e chiarimento delle diversi componenti che compongono la catena di trasporto degli elettroni, e come avviene il trasporto di protoni tra lo spazio intermembrana e la matrice mitocondriale.
- Ruolo delle proteine di trasporto nella catena di trasporto di protoni.
- Trasferimento di elettroni in tutte le fasi, e in tutte le componenti della catena per produzioni di ATP.
ATP sintasi
- Descrizione dell'ATP sintasi (Complesso V) e le sue subunità che convertono l'energia del gradiente protonico in energia chimica dell'ATP
- I processi principali nella ATP sintasi, come il sito loose, tight, open.
- Descrizione delle diverse fasi del ciclo di sintesi di ATP.
Racker e Stoeckenius
- Esperimento di Racker e Stoeckenius che dimostrò il ruolo del gradiente protonico nella sintesi di ATP.
Sistema navetta del glicerolo fosfato
- Riassunto del processo di trasporto di elettroni dalla gliceraldeide durante la conversione in glicerolo 3-fosfato.
- Mostra gli stadi e i composti di questo processo energetico.
Sistema navetta malato-aspartato
- Descrizione dettagliata del trasporto di coenzimi ridotti tra citosol e matrice mitocondriale.
- Il ruolo di diversi enzimi come la malato deidrogenasi e l'aspartato amminotransferasi nella conversione tra ossalacetato e malato, e aspartato e glutammato all'interno della matrice mitocondriale.
Traslocazione di ATP e ADP
- Descrizione di come avviene il trasporto di ATP e ADP attraverso la membrana mitocondriale interna.
- Il ruolo dell'ATP/ADP traslocasi nella traslocazione.
Inibitori del trasporto elettronico
- Elenco degli inibitori che inibiscono il trasporto elettronico e la fosforilazione ossidativa.
Digestione e assorbimento dei trigliceridi
- Descrizione della digestione e assorbimento dei trigliceridi nell'intestino.
- Ruolo delle lipasi pancreatiche, delle micelle e dell'assorbimento dei prodotti della digestione.
Fosfolipidi e trigliceridi
- Struttura chimica dei fosfolipidi e dei trigliceridi.
- Differenze tra fosfolipidi e trigliceridi.
Acidicità biliari
- Classificazione degli acidi biliari e loro strutture.
- Il ruolo degli acidi biliari nella digestione dei lipidi.
Chilomicroni VLDL, IDL, LDL, HDL
- Tabella con valori di densità, diametro, massa e percentuale.
Degradazione degli acidi grassi
- La traslocazione dei gruppi acile da citosol a matrice mitocondriale, utilizzando la carnitina aciltransferasi I e II, e carnitina-acilcarnitina traslocasi.
Glicolisi anaerobica
- Descrizione del processo di fermentazione lattica e alcolici nei muscoli che non possono consumare abbastanza ossigeno dall'apparato cardiovascolare.
- Il ruolo delle reazioni di degradazione di composti organici in assenza di ossigeno.
Metabolismo del glicogeno
- Fosforilazione del glicogeno con l'azione di enzimi come la glicogeno fosforilasi.
- Attività catalitica di enzimi deramificanti, con un chiarimento della loro funzione e del loro ruolo nelle suddivisioni della molecola.
Sintesi del glicogeno
- Ruolo dell'UDP glucosio.
- Formazione di legami glicosidici a (1→4) e α (1→6).
- Sintesi del glicogeno con gli enzimi chiave.
Regolazione ormonale del glicogeno
- Regolazione degli enzimi chiave nel metabolismo del glicogeno da ormoni come glucagone e adrenalina.
- Descrizione delle vie intracellulari responsabili per attivare o inibire gli enzimi, inclusi il ruolo dei secondi messaggeri.
Vie metaboliche del glucosio
- Il ruolo di molecole chiave come intermedio, enzima, e coenzimi.
- Descrizione degli stadi/componenti chiave della via dell'esoso monofosfato, inclusa la parte ossidativa e quella non ossidativa.
Metabolismo degli aminoacidi
- Descrizione generale delle reazioni di transaminazione, deaminazione ossidativa, e il ciclo dell'urea.
- Ruolo degli interrmedi e dei composti organici presenti nei processi.
Ciclo dell'urea
- Le diverse fasi del ciclo dell'urea nel fegato e la loro relativa importanza nel metabolismo.
- I composti coinvolti nel ciclo, come l'ornitina, la citrullina e l'arginina.
Sintesi dei nucleotidi
- Vie di sintesi de novo e di recupero dei nucleotidi.
- Descrive i precursori, gli enzimi e le reazioni chiave per la sintesi de novo dei nucleotidi pirimidinici e purinici.
- Descrizione dettagliata dei trasportatori, dei composti coinvolti e di alcune reazioni chiave.
Metabolismo dei Corpi Chetonici
- Descrizione delle fasi e dei composti del metabolismo dei corpi chetonici.
- Dove il meccanismo coinvolge la demolizione di acidi grassi in acetil-CoA e la successiva produzione di acetoacetato, 3-idrossibutirrato e acetone.
Integrazione del metabolismo
- Un diagramma che illustra il legame tra la glicolisi, la gluconeogenesi, la decarbossilazione ossidativa del piruvato, il ciclo di Krebs, la sintesi degli acidi grassi, la demolizione degli acidi grassi.
- Descrive i punti di connessione tra questi processi.
Digestione degli alimenti
- Riassunto della digestione degli alimenti: amidi, carboidrati, lattosio, cellulosa, proteine, grassi.
- Descrive il processo, le componenti e i prodotti che si formano.
Digestione e assorbimento dei trigliceridi
- Processi enzimatici per la digestione e l'assorbimento dei trigliceridi derivanti dall'alimentazione.
Struttura dei fosfolipidi e dei Trigliceridi
- Struttura dei fosfolipidi/trigliceridi, concentrandosi sulle differenze e caratteristiche di queste molecole.
Sintesi degli acidi grassi
- Descrizione di come viene sintetizzato l'acido grasso.
- Come viene allungato, e le tappe coinvolte.
Sintesi dei trigliceridi
- I diversi processi per la sintesi, tramite l'utilizzo di composti come il diidrossiacetone fosfato, e glicerolo 3-fosfato.
- Presentazione delle vie metaboliche, con l'identificazione dei composti, degli interrmedi e degli enzimi coinvolti.
Metabolismo di acidi grassi
- La riassunzione di come avvengono i processi relativi alle proteine, per produrre energia, per immagazzinare, e per altre funzioni.
- Le tappe chiave di questo processo, gli enzimi e i cofattori coinvolti.
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Description
Questo quiz esplora i concetti chiave della biochimica legati agli stati conformazionali delle proteine e alla fermentazione. Analizzeremo le differenze tra gli stati T e R, il ruolo degli enzimi e l'importanza della fermentazione negli organismi anaerobi. Testa le tue conoscenze su argomenti come la glicogenolisi e l'attività degli enzimi durante la fermentazione.