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Questions and Answers
¿Cuál es la configuración de las hébras del ADN?
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¿Qué ocurre cuando se aplica calor al ADN de doble banda?
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¿Cuáles bases nitrogenadas se unen entre sí?
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¿Cuál es el nombre del proceso que se utiliza para amplificar los nucleótidos?
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¿Cuáles son los componentes del nucleótido?
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¿Cuántos nucleótidos diferentes hay en el ADN?
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¿Por qué es importante recordar la configuración del ADN?
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¿Qué ocurre después de separar las dos hébras del ADN?
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¿Cuál es la fórmula que describe la reacción de amplificación de ADN durante el proceso de PCR?
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¿Por qué no se puede visualizar automáticamente una sola copia de ADN?
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¿Cuál es el propósito principal de correr el ADN en una electroforesis?
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¿Cuál es el propósito de los primers en la reacción de PCR?
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¿Qué ocurre cuando se alcanzan los 95°C en un proceso de PCR?
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¿Qué sucede con la cadena de ADN original después de un ciclo de PCR?
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¿Cuántas copias de ADN se obtendrían después de 3 ciclos de PCR?
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¿Cuál es la función del bromuro de tidio en un gel de agarosa?
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¿Por qué se utiliza la PCR en lugar de otras técnicas de amplificación de ADN?
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¿Qué se forma en el paso 5 del PCR convencional?
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¿Qué representa la columna de peso molecular en un gel de agarosa?
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¿Qué sucede con la hebra de ADN cuando se aplica calor?
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¿Qué es lo que se coloca en la plataforma luminiscente para poder ver?
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¿Cuál es el resultado final de una reacción de PCR después de 50 ciclos?
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¿Cuál es el propósito de los primers en un proceso de PCR?
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¿Qué se forma cuando se alcanzan los 500 pares de bases en la columna de peso molecular?
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¿Qué sucede en el ciclo 18,5 en este experimento?
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¿Qué ocurre cuando se tiene una gran cantidad de ADN o ARN en la muestra?
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¿Por qué un valor de CT bajo significa que fue fácil amplificar?
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¿Qué sucede cuando el valor de CT es muy alto?
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¿Qué indica un valor de CT bajo en un PCR para SARS-CoV-2?
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¿Cuál es el propósito de determinar el valor de CT en un PCR?
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¿Qué sucede cuando se alcanza el valor de CT en un PCR?
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¿Por qué la cantidad de ADN o ARN en la muestra afecta el valor de CT?
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¿Cuál es el patrón de crecimiento de la cantidad de moléculas de fluoróforo en el proceso de PCR?
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¿Por qué la cantidad de fluorescencia es muy baja en los primeros ciclos del proceso de PCR?
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¿Qué ocurre en el punto morado de la gráfica de fluorescencia?
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¿Qué se utiliza para determinar el punto en el que se dispara la cantidad de fluorescencia?
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¿Qué representa la primera derivada de la curva de fluorescencia?
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¿Cuál es el resultado final del proceso de PCR?
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¿Qué se observa en la gráfica de fluorescencia después del ciclo 10?
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¿Qué representa el eje 'y' en la gráfica de fluorescencia?
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Study Notes
Secuenciación del Genoma
- El proceso de secuenciación del genoma implica la lectura del ADN todo.
- La técnicas moleculares de diagnóstico viral, como la PCR, se utiliza para amplificar segmentos específicos del ADN.
Configuración del ADN
- El ADN está formado por nucleósidos (azúcar y fosfato) y bases nitrogenadas (A, C, G, T).
- Las bases nitrogenadas se complementan: Aparea con T y G aparea con C.
- El ADN tiene dos hebras que se orientan en direcciones opuestas: 5' a 3' y 3' a 5'.
Fundamento de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
- La PCR se basa en la separación de las hebras del ADN doble mediante calor (95°C).
- Las hebras separadas se vuelven a unir con la ayuda de primers específicos y polimerasa, lo que permite amplificar un segmento específico del ADN.
- La PCR es un proceso exponencial, es decir, en cada ciclo se duplica el número de copias de ADN.
Visualización de la amplificación
- La amplificación del ADN se puede visualizar mediante electroforesis en un gel de agarosa.
- La electroforesis separa los fragmentos de ADN según su tamaño y carga.
- Al revelar el gel con bromuro de etidio, se pueden ver las bandas de ADN amplificado.
Desnaturalización
- La desnaturalización es el proceso de separación de las hebras del ADN.
- In vivo, la desnaturalización ocurre durante la replicación del ADN.
- In vitro, la desnaturalización se logra mediante calor (95°C).
Reacción de PCR
- La reacción de PCR implica la unión de los primers a las hebras de ADN separadas.
- La polimerasa se une al grupo hidroxilo (HO) y comienza a sintetizar el ADN.
- La fluorescencia aumenta exponencialmente con cada ciclo de PCR.
- La curva de fluorescencia muestra una fase exponencial, una meseta y un punto de inflexión, que se utiliza para determinar el valor de CT (ciclo threshold).
Valor de CT
- El valor de CT es el ciclo en el que se alcanza la fase exponencial de la amplificación.
- El valor de CT es más bajo cuando se tiene más cantidad de ADN o ARN en la muestra.
- El valor de CT se utiliza para determinar la presencia de virus o antígenos en una muestra.
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Description
Determinar el valor de CT en función de los ciclos y la fluorescencia. Analizar cómo la fluorescencia cambia en cada ciclo. Calcular el punto de inflexión en la gráfica.