Notes de révision des acides aminés PDF

Chapitre 5: ionisation des acides aminés 1- Propriétés des acides aminés Forme ionique des acides aminés : Les acides aminés sont des molécules amphotères, c’est à dire qu’ils peuvent agir comme des acides ou des bases les valeurs de pK déterminent à quel pH chaque acide aminé sera capable d...

Chapitre 5: ionisation des acides aminés 1- Propriétés des acides aminés Forme ionique des acides aminés : Les acides aminés sont des molécules amphotères, c’est à dire qu’ils peuvent agir comme des acides ou des bases les valeurs de pK déterminent à quel pH chaque acide aminé sera capable de libérer un proton. PK: capacité à s’ioniser NB: La chaîne R est non ionisable pour les acides aminés simples 2- Courbe de titration d’un acide aminé simple Exemple de la glycine 3-Calcul du point isoélectrique (pI) le pH d’un acide aminé où ils se trouve sous sa forme électrique neutre. Donc, si pH différent du pi, l’acide aminé est chargé soit positivement ou négativement À- calcul de pI pour un acide aminé simple ( sans chaîne R non ionisable) pI = (pK1 +pK2)/2 B- Calcul de pI pour un acide aminé complexe Les acides aminés complexes ont une chaîne R ionisable et des courbes de titration avec trois possibilités d’ionisation. Ils possèdent ainsi 3 valeurs de pK ( pK1, pK2 et pKr). Ainsi pour calculer le pI on prend les valeurs de pK entre lesquels l’acide aminé est neutre C- Les acides aminés complexes et la forme de leur groupement R Aspartate ( Asp, D) Cha-Eo-e Ch-cof Glutamate ( Glu, E) Chac-Che-le- Histidine ( His, H) C- CH - XTN  Cysteine ( Cys, C) CHy-SHCHz-S Tyrosine ( Tyr, Y) deet ecto- Lysine ( Lys, K) (CH2)y NHzt E (CHy - - WHy Arginine ( Arg, R) (CHey-NH-c + Es (H)-N D- exemple de l’ionisation de la lysine 4- chargé d’un acide aminé selon le pH À un pH supérieur au pI, les acides aminés. forment des anions (négatifs) et vont migrer vers l’électrode positive lorsque placés dans un champ électrique. (NH2 et COO-) À un pH inférieur au pI, les acides aminés existent à l’état de cations (positifs) et vont migrer vers l’électrode négative. (NH3+ et COOH) Si le pH est égal au pI, les acides aminés n’auront aucune charge (neutre) nette et ne migreront pas lorsque placés dans un champ électrique. 5-Techniques expérimentales A- étapes de résolution des questions d’une expérience donnée 1) Vous avez: - Le pH de l’expérience - Le nom des acides aminés à séparer - Les pKs associés aux acides aminés 2) Vous devez: - Calculer le pI des différents acides aminés - Comparer le pI au pH de l’expérience - Évaluer la charge des acides aminés à ce pH - Prédire la migration/séparation des acides aminés pour votre expérience B-La chromatographie Autre méthode utilisée pour la séparation des acides aminés (ou protéines) dans un mélange. Cette technique exploite essentiellement les différences de signe et d’amplitude des charges électriques des molécules à un pH donné. Chapitre 6: structure et fonction biologiques Liaisons peptidique