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Les aspects épigénétiques du vieillissement Matthew Borok Septembre 11 2023 Avant et apres Questions sur le cours de télomères et senescence Modification de diapos pour Cristolink Mini-conférences mercredi et jeudi Discussion des télomères, épigénétique et...

Les aspects épigénétiques du vieillissement Matthew Borok Septembre 11 2023 Avant et apres Questions sur le cours de télomères et senescence Modification de diapos pour Cristolink Mini-conférences mercredi et jeudi Discussion des télomères, épigénétique et senescence en anglais Traitement des données des diapos New hallmarks of aging Lopez-Ortin et al. 2023 Qu’est-ce que vous savez? Quels sont les principaux marques épigénétiques? Ces marques affectent quels processus cellulaires? Quels sont les liens entre les marques épigénétiques et le vieillissement? Pourrait-on modifier l’épigénome pour ralentir le vieillissement? Questions épigénétiques https://app.wooclap.com/KAXYZG?from=instruction-slide Questions épigénétiques https://app.wooclap.com/KAXYZG?from=instruction-slide Questions épigénétiques https://app.wooclap.com/KAXYZG?from=instruction-slide Structure du cours Méthylation de l’ADN Modification des histones Méthylation Acétylation Variants d’histones Réjuvénation par intervention épigénétique Quelques définitions Epigénétique: Modifications chimiques a l’ADN ou aux protéines du nucléosome qui sont maintenus après division cellulaire CpG: Cytosine-phospho-Guanine (CG) La méthylation de l’ADN Les cytosines peuvent être méthylées La méthylation est maintenue par DNA methyl transferase 1 (Dnmt1) pendant la réplication de l’ADN Gujar et al. 2019 Comment déterminer la méthylation d’une cytosine? Traitement a bisulfite modifie des cytosines non-méthylées en uraciles Conversion bisulfite ADN original En séquençant, ces uraciles sont lus comme thymines Séquençage ADN converti Comparaison avec la séquence de référence Sequencage de l’ADN converti identifie les cytosines méthylés (un C qui reste un C est méthylé) Eurofins La méthylation varie entre des tissus et gènes différents Y: young, jeune O: old, vieux SI: small intestine Titres des graphiques: Gènes différents Maegawa et al. 2010 Analyse bisulfite https://app.wooclap.com/KAXYZG?from=instruction-slide Les horloges épigénétiques Horvath (Horvath 2013) 7844 échantillons 51 tissus et populations cellulaires différentes 353 CpGs: 193 ou la méthylation est positivement corrélé avec l'âge, 60 ou la méthylation est négativement corrélé avec l'âge Hannum (Hannum et al. 2013) 482 échantillons Seulement le sang 71 CpGs DNAm PhenoAge (Levine et al. 2018) 9926 échantillons Données cliniques Seulement le sang 513 CpGs DNAm GrimAge (Lu et al. 2019) 6935 échantillons Seulement sang 2356 personnes Effets de mode de vie 1030 CpGs  Les horloges épigénétiques Age DNAm/ Méthyl épigénétique/ Séquence sans méthylation biologique Patient 1 40 ans* Si méthylé +10 ans -5 ans Patient 2 50 ans Patient 3 45 ans *calculé avec l’analyse de la méthylation d’autres CpG dans le génome Eurofins Accélération et décélération de l'âge Duan et al. 2022 Analyses de la méthylation de l’ADN a niveau cellule unique montrent que les cellules souches du muscle âgent lentement MuSC: cellules souches du muscle Trapp et al. 2021 Horloges épigénétiques résumé Algorithmes qui calculent l’âge DNAm/épigénétique/biologique avec l’état de méthylation de combinaisons de CpGs spécifiques qui deviennent méthylés ou pas méthylés avec l'âge Accélération d'âge: âge DNAm/épigénétique/biologique >âge chronologique, du a l’infection, fumeur, etc. Décélération d'âge: âge DNAm/épigénétique/biologique