Enzim Block 1B 2024 PDF

ENZIM Hendi Wicaksono FK UKDW 2024 Pengertian ◦ Enzyme/enzim berasal dari kata Yunani, “enzymos” ◦ Enzim adalah biokatalisator yang berperan dalam berbagai reaksi di dalam tubuh organisme ◦ Sebagian besar enzim adalah “protein” ◦ Enzim sebagai katalis dan bersifat spesifik (CIRI KHAS)...

ENZIM Hendi Wicaksono FK UKDW 2024 Pengertian ◦ Enzyme/enzim berasal dari kata Yunani, “enzymos” ◦ Enzim adalah biokatalisator yang berperan dalam berbagai reaksi di dalam tubuh organisme ◦ Sebagian besar enzim adalah “protein” ◦ Enzim sebagai katalis dan bersifat spesifik (CIRI KHAS) ◦ Enzim mampu mempercepat reaksi 107 -1013 Bagaimana cara kerja enzim? Enzim mempercepat reaksi, dengan cara menurunkan energi aktivasi pada suatu reaksi Struktur enzim ◦ Enzim sebagian besar merupakan protein ◦ Bentuk dan struktur enzim menentukan fungsi dari enzim ◦ Enzim mempunyai bentuk dan fungsi yang spesifik terhadap substrat, Beberapa enzim yang bukan protein,contohnya Ribozyme➔tersusun dari rRNA  ENZYME Holoenzyme (protein part and non protein part) Apoenzyme (protein part) Prosthetic group (non- protein) Cofactor Coenzyme - Small inorganic - Large organic molecule or atom molecule - Usually tightly bound - Loosely bound to to apoenzyme apoenzyme Karakteristik sisi aktif enzim 1. Sisi aktif enzim berbentuk struktur 3D yang dibentuk oleh berbagai macam gugus dari asam amino, dan biasanya berbentuk celah 2. Sisi aktif enzim relatif kecil dibandingkan dengan keseluruhan volume enzim 3. Ikatan substrat dan enzim bersifat lemah 4. Spesifitas enzim bergantung pada susunan atom pada sisi aktif enzim 5. Sisi aktif enzim punya 2 bagian penting, bagian yg mengenali substrat dan bagian yang mengkatalisis reaksi setelah berikatan dgn substrat Mekanisme kerja enzim ◦ Kemampuan katalis dari enzim ditentukan oleh sisi aktif dari enzim Teori Kinerja Enzim Induced-fit Model Lock and Key Model Mekanisme kerja enzim Klasifikasi enzim Secara umum enzim diklasifkasikan Berdasarkan substratnya, ditambah menjadi 2, akhiran “-ase” ◦ Endoenzim : enzim yang aktif di dalam - Laktase sel, - Maltase ◦ Eksoenzim : enzim yang aktif di luar - Protease sel - Nuklease - Lipase Klasifikasi enzim Berdasarkan IUB (International Union Biochemistry, 1964), enzim digolongkan berdasarkan reaksi yang dikatalis: Dulu pemberian nama enzim berdasarkan substratnya Klasifikasi enzim Cara penamaan enzim Menurut IUB: ◦ Contoh Menggunakan kode nomor yang 2 : Transferase sistematik 7 : Transferase fosfat ◦ Angka I: Kelas 1 : fungsi alcohol sebagai ◦ Angka 2 sub kelas penerima fosfat ◦ Angka 3: sub-sub kelas 1 : Heksokinase ◦ Angka 4: nama enzim Enzim: 2.7.1.1 (Heksokinase) https://enzyme.expasy.org/ Faktor yang mempengaruhi kerja enzim ◦ Suhu ◦ pH ◦ Konsentrasi substrat ◦ Inhibitor ◦ Kofaktor dan koenzim Pengaruh Suhu ◦ Setiap enzim memiliki suhu optimum sehingga dapat bekerja optimal. ◦ Pada suhu tinggi, laju reaksi turun - denaturasi protein enzim - mengganggu ikatan pada enzim maupun enzim-substrat ◦ Pada suhu rendah, laju reaksi berkurang Pengaruh pH ◦ Setiap enzim memiliki pH optimum. pada manusia rata-rata pH (7,35-7,4) ◦ Enzim dapat bekerja pada pH 6-8 ◦ pH yang terlalu tinggi/rendah akan menyebabkan denaturasi protein pada enzim Pengaruh Konsentrasi Substrat ◦ Penambahan subtrat pada jumlah tertentu akan meningkatkan laju reaksi ◦ Tetapi pada kondisi enzim tersaturasi (saturated), penambahan substrat tidak berpengaruh Inhibitor ◦ Menyebabkan substrat tidak dapat berikatan dengan enzim sehingga reaksi tidak dapat terjadi ◦ Dibagi menjadi 2 secara umum - Competitive - Non-competitive Competitive Inhibitor ◦ Saling berkompetisi dengan substrat untuk dapat berikatan dengan sisi aktif enzim ◦ Pada umumnya memiliki struktur yang mirip dengan substrat Non-competitive Inhibitor ◦ Pada umumnya berikatan bukan pada sisi aktif enzim, ◦ Ikatan EI (Enzim dan Inhibitor) mengubah konformasi dari sisi aktif enzim sehingga tidak dapat berikatan dengan substrat➔ allosteric effect Kofaktor dan Koenzim Koenzim Sering disebut substrat kedua Merupakan molekul organik non protein yang digunakan untuk membantu kerja dari enzim Terikat secara non kovalen (ikatan lemah dan smentara) dengan enzim Biasanya berupa bentuk aktif dari vitamin, contoh: vit B3 (Niacin)➔ NAD  Kofaktor Merupakan molekul inorganik non protein yang digunakan untuk membantu kerja dari enzim. Merupakan mineral dalam bentuk ion Metalloenzim mineral bukan sebagai kofaktor tetapi sebagai penyusun dari enzim Regulasi aktivitas enzim Regulation of enzyme Genetic regulation Already produced enzyme Feedback Covalent kompartementasi inhibition modification Feedback inhibition ◦ Enzim dalam suatu reaksi merupakan enzim kunci (“rate limiting enzyme”), biasanya bersifat allosterik ◦ Produk akhir dari reaksi akan berikatan dengan enzim kunci secara allosterik, sehingga akan menyebabkan laju reaksi berkurang bahkan berhenti Enzim dalam dunia medis Sebagai Biomarker beberapa gangguan di dalam tubuh ◦ Sebagai salah titik tangkap dalam terapi farmakologis (berperan dalam metabolisme obat) TERIMA KASIH MAtUR NuWuN Post test ◦ Menggunakan quiziz.com ◦ Tuliskan nama singkat dan NIM ◦ Link: https://quizizz.com/join?gc=41354990