"Coronavirus. SARS-CoV-2" Clase 14. PDF

Universidad de El Salvador Facultad de Química y Farmacia Departamento de Bioquímica y Contaminación Ambiental Sección de Microbiología Microbiología y Parasitología “Coronavirus. SARS-CoV-2” Egr. D. C. Guillermo Emilio Alvarenga Marroquín, M. Sc....

Universidad de El Salvador Facultad de Química y Farmacia Departamento de Bioquímica y Contaminación Ambiental Sección de Microbiología Microbiología y Parasitología “Coronavirus. SARS-CoV-2” Egr. D. C. Guillermo Emilio Alvarenga Marroquín, M. Sc. 26/agosto/2024 [email protected]  Objetivos Estudiar la clasificación del Coronavirus 2 causante de la enfermedad COVID-19. Describir las características morfológicas generales del SARS-CoV-2. Mencionar de forma general el ciclo intracelular del Coronavirus 2. Analizar la patogenia, manifestaciones clínicas, diagnostico, epidemiología, prevención y control de la COVID-19.  Introducción Se han identificado dos coronavirus zoonóticos: El síndrome respiratorio agudo grave (SARS) y el síndrome respiratorio del Oriente Medio (MERS). SARS y MERS surgieron en 2003 y 2012, respectivamente; SARS en China y MERS en el Oriente Medio. Los agentes etiológicos son Coronavirus altamente patógenos para los humanos y sus reservorios animales originales son los murciélagos. En el caso de SARS el reservorio intermedio fue el gato civet y en el caso de MERS son los camellos dromedarios. Durante 2016 y 2017, otro Coronavirus derivado de murciélagos causó un brote grave en animales en China, conocido como el síndrome de diarrea aguda porcina (SADS). En este brote, el coronavirus fue transmitido directamente de los murciélagos a los cerdos, a través de sus heces. La COVID-19 inició, presuntamente, en un mercado de animales vivos en la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, China, en diciembre de 2019. Su agente etiológico es el Coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave. Estudios filogenéticos orientan a, pero no confirman, que el virus pudo haberse originado en murciélagos. Árbol filogenético de Coronavirus.  Definiciones Mutación: Se refiere a un cambio único en el genoma del virus (código genético). Las mutaciones ocurren con gran frecuencia, pero solo a veces cambian las características del virus. Linaje: Es un grupo de virus estrechamente relacionados con un ancestro en común. El SARS-CoV-2 tiene muchos linajes; todos causan la COVID-19. Variante: Es un genoma viral (código genético) que puede incluir una o más mutaciones. En algunos casos, un grupo de variantes con cambios genéticos similares, como un linaje o grupo de linajes, puede ser designado por las organizaciones de salud pública como una variante de preocupación o una variante de interés debido a los atributos y características compartidas que pueden requerir medidas de salud pública.  Clasificación Orden: Nidovirales, Familia: Coronaviridae, Género: Coronavirus, Variantes: Variante bajo monitoreo (VBM). Variante de interés (VOI o VI). Variante de preocupación (VOC o VP). Variante con grandes consecuencias (VOHC o VCGC). Su genoma viral es un ARN monocatenario, incorporado en la cápside, de polaridad positiva (ss(+) arn) de 27 a 32 kb y se considera el genoma más grande entre los virus de Ácido ribonucleico.  Variante bajo monitoreo (VBM) Incluyen variantes sobre las que existen datos que indican un posible o claro impacto sobre las contramedidas médicas aprobadas o autorizadas, que han sido asociadas a enfermedades más graves o de mayor transmisión; pero que ya no se detectan o están circulando a niveles muy bajos y no representan un riesgo significativo e inminente para la salud pública. Variantes: Nomenclatura de OMS/Linaje Pango Alpha (linajes B.1.1.7 y Q) Beta (linajes B.1.35 y Iota (B.1.53) descendientes) Kappa (B.1.617.1) Gamma (linajes P.1 y N/A (B.1.617.3) descendientes) Mu (B.1.621, B.1.621.1) Epsilon (B.1.43 y B.1.43) Zeta (P.2) Eta (B.1.52)  Variante de interés (VOI o VI) Una variante de interés podría requerir una o más medidas de salud pública adecuadas, incluida una mejor vigilancia secuencial, una mejor caracterización de laboratorio o investigaciones epidemiológicas para evaluar con qué facilidad se propaga el virus a otras personas, la gravedad de la enfermedad, la eficacia de los tratamientos y si las vacunas aprobadas o autorizadas actualmente ofrecen protección. Variantes: Nomenclatura de OMS/Linaje Pango Actualmente, no hay variantes de interés del SARS-CoV-2.  Variante de preocupación (VOC o VP) Variante para la cual existe evidencia de una mayor transmisibilidad, casos más graves de enfermedad (por ejemplo, mayor cantidad de hospitalizaciones o muertes), reducción significativa en la neutralización por los anticuerpos generados durante una infección anterior o la vacunación, menor efectividad de los tratamientos o las vacunas, o fallas de detección de diagnóstico. Variantes: Nomenclatura de OMS/Linaje Pango Delta (Linajes B.1.617.2 y AY). Ómicron (Linajes B.1.1.529, BA.1, BA.1.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5).  Variante con grandes consecuencias (VOHC o VCGC) La variante de gran consecuencia muestra una clara evidencia de que las medidas de prevención o las medidas médicas paliativas han reducido significativamente la efectividad con respecto a las variantes que circularon previamente. Una variante de gran consecuencia requeriría notificar a la OMS de conformidad con el Reglamento Sanitario Internacional, anunciar estrategias para prevenir o contener la transmisión, y brindar recomendaciones para actualizar los tratamientos y las vacunas. Variantes: Nomenclatura de OMS/Linaje Pango En la actualizad no hay variantes del SARS-CoV-2 que alcancen el nivel de gran consecuencia. Morfología  Virión esférico entre 120-160 nm de diámetro, con nucleocápside helicoidal, con envoltura que contiene grandes espigas ampliamente espaciadas. Proteina de Espicula, Espiga o Spike (S) Envoltura (E) Proteasa Membrana (M) Polimerasa (Pol) Nucleocápside (N) Estructura antigénica  Ciclo viral intracelular A. Las proteínas espiga S se unen a los receptores enzima convertidora de angiotensina 2 (ECA-2) en la superficie de la célula diana. B. La proteasa de serina transmembrana de tipo II (TMPRSS2) se une y escinde el receptor ECA-2. En el proceso, la proteína espiga S se activa. CITOPLASMA CÉLULAR  Patogenia El virus se une a toda célula corporal que expresa ECA2 y TMPRSS2 en su superficie, causando una respuesta inflamatoria sistémica. Esta se inicia con una tormenta de citocinas pro inflamatorias (IFN-a, IFN-g, IL-1b, IL-6, IL-12, IL-18, IL-33, TNF-a, TGFb, otras) y quimiocinas (CCL2, CCL3, CCL5, CXCL8, CXCL9, CXCL10). El daño alveolar difuso es la lesión patológica pulmonar clásica del síndrome de dificultad respiratoria aguda (SDRA): Desarrollo de congestión capilar, atelectasias, edema y micro hemorragia alveolar; seguidos días después, por formación de membrana hialina, hiperplasia de células epiteliales y edema intersticial. El engrosamiento de la pared alveolar no permite el intercambio gaseoso O2-CO2 entre la luz del alveolo y la luz capilar.  Manifestaciones clínicas Todas las variantes del COVID-19 causan los mismos síntomas. Puede enfermarse más gravemente e incluso morir a causa de algunas variantes, como la alfa y la delta. Síntomas: Fiebre o escalofríos. Tos seca. Dificultad para respirar (sentir que le falta el aire). Fatiga. Dolores musculares y corporales. Dolor de cabeza. Pérdida reciente del olfato o el gusto. Dolor de garganta. Congestión o moqueo. Náuseas o vómitos. Diarrea.  Diagnostico PRUEBAS ESPECÍFICAS: ✓ Ensayos de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa en tiempo real. ✓ Pruebas imunocromatograficas,  Epidemiología DISTRUIBUCIÓN MUNDIAL (Pandémico). 2021 2022  Prevención y control PREVENCIÓN: Mantenerse aislado (cuarentena domiciliar). Usar mascarilla es sumamente importante si usted o un miembro de su hogar: Tienen el sistema inmunitario debilitado, tienen una afección subyacente, son adultos mayores o no están totalmente vacunados. Vacunación. CONTROL: Medidas de contención epidemiológica. Trabajo mundial conjunto. Educación de la población en materia de bioseguridad. Referencias CDC (Centro para el Control y la Prevención de Enfermedades, Estados Unidos). https://espanol.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html. Revisado el 25 de agosto de 2023. Jawetz et all. 2016. Microbiología medica. McGraw-Hill Education. 27ª edición. USA. 867 p. MINSAL (Ministerio de Salud de El Salvador). Boletín epidemiológico semana 31 2022. Boletines Epidemiológicos 2022 - Ministerio de Salud. Revisado el 25 de agosto de 2022. Oliva Marín JE. SARS-CoV-2 origen, estructura, replicación y patogénesis. Alerta. 2020;3(2):79-86. DOI: https://doi.org/10.5377/alerta.v3i2.9619. Vásquez Rodríguez EP, Guadrón Meléndez AA, Cruz Aguilar RJ, Cuadra Zelaya TE. Factores relevantes sobre el ensayo RT-PCR para la detección de SARS-CoV-2, virus causante del COVID-19. Alerta 2021;4(1):31-39. DOI 10.5377/alerta.v4i1.10060. Vincent C. C. Cheng, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo, and Kwok Yung Yuen. 2007. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus as an Agent of Emerging and Reemerging Infection. CLINICAL MICROBIOLOGY REVIEWS. State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, Department of Microbiology, Research Centre of Infection and Immunology, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region, China. p. 660–694. doi:10.1128/CMR.00023-07 Sistema Bibliotecario [Internet]. Sistema Bibliotecario. 2024 [citado 21 de agosto de 2024]. Disponible en: https://biblioteca.ues.edu.sv/.  Universidad de El Salvador Facultad de Química y Farmacia Departamento de Bioquímica y Contaminación Ambiental Sección de Microbiología Microbiología y Parasitología “Coronavirus. SARS-CoV-2” Egr. D. C. Guillermo Emilio Alvarenga Marroquín, M. Sc. 26/agosto/2024 [email protected]