amélioration-animale.docx

Définitions =========== - Domestication : - Transformation d\'une espèce sauvage en espèce soumise à une exploitation par l\'homme, en vue de lui fournir des produits ou des services. [pas de sélection génétique] - Le fait d'être domestiqué - Durant le pro...

Définitions =========== - Domestication : - Transformation d\'une espèce sauvage en espèce soumise à une exploitation par l\'homme, en vue de lui fournir des produits ou des services. [pas de sélection génétique] - Le fait d'être domestiqué - Durant le processus, il est possible de faire demi-tour mais il reste une modification du lien entre l'animal et l'homme. - Processus de domestication produit un animal domestique. - Dans l'espace et dans le temps - Domestique : - Sont considérés comme animaux domestiques les animaux appartenant à des populations animales sélectionnées ou dont les 2 parents appartiennent à des populations animales sélectionnées. - On appelle population animale sélectionnée une population d'animaux qui se différencie des populations sauvages génétiquement les plus proches par un ensemble de caractéristiques identifiables et héréditaires qui sont la conséquence d'une politique de gestion spécifique et raisonnée des accouplements. 2. Processus de la domestication =============================  - Le partenariat entre le chien et l'homme : - Chasse - Premier animal domestique, donnant-donnant - Le commensalisme des souris et du chat : - Le chat est devenu partenaire de l'homme par commensalisme - Le chat est venu par intérêt les souris se situent où il y a des hommes nourriture - Les herbivores proies de chasse : - Proie de l'homme ensuite régulation de la chasse, pour finir par être élevé/captif 3. Conséquences de la domestication ================================ - Conséquences anatomiques : - Diminution de la taille initiale - Raccourcissement de la face (et de la mandibule) - Diminution de la capacité crânienne - Modification de la couleur du pelage - Oreille pendantes - Aboiement - Physiologie digestive - Comportement - domestication = 1ière phase - sélection = 2e phase - Conséquences physiologiques : - Diminution du dimorphisme sexuel ---\> modifications hormonales, cycles de reproduction plus réguliers - Diminution de la taille - Diminution des cornes - Modification du pelage - couleur et composition (jarre ---\> laine) - Raccourcissement de la longueur de la face par rapport au crâne - Diminution du volume crânien lié à une diminution du cortex cérébral - Pas moins intelligents mais connections différentes - Perte de capacités sensorielles et motrices - Gain en communication - « Voix » , traits de comportement - Laxité du cartilage des oreilles et de la queue (oreilles pendantes) - Augmentation de la capacité du chien à digérer l'amidon (chien mange les restes) - Augmentation de la fréquence des cycles reproducteurs - Diminution du dimorphisme sexuel par modifications hormonales 4. Syndrome de domestication ========================= - Nouvelles hypothèses et nouvelles découvertes : - Expérience de Dimitri Beliaïv : - Biologiste soviétique ---\> Sélection des lignées dociles - Anomalie de la crête neurale en 2014  - Le gène SorCS1 en 2018 - Comparaison des génomes  Vers l'amélioration animale =========================== - Utilisation de l'animal : - Travail - Divertissement - Production 2. Conséquences phénotypiques et génotypiques - Modifications du phénotype - Animaux plus gros et musclés, pelage ou toison plus dense et de qualité augmenté  - Modifications de caractéristiques physiologiques - Production laitière, composition du lait, taille des portées - Nombre restreint de races de production - Diminution de la variabilité génétique - Tous les gènes - Sélection variabilité diminue - - Variabilité pour les domestiques - Inter-race élevé - Intra-race faible - Aucune espèce sauvage n'a une aussi grande variabilité que les espèces domestiques de compagnie - Pq ? Le temps accumulé, expansion géographique grâce à l'homme, mutations protégées et favorisées par l'homme, diversité des modes d'utilisation des animaux 3. Diversité génétique -- ------------------------------------------------------------------------------------------------- -- Correspondent à des gènes à effets visibles, qui ne peuvent adopter que des états biens définis Couleur du pelage, des yeux -- ------------------------------------------------------------------------------------------------- --  - En résumé : - Développements des sociétaux, politiques et économiques - Développements des méthodologies et outils génétiques - Modèles statistiques - Biotechnologies ---\> patrimoine génétique - Centralisations d'informations, outils de gestion - Dissémination du produit de sélection (IA, transfert embryons, \...) - Envie de progrès, ouverture d'esprit de la part des éleveurs - Ouverture internationale - Banques de données (ex : interbull) 1. Définition ========== - QTL (quantitative trait loci) - Région +/- grande d'ADN qui est étroitement associée à un caractère quantitatif, càd une région chromosomique où est localisée un ou plusieurs gènes à l'origine du caractère en question. - RFLP = restriction fragment length polymorphism - RAPD = random amplified polymorphic DNA - AFLP = amplification fragment length polymorphism - Micro-satellites - Locus - Emplacement physique très précis sur un chromosome qui peut contenir ou non un gène. - Chromosomes - Support de l'information génétique. - Hétérozygotes - Cellule ou individu qui possède 2 gènes différents (récessifs et dominant) sur chaque chromosome de la même paire. - Homozygotes - Cellule ou individu qui possède 2 gènes identiques sur chaque chromosome de la même paire. - Allèles - Chacune des versions possibles d'un même gène - Gènes - Unité définie localisée sur un chromosome, grâce à laquelle se transmet un caractère héréditaire. - Récéssif - Se dit d'un gène qui produit son effet seulement lorsqu'il existe sur les 2 chromosomes de la paire. - Dominant - Lorsque la caractéristique que l'allègre dominant code (physique ou maladie) va s'exprimer, même s'il n'est présent que sur un seul allèle du gène. Caractères quantitatifs ou qualitatifs ? ======================================== +-----------------------------------+-----------------------------------+ |. Non mesurables | - Loi normale | | | | |. Variation discontinue | | | | | | - Catégories/classes | - Déterminisme complexe | | | | |. Non sensibles à l'action du |. Intérêt économique important | | milieu | | | | | |. Peu de gènes impliqués | | | | | | - Detérminisme simple (lois de | | | Mendel,...) | | | | | |. Peu d'intérêt économique | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ 3. Déterminisme des caractères qualitatifs - Sans corne Sans corne -- ------------ ------------ Pp Pp -- -- -- -- -- -- -- --  - Pourquoi de telles fréquences ? Car les croisements sont très aléatoires au niveau des robes - Dans une grande population - Fréquences génotypiques dépendant de la loi de Hardy-Weinberg - On parle de déterminisme simple, les fréquences sont « facilement » calculables 1. Introduction ============ - Bienvenue dans la génétique quantitative : - Génétique des populations - Caractères quantitatifs : - Soumis aux mêmes règles d'hérédité que les qualitatifs - Sous l'influence d'un très grand nombre de gènes ayant chacun plusieurs allèles - Addition des effets de chaque allèle sur le caractère 2. Valeurs phénotypiques, génétique et environnementale ==================================================== +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Phénotype : ce qui | Un petit nombre de | Un nombre illimité de | | est mesuré, ce qui | phénotypes diffèrent | phénotypes | | est observé | | | | | | - Valeur | | | | phénotypique (ou | | | | performance) | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Génotype : l'ensemble | Gènes et allèles en | Nombre gènes-allèles | | du matériel génétique | petit nombre sont | | | impliqué | clairement | - Valeur génétique | | | | | | dans le caractère | identifiés | - Pas tous | | étudié | | identifiés | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Environnement : les | Augmente | Augmente fortement | | conditions de | | | | l'environnement | | - Valeur | | déterminent | | | | l'expression des | | | | | | | | gènes, des caractères | | | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ -  - L'animal transmet la moitié de ses allèles à sa descendance Quelle est la valeur génétique moyenne transmise à la descendance ? - Pour le taureau MAX : production minimale de **15** (A1 **10** + B1 **5**) et une production maximale de **45** (A3 **30** + B3 **15**). - Moyenne MAX = ^15+45^ = 30 - Pour ATTILA : production minimale de **15** (A1 **10** + B1 **5**) et une production maximale de **35** (A2 - Moyenne MAX = ^15+35^ = 25 - Notion de variation quand on considère une population - On ne va pas génotyper les 4 descendants pour savoir ce qu'ils ont hérité, tout est question de probabilités, et donc, de statistiques - L'intérêt des modèles statistiques complets - Nombre de génotypes très grand/infini dans la population - Distribution normale des performances - Qu'est-ce que la valeur génétique G d'un individu ? - C'est le total des effets moyens des gènes pour un caractère quantitatif chez un individu - C'est la contribution moyenne des gènes d'un individu à l'expression des caractères - Elle est mesurée par l'index de sélection - Variation des effets des génotypes qui gouvernent le caractère qu'on veut V(E) : Variation de la valeur environnementale - 3. Paramètres génétiques ===================== - Définition : - Peu d'influence du milieu sur le caractère - Bon outil de sélection (plus on a une grande variation  - Réflexion : - Quelles conclusions pouvez-vous en tirer d'un caractère dont le coefficient d'h2 est de 0 ?  - Si h2 = 1, alors V(p) = V(g)  super amélioration génétique - En résumé, h2 varie SURTOUT selon le caractère étudié mais aussi : - D'une population à l'autre, sélectionnée depuis longtemps VS non sélectionnée - Au sein d'une même population, selon la localisation des individus (impact du milieu) - Quid si consanguinité élevée ? - Outil de prédiction de l'efficacité de la sélection sur l'amélioration génétique -- -- -- -- - Coefficient de corrélation : - Intérêt ? - Prédictions des effets de la sélection - 1. Introduction ============ - Les structures concernées : - Une population dans son ensemble - Pas des élevages/troupeaux individuels - Mise en place d'un plan de sélection  - 3 questions : - Que veut on améliorer ? - OBJECTIFS - Que peut-on améliorer ? - Performances zootechniques - Caractères quantitatifs - Critères de sélection - Comment améliorer ? - - Programme de sélection - Évaluer le potentiel génétique des animaux pour... - Choisir les meilleurs génétiquement par rapport aux objectifs et enfin... - Les diffuser 2. Les objectifs ============= - Les facteurs d'influence : - Les conditions d'élevage - L'attente des consommateurs - Le marché des produits d'origine animale - Tenir compte de tous les acteurs ----------------------------- -- -- --. Facilité de naissance. Croissance. Aptitude des mères à élever leur veau (potentiel d'allaitement) ----------------------------- -- -- -- 1. Processus long - 3 ans pour les poules de chair, 10 ans pour les bovins - Les attentes seront-elles les mêmes à l'avenir ? - Anticiper les évolutions du marché et des systèmes de production 2. Contraintes environnementales - Type BBB ne convient pas aux pays en voies de développement - Bonne relation entre spécificité de la race et le créneau d'utilisation - Éviter les effets antagonistes - Intérêt des coefficients de corrélation - Selon l'espèce et la race, cela ne convient pas à l'environnement +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Sélection d'un | | | | extrême | | | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Ex : sélection de | | | | l'espèce a | | | | | | | | longue queue | | | | seulement | | | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ Réaliser un état des lieux ========================== 1. L'identification des animaux - Obligatoire pour plusieurs raisons (y compris élevage domestique puisqu'abattage à domicile interdit) - Actes techniques collectifs (prévention sanitaire, sélection,...) - Traçabilité des produits animaux - Attributions de primes 2. Répertoire généalogique et contrôle de filiation 3. Contrôle des performances par des organismes de contrôle - Aptitudes d'élevage et de reproduction (en exploitation) - Aptitude laitières (contrôle laitière tous les ans) - Aptitude bouchères (contrôle de croissance) 4. Les typages moléculaires - Marqueurs moléculaires (microsatellites et séquençage de génomes entier) - Mise en évidence de mutations causales - Détection de QTL (quantitative trait loci) 4. Détermination des critères de sélection ======================================= - Doivent être... : - Corrélés avec l'objectif de sélection (positivement ou négativement) - Être facilement et précocement mesurables - Être héritables  V(g) non nulle - Multiplicité des objectifs/critères de sélection - Élaboration de critères synthétiques - - Pondération des critères élémentaires . - Selon... - - - 5. Estimation de la valeur génétique -- indexation =============================================== - Buts ? - Classer les candidats futurs reproducteurs - Classement sur base duquel on compare les reproducteurs entre eux - Valeur génétique non réelle mais RELATIVE d'un individu par rapport aux autres - Conditions - Valeur relative - Calcul intrarace - Grande nombre d'individus = sélection plus efficace - Test de descendance : on choisit le meilleur producteur en évaluant sa descendance - Calcul de l'INDEX - Pour calculer l'index d'un individu, il nous faut des informations qui soient corrélées avec la valeur génétique (G) de l'individu Performances mesurées sur --------------------------- -- L'individu lui-même Ses parents Ses enfants Ses frères et sœurs Ses grands parents - Plus le degré d'apparenté est élevé, plus la génétique commune sera importante  plus l'estimation de G de l'individu sera précise Performances mesurées sur --------------------------- -- L'individu lui-même Ses parents Ses enfants Ses frères et sœurs Ses grands parents - Nécessité de multiplier les mesures car... - - - Mode d'évaluation +-----------------+-----------------+-----------------+-----------------+ | Évaluation | | | | | massale (Mesure | | | | | de la | | | | | performance | | | | | lui- | | | | | | | | | | même) | | | | +-----------------+-----------------+-----------------+-----------------+ | Évaluation | | | | | | | | | | généalogique | | | | | sur ascendants | | | | | (Parent) | | | | +-----------------+-----------------+-----------------+-----------------+ | Évaluation | | | | | généalogique | | | | | sur collatéraux | | | | | (Demi- | | | | | | | | | | frère/sœur) | | | | +-----------------+-----------------+-----------------+-----------------+ | Évaluation | | | | | généalogique | | | | | sur descendants | | | | | (Enfant) | | | | +-----------------+-----------------+-----------------+-----------------+ - Récapitulatif - Précision de l'index : - L'erreur est inévitable puisqu'il s'agit d'une estimation - Dépend de... - - - ------------------ ------------ CD \< 0.3 Mauvaise 0.3 \< CD \< 0.7 Correcte CD \> 0.7 Très bonne ------------------ ------------ - Le choix d'un futur reproducteur se base le plus souvent sur... - Ses promesses performances - La valeur attendue de la descendance - Les performances de ses parents - Toutes les propositions sont correctes - Vrai ou faux - L'index permet de classer les candidats à la sélection - - - - Valeur relative  dépend de la V(g) des autres animaux compris dans l'index - Mesure des performances est continue et non figée (ex :Prim'Holstein en France 3 index/an) - Résumé - Calcul intrarace - Estimation de la valeur génétique - - - - - 6. Étapes d'une indexation ======================= - Données de performances et Pédigrées : - Collecte, stockage et centralisation des données de performances et de Pedigree - Fiabilité de la V(g) est fonction de la fiabilité des paramètres génétiques estimés (h2, corrélation,...) - Schématisation de la réalité : - Facteurs de variation non génétiques - - - - Variations génétiques - - - Validation des procédures : - Test globaux et établissement « d'indices de cohérence » - Ex : placer des animaux apparentés sources de données de performances dans des milieux différents pour bien mettre en évidence la différence entre V(G) et V non (G) 7. Modèle de calcul d'un index =========================== - Méthode classique (index de sélection) (Duclos et al, 1992) - N'est presque plus utilisée car repose sur des hypothèses rarement vérifiées en pratique. - Un animal ne peut donc être comparé qu'aux animaux issus de la même bande de contrôle - La méthode ne tient pas compte de toutes les relations de parentés - Hypothèses fausses - - Méthode BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) - Celle qui est le plus utilisée à l'heure actuelle - Plus précis que l'index - Comparaison inter population !!CONDITIONS !! - - - - - - - Prédicteur - - - Unbiased (sans biais) -  - Plus elle vieilli, moins elle produit - Blup tient compte de ce déséquilibre - BLUP « père » ou « père/mère » - Perte d'une partie des caractéristiques du modèle animal mais simplification des modèles d'analyse et des calculs - Validation de l'ensemble de la procédure doit se faire régulièrement 8. Exemple d'index ===============  - Taille : - Augmente la distance entre le plancher du pis et le sol - Réduction des risques de blessure et d'infection de la mamelle et des trayons - - Corrélation avec capacité - Diminue la longévité - - Profondeur de poitrine/corps et largeur de poitrine : - Bonne capacité d'ingestion - Cœur/poumons spacieux - Gène au déplacement - Déplacement de caillette PP  - Force du rein : - solidité de la vache - pas de « renversement de bassin »  - Inclinaison du basin : - Sortie du veau - Écoulement d'urine dans l'utérus lorsque le col est ouvert lors de chaleurs - Angle du pied et hauteur du talon : - Protection des tendons - Plus le pied est haut plus la vache durera  - Courbure des jarrets : - Usure régulière des sabots - Longévité des aplombs - Trop coudé  usure des talons - Trop droit  impact sur les articulations - Qualité de l'ossature au niveau des jarrets : - Plus fin possible car risque de problème de déplacement  - Caractère laitier : - Cellules somatiques  indicateur de résistance aux mammites - Vitesse de traite  facilité la traître et la santé du pis - T° de l'animal  facilite le travail - Facilité de vêlage  tient compte des risques sur les veaux -- -- -- -- 9. Utilisation des index ===================== - Outils de sélection - Classer les reproducteurs - Prévoir les accouplements - Outils d'analyse du passé et du présent - Voir l'évolution du troupeau au cours du temps et par rapport à la race - Mesure du progrès génétique au sein d'une race - Outils de prévention - Potentiel de reproduction du troupeau - Prédire le niveau génétique futur de la race 10. Index et génie génétique ========================  - Après la génomique  - sur la descendance car ça prend énormément de temps. On 11. Progrès génétique ================= - Par génération (PC/gn) : - Différence entre la valeur génétique moyenne de la population à la génération n + 1 par rapport à la génération n - Différence entre valeur génétique moyenne des reproducteurs et la valeur génétique moyenne de la population à laquelle ils appartiennent - Annuel (PG/an) - Progrès génétique par unité de temps - Tient compte du temps qui s'écoule entre 2 générations - - 12. Les problématiques ================== - Utilisation du génomique au-delà de l'amélioration... les bioréacteurs...  - Tares chez les animaux - Problème de la sélection animale et de bien être - En fct de la couleur du pelage, il peut avoir des handicaps - La consanguinité ? - Entre 1990 et 2000, le niveau moyen de consanguinité a doublé \... - Adaptation peu rapide en cas d'évolution brutale des marchés - Progrès génétique réduit avec caractères faiblement héritables - Difficulté d'améliorer plusieurs caractères en même temps - Diminution de la variabilité génétique - Limité dans les caractères de choix au sein d'une même race - Croiser des reproducteurs de races différentes (mais appartenant à la même espèce) 1. Objectifs ========= - Créer des souches composites  futures races - Augmenter la variabilité génétique  améliorer une race - Remplacement d'une race par une autre - Valoriser la complémentarité de 2 races :  - Effet d'hétérosis d'autant plus élevé que les 2 races parentales sont éloignées - Hétérosis \>\< Héritabilité - Hétérosis élevé 8 à 20%  reproduction ou la vigueur, h2 faible - Hétérosis moyen 5 à 7%  croissance ou la vigueur, h2 moyen - Hétérosis ± 0%  composition de produits animaux, h2 élevé  - Choix de la méthode d'amélioration selon le type de caractère concerné - Sélection - Croisement - Mais les races utilisées en croisement sont aussi améliorées génétiquement en race pure par la sélection... 2. Différents types de croisement ============================== - - A chaque génération, les animaux non conformes sont éliminés - Quand homogénéité entre les animaux  on peut considéré qu'une nouvelle race est créée Ex : le cheval Anglo-Arabe, les chiens Doodle  - - Augmenter niveau génétique de la race A - Augmenter la variabilité génétique - - F4 est reconnu officiellement comme SPHYNX - Amélioration morphologique - Augmentation de la variabilité génétique - Lutte contre les maladies héréditaires - CMH (CardioMyopathie Hypertrophique) - PKD (Polycystic Kydney Disease) - - Croisement à double étage Les deux principes de l'amélioration animale ============================================ +-----------------------------------+-----------------------------------+ |. Pour des caractères peu | | | héritables | | | | | |. Croisement entre races | | | | | |. Réduit les effets négatifs de | | | la consanguinité | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Objectif : Amélioration d'une | | | population au départ de 2 | | | préexistantes donc on souhaite | | | trier les qualités | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ 4. Hybridation  - Les hybrides sont souvent stériles mais pas toujours\... - Mais est-ce vraiment « contre-nature »? +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | = 2 sous espèces | = 2 espèces | = 2 genres | | différentes | différentes | différentes | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Pour la production de | Fertiles | Fertile | | viande | | | | | A double étage | | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ | Ex : cochonglier | Ex : Tigron, Ligre, | Ex : Wholphin, | | | Zorse, Grolar | Brahman, Chat | | | | | | | | Savannah, Chat Bengal | +-----------------------+-----------------------+-----------------------+ - Zones hybrides : - Régions étroites dans lesquelles des populations génétiquement distinctes se rencontrent, s\'accouplent et produisent des hybrides. - Souvent, elles font seulement quelques centaines de mètres de large et peuvent cependant  +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Sélection par l'environnement : | | | | | | Les hybrides sont les individus | | | les mieux adaptés aux conditions | | | régnant dans la zone hybride | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ +-----------------------------------+-----------------------------------+ |. Menace le patrimoine génétique | - Un des moteurs de l'évolution | | des espèces | des | | | | |. Augmentation de la sensibilité | | | aux maladies | | | | | |. Diminution de la fertilité et | | | de la longévité | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ Introduction ============ - Consanguinité - Augmentation de l'homozygotie - Individus reproducteurs homozygotes  allèle transmis à la descendance est connu. - Fixation des gènes - Recherchés pour fixer les standards de race - Ou pas → tares 2. Homozygotie =========== - 2 types : pas d'ancêtre commun 3. Définition ========== - Parenté - Deux individus sont apparentés s\'ils possèdent au moins un ancêtre commun. Deux individus apparentés sont reliés l\'un à l\'autre par une suite d\'individus, comprenant l\'ancêtre commun, et constituant une chaîne de parenté. - La parenté concerne des paires d\'individus. - Coefficients de parenté - Probabilité d'obtenir en tirant au hasard des gènes identiques entre 2 individus A et B. - Individu consanguin - Individu qui a potentiellement des gènes identiques par descendance. - Un individu est consanguin si ses deux parents sont apparentés. - Consanguinité - Mesure de l'identité entre gènes. - C'est la probabilité d'obtenir des gènes identiques (Valeur de 0 à 1) chez un individu. 4. Généalogie ou pédigrée ====================== - Caractérise les relations entre individus - Officiels (sociétés d'élevage) ou non (arbre généalogique) - Différents types de présentation  Coefficient de consanguinité ============================  6. Les effets de la consanguinité chez les animaux de production ============================================================= - En conclusion\... - Effets néfastes sur les caractères de production et de reproduction - Baisse de la variabilité génétique (risque de disparition de certains gènes) - Augmentation des tares génétiques 7. Comment limiter l'apparition de la consangunité en production ? =============================================================== - Limiter l'utilisation des mâles les plus utilisés (et leur descendants) - Systèmes de choix de reproducteurs - Logiciels d'accouplements - Optim Bull en Belgique - Centralisation des valeurs de - Coefficient de consanguinité des individus - Coefficient de parenté entre individus - Généalogies qui remontent le plus loin possible - Choix d'un seuil de consanguinité - Variable selon la race - Variable selon le pays - Seuil de consanguinité - Blanc Bleu Belge (3.25%) - Prim'Holstein (6.25%) 8. Et en élevage canin ? ===================== - Consanguinité \>\>\> - - Introduction de gènes d'autres races (croisements) - Accouplements dirigés - Fixer un seuil de consanguinité mais\... - Variable selon la race - Dépend du nombre de lignées disponibles 1. Introduction ============ - Évolution des objectifs d'élevage : - Du chien de travail à chien d'égarement et d'appart - Évolution des standards de race : - Berger allemand : inclinaison du corps (dysplasie de la hanche) - - Boxer : inclinaison du corps, face de plus en plus aplatit - Teckels : patte plus courte, plus long (hernie discale) - Basset Hound : idem teckels - - - Fixer des caractères mais aussi des tares génétiques - Mutation à transmission autosomale dominante - Sans Crète : ne fait pas partie du standard de la race  Élimination des chiots - Prédisposition aux sinus dermoïdes (= trou au niveau de la peau jusqu'à la moelle épinière) - Dépression de la consanguinité -- reportage « grandeur nature » « chiens de race, les maîtres fous » 1. Quelques pathologies dont l'incidence augmente suite à la consanguinité ? 2. Caractère scientifique du reportage ? 3. Problématique des concours canins ? 4. Solution ? 5. Intérêts de la consanguinité ? 6. Faut-il abolir la consanguinité de l'élevage ? +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Syringomyélie du Cavalier King | - Mauvaise évacuation du LCR | | | vers le conduit de la moëlle | | Charles | épinière | | | | | (+ insuffisance cardiaque de la | - Accumulation de LCR qui | | valve vitrale) | comprime les structures | | | nerveuses | | | | | | - Crise d'épilepsie, douleur | +===================================+===================================+ | Myélopathie dégénérative du | - Affaissement de | | Berger Allemand | l'arrière-train (dysplasie de | | | la hanche) | +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Épilepsie et Boxer | - Pas de tumeur, pas trauma, | | | pas d'hémorragie, pas | | | d'infection | +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Syndrome Brachycéphale ou | | | syndrome obstructif des voies | | | respiratoire (BAOS) | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ - Prise de conscience du phénomène : - Progressive et laborieuse chez les éleveurs et les sociétés officiels et de Stud-book - Belles initiatives existent - C'est possible de « revenir en arrière » - 50% Bulldog Anglais moderne - 50% Pitt Bull, Bullmastiff et Bulldog Américain en proportions égales - Obtention d'un chien avec un plus long chanfrein - Chien athlétique, respirant sans difficulté et débarrassé de ses tares génétiques. - Mise en place de réglementations : - Détection systématique pour les futurs reproducteurs (dysplasie du coude ou de la hanche) - Adaptation de la formation des juges de concours - Révision des standards des races et promotion la diversité génétique - Registre des maladies héréditaires par race (répertoire de diff test fait sur une espèce/pays) - Attention un animal malade (ex : dysplasique) n'est pas forcément symptomatique 2. La dysplasie de la hanche ========================= - Fréquence : jusque 40% des chiens dans certaines races - Système de cotation sur base d'examens officiels - Radio officiel vers 12 -- 16 mois - Races les plus touchées : - Bouvier bernois - Rottweiler - Golden Retriever - Berger allemand - Facteurs environnementaux : - Nutrition (obésité, calcium,...) - Surcharge pondérale - Maladie - Maladie polygénique et multifactorielle : - Effet de seuil - Bergers picards - St-Bernard - Terre-neuve - Setter Gordon - Trauma - Exercices excessifs pendant la croissance - Addition d'un certain nombre de gènes défavorables pour que la maladie s'exprime - - On peut avoir une descendance touchée même si les 2 parents sont exempts (addition des gênes favorable) - Programme de sélection  forte réduction l'incidence (réduction de l'apparition de cas) Ex : Berger allemand, on est passé de 50% de chien atteints en 1970 à 19% de nos jours - - Chien atteint peut être asymptomatique (compensation musculaire possible) - 2 chiens indemnes peuvent donner naissance à un individu atteint 3. La dysplasie du coude ===================== - Terme qui regroupe 4 affections différentes : - Ostéochondrite disséquante - Fragment cartilagineux détaché du condylien huméral (humérus) - Fragment osseux dans l'articulation - Fragmentation du processus coronoïde - Petit fragment détaché du cubitus - Non union du processus anconé (non-soudure au reste de l'ulna) - Incongruence du coude - Mauvais emboîtement de l'articulation du coude - Usure de l'articulation bcp plus vite  - Diagnostic radiographique (4 grades) : - 0 = indemne - 1 = légère - 2 = Modérée - 3 = Sévère - Affection multifactorielle polygénique : - Alimentation trop riche en énergie - Croissance trop rapide (non-union du processus anconé) - Activité physique trop intense - Héritabilité = 28% - Sélection basée sur le phénotype et pas sur les index comme la dysplasie de la hanche - radio officiel à 14 mois -- obligatoire pour les reproducteurs - Ex obligatoire à min 14 mois pour les reproducteurs - Seuls les grades 0 et 1 sont admis à l'élevage - Ce programme aurait passer le % de ; ------------------------ -- -- Chiens de grade 2 ou 3 Chiens de grade 0 ------------------------ -- -- 1. La torsion d'estomac (SDTE = syndrome de dilatation torsion d'estomac) ====================================================================== - - Dogue Allemand - Saint Bernard - Bassets Hound - Labrador Retriever - Setter Irlandais - Berger Allemand - Boxer - Irish Wolfhound - Fréquence croissante : de 0,036 % en 1964 à 0,57 % en 1994 (F = M) - Facteurs de risque : - Rapport profondeur/largeur - Aliment placé en hauteur (dilatation d'estomac) - Apparenté - Vitesse d'ingestion - Exercice avant ou après ingestion du repas (compter 1h) - Symptômes : - Anxiété - Essais de vomissement sans succès - Douleur abdominale - Salivation excessive - Abdomen distendu, son tympanique à la percussion (accumulation de gaz) - Fréquence cardiaque élevée, muqueuses pales  animal en choc - Mort assurée si pas d'action rapide (donc radio pas nécessaire) - Urgence sévère - Traitement : - Agir vite - Sondage et/ou trocart - but : évacuer le gaz accumulé - Traiter l'état de choc  double perfusion - Chirurgie - Remettre l'estomac en place - Le fixer pour éviter les récidives (gastropexie = fixation de l'entre pylorique et la paroi) - Saturation avec une aiguille rond et pas triangulaire - Être plusieurs vt (si de garde, appeler un collègue) car bcp de chose à faire en peu de temps ! - Prévention - Fractionner repas (au mieux, 3x) - Éviter exercice 1h avant et 2h après le repas - Pas d'alimentation en hauteur - Allonger la durée des repas (gamelles labyrinthes) 2. Le comportement =============== - Domestication : - Docilité - Renards sélectionnés (\> 20 générations) pour docilité développent des oreilles pendantes, queue enroulée, taches blanches - Néoténie - Caractère juvénile qui reste chez l'adulte - Chiens 'chiots' plus aptes à rester près de l'homme? - Degrés variables - Husky : proche du canidé adulte - Chihuahua : aspect et comportement proche du chiot - Grosse tête, gros yeux « mignon » du chiot - Phénotypes difficilement mesurables - Distribution des caractères non continue - Effet important de l'environnement - Ex : individu toujours à bras VS toujours dehors 3. Le travail ========== - Exemples : - Chiens guide - aveugle, handicap physique ou mental, épilepsie - Chien de chasse - Chien de troupeau (border collie) - Chien policiers/militaires (bergers) - défense, anti-drogue, anti-explosif - Chien sauveteur - sauvetage aquatique (terre neuve), avalanches (st Bernard) - Chien de recherche - personne disparue, décombres, cadavre - Cas du chien « guide d'aveugle » : - Généralement labrador et Golden - Dysplasie de la hanche - Habilité à l'entraînement - Poids/taille - Nombre de chiots +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Poids à 42j | | | | | | - Berger allemand | | | | | | - Labrador | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Taille adulte | | | | | | - Berger allemand | | | | | | - Labrador | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ | Comportement | | | | | | - Habilité à l'entraînement | | | | | | - Aboiement | | | | | | - Persévérance | | +-----------------------------------+-----------------------------------+ - Conclusion : - Faible héritabilité pour les caractères comportementaux - Évaluation plutôt « subjective » - Erreur de mesure augmente - Quantification difficile  revoir la méthode d'évaluation - Effet de l'environnement - On ne peut pas conclure qu'une race est agressive car l'héritabilité est faible 4. Autres exemples =============== - Voir doc « MDR1: la sensibilité médicamenteuse des races apparentées au Colley » - Existe différents types de mutation causé par les médicaments (phase la barrière hématome méningé/cérébrale) - Races concernées - Colley, Berger Australien, Border Colli, Berger Blanc Suisse, Bobtail, Shetland - Les chiens issus de croisement avec les races citées, peuvent présenter un risque de sensibilité médicamenteuse - MDR1 = Multi Drug Résistance (résistance à divers médicament) - Délétion de 4 nucléoïdes  gène qui devint non fonctionnel (synthétise la glycoprotéine-P qui protégé le SNC) - Gène qui code pour la glycoprotéine P, qui se retrouve dans les C. Enthéliales des capillaires cérébraux. - Les capillaires participent à la barrière hémato méningé - La glycoprotéine agit comme un transporteur qui permet d'éliminer les toxines et les amenés dans le sang - Lire « barrière hémato céphalique » et « mutation MDR1, que risque mon chien ? » - Le cerveau n'est pas débarrassé des toxines car il n'y a plus de glycoprotéine P  - Symptôme - mydriase (pupille dilaté) - ataxie (mauvaises coordinations des mouvements) - crise d'épilepsie, convulsion - parésie (paralysie de certains membres) - tremblement - trouble digestif, hépatique, rénaux (mais moins affecté que les troubles nerveux) - hypersalivation - coma - mort - Lire « conséquences pour nos chien et réactions » - Quels profils génétiques existent-ils ? Quels impacts ont-ils ? - Homozygotes pas malade (+/+)  sain - -/+  1 gène muté et 1 normal (le chien va être sensible mais avoir qd même une glycoprotéine P qui pourra être fonctionnel - -/-  2 gènes atteinte (malade, le chien est très sensible aux substance toxiques) - La gravité de l'intoxication dépend de la molécule, de la dose, de la race été de l'âge du chien - Il est vivement conseillé de prendre autant de précautions avec les chiens hétérozygotes qu'avec les chiens homozygotes mutés - Molécule dangereuse pour le chien porteur - Lire « a proscrire impérativement » et « et en cas d'accident » - ivermectine (antiparasitaire)  mortelle chez les homozygotes mutés donc interdit pour les +/- et -/- - milbemycine - anti-diarrhéique (Motilium, Imodium\...) - anesthésie par voie injectable (anesthésié alors par voie gazeuse) - Prévention (lire) - Prélèvement buccale ou prise de sang que l'on enverra dans un centre de dépistage (test ADN) - On fait le test pour les élevages (production possible des -/+  bénéfique pour la diversité)