T.11 La transcripción de la RNA Pol II (títol)

Study Notes

Initiation

RNA polymerase II (Pol II) initiation involves the assembly of a pre-initiation complex (PIC) at the promoter region
The PIC consists of:
- RNA Pol II
- General transcription factors (GTFs):
  - TFIID (binds to the TATA box)
  - TFIIA (stabilizes TFIID binding)
  - TFIIB (recruits Pol II)
  - TFIIE (recruits TFIIH)
  - TFIIH (has kinase and helicase activities)
The PIC is stabilized by the binding of transcription factors to specific DNA sequences

Elongation

After initiation, Pol II escapes the promoter and begins transcribing the gene
Elongation involves the addition of nucleotides to the growing RNA chain
Pol II pausing and backtracking can occur, allowing for proofreading and editing of the transcript
Elongation factors, such as P-TEFb, can stimulate transcription elongation

Transcriptional Regulation

Transcriptional regulation involves the control of gene expression in response to cellular signals
Regulation can occur at the initiation or elongation stages
Transcriptional regulators, such as transcription factors, can activate or repress gene expression
Regulation can also occur through epigenetic modifications, such as DNA methylation and histone modifications

Transcription Factors

Transcription factors are proteins that bind to specific DNA sequences to regulate gene expression
They can act as activators or repressors of transcription
Transcription factors can be classified into different families based on their DNA-binding domains
Examples of transcription factors include:
- Sp1 (binds to GC-rich regions)
- NF-κB (binds to κB sites)
- AP-1 (binds to TRE sites)

RNA Processing

RNA processing involves the modification of the primary transcript to form mature RNA
Steps involved in RNA processing:
1. Capping: the addition of a 7-methylguanosine cap to the 5' end of the RNA
2. Splicing: the removal of introns and joining of exons
3. Polyadenylation: the addition of a poly(A) tail to the 3' end of the RNA
4. Editing: the modification of specific nucleotides within the RNA
RNA processing is critical for the formation of mature RNA molecules that can be translated into protein

Iniciación de la Transcripción

La ARN Pol II se une a la región promotora, reconocida por factores de transcripción específicos.
La región promotora se encuentra típicamente upstream del gen.
La ARN Pol II, factores de transcripción y otras proteínas se unen para formar el complejo de pre-iniciación.
El complejo de pre-iniciación es necesario para la iniciación de la transcripción.

Desenrollamiento del DNA

La doble hélice del DNA se desenrolla, y la cadena template se hace disponible para la transcripción.

Elongación de la Transcripción

La ARN Pol II lee la cadena template y empareja los nucleótidos entrantes según las reglas de emparejamiento de bases.
El RNA se sintetiza en la dirección 5' a 3'.
La ARN Pol II puede sintetizar largas cadenas de RNA sin disociarse de la plantilla de DNA.
La factor de procesividad ayuda a mantener la interacción entre la ARN Pol II y la plantilla de DNA.
La ARN Pol II puede pausar en sitios específicos en la plantilla de DNA, permitiendo la regulación de la transcripción.

Terminación de la Transcripción

La ARN Pol II reconoce la secuencia del terminador, que es típicamente una región rica en GC.
La secuencia del terminador señala el final de la unidad de transcripción.
El transcrito de RNA se libera de la ARN Pol II, y la enzima se disocia de la plantilla de DNA.
Proteínas como Rho y NusA ayudan a facilitar la terminación de la transcripción.

Modificaciones Postranscripcionales

Un nucleótido especializado, llamado tapón, se agrega al extremo 5' del transcrito de RNA.
El tapón ayuda a proteger el RNA de la degradación y facilita la iniciación de la traducción.
Los intrones (regiones no codificantes) se eliminan, y los exones (regiones codificantes) se unen.
La poliadenilación agrega una larga cadena de nucleótidos de adenina al extremo 3' del transcrito de RNA.
Esto ayuda a estabilizar el RNA y facilita la iniciación de la traducción.

Regulación de la Expresión Génica

La regulación de la transcripción se logra a través de la unión de factores de transcripción a secuencias de DNA específicas.
La regulación epigenética se logra a través de cambios heredables en la función génica que ocurren sin un cambio en la secuencia de DNA subyacente.
La regulación postranscripcional se logra a través del control de la estabilidad del mRNA, la traducción y la localización.
Esto se logra a través de la acción de microARNs, proteínas de unión a RNA y otros mecanismos.

Description

Aprende sobre la transcripción de ADN, incluyendo la iniciación, la elongación, la regulación transcripcional y el procesamiento de RNA. Descubre cómo se controla la expresión de genes en respuesta a señales celulares.

T.11 La transcripción de la RNA Pol II (títol)

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Questions and Answers

What is the role of Rho and NusA proteins during transcription?

What is the function of the cap added to the 5' end of the RNA transcript during post-transcriptional modification?

Which type of regulation involves the control of mRNA stability, translation, and localization?

What is the result of the splicing process during post-transcriptional modification?

Which type of regulation involves heritable changes in gene function that occur without a change in the underlying DNA sequence?

What is the primary function of the pre-initiation complex during transcription initiation?

During transcription elongation, what is the function of the processivity factor?

What is the primary function of the terminator sequence during transcription termination?

During transcription initiation, what is the role of specific transcription factors?

What is the direction of RNA synthesis during transcription elongation?