Sistema delle Endomembrane e Tecniche di Studio

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Questions and Answers

Qual è la funzione principale della mannosidasi II nella cellula?

  • Facilitare il trasporto di proteine (correct)
  • Impedire la sintesi di ribosomi
  • Sintetizzare il RNA
  • Attivare il metabolismo degli acidi grassi

Quale organello è responsabile della sintesi di proteine?

  • Perossisomi
  • Reticolo Endoplasmatico Ruvido (correct)
  • Lisosomi
  • Mitocondri

Qual è la differenza principale tra il Reticolo Endoplasmatico Ruvido e quello Liscio?

  • Il Liscio ha ribosomi sulla superficie e il Ruvido no.
  • Il Ruvido è coinvolto nella sintesi proteica mentre il Liscio no. (correct)
  • Il Ruvido è presente solo nelle cellule animali.
  • Il Liscio è impermeabile alle proteine.

Cosa accade all'mRNA quando il siRNA si lega ad esso?

<p>Viene silenziato e impedisce la sintesi della proteina. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale dei seguenti organelli non è coinvolto nella sintesi proteica?

<p>Mitocondri (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è la funzione principale della proteina Green Fluorescent Protein (GFP)?

<p>Emettere luce fluorescente (D)</p> Signup and view all the answers

Dove si localizza GFP associata a un gene virale quando la temperatura è mantenuta a 40°C per 60 minuti?

<p>Nel reticolo endoplasmatico (A)</p> Signup and view all the answers

Quale di queste affermazioni è vera riguardo alla struttura della GFP?

<p>Ha 11 foglietti beta e 2 segmenti alfa elica (C)</p> Signup and view all the answers

Che cosa accade quando la temperatura viene abbassata a 32°C per 10 minuti dopo l'incubazione a 40°C?

<p>GFP associata al gene virale si sposta nell'apparato di Golgi (A)</p> Signup and view all the answers

Perché la GFP è utile nello studio delle proteine cellulari?

<p>Consente di monitorare il traffico e la localizzazione delle proteine (A)</p> Signup and view all the answers

Quale organello non è coinvolto nella via secretoria delle proteine contenute nei granuli zimogeni?

<p>Nucleo (B), Mitocondri (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il vantaggio della GFP nelle analisi di traffico proteico?

<p>Ha piccole dimensioni che ne facilitano l'uso (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresenta il termine 'MERG' nell'uso della GFP?

<p>Sovrapposizioni per individuare diverse localizzazioni di proteine (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è l'effetto della mutazione sec12 nel lievito?

<p>Impedisce la formazione di vescicole nel reticolo endoplasmatico. (D)</p> Signup and view all the answers

Quale funzione ha la mutazione sec17?

<p>Inibisce la fusione delle vescicole con la membrana del Golgi. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa sono gli siRNA?

<p>RNA di piccole dimensioni che regolano l'espressione genica. (C)</p> Signup and view all the answers

Come gli siRNA mediano il silenziamento genico?

<p>Degradano l'mRNA a cui sono complementari. (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo della mannosidasi II nel lievito?

<p>È un enzima che si trasferisce dal reticolo endoplasmatico al Golgi. (C)</p> Signup and view all the answers

Quale delle seguenti affermazioni è vera riguardo agli smallRNA?

<p>I piccoli RNA non codificanti includono famiglie come siRNA. (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa accade quando si usa uno siRNA che si lega all'mRNA della mannosidasi II?

<p>La mannosidasi II viene trattenuta nel reticolo endoplasmatico. (B)</p> Signup and view all the answers

Quali sono le caratteristiche principali degli siRNA?

<p>Hanno una lunghezza di 21-22 nucleotidi e sono a doppio filamento. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il fattore che determina la destinazione di una proteina?

<p>Le sequenze segnale presenti (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa indica l'ipotesi del segnale riguardo al passaggio delle proteine?

<p>Esistono sequenze segnale che indirizzano le proteine. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale tipo di proteina termina la sua sintesi nel citosol?

<p>Proteine dirette agli organelli interni (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è la lunghezza tipica delle sequenze segnale sulle proteine?

<p>15-30 amminoacidi (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresenta il 'traffico cellulare' descritto nell'esperimento con i mielomi?

<p>Il movimento delle vescicole nella cellula. (D)</p> Signup and view all the answers

Quale organello è direttamente coinvolto nella secrezione di proteine?

<p>Reticolo Endoplasmatico Ruvido (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa sono i mielomi?

<p>Tumori maligni dei linfociti B (D)</p> Signup and view all the answers

Quale descrizione dell'inserimento delle proteine integrali di membrana è corretta?

<p>Attraversano la membrana con regioni alfa-elica idrofobiche. (C)</p> Signup and view all the answers

Come viene bloccata la traduzione della catena polipeptidica durante il suo attraversamento della membrana?

<p>Quando il traslocone riconosce una sequenza transmembrana. (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa accade al terminale amminico della proteina durante il processo di inserimento nel reticolo endoplasmatico?

<p>Viene esposto nel lume del reticolo endoplasmatico. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è la lunghezza tipica delle regioni alfa-elica idrofobiche delle proteine integrali di membrana?

<p>20-25 aminoacidi (D)</p> Signup and view all the answers

Quale affermazione è vera riguardo all'inserimento di proteine con sequenze segnale removibili?

<p>La sequenza segnale viene tagliata durante il processo di inserimento. (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa dimostra il fatto che le catene leggere sintetizzate dai ribosomi legati a membrana sono resistenti alla digestione?

<p>Sono trasferite all'interno delle vescicole. (A)</p> Signup and view all the answers

Quale differenza esiste tra la traduzione in vitro di mRNA con ribosomi liberi rispetto a quelli legati a membrana?

<p>Le dimensioni delle proteine sono maggiori con ribosomi liberi. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è il ruolo principale della proteina disolfuro isomerasi?

<p>Correggere i legami disolfuri non corretti (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è l'effetto della fosforilazione di eIF2α sul processo di traduzione proteica?

<p>Inibisce l'attività di eIF2α rallentando la traduzione (A)</p> Signup and view all the answers

A quale fattore di trascrizione si riferisce l'ATF4 quando viene sovraregolato?

<p>CHOP (C)</p> Signup and view all the answers

Quali sostanze chimiche sono comunemente usate per evocare stress ER in esperimenti?

<p>Tunicamicina e Tapsigargin (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è una conseguenza della malfunzione nel metabolismo del Ca2+ nell'ER?

<p>Induzione di stress ER (D)</p> Signup and view all the answers

Che ruolo svolgono i chaperoni molecolari nel reticolo endoplasmatico?

<p>Ripiegano correttamente le proteine (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa accade alle proteine mal ripiegate nel reticolo endoplasmatico?

<p>Vengono traslocate nel citoplasma e degradate (D)</p> Signup and view all the answers

Qual è una funzione chiave di CHOP nel contesto dello stress ER?

<p>Regolare l'omeostasi dell'ER (D)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Tempo di Chase (117 min)

Il tempo di traslocazione attraverso il reticolo endoplasmatico.

Proteine nei granuli zimogeni

Proteine con funzione enzimatica localizzate nei granuli zimogeni.

Nucleo

Struttura cellulare che non partecipa alla via di secrezione delle proteine.

Mitocondrio

Struttura cellulare che non partecipa alla via di secrezione delle proteine.

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GFP (Green Fluorescent Protein)

Proteina che emette fluorescenza quando eccitata da una specifica lunghezza d'onda di luce.

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Analisi del traffico proteico con GFP

Utilizzo della GFP per seguire il movimento di proteine all'interno della cellula.

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Gene VSVG fuso alla GFP

Un gene virale fuso alla GFP utilizzato per studiare la secrezione di proteine.

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Gene termosensibile VSVG

Una mutazione che rende il gene VSVG sensibile alla temperatura.

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Reticolo Endoplasmatico

Un sistema di membrane interconnesse, diviso in due tipi: liscio e ruvido.

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Reticolo Endoplasmatico Ruvido (RER)

Parte del Reticolo Endoplasmatico che contiene i ribosomi e svolge un ruolo cruciale nella sintesi proteica.

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Reticolo Endoplasmatico Liscio (REL)

Parte del Reticolo Endoplasmatico che non ha ribosomi ed è responsabile di diverse funzioni, tra cui il metabolismo dei lipidi e lo stoccaggio del calcio.

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Ribosomi

Organelli cellulare che producono le proteine, sia nel citosol che nel Reticolo Endoplasmatico Ruvido

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Sintesi proteica

Il processo che permette alle proteine di essere prodotte.

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Destinazione delle proteine nel RE

Le proteine destinate alla secrezione, alla membrana plasmatica o ai lisosomi vengono sintetizzate nel Reticolo Endoplasmatico (RE).

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Destinazione delle proteine nel citosol

Le proteine destinate all'interno della cellula (mitocondrio, cloroplasto, perossisoma, nucleo) vengono sintetizzate nel citosol.

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Sequenze segnale

Le sequenze segnale sono brevi sequenze di amminoacidi (15-30) che indirizzano le proteine al RE.

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Posizione delle sequenze segnale

Le sequenze segnale si trovano generalmente all'estremità N-terminale delle proteine.

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Ipotesi del segnale

L'ipotesi del segnale spiega come le proteine vengono dirottate al RE.

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Test dell'ipotesi del segnale

L'ipotesi del segnale è stata testata usando i mielomi, cellule tumorali che secernono immunoglobuline.

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Vescicole nel traffico cellulare

Le vescicole sono piccole sacche membranose che trasportano le proteine all'interno della cellula in direzioni opposte.

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Traffico cellulare

Il traffico cellulare include il movimento di vescicole dall'interno verso l'esterno (esocitosi) e viceversa (endocitosi).

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Secrezione

Il processo mediante il quale proteine e lipidi vengono sintetizzati, modificati e trasportati attraverso vari compartimenti cellulari per raggiungere la loro destinazione finale, spesso la membrana plasmatica, le vescicole secretorie o altri organelli.

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Gene sec12

Un gene che codifica per una proteina coinvolta nella formazione delle vescicole di trasporto dal reticolo endoplasmatico (RE).

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Mutazione sec12

Una mutazione nel gene sec12 che impedisce la formazione delle vescicole dal reticolo endoplasmatico. Questo porta all'accumulo di proteine nel RE e alla dilatazione delle sue cisterne.

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Gene sec17

Un gene che codifica per una proteina coinvolta nella fusione delle vescicole di trasporto con il Golgi.

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Mutazione sec17

Una mutazione nel gene sec17 che impedisce la fusione delle vescicole con il Golgi. Questo porta all'accumulo di vescicole nel citosol.

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siRNA (Small Interfering RNA)

Piccoli RNA non codificanti a doppio filamento di 21-22 nucleotidi che si legano a specifici RNA messaggeri bersaglio per regolare l'espressione genica.

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Silenziamento genico con siRNA

Un metodo di silenziamento genico che utilizza siRNA per bloccare la traduzione di un gene specifico.

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Mannosidasi II

Un enzima che viene sintetizzato nel reticolo endoplasmatico e si trasferisce nel Golgi. Il suo spostamento è stato utilizzato come modello per studiare il traffico di proteine all'interno delle cellule.

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Proteine integrali di membrana

Le proteine integrali di membrana attraversano la membrana attraverso regioni alfa-elica costituite da 20-25 aminoacidi idrofobici.

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Orientamento delle proteine di membrana

Le proteine integrali di membrana possono attraversare la membrana una sola volta, con il terminale carbossilico o il terminale amminico sul versante citosolico, oppure più volte.

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Inserimento di proteine di membrana: Inizio

Un segmento idrofobico vicino all'estremità N-terminale inizia l'inserimento della catena proteica nella membrana, orientando l'estremità N-terminale verso il citosol.

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Inserimento di proteine di membrana: Allungamento

Man mano che la catena proteica si allunga, si sposta attraverso il traslocone fino a quando non si forma una seconda alfa-elica idrofobica.

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Sequenza segnale: Taglio

La sequenza segnale è tagliata quando la catena polipeptidica attraversa la membrana, lasciando il terminale amminico esposto nel lume del reticolo endoplasmatico.

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Sequenza transmembrana: Riconoscimento

La traduzione della catena polipeptidica attraverso la membrana è bloccata quando il traslocone riconosce una sequenza transmembrana.

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Sequenza transmembrana: Ancoraggio

La proteina esce lateralmente dal traslocone e rimane ancorata alla membrana del reticolo endoplasmatico. La traduzione prosegue, formando una proteina che attraversa la membrana con il terminale carbossilico sul versante citosolico.

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Mielomi: Un sistema modello

I mielomi sono tumori maligni dei linfociti B che secernono immunoglobuline.

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Ruolo dell'Esso nel ripiegamento delle proteine

L'Esso non determina la via di ripiegamento, ma accelera la formazione di legami disolfuro che altrimenti si formerebbero lentamente.

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Destino delle proteine mal ripiegate

Le proteine mal ripiegate vengono translocate nel citoplasma e degradate nel proteasoma.

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Glicosilazione e stress ER

La glicosilazione è un processo importante per il ripiegamento corretto delle proteine. Disturbi nella glicosilazione possono portare a stress ER.

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Calcio e stress ER

La concentrazione di ioni Ca2+ nel RE è mantenuta ad un livello elevato. Disturbare il metabolismo del Ca2+ porta a stress ER.

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Fosforilazione di eIF2α e stress ER

La fosforilazione di eIF2α inibisce l'attività di traduzione proteica, dando alla cellula più tempo per ripiegare le proteine già presenti nel lume del RE.

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Ruolo di ATF4 nello stress ER

ATF4 è un fattore di trascrizione che è sovraregolato quando la quantità di eIF2α è limitata. ATF4 attiva geni che aiutano a mitigare lo stress ER.

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Ruolo di CHOP nello stress ER

CHOP è una proteina che viene sovraregolata da ATF4. CHOP aiuta a ripristinare l'omeostasi del RE inducendo geni correttivi.

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Ruolo di XBP1 nello stress ER

XBP1 è un gene che viene sovraregolato da ATF4. XBP1 aiuta a migliorare la capacità del RE di gestire lo stress.

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Study Notes

Sistema delle Endomembrane

  • Le vie biosintetiche secretorie ed endocitiche interconnettono le endomembrane, creando una rete di scambio di materiale cellulare.
  • La via secretoria inizia nel reticolo endoplasmatico (RE), passa attraverso l'apparato di Golgi e poi viene secreta attraverso l'esocitosi.
  • La via endocitica internalizza materiale esterno attraverso l'endocitosi.
  • La via secretoria può essere costitutiva (continua) o regolata (in risposta a stimoli).

Autoradiografia

  • Una tecnica per studiare la posizione di materiale marcato radioattivamente in cellule o tessuti.
  • Il campione marcato viene posto a contatto con un'emulsione fotografica, e i siti di radioattività vengono rivelati dai granuli di argento quando il film viene sviluppato.
  • Utile per studiare il percorso delle proteine di secrezione nelle cellule pancreatiche, dove vinse un premio Nobel.

Pulse-Chase

  • Un esperimento per studiare il percorso di proteine a partire dal reticolo endoplasmatico nel processo di secrezione.
  • Fase di pulse: le cellule sono esposte ad amminoacidi marcati radioattivamente.
  • Fase di chase: gli amminoacidi marcati vengono sostituiti da amminoacidi non marcati, permettendo di seguire il percorso temporale delle proteine.
  • I risultati mostrano che le proteine sono prodotte nel reticolo endoplasmatico ruvido, si spostano all'apparato di Golgi e poi vengono secrete.

GFP (Proteina Fluorescente Verde)

  • Una proteina che emette luce fluorescente quando esposta a determinate lunghezze d'onda di luce.
  • Può essere utilizzata per studiare il percorso di proteine all'interno delle cellule.
  • L'utilizzo di GFP permette di individuare dove si trovano le proteine di interesse all'interno delle cellule o gli organelli.

Studio dei Mutanti

  • Studi sui lieviti (Organismi unicellulari) perché hanno un numero limitato di geni quindi mutazioni in un singolo gene provocano effetti visibili.
  • Mutazioni di sec12 e sec17, enzimi coinvolti nella formazione delle vescicole dal RE e la fusione con il Golgi, rispettivamente, portano all'accumulo anormale di vescicole nel RE e nel citosol.
  • Gli esperimenti su questi mutanti aiutano a comprendere il processo di secrezione e il trasporto delle proteine tra i vari compartimenti cellulari.

siRNA

  • Piccole molecole di RNA a doppio filamento che possono silenziare l'espressione di specifici geni.
  • L'uso di siRNA può essere utilizzato per impedire il movimento di proteine.
  • Interagendo con mRNA simili, impediscono alla cellula di sintetizzarli, quindi di creare le proteine associate.

Organelli

  • Componenti cellulari con funzioni specifiche.
  • Sono menzionati reticolo endoplasmatico (liscio e ruvido), apparato di Golgi, lisosomi e mitocondri e perossisomi.

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