Secuenciación del ADN y métodos

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Questions and Answers

¿Cuál es una de las principales ventajas de la secuenciación de cuarta generación?

  • Es más costosa que otros métodos de secuenciación.
  • Depende de un ciclo repetitivo para la secuenciación.
  • Requiere amplificación del ADN para su análisis.
  • Permite la secuenciación en tiempo real de ADN o ARN. (correct)

¿Qué tecnología permite decodificar casi mil millones de bases de ADN en un cuarto de día?

  • Tecnología de Oxford Nanopore. (correct)
  • Método de Sanger.
  • Electroforesis capilar.
  • Reacción en cadena de la polimerasa (PCR).

¿Cuál es el costo asociado a la tecnología de secuenciación de cuarta generación mencionada?

  • $500.
  • $900. (correct)
  • $1500.
  • $3000.

¿Qué aplicación social se destaca como importante gracias a la secuenciación de bajo costo?

<p>Medicina personalizada. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Qué proceso permite la síntesis en tiempo real en la secuenciación de cuarta generación?

<p>Secuenciación sin repeticiones del ciclo. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a las secuencias generadas por NGS?

<p>Permiten análisis rutinarios de genomas completos. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Qué técnica no está relacionada con la secuenciación de cuarta generación?

<p>Metodo de Sanger. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Cómo contribuye la tecnología de secuenciación a la investigación biomédica?

<p>Facilita la investigación detallada de variantes génicas individuales. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál es una ventaja clave de la secuenciación de nueva generación (NGS) en comparación con la electroforesis?

<p>No requiere la técnica de electroforesis. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál de los siguientes métodos de secuenciación no pertenece a la categoría de NGS?

<p>Método de Sanger. (D)</p> Signup and view all the answers

En la secuenciación de cuarta generación, ¿cuántos nanoporos tiene una célula de flujo MinION?

<p>2.048 nanoporos. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Qué aspecto hace que la secuenciación de nueva generación (NGS) sea económicamente ventajosa?

<p>Mayor velocidad durante el proceso y bajo costo. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál de los siguientes métodos es un tipo de secuenciación por síntesis?

<p>Secuenciación Illumina. (B)</p> Signup and view all the answers

Una desventaja común del método de Sanger en comparación con NGS es que:

<p>Es más costoso y toma más tiempo. (A)</p> Signup and view all the answers

¿Qué técnica permite realizar la secuenciación de moléculas individuales en tiempo real?

<p>Secuenciación SMRT. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre la NGS es correcta?

<p>Puede generar millones a billones de lecturas simultáneamente. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál es la principal ventaja de la Secuenciación de Última Generación (NGS) en comparación con el Método de Sanger?

<p>Capacidad de secuenciar múltiples fragmentos simultáneamente. (C)</p> Signup and view all the answers

¿Qué técnica se utiliza en el Método de Sanger para identificar las secuencias de ADN?

<p>Electroforesis capilar con trazadores fluorescentes. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Qué representa la automatización en el Método de Sanger desde 1995?

<p>La capacidad de procesar millones de secuencias por día. (A)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál es una característica distintiva de la electroforesis capilar utilizada en la secuenciación de ADN?

<p>Proporciona una resolución más alta y mayor rapidez en la separación. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Quiénes son los inventores del Método de secuenciación que se presenta en la información?

<p>Walter Gilbert y Frederick Sanger. (A)</p> Signup and view all the answers

¿Qué tipo de fragmentos de ADN se pueden secuenciar utilizando NGS?

<p>Fragmentos individuales sin necesidad de clonación. (C)</p> Signup and view all the answers

¿Qué método se utiliza para visualizar los productos de reacción en la secuenciación automatizada?

<p>Detección mediante láser de fluorocromos. (C)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál es la longitud típica de los fragmentos de ADN que se secuencian usando el Método de Sanger?

<p>200 a 400 bp. (B)</p> Signup and view all the answers

¿Qué aspecto diferencia a la tecnología de secuenciación NGS de otros métodos convencionales?

<p>Permite la ejecución de reacciones en paralelo. (D)</p> Signup and view all the answers

¿Cuál de las siguientes afirmaciones sobre el Método de Sanger es incorrecta?

<p>Es más rápido que el NGS en la mayoría de los casos. (D)</p> Signup and view all the answers

Flashcards

Pozos insertados en membrana

Pozos microscópicos insertados en una membrana de polímero resistente eléctricamente, apoyados por micro andamios conectados a un chip sensor.

Secuenciación de Nueva Generación (NGS)

Método de secuenciación que genera millones de "reads" cortos en paralelo, con mayor velocidad y bajo costo que las técnicas tradicionales.

Secuenciación de cuarta generación

Método que secuencia una sola molécula de ADN o ARN sin amplificación previa, permitiendo síntesis y secuenciación en tiempo real sin repeticiones.

Ventajas de NGS

Mayor velocidad, bajo costo y no requiere electroforesis para la detección.

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Métodos de NGS

Incluye pirosecuenciación, secuenciación por síntesis, Ion Torrent, SOLiD y secuenciación de moléculas individuales (SMRT).

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Tecnología Oxford Nanopore (ONT)

Tecnología de secuenciación de cuarta generación que secuencía moléculas individuales, sin amplificación, en tiempo real.

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Secuenciación Illumina (segunda generación)

Método de secuenciación de NGS que sigue un proceso con etapas definidas.

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Precio de secuenciación ONT

Costo de 900 dólares para decodificar casi mil millones de bases de ADN en un cuarto de día.

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Secuenciación de Cuarta Generación

Secuenciación que utiliza nanoporos para secuenciar ADN/ARN, con una célula de flujo que contiene canales con muchos nanoporos para la lectura.

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NGS

Secuenciación de Nueva Generación, nombre alternativo para la secuenciación de alta capacidad en biología.

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Medicina personalizada

Tratamientos médicos diseñados específicamente para un individuo con base en su genoma, buscando un mejor resultado.

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Volúmenes de reacción en NGS

Son extremadamente pequeños en la secuenciación de nueva generación.

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Importancia social de la secuenciación génica

La capacidad de secuenciar genomas abre nuevas posibilidades en investigación biológica y aplicaciones biomédicas como la medicina personalizada.

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Costo de la secuenciación a través del tiempo

Un concepto que estudia la evolución del costo de la secuenciación genómica a lo largo del tiempo.

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Secuenciación del ADN

Proceso de determinar el orden de los nucleótidos (A, C, G y T) en una molécula de ADN.

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Método de Sanger

Técnica de secuenciación de ADN que utiliza didesoxinucleótidos para detener la síntesis de ADN en puntos específicos.

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Didesoxinucleótidos

Nucleótidos modificados que carecen del grupo hidroxilo en el carbono 3' del azúcar, deteniendo la elongación de la cadena de ADN durante la secuenciación.

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Maxam-Gilbert

Técnica temprana de secuenciación de ADN que utiliza reacciones químicas para romper el ADN en diferentes puntos.

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Electroforesis capilar

Técnica que separa fragmentos de ADN según su tamaño utilizando un capilar y un campo eléctrico.

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Secuenciación de NGS

Método de secuenciación de ADN de última generación que secuenciar millones de fragmentos de ADN en paralelo.

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Fluorocromos

Moléculas que emiten luz de un color específico cuando se excitan con una luz láser, utilizado para identificar las bases nitrogenadas en la secuenciación de ADN.

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Reacciones libres

Método de secuenciación en el que los fragmentos de ADN se secuencian sin necesidad de clonación en huéspedes.

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Study Notes

Secuenciación del ADN

  • Método desarrollado por Walter Gilbert y Frederick Sanger
  • Premio Nobel de Química 1980
  • Técnicas de secuenciación
    • Método de Maxam-Gilbert (publicado en 1977)
    • Método de Sanger (publicado en 1977)
      • Usando didesoxinucleótidos
      • Automatizado en 1995 (Sistema ABI 370)
  • Principio del método de Sanger
    • ADN como plantilla
    • Utilizando dideoxinucleótidos, que terminan la cadena
    • Cuatro tubos con distintos dideoxinucleótidos marcados
      • ddATP
      • ddTTP
      • ddGTP
      • ddCTP
  • Secuenciación automatizada
    • Electroforesis capilar
    • Detección mediante fluorocromos (pictogramas)
    • Leer la secuencia de la electroforesis capilar
  • Secuenciación de ADN de última generación (NGS)
    • Miles de millones de fragmentos simultáneamente
    • Técnicas de secuenciación
      • Pirosecuenciación
      • Secuenciación por ligado de oligonucleótidos
      • Secuenciación de moléculas individuales en tiempo real (SMRT)

Ventajas de la NGS

  • Mayor velocidad en el procesamiento de la información y a menor costa
  • Estudio de gran número de genes
  • Análisis de pares cromosómicos completo
  • Tiempo de análisis reducido
  • Coste asequible
  • No se necesita realizar detección con la técnica de detección específica

Costo de la secuenciación a través del tiempo

  • La secuenciación del ADN a bajado considerablemente de costo con el tiempo.

Métodos de secuenciación usados

  • NGS usados en la secuenciación de genomas:
    • Pirosecuenciación
    • Secuenciación por ligado
    • Secuenciación de Moléculas Individuales en tiempo real (SMRT)

Secuenciación de ADN: Generaciones

  • Primera generación
    • Sanger y Maxam-Gilbert
    • Secuenciación de lectura corta (~500-1000 pb)
  • Segunda generación (NGS)
    • 454, Solexa, Ion Torrent, Illumina
    • Alta capacidad de procesamiento por paralización
    • Secuenciación de lectura corta (~50-500 pb)
  • Tercera generación
    • PacBio y Oxford Nanopore
    • Secuenciación de lectura larga (varios kb)

Secuenciación de cuarta generación

  • Posibilidades de secuenciación en tiempo real de una sola molécula.
  • Precio menor costo.

NGS a nivel social

  • Posibilidades en la investigación biológica y en aplicaciones biomédicas.
  • Medicina personalizada con base en variantes génicas.

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