Peptid ve Proteinler: Yapıları I

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Questions and Answers

Bir amino asidin ortama H+ iyonu verme yeteneği hangi parametre ile ifade edilir?

pKa

pK (correct)

Aşağıdakilerden hangisi α-karboksil grubunun pK değerine en yakın olan değerdir?

2 (correct)

Zwitterion yapısına sahip bir amino asit ne özelliğe sahiptir?

Net pozitif yük taşır

Sadece pozitif yük taşır

Net negatif yük taşır

Net yük taşımaz (correct)

Nötral pH değeri nedir?

7 Signup and view all the answers

Bir amino asidin amino grubu pK değeri yaklaşık olarak nedir?

10 Signup and view all the answers

Amino asitlerin adlandırılmasında hangi karbon atomu referans alınır?

α-karbon Signup and view all the answers

Hangisi glisin dışında kalan bir amino asidin özelliklerinden biridir?

Yan zincir R ile gösterilir Signup and view all the answers

Amino asitlerin yapısında bulunmayan özellik nedir?

Sadece hidrojen atomu ile bağ oluşturması Signup and view all the answers

Amino asitlerin yan zincir özellikleri hangi harfler ile gösterilir?

β, γ, δ, ε Signup and view all the answers

Hangisi doğru bir ifade değildir?

Glisin, α-karbonu asimetrik olan bir amino asittir. Signup and view all the answers

Chiral atom nedir?

Asimetrik karbon atomu Signup and view all the answers

Doğal amino asitlerin çoğu hangi izomerlerden oluşur?

L-izomerleri Signup and view all the answers

Kiral merkezi olan bileşiklerin özelliği nedir?

Polarize ışığın titreşim düzlemini değiştirmek Signup and view all the answers

D ve L stereoizomerlik terimleri neyi ifade eder?

Asimetrik karbonların ayna görüntülerini Signup and view all the answers

Polarize ışığın saat yönünde çeviren bileşikler için hangi izomerlik geçerlidir?

D-izomerler Signup and view all the answers

Nonpolar R gruplarının protein yapısındaki önemi nedir?

Proteinlerin üç boyutlu yapı kazanmasına yardımcı olur. Signup and view all the answers

Aşağıdakilerden hangisi yan zincirlerde bulunmayan bir özelliktir?

Oksijen atomu varlığı Signup and view all the answers

Nonpolar R gruplarının proteinlerin iç kısmında yer almasının sonucu nedir?

Proteinlerin katlanma ve yapısal stabilitesinin artması. Signup and view all the answers

Hangi radikal grup özelliği yan zincirler arasında yaygın olarak bulunmaz?

Polar özellikler Signup and view all the answers

Proteinlerin üç boyutlu yapı kazanmasının önemi nedir?

Fonksiyonel aktivitesini artırır. Signup and view all the answers

Study Notes

Peptid ve Proteinler: Yapıları ve Genel Özellikleri I

Sunum, peptid ve proteinlerin yapısını ve genel özelliklerini ele alıyor.
Sunum, 18 Kasım 2021 tarihinde sunulmuş.
Konular arasında aminoasitler, aminoasit reaksiyonları, proteinlerin yapısı ve işlevi, hemoglobin ve myoglobin bulunuyor.
Proteinlerin, hücre kuru ağırlığının en az yarısını oluşturduğu belirtiliyor.
Her bir molekül arasında proteinlerden asla vazgeçilmeyeceği vurgulanıyor.

Proteinlerin Sınıflandırılması

Proteinler, molekül biçimlerine göre fibriler ve globüler olarak sınıflandırılır.
Fibriler proteinlerin boy/çap oranı yüksek ve çözünmezdir. Örnekler: kolajen, elastin ve keratin bulunur.
Globüler proteinler küresel veya elips şeklindedir ve çözünürler. Örnekler: enzimler, hemoglobin, myoglobin ve reseptörlerdir.

Monomer (Alt Birim) Sayısına Göre Sınıflandırma

Proteinler, monomer (alt birim) sayılarına göre de sınıflandırılabiliyor.
Monomerik, Dimerik, Trimerik ve Tetramerik protein türleri var.
Hemoglobin ve insülin bu sınıflandırmalara örnek olarak veriliyor.

Proteinlerin Fonksiyonlarına Göre Sınıflandırılması

Proteinler şu fonksiyonlara göre de ayrılabilir:
- Savunma: Antikorlar
- Taşıma: Hemoglobin
- Yapı: Kolajen

Canlı Türlerindeki Benzerlikler

Farklı türlerde görev alan, ancak yapılarında benzerlik gösteren proteinler, homolog proteinler olarak adlandırılıyor.
Hemoglobin ve insülin homolog protein örnekleri olarak veriliyor.

Proteinlerin İçeriğine Göre Sınıflandırılması

Proteinler, içeriğine göre basti ve bileşik proteinler olarak ikiye ayrılabilir.
Basit proteinler sadece aminoasitlerden oluşur (örn. histon, albümin).
Bileşik proteinler ise ek gruplar (örn. karbohidrat, lipit, metal) içerir.

Holoproteinler ve Apoproteinler

Holoproteinler, protein grubunun işlevini yerine getiren bir protein ile protetik grubunun birleşmesinden meydana gelir.
Apoproteinler ise protein ile birleşmemiş protetik grup olarak tanımlanır.

Aminoasitler

Proteinlerin yapı taşları aminoasitlerdir.
20 standart ve iki veya daha fazla ek aminoasit vardır.
Protein alfabesine göre listelenir.

Aminoasitlerin Sayısı

<20: Oligopeptid
20-100: Polipeptid
100: Protein
Bir amino asitin ortalama kütlesi 110 dalton olarak belirlenmiştir.
Çoğu proteinin 5500 ila 220000 dalton arasında değişen bir kütlesi vardır.

Aminoasitlerin Yapısı

Karboksil, amino, hidrojen ve değişken R gruplarından oluşuyor.

Aminoasitlerin Özellikleri

Yan zincirlerde bulunan karbon atomları β, γ, δ ve ε gibi harflerle belirtilir.
Aminoasitler, amino grubunun bağlandığı karbona göre (α, β, γ, δ, ε) - amino asit olarak adlandırılırlar.
Proteinler yalnızca a-aminoasitlerden oluşur.
Glisin dışında diğer tüm aminoasitler a-karbonuna bağlanan dört grup birbirinden farklıdır, a-karbon asimetriktir.
Asimetrik karbon atomuna Yunanca "cheir=el" anlamına gelen chiral atom denir.
Doğal amino asitlerin çoğu D-izomeri değil, L-izomeridir.

Aminoasitlerin Sınıflandırılması

R gruplarıyla yapılır.Örneğin, düz zinciri, kükürtlü, aromatik, hidroksilli, polar vs. aminoasitler kategorize edilir.

Zwitterion

Yükü yok olsa bile iki kutuplu bir iyon oluştururlar.
Amfoter bileşikler veya amfolitler olarak da adlandırılırlar.

Genel Sınıflama

Alifatik, Çift Karboksilli, Kükürtlü, Hidroksilli, Çift Aminolu ve Guanidin gruplu amino asitlerin ayrıntılı bir listesi.

Halkalı Aminoasitler

Fenilalanin, Tirozin, Triptofan ve Histidin ve Prolin'in ayrıntılı özellikleri

Fenilalaninin özellikleri

Aromatik ve Polar olmayan özelliğe sahiptir.

Fenilketonüri

Fenilalanin metabolize edilemez.
Bu metabolik ürünler idrarda birikir, ve ayrıca sinir sistemi ve deri ile ilgili problemleri de içerir.
Mikrosefali ve idrarda fare benzeri (mouse-like) koku gibi özel belirtiler görülür.

Topuk Kanı Örneği ile Yapılan Yenidoğan Tarama Testinin Ülkemizdeki Tarihçesi

Fenilketonüri (1994), konjenital hipotiroidi (2006) ve biotinidaz eksikliği (2008) testlerinin ülkemizdeki uygulanmaya başlamasını ele alıyor.

Triptofan

Polar olmayan ve aromatiktir.
Ultraviyole ışığı emer.
Bir amino asid örneği.

Metiyonin

Polar olmayan ve alifatiktir.
S içerir.
Bir amino asid örneği.

Polar Amino Asitler

Polar olan ancak yüksüz olan amino asitlerdir.

Glisin

En küçük amino asittir.
Hem porfirin ve hem yapısının bir öncüsüdür.
Proteinlerde hidrofilik ve hidrofobik bölgelerde bulunabilir.
Asimetrik karbon atomu yoktur.

Serin, Treonin ve Tirozin

Polar aminoasitler
Birçok enzim reaksiyonunda fosforileler

Sistein

Hidrofiliktir.
Protein yapısındaki disülfit köprülerinin yapısına katılır.

Asparajin ve Glutamin

Yan zincirlerinde yük taşımazlar.
Amid grupları nedeniyle polar özellik gösterirler.

Asidik R Gruplu (Negatif Yüklü) Amino Asitler

Aspartat (Asp, D) ve Glutamat (Glu, E)
Fizyolojik pH'da negatif yüklüdürler.
Proton vericilerdir.

Bazik R Gruplu (Pozitif Yüklü) Amino Asitler

Lizin (Lys), Arginin (Arg) ve Histidin (His)
Fizyolojik pH'da pozitif yüklüdürler
Yan zincirleri proton alıcıdır.

Histidin

Beta C'da imidazol halkası taşır.
Fizyolojik pH'da tampon görevi yapan tek amino asittir.
Hemoglobinin H+ iyonu bağlamasına yardımcı olur.

Standart Olmayan Amino Asitler

Translasyon sonrası değişikliklerle oluşan aminoasitler
✓ Hidroksiprolin, ✓ Hidroksilizin, ✓ Desmozin, ✓ Metillizin, ve ✓Gama-karboksiglutamat

Gama-Karboksiglutamat

Glutamatın gama karbonuna bir karboksil grubu daha eklenmesiyle oluşur.
Fizyolojik pH'da negatif yüklü ve Ca+2 gibi pozitif yüklü iyonlara bağlanır.

Diğer Aminoasitler

Selenosistein, Pirrolizin, özel özelliklerine göre sınıflandırılır.

Hemoglobin

Hemoglobinin globin ve hem bileşenlerinden oluştuğu belirtilir.

Diğer Konular

Sunumda, bazı aminoasitlerin metabolizma hastalıkları, spesifik protein fonksiyonlarının ayrıntıları, ve yeni doğan tarama testlerinin tarihçesine de değinilmektedir.

Studying That Suits You

Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

Description

Bu quiz, peptid ve proteinlerin yapısı, işlevi ve sınıflandırılması üzerine odaklanmaktadır. Aminoasitlerden, protein çeşitlerine ve onların moleküler özelliklerine kadar birçok önemli konuyu ele almaktadır. Proteinlerin biyolojik önemi ve hücrelerdeki rolleri hakkında bilgi sağlamaktadır.