PCR Contamination and Prevention

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Hoe kunnen we cellen openbreken om er DNA uit te isoleren?

Met behulp van enzymen die de celwand afbreken
Door de cellen te bevriezen en te ontdooien (correct)
Door de cellen te verhitten tot 100°C
Door de cellen te centrifugeren

Wat is het doel van PCR?

Het isoleren van DNA uit cellen
Het bepalen van de DNA-sequentie
Het analyseren van de zuiverheid van geïsoleerd DNA
Het vermenigvuldigen van een specifiek stukje DNA (correct)

Wat is het principe van PCR?

Het binden van eiwitten aan het DNA
Het verhitten en afkoelen van het DNA om replicatie te bewerkstelligen (correct)
Het veranderen van de DNA-sequentie
Het isoleren van DNA uit een monster

Wat zijn negatieve controles bij PCR?

Controles waarbij alle PCR-componenten worden weggelaten om te controleren op vervuiling (B) Signup and view all the answers

Wat zijn dNTP's in de context van PCR?

De bouwstenen voor het vormen van nieuwe DNA-strengen (B) Signup and view all the answers

Hoe kunnen we DNA-contaminatie bij PCR voorkomen?

Door strikte scheiding van pre- en post-PCR laboratoriumfaciliteiten (C) Signup and view all the answers

Wat is het doel van het isoleren van DNA uit cellen/weefsels?

Om enzymatische activiteit te bevorderen (A) Signup and view all the answers

Welke methode kan gebruikt worden om cellen open te breken om er DNA uit te isoleren?

Alkalische buffer (NaOH) (C) Signup and view all the answers

Wat is de functie van proteïnase K bij het isoleren van DNA?

Breekt eiwitten af uit celmembraan en maakt nucleasen onschadelijk (A) Signup and view all the answers

Wat is een voordeel van het gebruik van lysozyme bij het isoleren van DNA?

Breekt celwand van gramnegatieve bacteriën open (C) Signup and view all the answers

Wat is een fysische methode die gebruikt kan worden om cellen open te breken voor het isoleren van DNA?

Vortexen (C) Signup and view all the answers

Wat wordt bedoeld met 'denatureren' in het kader van het isoleren van DNA?

Het veranderen van de ruimtelijke structuur van een molecuul, zoals DNA (A) Signup and view all the answers

Wat is een essentieel onderdeel bij het verwijderen van ongewenste componenten bij het isoleren van DNA?

Fasenextractie met fenol-chloroform (A) Signup and view all the answers

Waarom is het belangrijk om kwaliteitscontrole uit te voeren op geïsoleerd DNA?

Om de zuiverheid en concentratie van het DNA te bepalen (A) Signup and view all the answers

Wat is een voordeel van proteïnase K bij het isoleren van DNA?

Breekt eiwitten af uit celmembraan en maakt nucleasen onschadelijk (B) Signup and view all the answers

Welke methode wordt gebruikt om cel debris te scheiden tijdens de isolatie van DNA?

Fasenextractie met fenol-chloroform (B) Signup and view all the answers

Wat wordt bedoeld met 'lyse' in het kader van het isoleren van DNA?

Het openbreken van de celwand (C) Signup and view all the answers

Welke methode kan gebruikt worden om cellen open te breken bij humane cellen?

Alkalische buffer (NaOH), warmte, chaotrope stof/zout (in lysebuffer) (C) Signup and view all the answers

Wat zijn de voordelen van isopropanol precipitatie bij de extractie van DNA?

Zeer goede opbrengst en minder schadelijke organische solventen (A) Signup and view all the answers

Welke functie heeft de bindingbuffer met een hoge zoutconcentratie en chaotrop agens bij de boom-'extractie'?

Vormen kationbrug tussen silicakolom en negatief geladen DNA (D) Signup and view all the answers

Waarom wordt genomisch DNA dat intact moet blijven voor een bepaalde toepassing anders bewaard dan standaard?

Om de DNA-grootte te behouden (B) Signup and view all the answers

Wat is het gevolg van herhaaldelijk invriezen en ontdooien van het startmateriaal?

Het vermindert de DNA-grootte (A) Signup and view all the answers

Wat is een mogelijke reden om RNase toe te voegen tijdens de extractie?

Om RNA te digesteren (C) Signup and view all the answers

Wat is het doel van PCR?

Het snel exponentieel vermeerderen van een DNA-fragment (C) Signup and view all the answers

Wat gebeurt er tijdens de denaturatiefase van de PCR-reactie?

Smelten van dubbelstrengig DNA door verbreken van waterstofbruggen tussen nucleotiden (C) Signup and view all the answers

Wat is de formule voor het verdunnen van template DNA?

$c1 * V1 = c2 * V2$ (B) Signup and view all the answers

Waarom worden primeroplossingen vaak opgeslagen met een hoge primerconcentratie?

'Hoe lager primerconcentratie, hoe sneller primer degradeert' (C) Signup and view all the answers

Wat is het doel van agarosegelelektroforese (AEG)?

Scheiding van DNA-fragmenten op basis van grootte. (D) Signup and view all the answers

Wat gebeurt er met het scheidend vermogen als de hoeveelheid agarose in de gel toeneemt?

Het scheidend vermogen neemt af. (C) Signup and view all the answers

Hoe wordt de resolutie bij agarosegelelektroforese (AEG) gemeten?

In aantal baseparen. (C) Signup and view all the answers

Wat is een moleculaire marker in het kader van agarosegelelektroforese (AEG)?

Een mengsel van DNA-fragmenten met bekende grootte. (A) Signup and view all the answers

Wat zijn de voordelen van SybrGreen ten opzichte van Ethidiumbromide bij agarosegelelektroforese (AEG)?

SybrGreen heeft sterkere fluorescerende eigenschappen en is minder mutageen. (D) Signup and view all the answers

Wat is het neurotoxine dat gebruikt wordt bij polyacrylamide gelelektroforese (PAGE)?

Polyacrylamide (D) Signup and view all the answers

Wat is de resolutie bij capillaire gelelektroforese (CE)?

<ul> <li>1bp (D)</li> </ul> Signup and view all the answers

Wat is de voornaamste functie van DNA?

Opslag en verzending van genetische informatie. (B) Signup and view all the answers

Wat kenmerkt een dubbele helixstructuur van DNA?

Twee strengen verbonden door H-bruggen en antiparallel gerangschikt. (C) Signup and view all the answers

Wat is de functie van euchromatisch DNA?

Het is functioneel actief DNA (A) Signup and view all the answers

Wat is heterochromatine?

Compact en inactief DNA (C) Signup and view all the answers

Wat is het verschil tussen facultatieve heterochromatine en constitutieve heterochromatine?

Facultatieve heterochromatine kan omgezet worden tot euchromatine, terwijl constitutieve heterochromatine permanent compact blijft (D) Signup and view all the answers

Wat is de rol van een gen binnen een cel?

Het regelt een afzonderlijke erfelijke eigenschap en codeert meestal voor een specifiek product zoals een eiwit (D) Signup and view all the answers

Hoe wordt genexpressie gedefinieerd?

Als het proces waarbij informatie in een gen tot expressie komt doordat het gen afgelezen wordt en RNA en eiwitten worden gemaakt (C) Signup and view all the answers

Wat zijn de twee belangrijkste stappen van het centrale dogma?

Transcriptie en translatie (D) Signup and view all the answers

Wat houdt epigenetische modificaties in?

Chemische modificaties van DNA en histonen (C) Signup and view all the answers

Hoe wordt expressie van RNA/eiwitten gereguleerd op transcriptioneel niveau?

Synthese (B) Signup and view all the answers

Wat is differentiatie in de context van genexpressie?

Het proces waarbij cellen gespecialiseerd raken en een eigen patroon van genexpressie krijgen (D) Signup and view all the answers

Wat is fenotypische plasticiteit?

'n Genotype kan hetzelfde zijn, maar het fenotype verschilt onder invloed van de omgeving (C) Signup and view all the answers

Wat is compartimentalisatie in de context van celarchitectuur?

Ruimtelijke organisatie van cellulaire componenten voor functies en regulering te vergemakkelijken (C) Signup and view all the answers

Wat onderscheidt prokaryoten van eukaryoten?

Prokaryoten hebben geen interne membraangebonden compartimenten, terwijl eukaryoten wel interne membraangebonden compartimenten hebben (B) Signup and view all the answers

Wat is de functie van een isolatiecontrole bij PCR?

Het spoort contaminatie tijdens nucleïnzuurisolatie op. (D) Signup and view all the answers

Wat is het doel van een positieve controle bij PCR?

Het monster waarin het te amplificeren target aanwezig is. (A) Signup and view all the answers

Wat is de functie van dNTP's in de context van PCR?

Het synthetiseren van lange ketens/polymeren van AZ of nucleotiden. (B) Signup and view all the answers

Wat is het principe van elektroforese?

Beweging van geladen deeltjes onder invloed van een elektrisch veld. (B) Signup and view all the answers

Wat is het doel van hulpstoffen (additieven, enhancers) bij PCR?

Stabiliseren de activiteit van de polymerase en verbeteren de opbrengst. (A) Signup and view all the answers

Wat gebeurt er als de concentratie dNTP's te hoog is bij PCR?

Fouten ontstaan en de synthesesnelheid van polymerase daalt. (A) Signup and view all the answers

Wat kenmerkt een dubbele helixstructuur van DNA?

Specifieke binding met complementaire sequentie. (A) Signup and view all the answers

Wat zijn de voornaamste toepassingen van PCR?

Hot-start, touch down, nested en multiplex PCR. (C) Signup and view all the answers

Wat is het verschil tussen capillaire gelelektroforese (CE) en polyacrylamidegelelektroforese (PAGE)?

Scheiding van DNA-fragmenten in lang capillair versus in polyacrylamidegel. (A) Signup and view all the answers

Wat is het doel van negatieve controles bij PCR?

Controleert of er geen template DNA aanwezig is. (B) Signup and view all the answers

Wat wordt bedoeld met 'denatureren' in het kader van DNA isolatie?

Het 'ontwinden' of 'smelten' van dubbele helixstructuur om enkelstrengs-DNA te verkrijgen. (D) Signup and view all the answers

PCR Contamination and Prevention

Choose a study mode

Podcast

Questions and Answers

Hoe kunnen we cellen openbreken om er DNA uit te isoleren?

Wat is het doel van PCR?

Wat is het principe van PCR?

Wat zijn negatieve controles bij PCR?

Wat zijn dNTP's in de context van PCR?

Hoe kunnen we DNA-contaminatie bij PCR voorkomen?

Wat is het doel van het isoleren van DNA uit cellen/weefsels?

Welke methode kan gebruikt worden om cellen open te breken om er DNA uit te isoleren?

Wat is de functie van proteïnase K bij het isoleren van DNA?

Wat is een voordeel van het gebruik van lysozyme bij het isoleren van DNA?

Wat is een fysische methode die gebruikt kan worden om cellen open te breken voor het isoleren van DNA?

Wat wordt bedoeld met 'denatureren' in het kader van het isoleren van DNA?

Wat is een essentieel onderdeel bij het verwijderen van ongewenste componenten bij het isoleren van DNA?

Waarom is het belangrijk om kwaliteitscontrole uit te voeren op geïsoleerd DNA?

Wat is een voordeel van proteïnase K bij het isoleren van DNA?

Welke methode wordt gebruikt om cel debris te scheiden tijdens de isolatie van DNA?

Wat wordt bedoeld met 'lyse' in het kader van het isoleren van DNA?

Welke methode kan gebruikt worden om cellen open te breken bij humane cellen?

Wat zijn de voordelen van isopropanol precipitatie bij de extractie van DNA?

Welke functie heeft de bindingbuffer met een hoge zoutconcentratie en chaotrop agens bij de boom-'extractie'?

Waarom wordt genomisch DNA dat intact moet blijven voor een bepaalde toepassing anders bewaard dan standaard?

Wat is het gevolg van herhaaldelijk invriezen en ontdooien van het startmateriaal?

Wat is een mogelijke reden om RNase toe te voegen tijdens de extractie?

Wat is het doel van PCR?

Wat gebeurt er tijdens de denaturatiefase van de PCR-reactie?

Wat is de formule voor het verdunnen van template DNA?

Waarom worden primeroplossingen vaak opgeslagen met een hoge primerconcentratie?

Wat is het doel van agarosegelelektroforese (AEG)?

Wat gebeurt er met het scheidend vermogen als de hoeveelheid agarose in de gel toeneemt?

Hoe wordt de resolutie bij agarosegelelektroforese (AEG) gemeten?

Wat is een moleculaire marker in het kader van agarosegelelektroforese (AEG)?

Wat zijn de voordelen van SybrGreen ten opzichte van Ethidiumbromide bij agarosegelelektroforese (AEG)?

Wat is het neurotoxine dat gebruikt wordt bij polyacrylamide gelelektroforese (PAGE)?

Wat is de resolutie bij capillaire gelelektroforese (CE)?

Wat is de voornaamste functie van DNA?

Wat kenmerkt een dubbele helixstructuur van DNA?

Wat is de functie van euchromatisch DNA?

Wat is heterochromatine?

Wat is het verschil tussen facultatieve heterochromatine en constitutieve heterochromatine?

Wat is de rol van een gen binnen een cel?

Hoe wordt genexpressie gedefinieerd?

Wat zijn de twee belangrijkste stappen van het centrale dogma?

Wat houdt epigenetische modificaties in?

Hoe wordt expressie van RNA/eiwitten gereguleerd op transcriptioneel niveau?

Wat is differentiatie in de context van genexpressie?

Wat is fenotypische plasticiteit?

Wat is compartimentalisatie in de context van celarchitectuur?

Wat onderscheidt prokaryoten van eukaryoten?

Wat is de functie van een isolatiecontrole bij PCR?

Wat is het doel van een positieve controle bij PCR?

Wat is de functie van dNTP's in de context van PCR?

Wat is het principe van elektroforese?

Wat is het doel van hulpstoffen (additieven, enhancers) bij PCR?

Wat gebeurt er als de concentratie dNTP's te hoog is bij PCR?

Wat kenmerkt een dubbele helixstructuur van DNA?

Wat zijn de voornaamste toepassingen van PCR?

Wat is het verschil tussen capillaire gelelektroforese (CE) en polyacrylamidegelelektroforese (PAGE)?

Wat is het doel van negatieve controles bij PCR?

Wat wordt bedoeld met 'denatureren' in het kader van DNA isolatie?

More Like This

PCR Primer Design Basics Quiz: Master the Primer Quiz

PCR Basics Flashcards

PCR Flashcards

Instruction 3 - PCR