59 Questions
Hoe kunnen we cellen openbreken om er DNA uit te isoleren?
Door de cellen te bevriezen en te ontdooien
Wat is het doel van PCR?
Het vermenigvuldigen van een specifiek stukje DNA
Wat is het principe van PCR?
Het verhitten en afkoelen van het DNA om replicatie te bewerkstelligen
Wat zijn negatieve controles bij PCR?
Controles waarbij alle PCR-componenten worden weggelaten om te controleren op vervuiling
Wat zijn dNTP's in de context van PCR?
De bouwstenen voor het vormen van nieuwe DNA-strengen
Hoe kunnen we DNA-contaminatie bij PCR voorkomen?
Door strikte scheiding van pre- en post-PCR laboratoriumfaciliteiten
Wat is het doel van het isoleren van DNA uit cellen/weefsels?
Om enzymatische activiteit te bevorderen
Welke methode kan gebruikt worden om cellen open te breken om er DNA uit te isoleren?
Alkalische buffer (NaOH)
Wat is de functie van proteïnase K bij het isoleren van DNA?
Breekt eiwitten af uit celmembraan en maakt nucleasen onschadelijk
Wat is een voordeel van het gebruik van lysozyme bij het isoleren van DNA?
Breekt celwand van gramnegatieve bacteriën open
Wat is een fysische methode die gebruikt kan worden om cellen open te breken voor het isoleren van DNA?
Vortexen
Wat wordt bedoeld met 'denatureren' in het kader van het isoleren van DNA?
Het veranderen van de ruimtelijke structuur van een molecuul, zoals DNA
Wat is een essentieel onderdeel bij het verwijderen van ongewenste componenten bij het isoleren van DNA?
Fasenextractie met fenol-chloroform
Waarom is het belangrijk om kwaliteitscontrole uit te voeren op geïsoleerd DNA?
Om de zuiverheid en concentratie van het DNA te bepalen
Wat is een voordeel van proteïnase K bij het isoleren van DNA?
Breekt eiwitten af uit celmembraan en maakt nucleasen onschadelijk
Welke methode wordt gebruikt om cel debris te scheiden tijdens de isolatie van DNA?
Fasenextractie met fenol-chloroform
Wat wordt bedoeld met 'lyse' in het kader van het isoleren van DNA?
Het openbreken van de celwand
Welke methode kan gebruikt worden om cellen open te breken bij humane cellen?
Alkalische buffer (NaOH), warmte, chaotrope stof/zout (in lysebuffer)
Wat zijn de voordelen van isopropanol precipitatie bij de extractie van DNA?
Zeer goede opbrengst en minder schadelijke organische solventen
Welke functie heeft de bindingbuffer met een hoge zoutconcentratie en chaotrop agens bij de boom-'extractie'?
Vormen kationbrug tussen silicakolom en negatief geladen DNA
Waarom wordt genomisch DNA dat intact moet blijven voor een bepaalde toepassing anders bewaard dan standaard?
Om de DNA-grootte te behouden
Wat is het gevolg van herhaaldelijk invriezen en ontdooien van het startmateriaal?
Het vermindert de DNA-grootte
Wat is een mogelijke reden om RNase toe te voegen tijdens de extractie?
Om RNA te digesteren
Wat is het doel van PCR?
Het snel exponentieel vermeerderen van een DNA-fragment
Wat gebeurt er tijdens de denaturatiefase van de PCR-reactie?
Smelten van dubbelstrengig DNA door verbreken van waterstofbruggen tussen nucleotiden
Wat is de formule voor het verdunnen van template DNA?
$c1 * V1 = c2 * V2$
Waarom worden primeroplossingen vaak opgeslagen met een hoge primerconcentratie?
'Hoe lager primerconcentratie, hoe sneller primer degradeert'
Wat is het doel van agarosegelelektroforese (AEG)?
Scheiding van DNA-fragmenten op basis van grootte.
Wat gebeurt er met het scheidend vermogen als de hoeveelheid agarose in de gel toeneemt?
Het scheidend vermogen neemt af.
Hoe wordt de resolutie bij agarosegelelektroforese (AEG) gemeten?
In aantal baseparen.
Wat is een moleculaire marker in het kader van agarosegelelektroforese (AEG)?
Een mengsel van DNA-fragmenten met bekende grootte.
Wat zijn de voordelen van SybrGreen ten opzichte van Ethidiumbromide bij agarosegelelektroforese (AEG)?
SybrGreen heeft sterkere fluorescerende eigenschappen en is minder mutageen.
Wat is het neurotoxine dat gebruikt wordt bij polyacrylamide gelelektroforese (PAGE)?
Polyacrylamide
Wat is de resolutie bij capillaire gelelektroforese (CE)?
- 1bp
Wat is de voornaamste functie van DNA?
Opslag en verzending van genetische informatie.
Wat kenmerkt een dubbele helixstructuur van DNA?
Twee strengen verbonden door H-bruggen en antiparallel gerangschikt.
Wat is de functie van euchromatisch DNA?
Het is functioneel actief DNA
Wat is heterochromatine?
Compact en inactief DNA
Wat is het verschil tussen facultatieve heterochromatine en constitutieve heterochromatine?
Facultatieve heterochromatine kan omgezet worden tot euchromatine, terwijl constitutieve heterochromatine permanent compact blijft
Wat is de rol van een gen binnen een cel?
Het regelt een afzonderlijke erfelijke eigenschap en codeert meestal voor een specifiek product zoals een eiwit
Hoe wordt genexpressie gedefinieerd?
Als het proces waarbij informatie in een gen tot expressie komt doordat het gen afgelezen wordt en RNA en eiwitten worden gemaakt
Wat zijn de twee belangrijkste stappen van het centrale dogma?
Transcriptie en translatie
Wat houdt epigenetische modificaties in?
Chemische modificaties van DNA en histonen
Hoe wordt expressie van RNA/eiwitten gereguleerd op transcriptioneel niveau?
Synthese
Wat is differentiatie in de context van genexpressie?
Het proces waarbij cellen gespecialiseerd raken en een eigen patroon van genexpressie krijgen
Wat is fenotypische plasticiteit?
'n Genotype kan hetzelfde zijn, maar het fenotype verschilt onder invloed van de omgeving
Wat is compartimentalisatie in de context van celarchitectuur?
Ruimtelijke organisatie van cellulaire componenten voor functies en regulering te vergemakkelijken
Wat onderscheidt prokaryoten van eukaryoten?
Prokaryoten hebben geen interne membraangebonden compartimenten, terwijl eukaryoten wel interne membraangebonden compartimenten hebben
Wat is de functie van een isolatiecontrole bij PCR?
Het spoort contaminatie tijdens nucleïnzuurisolatie op.
Wat is het doel van een positieve controle bij PCR?
Het monster waarin het te amplificeren target aanwezig is.
Wat is de functie van dNTP's in de context van PCR?
Het synthetiseren van lange ketens/polymeren van AZ of nucleotiden.
Wat is het principe van elektroforese?
Beweging van geladen deeltjes onder invloed van een elektrisch veld.
Wat is het doel van hulpstoffen (additieven, enhancers) bij PCR?
Stabiliseren de activiteit van de polymerase en verbeteren de opbrengst.
Wat gebeurt er als de concentratie dNTP's te hoog is bij PCR?
Fouten ontstaan en de synthesesnelheid van polymerase daalt.
Wat kenmerkt een dubbele helixstructuur van DNA?
Specifieke binding met complementaire sequentie.
Wat zijn de voornaamste toepassingen van PCR?
Hot-start, touch down, nested en multiplex PCR.
Wat is het verschil tussen capillaire gelelektroforese (CE) en polyacrylamidegelelektroforese (PAGE)?
Scheiding van DNA-fragmenten in lang capillair versus in polyacrylamidegel.
Wat is het doel van negatieve controles bij PCR?
Controleert of er geen template DNA aanwezig is.
Wat wordt bedoeld met 'denatureren' in het kader van DNA isolatie?
Het 'ontwinden' of 'smelten' van dubbele helixstructuur om enkelstrengs-DNA te verkrijgen.
This quiz covers the transfer of DNA or PCR products, leading to false-positive PCR results, and the sources and spread of contamination in the laboratory. It also includes methods to prevent contamination, such as working in separate areas and following a unidirectional workflow.
Make Your Own Quizzes and Flashcards
Convert your notes into interactive study material.
Get started for free
